در مورد تنش اکسیداتیو یا Oxidative stress در سلول های جانوری چه می دانید؟
تهیه و تدوین: تیم ادمین کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی

استرس اکسیداتیو به عدم تعادل بین تولید گونه‌های فعال اکسیژن (ROS) و توانایی سیستم بیولوژیکی برای دفع سریع این واسطه‌های واکنشی یا ترمیم آسیب‌های حاصل از آن اشاره دارد. اختلال در حالت طبیعی اکسید و احیاء (ردوکس) سلول‌ها می‌تواند از طریق تولید پراکسیدها و رادیکال‌های آزاد که به تمامی اجزای سلول از جمله پروتئین‌ها، لیپیدها و DNA آسیب می‌زنند، اثرات سمی ایجاد کند. استرس اکسیداتیو ناشی از متابولیسم اکسیداتیو باعث آسیب به بازهای DNA و شکست در رشته‌های DNA می‌شود. آسیب به بازها عمدتاً به‌صورت غیرمستقیم و توسط گونه‌های فعال اکسیژن مانند O2− (رادیکال سوپراکسید)، OH (رادیکال هیدروکسیل) و H2O2 (پراکسید هیدروژن) ایجاد می‌شود.
@irbioinformatics
فعال‌سازی فاکتور هسته‌ای مرتبط با اریتروئید 2 (Nrf2) به عنوان یک استراتژی امیدبخش برای مقابله با هر دو استرس اکسیداتیو و التهاب در درمان بیماری‌های مزمن در نظر گرفته می‌شود. اخیراً، مهار مستقیم تعامل پروتئین-پروتئین (PPI) بین Nrf2 و پروتئین مرتبط با Kelch-like ECH (Keap1) به عنوان یک استراتژی جذاب برای فعال‌سازی Nrf2 در ارگانیسم‌ها مطرح شده است. توسعه فعلی مهارکننده‌های PPI Keap1-Nrf2 عمدتاً بر اساس تعامل بین Keap1 و موتیف ETGE موجود در Nrf2 استوار است. با این حال، در دهه گذشته گروهی از پروتئین‌ها که دارای موتیف ETGE مشابه Nrf2 هستند به عنوان سوبستراهای جدید Keap1 شناخته شده‌اند.

انتشار این مطلب با ذکر نام کانال مجاز است.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/931

#تصویر_روز
در اینجا می‌توانید ساختار کریستالی با وضوح بالای پروتئین Kelch-like ECH-associated (Keap1) را در ترکیب با یک مهارکننده با وزن مولکولی پایین مشاهده کنید (کد PDB: 8XGK).
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/932

#دانستنی_ها
تهیه و تدوین: تیم ادمین کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی

آیا تا به حال فکر کرده‌اید که بدن شما چگونه لمس، تعادل و درد را حس می‌کند؟ همه این‌ها به لطف کانال‌های کوچکی است که احساسات مکانیکی را به سیگنال‌های الکتریکی تبدیل می‌کنند! دانشمندان در حال کشف چگونگی عملکرد این کانال‌ها هستند. یک ایده این است که آن‌ها یا از طریق تغییرات در کشش غشاء فعال می‌شوند یا توسط تترهایی که نیرو را منتقل می‌کنند. NOMPC، یک کانال که در گونه‌های مختلفی مانند کرم‌ها و ماهی‌ها یافت می‌شود، یکی از عوامل کلیدی است.

@irbioinformatics
تصور می‌شود که این کانال توسط تترهایی که آن را به اسکلت سلولی متصل می‌کنند، باز می‌شود. با مطالعه ساختار NOMPC، دانشمندان امیدوارند رازهای نحوه عملکرد این کانال‌ها را کشف کنند. مشخص شده است که NOMPC دارای ساختار منحصر به فردی است که مانند یک فنر عمل می‌کند و حرکات مکانیکی را به سیگنال‌های الکتریکی متصل می‌کند. درک NOMPC می‌تواند به ما کمک کند بفهمیم بدن ما چگونه لمس و حرکت را به سیگنال‌هایی که مغز می‌تواند پردازش کند، تبدیل می‌کند.

انتشار این مطلب با ذکر نام کانال مجاز است.

https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/933

در مورد بیماری ام اس چه می دانید؟
تهیه و تدوین: تیم ادمین کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی

بیماری مولتیپل اسکلروزیس (MS) که تقریباً ۳ میلیون نفر را در سراسر جهان تحت تأثیر قرار می‌دهد، با نقص‌های پیش‌رونده فیزیکی و شناختی همراه است که به دلیل تخریب سلول‌های اولیگودندروسیت تولیدکننده میلین توسط سیستم ایمنی در سیستم_عصبی_مرکزی (CNS) رخ می‌دهد. تعداد زیادی از داروهای تعدیل‌کننده ایمنی تأیید شده توسط FDA برای MS علائم بیماران را کاهش می‌دهند، اما توانایی محدودی در کند کردن پیشرفت بیماری دارند!
@irbioinformatics
در حالی که داروهای موفقیت‌آمیز اولیه در این کمپین‌های استفاده مجدد از دارو یا drug repurpose در ابتدا تصور می‌شد که از طریق #هدف_دارویی کلاسیک خود عمل می‌کنند، تحقیقات اخیر نشان داده که تقریباً همه تقویت‌کننده‌های #مولکول_کوچک تشکیل اولیگودندروسیت، در واقع از طریق یک مکانیسم مشترک عمل می‌کنند: مهار مستقیم آنزیم‌های خاص مسیر کلسترول و تجمع استرول‌های ۸,۹-غیراشباع، که به عنوان لیپیدهای سیگنال‌دهنده برای تقویت تشکیل #اولیگودندروسیت عمل می‌کنند!
در این مقاله شگفت‌انگیز که از طریق انتشارات ACS، در مجله #شیمی_دارویی منتشر شده است، ماری-گابریل براون، روت دورل، برد لنگ و همکارانشان از شرکت‌های جننتک و کونوولو تراپوتیکس، کشف و بهینه‌سازی مهارکننده‌های قابل نفوذ به مغز و مهارکننده های خوراکی زیست فراهم آنزیم ایزومراز استرول EBP را توصیف می‌کنند:

معرفی می کنم حضورتون 😉
این بزرگوار که یک نوع تک سلولی یوکاریوتی از جنس Monocercomonoides و سرده Excavata می باشد از ارگانیسمهای روی این کره خاکی است که فاقد میتوکندری است

۶ پوزیشن پست داک فرانکفورت آلمان

genomics, bioinformatics/computational biology,

🔗لینک اطلاعات
⛔️ددلاین: ۱۵ نوامبر

پوزیشن دکتری تنسی آمریکا

Animal Science, Biology, Genetics, or Data/Computer Science

🔗لینک اطلاعات

قطعه زیبای سنتور نوازی با هنرمندی سرکار‌خانم ملینا فرجی

فرق انسان پیشرفت‌گرا با انسان کمالگرا!

-فرقشون اینجاست که در کمالگرایی فرد بدون در نظر گرفتن شرایط و محیط میخواد عملکردش عالی و بدون هیچ عیب و نقصی باشه و همین ترس از اشتباه و شکست ممکنه باعث شه اصلا دست به کاری نزنه و اقدامی نکنه که نتیجش میشه اهمالکاری
اما پیشرفت‌گرایی یعنی فرد تلاشش رو میکنه، از اشتباه و شکست نمیترسه و میدونه تو مسیر زندگی باید تجربه کسب کنه و درس بگیره، برعکسِ افراد کمالگرا خودشو با دیگران مقایسه نمیکنه بلکه خودشو با نسخه گذشتش میسنجه و میدونه تغییرات بزرگ حاصل قدم های کوچیکه و استمرار و صبر میطلبه!
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/944

معرفی متابولیت ثانویه کوئرستین
کوئرستین (Quercetin) یک ترکیب فلاونوئیدی است که به طور طبیعی در بسیاری از میوه‌ها، سبزیجات، برگ‌ها و دانه‌ها یافت می‌شود. این ماده به دلیل خواص آنتی‌اکسیدانی و ضدالتهابی خود شناخته شده است و در غذاهایی مانند سیب، پیاز، توت‌ها، چای سبز و انگور وجود دارد. کوئرستین به عنوان یک مکمل غذایی نیز به منظور تقویت سیستم ایمنی، کاهش التهاب، بهبود عملکرد قلبی-عروقی و حتی کاهش علائم آلرژی استفاده می‌شود. مطالعات نشان داده‌اند که کوئرستین ممکن است به کاهش خطر ابتلا به بیماری‌های مزمن مانند بیماری‌های قلبی، دیابت و برخی سرطان‌ها کمک کند، هرچند هنوز تحقیقات بیشتری برای تایید کامل اثرات آن نیاز است
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/945

Quercetin: Potential antidiabetic effects through enzyme inhibition and starch digestibility
سال چاپ: 2024
وضعیت مقاله: open access
نوع مقاله: مروری
تعداد صفحات مقاله: 14
افیلیشن نگارندگان: ترکیه-آلمان
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/950

آنژیوتانسین و فشار خون
تهیه و تدوین: از تیم ادمین کانال
انتشار این مطلب در کانال ها و مراجع علمی دیگر با ذکر نام کانال مجاز است.
فشار خون سالم نیاز به یک تعادل ظریف دارد: فشار باید به اندازه‌ای باشد که خون را در سراسر بدن به گردش درآورد، اما نه آن‌قدر بالا که باعث آسیب شود. بدن ما به طور مداوم فشار خون را کنترل می‌کند و در صورت خارج شدن از محدوده بهینه، تغییراتی ایجاد می‌کند. هورمون آنژیوتانسین نقشی کلیدی در این کنترل دارد. این هورمون زمانی آزاد می‌شود که نیاز به افزایش فشار خون باشد. آنژیوتانسین در بدن گردش می‌کند و اثرات مختلفی از جمله تنگ کردن عروق خونی و ایجاد احساس تشنگی دارد.
@irbioinformatics
آنژیوتانسین وظایف خود را در چند مرحله انجام می‌دهد. این هورمون به صورت یک پیش‌ساز غیرفعال بزرگ به نام آنژیوتانسینوژن توسط سلول‌های کبد ساخته می‌شود و در صورت نیاز به جریان خون آزاد می‌شود. همزمان پروتئاز کوچک رنین از کلیه‌ها آزاد شده و آنژیوتانسینوژن را به یک دکاپپتید کوچک به نام آنژیوتانسین I برش می‌دهد. سپس آنژیوتانسین I توسط آنزیم مبدل آنژیوتانسین (ACE) برش داده می‌شود و دو آمینواسید دیگر از آن جدا می‌شود تا اوکتاپپتید آنژیوتانسین II را تشکیل دهد. آنژیوتانسین II هورمون فعال است که به گیرنده‌های سطح سلول‌ها در سراسر بدن متصل شده و فرآیندهای متعددی را آغاز می‌کند که شامل کنترل جریان آب و نمک، آزادسازی هورمون‌های اضافی، و انقباض عروق خونی می‌باشد
@irbioinformatics
ما می‌توانیم جزئیات مولکولی این سیستم تنظیم فشار خون را در آرشیو PDB پیدا کنیم. همان‌طور که در اطلاعات مندرج در این پایگاه داده مشاهده می‌شود، می‌توانیم ساختارهای پیش‌ساز غیرفعال رنین (PDB ID 3vcm) را با فرم فعال آن هنگام برش دادن آنژیوتانسینوژن (PDB ID 2x0b) مشاهده کنیم. ACE یک آنزیم غشایی است که دارای دو ناحیه مشابه برای برش پروتئین‌ها است و آنژیوتانسین I و سایر هورمون‌های پپتیدی را نیز برش می‌دهد. همچنین ساختارهایی برای آنژیوتانسین I (PDB ID 1n9u) و گیرنده متصل به آنژیوتانسین II (PDB ID 6os0) در بانک PDB در دسترس است.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/951