♨️♨️ ششمین وبینار از بزرگترین رویداد بیوانفورماتیکی ایران

🧬Gene Set Enrichment Analaysis and Functional Analysis of the Genes

👨‍🏫 با سخنرانی دکتر هادی نجفی: محقق ژنتیک مولکولی در دانشگاه اتاوا

🗓 امشب، ساعت 20:30

لینک رویداد:
https://evnd.co/vAZP3

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💡راهنمای ورود به وبینار

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🎧 کتاب صوتی ” ژن: تاریخ خودمانی”

📝 قسمت چهارم

ٖاصلاحیه: در این اپیزود به اشتباه گفته شده که اسیدهای آمینه واحدهای سازنده‌ی ژن‌ها هستند. درستش اینه که واحدهای سازنده‌ی DNA نوکلئوتید‌ها هستند.
🖋نویسنده: سيدارتا موکِرجی

پنجشنبه‌ها: #کتاب_صوتی

#ژن

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام:
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💠منبع: کانال بی پلاس کم حجم

@bpluscast 💫

😜 خیالت راحته ک تو این همه‌گیری هم باز فقط خودتی و لپ‌تاپت

#طنز

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📎جنبه های مثبت اختلال بیش فعالی با کمبود توجه یا Attention Deficit Hyperactivity Disorder (ADHD): یک بررسی کیفی از بزرگسالان موفق مبتلا ADHD

✏️ ویژگی های رفتاری ADHD یک اختلال سلامت روان است که می تواند باعث رفتارهای بیش فعال و تکانشی بیش از حد طبیعی شود و به صورت دودویی (به عنوان مثال طبیعی در مقابل غیر طبیعی) وجود ندارد. درعوض آنها در یک طیف یا پیوستار وجود دارند. این بدان معنی است که برخی از جنبه های ADHD می توانند سازگار و یا مفید واقع شوند تا اینکه بخواهند موجب مشکلات برای زندگی فردی افراد گردند. حتی برخی از بزرگسالان ممکن است دارای نقاط قوت یا ویژگی های خاصی باشند که باعث کمبود یا اختلالات مرتبط با ADHD می شود. برای روشن شدن این مشاهدات، تحقیقات بیشتری لازم است. برای بررسی و توصیف جنبه های مثبت ADHD از تعدادی ازمبتلایان به ADHD برای جمع آوری داده ها استفاده شد و در یک رویکرد پدیدارشناختی و مصاحبه هایی با موضوع دلخواه، داده ها جمع آوری گردید. مصاحبه ها به صورت صوتی ضبط شد و کلمه به کلمه رونویسی و با استفاده از تحلیل محتوای موضوعی، مورد تجزیه و تحلیل قرارگرفت.

ادامه مطلب

تعداد کلمات: 600 کلمه
⏰زمان مطالعه:5 دقیقه

📝 تهیه و تنظیم:#پرهام_حاجی_شفیع
دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها : #مقاله_علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://link.springer.com/article/10.1007/s12402-018-0277-6

آنالیز شبکه ‏های زیستی:
رویکرد‏ها، تئوری گراف و الگوریتم ها


دانلود کتاب

یکشنبه‌ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🧗‍♀راز سلول‌های عضلانی

📚فیبر عضلانی فقط از یک سلول تشکیل شده‌است، اما تعداد زیادی هسته دارد. یک تیم تحقیقاتی به سرپرستی پروفسور کارمن بیرچمایر نشان داده‌است که این هسته‌ها تا چه اندازه متنوع هستند. این مطالعه که در Nature Communications منتشر شده‌است، می‌تواند به درک بهتر بیماری‌های عضلانی مانند دیستروفی عضلانی دوشن کمک کند.

🔬معمولاً هر سلول دقیقاً یک هسته دارد. اما سلول‌های عضلات اسکلتی متفاوت است؛ این سلول‌های بلند یک سیتوپلاسم نسبتاً بزرگ دارند که حاوی صدها هسته است. تاکنون اطلاعات محققان در مورد میزان تفاوت هسته‌های یک فیبر عضلانی از نظر فعالیت ژنی و تاثیر آن‌ها بر عملکرد عضله بسیار کم بوده‌است. این تیم تحقیقاتی پرده از برخی اسرار هسته‌های سلول‌ عضلانی برداشته‌است. آن‌ها بیان ژن هسته‌های سلول‌ عضلانی را با استفاده از یک تکنیک کاملاً جدید به نام توالی یابی RNA تک-هسته‌ای بررسی کردند و در این روند با یک نوع فعالیت ژنتیکی غیرمنتظره مواجه شدند.

💻در این تیم افرادی کارهای تجربی انجام دادند و داده‌های این آزمایشات توسط تجزیه و تحیل بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. به گفته‌ی نویسندگان این مقاله، تنها به لطف همکاری نزدیک بین تیم‌های مبتنی بر آزمایشگاه و مبتنی بر تئوری بود که توانستند به نتایج قابل قبولی برسند. تکنیک‌های جدید در زیست‌شناسی مولکولی مانند توالی یابی، مقادیر زیادی داده ایجاد می‌کند، در نتیجه ضروری است آزمایشگاه‌های محاسباتی از همان ابتدا بخشی از فرآیند باشند؛ زیرا تجزیه و تحلیل داده‌ها به اندازه تولید داده مهم است.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۸۳۹
⏰زمان مطالعه: حدود ۴ دقیقه

📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعی‌پور
دانشجوی کارشناسی‌ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه‌ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
Sciencedaily
📌لینک مقاله:
Nature

برای کسب اطلاعات بیشتر به سایت کدکول مراجعه فرمایید.


سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_تحصیلی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

♨️ سلسله لایوهای آشنایی با بیوانفورماتیک: بیوانفورماتیک ساختاری

💎اولین لایو بیوانفورماتیکی ایران

💡 با حضور بهترین‌های بیوانفورماتیک

❓سوال‌هاتون رو به @Codecool5 بفرستید.

⏱ پنجشنبه شب منتظرتون هستیم

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🔬فناوری آزمایشگاه روی چیپ امکان تشخیص سریع و آسان پاتوژن‌ها در منزل را فراهم می‌کند

🔎 غربالگری سریع و تشخیص کم هزینه نقش مهمی را در انتخاب زمان مناسب برای مداخله درمانی در مقابله با پاتوژن‌های با قابلیت بیماری‌زایی بالا ایفا می‌کند و این موضوع زمانی که عامل بیماری‌زا، مانند ویروس کرونای جدید SARS-CoV-2، درمان موثری نداشته باشد یا علائم مشخصی نشان ندهد، اهمیت بیشتری پیدا می‌کند.

🧬 در این پژوهش یک مبدل سیلیکونی یکبار مصرف با قابلیت کمی‌سازیِ در لحظه‌، برای تشخیص توالی نوکلئیک اسید اختصاصی عامل بیماری‌زا معرفی شده است.

◽️ این چیپ که TriSilix نام دارد، در ابعاد بسیار کوچک (10×10×0.65میلی‌متر) در زمان بسیار اندک (7 ساعت برای 37 چیپ) و با هزینه‌ی پایین قابل ساخت است.

🦠 از این چیپ، در تشخیص cDNA ویروس SARS-CoV-2 از SARS-CoV(2003) نیز دقت بالایی داشته است.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: 796
⏰زمان مطالعه: 4 دقیقه

📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع :
Nature

🎧 کتاب صوتی ” ژن: تاریخ خودمانی”

📝 قسمت پنجم

🖋نویسنده: سيدارتا موکِرجی

پنجشنبه‌ها: #کتاب_صوتی

#ژن

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام:
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💠منبع: کانال بی پلاس کم حجم

@bpluscast 💫

وقتی تا نیم ساعت پیش کدت کار میکرده ولی جلو استاد ارور میده😂😂

#طنز

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💉🤞تزریق امید
 
هنگامی که در ماه مارس موارد ابتلا به COVID-19 در ایالات متحده به میزان نگران‌کننده‌ای رسید، به مادر 90 ساله خود گفتم که باید در خانه خود پناه بگیرد. او به تنهایی در لس‌آنجلس زندگی می‌کند، و برای همراهی با او هر شب با او face time می‌کردم. در وارونگی نقش‌ها که با گذشت زمان رخ می‌دهد، من به والدین همیشه نگرانِ نق‌زن تبدیل شدم و او به یک کودکِ همیشه مردد و بدگمان.


با وجود اعتراض‌های فزاینده من، او با خواهرش به بازار رفت، برای ناخن‌هایش به آرایشگاه رفت، و با دوستانش mahjong بازی کرد. دنیایی که او می‌شناخت در حال مرگ بود، و بعد از چند هفته انکار، چانه‌زنی و عصبانیت، سرانجام وارد مراحل افسردگی و پذیرش قرنطینه خود شد.


تنهایی، ترس و بی‌حوصلگی مادرم این احساس را به من القا می‌کرد که گفتگوهایمان ملاقات در زندان، پای تلفن و پشت دیوارهای شیشه‌ای است. او می‌گوید امروز "بازهم" خانه را ترک نکرده است و همه چیز یکسان و بدون تغییر است. و او باشکوه این سؤال تکراری را دوباره مطرح می‌کند که
کی همه چی تموم می‌شه؟


ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۱۵۹۲
⏰زمان مطالعه: ۸ دقیقه


📝 تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


شنبه‌ها: #علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
Sciencemag

جعبه سیاه زیست شناسی: تاریخ انقلاب مولکولی

دانلود کتاب

📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان
دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه‌ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

⚡️ظهور همزمان هموکایرالیته‌ی زیستی و حیات

منشأ حیات یکی از مهم‌ترین پرسش‌هایی است که نه تنها ذهن دانشمندان بلکه ذهن بسیاری از عموم جامعه را نیز درگیر خود کرده است. پس از نظریه انقلابی داروین، بسیاری از زیست شناسان در صدد توجیه بسیاری از پدیده‌های زیستی با استفاده از نظریه وی برآمدند. اما یکی از سوالات اساسی که هنوز پاسخ روشنی به آن داده نشده، این است که حیات چگونه آغاز شد!؟ آیا از ابتدا ترکیبات اتم‌های ساده مانند هیدروژن و نیتروژن می‌توانست منجر به تشکیل مولکول‌های پیچیده‌ای چون DNA و پروتئین‌ها شود!؟

فرضیه‌های مختلفی راجع‌به چگونگی آغاز حیات بر روی کره‌ی زمین وجود دارد. معتبرترین نظریه‌ای که تا کنون برای توضیح آغاز حیات ارائه شده نظریه‌ی دنیای RNA (RNA World) است. طبق این نظریه، RNA ها مولکول‌هایی هستند که علاوه بر قابلیت انتقال اطلاعات، فعالیت آنزیمی هم دارند. وجود این دو ویژگی در کنارهم، آن‌ها را تبدیل به مولکول‌هایی استثنائی کرده که می‌توانند در مراحل اولیه حیات علاوه بر تکثیر خود(Self-replication) فعالیت آنزیمی نیز داشته باشند. چنین RNA هایی با عنوان Ribozyme ها شناخته می‌شوند.

بسیاری از مطالعات سعی در بازسازی سیستم‌های اولیه حیات برمبنای نظریه‌ی ذکرشده داشته‌اند که بسیاری از آن‌ها موفقیت‌آمیز نیزبوده‌اند. برخلاف چنین تحقیقاتی که غالبا در محیط آزمایشگاهی صورت گرفته‌اند، این مقاله سعی در بررسی موضوع کایرالیته‌ی ‌پلیمر‌های اولیه سیستم‌های شبه-زنده با استفاده از شبیه سازی مولکولی دارد.

ادامه‌ی مطلب ...

📝تعداد کلمات:338
⏰زمان مطالعه: کمتر از دو دقیقه

📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:

PLOS

برای کسب اطلاعات بیشتر به سایت کدکول مراجعه فرمایید.

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_تحصیلی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐Https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📎توسعه استراتژی ژنومیک برای دنبال کردن ویروس‌های کرونا

✏️ تیمی از محققان در حال استفاده از یک فناوری تعیین توالی ژنوم هستند که سریع است و می‌تواند به شناسایی منبع نمونه‌های کرونایی کمک کند.
محققان موسسه تحقیقات پزشکی گاروان و موسسه کربی در UNSW سیدنی به لطف فناوری روش تعیین توالی ژن پیشرفته nanopore، سریعترین استراتژی تعیین توالی ژن را برای ویروس کرونا، در استرالیا ایجاد کرده‌اند. پیشرفت فناوری، این امکان را دارد که سرنخ‌های مهم و به موقع را، برای چگونگی ارتباط موارد عفونت SARS-CoV-2 شناسایی کند.
محققان امروز یک رهنمود اعتبارسنجی و بهترین روش برای تعیین توالی SARS-CoV-2 را در nature منتشر کردند، که امیدوارند بتوانند باعث جذب بیشتر فن‌آوری در زمینه توالی‌یابی سریع، برای اقدامات بهداشتی در استرالیا و خارج از کشور شود.
هر بار که ویروس SARS-CoV-2 از شخصی به فرد دیگر منتقل شود، ممکن است خطاهای همانندسازی، ایجاد کند که باعث تغییر در برخی از 30 هزار نوکلوتید ژنتیکی آن شود. با شناسایی این تغییرات ژنتیکی، می‌توان ارتباط بین انواع مختلف ویروس‌های کرونا را شناسایی کرد. این مسئله می‌تواند به شناسایی اینکه یک نمونه مبتلا به کرونا، از کجا مبتلا شده است و چه کسی یا کسانی را ممکن است مبتلا کرده باشد، کمک کند.
هر بار که SARS-CoV-2از یک شخص به شخص دیگر منتقل می‌شود، ممکن است که در هنگام همانندسازی هر یک از 30000 حرف ژنتیکی خود دچار خطا شود. با شناسایی تغییرات ژنتیکی، ما می‌توانیم متوجه شویم که کدام یک از نمونه‌های کرونا به هم ارتباط دارند، همچنین این تغییرات نشان می‌دهد که نمونه یک فرد از کجا آمده است و ممکن است به چه اشخاصی منتقل شده باشد.
پروفسور Bull می‌گوید، تست‌های ژنتیکی برای دنبال کردن رد انتقال ویروس در مواردی که تنها تماس‌های اپیدمیولوژیک بررسی شده‌ی ناشناخته وجود دارد، بسیار حیاتی است. با ایجاد تاریخچه تکاملی ویروس یا درخت خانوادگی آنها، می‌توانیم رفتارهایی که منجر به شیوع ویروس می‌شود را شناسایی کنیم و به این وسیله شیوع‌های بسیار گسترده را مورد بررسی و تحلیل قرار دهیم.
زمانی که یک نمونه ویروس کرونا ناشناخته، شناسایی می‌شود، هر دقیقه حائز اهمیت است. در گاروان، ما از توانایی های توالی یابی سریع ژن توسعه داده شده، برای توالی یابی یک کرونا ویروس استفاده کردیم و این کار تنها در چند ساعت (کمتر از 4 ساعت) انجام شد.
تعیین دقیق روش انتقال SARS-CoV-2 بسیار مهم است NSW Health Pathology با موسسه گاروان و موسسه کربی برای توسعه سریعتر توالی یابی ژن SARS-CoV-2 همکاری کردند تا قابلیت‌های توالی یابی را افزایش دهند و از آن به منظور ردیابی سریعتر افرادی که در تماس با covid بودند استفاده کردند، تا در نهایت بتوانند در کمترین زمان ممکن عملیات قرنطینه و ردیابی بیماران را انجام دهند.
روش‌های توالی‌یابی استاندارد در حال حاضر، قادرند که خوانش‌های ژنتیکی کوتاه را فقط با 100-150 حرف ژنتیکی درواحد زمان بخوانند، در حالی که فن آوری‌های Nanopore محدودیتی برای طول قطعات DNA ندارند و می‌توانند با سرعت بیشتری توالی کامل یک ژنوم ویروسی را تعیین کنند. دکتر Deveson می‌گوید: "با این حال، مانند بسیاری از فن آوری‌های نوظهور، نگرانی‌هایی در مورد صحت تعیین توالی nanopore وجود دارد" ما در مقاله خود به این نگرانی‌ها پرداختیم و نکات حائز اهمیت را به صور مفصل بیان کرده‌ایم.
تجزیه و تحلیل‌ها نشان می‌دهد که روش تعیین توالی nanopore بسیار دقیق است. این روش در 157 بیمار کرونا مثبت مختلف، دارای حساسیت و دقت 99% بوده است.

ادامه مطلب

📝تعداد کلمات: 542
⏰زمان مطالعه: 3 تا 4 دقیقه

📝 تهیه و تنظیم:#کریم_رحیمیان
دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه : #اخبار فناوری

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
📌منابع:
Sciencedaily

♨️هفتمین سخنرانی آنلاین مباحث نوین در بیوانفورماتیک

🧬An integrative analysis of single cell data to identify recurrent microglia cell states

👨‍🏫 با سخنرانی دکتر وحید حاج‌حسینی گزستانی: زیست شناس محاسباتی در موسسه Broad اِم‌آی‌تی و هاروارد

🗓 پنج‌شنبه 4 دی، ساعت 16:30

🔗شرکت در رویداد

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💡راهنمای ورود به وبینار

✅ کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🎧 کتاب صوتی ” ذهن‌های دیگر”

📝 قسمت اول

🖋نویسنده: Peter Godfrey-Smith

پنجشنبه‌ها: #کتاب_صوتی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام:
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💠منبع: کانال بی پلاس کم حجم

@bpluscast 💫