Quercetin: Potential antidiabetic effects through enzyme inhibition and starch digestibility
سال چاپ: 2024
وضعیت مقاله: open access
نوع مقاله: مروری
تعداد صفحات مقاله: 14
افیلیشن نگارندگان: ترکیه-آلمان
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/950

آنژیوتانسین و فشار خون
تهیه و تدوین: از تیم ادمین کانال
انتشار این مطلب در کانال ها و مراجع علمی دیگر با ذکر نام کانال مجاز است.
فشار خون سالم نیاز به یک تعادل ظریف دارد: فشار باید به اندازه‌ای باشد که خون را در سراسر بدن به گردش درآورد، اما نه آن‌قدر بالا که باعث آسیب شود. بدن ما به طور مداوم فشار خون را کنترل می‌کند و در صورت خارج شدن از محدوده بهینه، تغییراتی ایجاد می‌کند. هورمون آنژیوتانسین نقشی کلیدی در این کنترل دارد. این هورمون زمانی آزاد می‌شود که نیاز به افزایش فشار خون باشد. آنژیوتانسین در بدن گردش می‌کند و اثرات مختلفی از جمله تنگ کردن عروق خونی و ایجاد احساس تشنگی دارد.
@irbioinformatics
آنژیوتانسین وظایف خود را در چند مرحله انجام می‌دهد. این هورمون به صورت یک پیش‌ساز غیرفعال بزرگ به نام آنژیوتانسینوژن توسط سلول‌های کبد ساخته می‌شود و در صورت نیاز به جریان خون آزاد می‌شود. همزمان پروتئاز کوچک رنین از کلیه‌ها آزاد شده و آنژیوتانسینوژن را به یک دکاپپتید کوچک به نام آنژیوتانسین I برش می‌دهد. سپس آنژیوتانسین I توسط آنزیم مبدل آنژیوتانسین (ACE) برش داده می‌شود و دو آمینواسید دیگر از آن جدا می‌شود تا اوکتاپپتید آنژیوتانسین II را تشکیل دهد. آنژیوتانسین II هورمون فعال است که به گیرنده‌های سطح سلول‌ها در سراسر بدن متصل شده و فرآیندهای متعددی را آغاز می‌کند که شامل کنترل جریان آب و نمک، آزادسازی هورمون‌های اضافی، و انقباض عروق خونی می‌باشد
@irbioinformatics
ما می‌توانیم جزئیات مولکولی این سیستم تنظیم فشار خون را در آرشیو PDB پیدا کنیم. همان‌طور که در اطلاعات مندرج در این پایگاه داده مشاهده می‌شود، می‌توانیم ساختارهای پیش‌ساز غیرفعال رنین (PDB ID 3vcm) را با فرم فعال آن هنگام برش دادن آنژیوتانسینوژن (PDB ID 2x0b) مشاهده کنیم. ACE یک آنزیم غشایی است که دارای دو ناحیه مشابه برای برش پروتئین‌ها است و آنژیوتانسین I و سایر هورمون‌های پپتیدی را نیز برش می‌دهد. همچنین ساختارهایی برای آنژیوتانسین I (PDB ID 1n9u) و گیرنده متصل به آنژیوتانسین II (PDB ID 6os0) در بانک PDB در دسترس است.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/951

اینفوگرافی ساختار مولکولی ویروس ها
فایل با کیفیت این اینفوگرافی را در ادامه با فرمت pdf می توانید دانلود کنید.

ویروس‌ها به سلول‌ها حمله کرده و آن‌ها را وادار به تولید تعداد زیادی ویروس جدید می‌کنند که اغلب باعث مرگ سلول می‌شود. برخی ویروس‌ها بسیار ساده هستند، مانند کپسیدهای پروتئینی که یک رشته کوتاه RNA یا DNA را احاطه کرده‌اند. ویروس‌های پیچیده‌تر، ژنوم ویروسی را به داخل سلول تزریق می‌کنند که قادر به رمزگذاری پروتئین‌هایی برای مقابله با دفاع سلول است.

بیشتر ویروس‌ها بسیار کوچک‌تر از سلول‌ها هستند. ویروس‌هایی که در اینجا نشان داده شده‌اند، همگی در حدود 900,000 برابر بزرگنمایی رسم شده‌اند و اندازه آن‌ها از کمتر از ۳۰ نانومتر تا بیش از ۵۰۰ نانومتر در قطر متغیر است (۱ نانومتر = یک میلیاردم متر).

مروری بر تاریخچه و عملکرد سالیسیلیک اسید در گیاهان
تهیه و تدوین: تیم ادمین کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
انتشار این مطلب در کانال ها و مراجع علمی دیگر با ذکر نام کانال مجاز است.
قرن‌ها پیش، هم یونانیان باستان و هم بومیان آمریکا کشف کردند که پوست درخت بید و برخی گیاهان دیگر می‌توانند درد را کاهش دهند. با تحلیل این درمان‌های سنتی، دانشمندان در قرن نوزدهم مولکول فعال آن، اسید سالیسیلیک، را استخراج کرده و یک مولکول اصلاح‌شده با خواص دارویی بهتر، یعنی اسید استیل‌سالیسیلیک یا آسپیرین، توسعه دادند. در بدن ما، آسپیرین آنزیمی را که یکی از مولکول‌های سیگنال‌دهنده درد را می‌سازد، مسدود می‌کند. اما در گیاهان، اسید سالیسیلیک برای یک نوع سیگنال‌دهی کاملاً متفاوت استفاده می‌شود.
@irbioinformatics
گیاهان یک سیستم پیچیده و چندلایه برای محافظت از خود در برابر حمله باکتری‌ها و ویروس‌ها توسعه داده‌اند. وقتی یک برگ آلوده می‌شود، مثلاً توسط ویروس موزاییک تنباکو، سلول‌های محلی فداکاری نهایی را انجام می‌دهند و نوعی مرگ برنامه‌ریزی‌شده سلولی را تحریک می‌کنند. این کار به کنترل گسترش ویروس کمک می‌کند، با حذف پیشگیرانه تمام سلول‌های قابل آلودگی در اطراف. در عین حال، گیاه یک دفاع گسترده‌تر را آغاز می‌کند. آن یک سیگنال به تمام بخش‌های دوردست خود می‌فرستد و به آن‌ها می‌گوید که پروتئین‌های دفاعی بسازند و خود را برای حمله آماده کنند. این دفاع‌ها پرهزینه هستند و ممکن است باعث کاهش رشد گیاه شوند، اما این بهتر از آن است که کاملاً در برابر مهاجم شکست بخورند
@irbioinformatics
متیل سالیسیلات، استر متیلی اسید سالیسیلیک، یکی از سیگنال‌هایی است که در سراسر گیاه منتشر می‌شود و آن را برای حمله آماده می‌کند. متیل سالیسیلات مولکولی آشناست، زیرا طعم و بوی مشخص اسانس‌های گیاهانی مانند "وینترگرین" را فراهم می‌کند. این ماده به عنوان یک پیام‌رسان بی‌طرف عمل می‌کند که توسط سلول‌های تحت حمله ایجاد شده و به سلول‌های دیگر در سراسر گیاه ارسال می‌شود. سپس آنزیم SABP2 (پروتئین متصل‌شونده به اسید سالیسیلیک 2) متیل سالیسیلات را تجزیه کرده و گروه متیل آن را جدا می‌کند، و اسید سالیسیلیک فعال را آزاد می‌سازد. این اسید فعال سپس تولید پروتئین‌های دفاعی را در سلول‌های هدف تحریک می‌کند
@irbioinformatics
پروتئین SABP2 به‌طور اولیه بر اساس توانایی‌اش در اتصال به اسید سالیسیلیک کشف شد (به همین دلیل نام آن این‌گونه است)، اما ساختار اخیر این پروتئین که توسط محققان NESG حل شده است، نقش آن در تجزیه متیل سالیسیلات و مهار واکنش توسط محصول، یعنی اسید سالیسیلیک را فاش کرد. ساختار این پروتئین، که در ورودی PDB با شناسه 1y7i موجود است، نشان می‌دهد که SABP2 یکی از آنزیم‌های هیدرولاز آلفا/بتا است که استرهای کوچک و سایر مولکول‌ها را تجزیه می‌کند. محل فعال آن به‌طور کامل مولکول را احاطه کرده و هم حلقه آروماتیک مشخص و هم گروه اسیدی را شناسایی می‌کند. یک تریاد کاتالیزوری که به پروتئازهای سرین گوارشی شباهت دارد، واکنش تجزیه را انجام می‌دهد. بر اساس این ساختار، محققان آنالوگ‌هایی از اسید سالیسیلیک طراحی کرده‌اند تا روش‌های سیگنال‌دهی در سایر گیاهان را مورد بررسی قرار دهند

وبینار علمی در مورد سالیسیلیک اسید و پروتئین های متصل شونده به این ترکیب در گیاهان و اهمیت آن در سلامت انسان

لینک ورود به وبینار

کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی

معرفی سیستم عامل Rhino Linux
این سیستم عامل نسخه پایدار و جدیدی از توزیع اوبنتو لینوکس است که دارای رابط LTS پایدارتر در مقایسه با اوبنتو کلاسیک است و سادگی و سهولت کار با منوهای این سیستم عامل، آن را به انتخابی مناسب برای متخصصان علوم داده بخصوص بیوانفورماتیکدانان تبدیل کرده است. اجرای نرم افزارهای محاسباتی زیستی در این سیستم عامل به سهولت و با چند کلیک ساده انجام می شود و پیچیدگی های مسیردهی مانند انچه که در توزیع های دیگر لینوکس اتفاق می افتد در اینجا وجود ندارد. اگرچه این سیستم عامل به صورت گسترده در حال حاضر استفاده نمی شود ولی به دلیل فیچرهای خاصی که ارائه می دهد به انتخاب اول متخصصان توسعه نرم افزار و کدهای اجرایی در برخی از زمینه ها تبدیل شده است و پیش بینی می شود در سال های اینده یکی از توزیع های پرکاربرد لینوکس در حوزه انالیزهای زیستی باشد.
دانلود و مشاهده اطلاعات بیشتر
@irbioinformatics
آموزش نصب و اجرای نرم افزارها و مشخصات کلی این سیستم عامل لینوکسی

اهمیت روغن کاملینا در صنعت غذایی و مارکتینگ جهانی آن
امروزه تقاضای جهانی برای محصولات پایدار و زیست‌محور، باعث گسترش قابل توجهی در بازار روغن camelina sativa, شده است. روغن کملینا که به خاطر ویژگی‌های منحصر به فرد و مزایای زیست‌محیطی‌اش ارزشمند است، در چندین صنعت از جمله بیودیزل، مواد غذایی، لوازم آرایشی و دارویی به طور فزاینده‌ای محبوب شده است. امروزه روغن کملینا به یک منبع ارزشمند روغنی تبدیل شده است که این موضوع آن را به حوزه‌ای جذاب برای نوآوری و سرمایه‌گذاری تبدیل می‌کند، زیرا مصرف‌کنندگان و شرکت‌ها به دنبال جایگزین‌های دوستدار محیط زیست برای محصولات سنتی هستند. امار و ارقام کنونی نشان می دهد که روغن کاملینا دارای بازار جهانی بسیار خوبی است و در سال 2023 و 2024 بازار فروش جهانی این روغن به حداکثر رشد خود رسیده است و براوردها حاکی از این است همچنان به صورت فزاینده ای تقاضا برای این محصول زیست سازگار و سرشار از مواد مغذی در حال گسترش است. ادامه داستان را در اینجا بخوانید.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/966

ژنوم #کلروپلاست
@irbioinformatics
#ژنوم کلروپلاست یک مولکول DNA حلقوی است که در کلروپلاست‌های گیاهان و جلبک‌ها یافت می‌شود. این ژنوم شامل حدود 120 تا 170 ژن است که برای فتوسنتز و سنتز پروتئین‌ها ضروری هستند. امروزه ژنوم کلروپلاست به‌طور گسترده‌ای مورد مطالعه قرار گرفته تا تکامل گیاهان و جلبک‌ها و همچنین مکانیسم‌های فتوسنتز را درک کنیم. مقالات مروری و تحقیقاتی که درباره ژنوم کلروپلاست چاپ شده است یک مرور کلی و جامع از ساختار، عملکرد و تکامل آن ارائه می‌دهند که شامل آخرین تحقیقات و کشفیات است. این بررسی‌ها منابع ارزشمندی برای محققان و دانشجویان در زمینه‌های زیست‌شناسی گیاهی، ژنتیک و بیوتکنولوژی هستند. برای آشنایی بیشتر با ژنوم کلروپلاست می توانید این مقاله را مطالعه کنید
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/967