آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
716 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
معرفی می کنم حضورتون 😉
این بزرگوار که یک نوع تک سلولی یوکاریوتی از جنس Monocercomonoides و سرده Excavata می باشد از ارگانیسمهای روی این کره خاکی است که فاقد میتوکندری است
👀6👍4
۶ پوزیشن پست داک فرانکفورت آلمان

genomics, bioinformatics/computational biology,

🔗لینک اطلاعات
⛔️ددلاین: ۱۵ نوامبر
👍3🔥1
پوزیشن دکتری تنسی آمریکا

Animal Science, Biology, Genetics, or Data/Computer Science

🔗لینک اطلاعات
👍3🔥2
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
قطعه زیبای سنتور نوازی با هنرمندی سرکار‌خانم ملینا فرجی
👍6👏3
فرق انسان پیشرفت‌گرا با انسان کمالگرا!

-فرقشون اینجاست که در کمالگرایی فرد بدون در نظر گرفتن شرایط و محیط میخواد عملکردش عالی و بدون هیچ عیب و نقصی باشه و همین ترس از اشتباه و شکست ممکنه باعث شه اصلا دست به کاری نزنه و اقدامی نکنه که نتیجش میشه اهمالکاری
اما پیشرفت‌گرایی یعنی فرد تلاشش رو میکنه، از اشتباه و شکست نمیترسه و میدونه تو مسیر زندگی باید تجربه کسب کنه و درس بگیره، برعکسِ افراد کمالگرا خودشو با دیگران مقایسه نمیکنه بلکه خودشو با نسخه گذشتش میسنجه و میدونه تغییرات بزرگ حاصل قدم های کوچیکه و استمرار و صبر میطلبه!
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/944
👍9
معرفی متابولیت ثانویه کوئرستین
کوئرستین (Quercetin) یک ترکیب فلاونوئیدی است که به طور طبیعی در بسیاری از میوه‌ها، سبزیجات، برگ‌ها و دانه‌ها یافت می‌شود. این ماده به دلیل خواص آنتی‌اکسیدانی و ضدالتهابی خود شناخته شده است و در غذاهایی مانند سیب، پیاز، توت‌ها، چای سبز و انگور وجود دارد. کوئرستین به عنوان یک مکمل غذایی نیز به منظور تقویت سیستم ایمنی، کاهش التهاب، بهبود عملکرد قلبی-عروقی و حتی کاهش علائم آلرژی استفاده می‌شود. مطالعات نشان داده‌اند که کوئرستین ممکن است به کاهش خطر ابتلا به بیماری‌های مزمن مانند بیماری‌های قلبی، دیابت و برخی سرطان‌ها کمک کند، هرچند هنوز تحقیقات بیشتری برای تایید کامل اثرات آن نیاز است
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/945
👍4
در مطالعه مروری پیوست اثرات ضد دیابتی ترکیب فلاونوییدی کوئرستین با تاکید بر خاصیت مهارکنندگی آن و مهار هضم کربوهیدرات ها به طور کامل شرح داده شده است و همراهان گرامی در صورتی که علاقه مند به مطالعه این خواص مفید هستند می توانند این مقاله مروری را دریافت کنند و از مطالب آن استفاده کنند.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/946
👍4
آنژیوتانسین و فشار خون
تهیه و تدوین: از تیم ادمین کانال
انتشار این مطلب در کانال ها و مراجع علمی دیگر با ذکر نام کانال مجاز است.

فشار خون سالم نیاز به یک تعادل ظریف دارد: فشار باید به اندازه‌ای باشد که خون را در سراسر بدن به گردش درآورد، اما نه آن‌قدر بالا که باعث آسیب شود. بدن ما به طور مداوم فشار خون را کنترل می‌کند و در صورت خارج شدن از محدوده بهینه، تغییراتی ایجاد می‌کند. هورمون آنژیوتانسین نقشی کلیدی در این کنترل دارد. این هورمون زمانی آزاد می‌شود که نیاز به افزایش فشار خون باشد. آنژیوتانسین در بدن گردش می‌کند و اثرات مختلفی از جمله تنگ کردن عروق خونی و ایجاد احساس تشنگی دارد.
@irbioinformatics
آنژیوتانسین وظایف خود را در چند مرحله انجام می‌دهد. این هورمون به صورت یک پیش‌ساز غیرفعال بزرگ به نام آنژیوتانسینوژن توسط سلول‌های کبد ساخته می‌شود و در صورت نیاز به جریان خون آزاد می‌شود. همزمان پروتئاز کوچک رنین از کلیه‌ها آزاد شده و آنژیوتانسینوژن را به یک دکاپپتید کوچک به نام آنژیوتانسین I برش می‌دهد. سپس آنژیوتانسین I توسط آنزیم مبدل آنژیوتانسین (ACE) برش داده می‌شود و دو آمینواسید دیگر از آن جدا می‌شود تا اوکتاپپتید آنژیوتانسین II را تشکیل دهد. آنژیوتانسین II هورمون فعال است که به گیرنده‌های سطح سلول‌ها در سراسر بدن متصل شده و فرآیندهای متعددی را آغاز می‌کند که شامل کنترل جریان آب و نمک، آزادسازی هورمون‌های اضافی، و انقباض عروق خونی می‌باشد
@irbioinformatics
ما می‌توانیم جزئیات مولکولی این سیستم تنظیم فشار خون را در آرشیو PDB پیدا کنیم. همان‌طور که در اطلاعات مندرج در این پایگاه داده مشاهده می‌شود، می‌توانیم ساختارهای پیش‌ساز غیرفعال رنین (PDB ID 3vcm) را با فرم فعال آن هنگام برش دادن آنژیوتانسینوژن (PDB ID 2x0b) مشاهده کنیم. ACE یک آنزیم غشایی است که دارای دو ناحیه مشابه برای برش پروتئین‌ها است و آنژیوتانسین I و سایر هورمون‌های پپتیدی را نیز برش می‌دهد. همچنین ساختارهایی برای آنژیوتانسین I (PDB ID 1n9u) و گیرنده متصل به آنژیوتانسین II (PDB ID 6os0) در بانک PDB در دسترس است.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/951
👍6
مکانیسم مولکولی عملکرد آنژیوتانسین در بدن به همراه داروی ضد فشارخون lisinopril به رنگ زرد در مرکز فعال پروتئین در این شکل به نمایش گذاشته شده است.
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/952
👍5
اینفوگرافی ساختار مولکولی ویروس ها
فایل با کیفیت این اینفوگرافی را در ادامه با فرمت pdf می توانید دانلود کنید.
👍4
viruses-shapes-sizes.pdf
5.1 MB
ویروس‌ها به سلول‌ها حمله کرده و آن‌ها را وادار به تولید تعداد زیادی ویروس جدید می‌کنند که اغلب باعث مرگ سلول می‌شود. برخی ویروس‌ها بسیار ساده هستند، مانند کپسیدهای پروتئینی که یک رشته کوتاه RNA یا DNA را احاطه کرده‌اند. ویروس‌های پیچیده‌تر، ژنوم ویروسی را به داخل سلول تزریق می‌کنند که قادر به رمزگذاری پروتئین‌هایی برای مقابله با دفاع سلول است.

بیشتر ویروس‌ها بسیار کوچک‌تر از سلول‌ها هستند. ویروس‌هایی که در اینجا نشان داده شده‌اند، همگی در حدود 900,000 برابر بزرگنمایی رسم شده‌اند و اندازه آن‌ها از کمتر از ۳۰ نانومتر تا بیش از ۵۰۰ نانومتر در قطر متغیر است (۱ نانومتر = یک میلیاردم متر).
👍4
مروری بر تاریخچه و عملکرد سالیسیلیک اسید در گیاهان
تهیه و تدوین: تیم ادمین کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
انتشار این مطلب در کانال ها و مراجع علمی دیگر با ذکر نام کانال مجاز است.

قرن‌ها پیش، هم یونانیان باستان و هم بومیان آمریکا کشف کردند که پوست درخت بید و برخی گیاهان دیگر می‌توانند درد را کاهش دهند. با تحلیل این درمان‌های سنتی، دانشمندان در قرن نوزدهم مولکول فعال آن، اسید سالیسیلیک، را استخراج کرده و یک مولکول اصلاح‌شده با خواص دارویی بهتر، یعنی اسید استیل‌سالیسیلیک یا آسپیرین، توسعه دادند. در بدن ما، آسپیرین آنزیمی را که یکی از مولکول‌های سیگنال‌دهنده درد را می‌سازد، مسدود می‌کند. اما در گیاهان، اسید سالیسیلیک برای یک نوع سیگنال‌دهی کاملاً متفاوت استفاده می‌شود.
@irbioinformatics
گیاهان یک سیستم پیچیده و چندلایه برای محافظت از خود در برابر حمله باکتری‌ها و ویروس‌ها توسعه داده‌اند. وقتی یک برگ آلوده می‌شود، مثلاً توسط ویروس موزاییک تنباکو، سلول‌های محلی فداکاری نهایی را انجام می‌دهند و نوعی مرگ برنامه‌ریزی‌شده سلولی را تحریک می‌کنند. این کار به کنترل گسترش ویروس کمک می‌کند، با حذف پیشگیرانه تمام سلول‌های قابل آلودگی در اطراف. در عین حال، گیاه یک دفاع گسترده‌تر را آغاز می‌کند. آن یک سیگنال به تمام بخش‌های دوردست خود می‌فرستد و به آن‌ها می‌گوید که پروتئین‌های دفاعی بسازند و خود را برای حمله آماده کنند. این دفاع‌ها پرهزینه هستند و ممکن است باعث کاهش رشد گیاه شوند، اما این بهتر از آن است که کاملاً در برابر مهاجم شکست بخورند
@irbioinformatics
متیل سالیسیلات، استر متیلی اسید سالیسیلیک، یکی از سیگنال‌هایی است که در سراسر گیاه منتشر می‌شود و آن را برای حمله آماده می‌کند. متیل سالیسیلات مولکولی آشناست، زیرا طعم و بوی مشخص اسانس‌های گیاهانی مانند "وینترگرین" را فراهم می‌کند. این ماده به عنوان یک پیام‌رسان بی‌طرف عمل می‌کند که توسط سلول‌های تحت حمله ایجاد شده و به سلول‌های دیگر در سراسر گیاه ارسال می‌شود. سپس آنزیم SABP2 (پروتئین متصل‌شونده به اسید سالیسیلیک 2) متیل سالیسیلات را تجزیه کرده و گروه متیل آن را جدا می‌کند، و اسید سالیسیلیک فعال را آزاد می‌سازد. این اسید فعال سپس تولید پروتئین‌های دفاعی را در سلول‌های هدف تحریک می‌کند
@irbioinformatics
پروتئین SABP2 به‌طور اولیه بر اساس توانایی‌اش در اتصال به اسید سالیسیلیک کشف شد (به همین دلیل نام آن این‌گونه است)، اما ساختار اخیر این پروتئین که توسط محققان NESG حل شده است، نقش آن در تجزیه متیل سالیسیلات و مهار واکنش توسط محصول، یعنی اسید سالیسیلیک را فاش کرد. ساختار این پروتئین، که در ورودی PDB با شناسه 1y7i موجود است، نشان می‌دهد که SABP2 یکی از آنزیم‌های هیدرولاز آلفا/بتا است که استرهای کوچک و سایر مولکول‌ها را تجزیه می‌کند. محل فعال آن به‌طور کامل مولکول را احاطه کرده و هم حلقه آروماتیک مشخص و هم گروه اسیدی را شناسایی می‌کند. یک تریاد کاتالیزوری که به پروتئازهای سرین گوارشی شباهت دارد، واکنش تجزیه را انجام می‌دهد. بر اساس این ساختار، محققان آنالوگ‌هایی از اسید سالیسیلیک طراحی کرده‌اند تا روش‌های سیگنال‌دهی در سایر گیاهان را مورد بررسی قرار دهند
👍6
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
مروری بر تاریخچه و عملکرد سالیسیلیک اسید در گیاهان تهیه و تدوین: تیم ادمین کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی انتشار این مطلب در کانال ها و مراجع علمی دیگر با ذکر نام کانال مجاز است. قرن‌ها پیش، هم یونانیان باستان و هم بومیان آمریکا کشف کردند که پوست درخت…
در شکل جایگاه فعال SABP2 به‌طور کامل سوبسترا را احاطه کرده است. در این ساختار، اسید سالیسیلیک در جایگاه فعال متصل شده است و با مدل CPK نشان داده شده است. تریاد کاتالیتیک جایگاه فعال این آنزیم شامل امینواسیدهای (سرین 81، هیستیدین 238 و آسپارتات 210) با مدل stick ضخیم نشان داده شده و بقیه زنجیره پروتئینی به رنگ سبز تیره نمایش داده شده است. در پست های بعدی در رابطه با این نوع برهمکنش و چگونگی اثرگذاری سالیسیلیک اسید بر مسیرهای سیگنالینگ گیاهی در شرایط عادی و تنشی بیشتر صحبت خواهیم کرد.
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
👍6