Neural signatures of cell assembly organization


What is a cell assembly?
What are the signatures of cell assembly organization in neural networks?
How can we study cell assemblies in the brain?
How is cell assembly hypothesis separate from temporal coding?

Is cell assembly internally-organized or stimulus-controlled?

#neurosyntax

Neural signatures of cell assembly organization


What is a cell assembly?
What are the signatures of cell assembly organization in neural networks?
How can we study cell assemblies in the brain?
How is cell assembly hypothesis separate from temporal coding?

Is cell assembly internally-organized or stimulus-controlled?

Levels of analysis in systems neuroscience

در این ارائه، کوشش کردم تا برخی از سطوح آنالیزی در علوم اعصاب سیستمی را بشناسانم. مواردی که به آن اشاره کردم:

Single neuron analysis (e.g. peri-stimulus (event) time histogram, spike density);

Identification of functional cell types from extracellular activity

Pairwise cell analysis (e,g. cofiring, cross-correlogram)

Population analysis: spectrolaminar analysis, dynamic interareal interaction, spike-LFP coherence,

Spike population analysis (e.g. synchronous activity, population burst events, cell assemblies)

هدف از ارائه آشنایی با این مفاهیم بوده است و نه انتقال دانش عملی و از این رو برای کسانی که علاقه مند به آشنایی با این آنالیزها هستند مفید خواهد بود.

#neurosyntax

اسلاید ها

Levels of analysis in systems neuroscience

در این ارائه، کوشش کردم تا برخی از سطوح آنالیزی در علوم اعصاب سیستمی را بشناسانم. مواردی که به آن اشاره کردم:

Single neuron analysis (e.g. peri-stimulus (event) time histogram, spike density);

Identification of functional cell types from extracellular activity

Pairwise cell analysis (e,g. cofiring, cross-correlogram)

Population analysis: spectrolaminar analysis, dynamic interareal interaction, spike-LFP coherence,

Spike population analysis (e.g. synchronous activity, population burst events, cell assemblies)

هدف از ارائه آشنایی با این مفاهیم بوده است و نه انتقال دانش عملی و از این رو برای کسانی که علاقه مند به آشنایی با این آنالیزها هستند مفید خواهد بود.

#neurosyntax

مقاله:
Diversity of information pathways drives sparsity in real-world networks

صفحه شخصی آرشام:
https://www.instagram.com/arsham_ghavasieh/?hl=en

در این جلسه به تعریف ویژگی های سیستم و انواع آن پرداختیم و به صورت ویژه بر روی سیستم های پیچیده تمرکز کردیم.

What is a system?
Interaction
How can we Categorize Systems?
Simple Systems
Complex Systems
The organization of complex systems
Nearly Decomposable Systems
The evolution of complex systems
Disorder and Robust order


از مجموعه جلسات دوره
Complexity, dynamics, and control in biological systems

ارائه دهنده: سامان عباس پور

مقالات کلیدی:

What is a complex system? Ladyman et al., 2013

The Architecture of Complexity, Herbert A. Simon

What is a complex system?

#ComplexityDynamicsControl

پیشگفتاری بر سیستم های کنترلی و معماری آنها

Feedback Control
Feedforward Control

ارائه دهنده: Parastoo Sodeifi

از مجموعه جلسات دوره
Complexity, dynamics, and control in biological systems


ارائه های مرتبط:
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax/1132

(* برای صدای خودم طی جلسه پوزش میخوام. بیمار بودم و گلوم گرفته بود.)

#ComplexityDynamicsControl
#neurosyntax

پیشگفتاری بر دوره سیستم های دینامیکی و معادلات دیفرانسیل

What are differential equations and how do we use them to study dynamical systems?

What are dynamical systems?

Concepts: Derivative, Phase Space, Stability, Bifurcation, Model Discovery

ارائه دهنده: سامان عباسپور

از مجموعه جلسات دوره
Complexity, dynamics, and control in biological systems

#neurosyntax
#ComplexityDynamicsControl

جلسه دوم معادلات دیفرانسیل و سیستم های دینامیکی

Relationships and functions

Power Series

Representation of functions by Power Series

Derivatives

Differential Equations and their classification

Solving first- and second-order linear ordinary homogeneous differential equations

Deriving Euler's formula from Power Series

#CODAC
COmplex Dynamics And Control

#ComplexityDynamicsControl

#neurosyntax

Relationships and functions

Power Series

Representation of functions by Power Series

Derivatives

Differential Equations and their classification

Solving first- and second-order linear ordinary homogeneous differential equations

Deriving Euler's formula from Power Series

#CODAC
COmplex Dynamics And Control

#neurosyntax

حدود یک سال پیش ما مجموعه جلسات فلسفه علوم اعصاب رو داشتیم که درباره بدنه فکری علوم اعصاب بحث میکردیم و در کنار به محتوای بنیادی تری از فلسفه هم پرداختیم. هر چند ماه هاست از جلسات میگذره ولی من هر از گاهی به این ویدیوها ارجاع میدم. این ویدیو رو فکر نمیکنم پیشتر در کانال گذاشته باشم.

در این جلسه درباره انواع تئوری هایی که برای حقیقت (Truth) وجود داره صحبت کردیم و به صورت کلی دو نوع تفکر رو نسبت به این واژه و معناش بررسی کردیم:

The Corresponding Theory of Truth
The Pragmatic Theory of Truth

تئوری دیگری هم وجود داره بنام The Coherence Theory of Theories که فکر میکنم در جلسه کمتر بررسی شد ولی میتونید جستجو کنید و مطالعه کنید.

از مجموعه جلسات فلسفه علوم اعصاب
ارائه دهنده: سامان عباسپور

#neurosyntax
#philosophy
#neurosyntax

محتوای تمام جلسات ضبط و در تاپیک Recording کانال فلسفه علوم اعصاب قرار گرفته:

https://news.1rj.ru/str/+Mqjp2e5OgMJmMmY0

جلسه سوم معادلات دیفرانسیل و سامانه های پویا

* How to solve Nth-order linear ODEs
* A primer to linear algebra
— Matrix, Vector, Matrix Operations, Determinant, Matrix system of equations
* Matrix exponential
* Eigendecomposition


#CODAC
COmplex Dynamics And Control

#neurosyntax

#ComplexityDynamicsControl

جلسه سوم معادلات دیفرانسیل و سامانه های پویا

* How to solve Nth-order linear ODEs
* A primer to linear algebra
— Matrix, Vector, Matrix Operations, Determinant, Matrix system of equations
* Matrix exponential
* Eigendecomposition


#CODAC
COmplex Dynamics And Control

#ComplexityDynamicsControl #neurosyntax

جلسه چهارم معادلات دیفرانسیل و سامانه های پویا

Geometric Interpretation (the qualitative theory of) of Dynamical Systems
Phase Portrait
Terminology: Fixed point, Steady State, Equilibrium
Terminology: Nullcline
Fixed points and stability
Linear Stability Analysis
Terminology: Vector fields - Trajectories
A quick guide to sketching phase planes and qualitative Analysis
Classification of Phase Portraits

#CODAC
COmplex Dynamics And Control

#neurosyntax

#ComplexityDynamicsControl

جلسه چهارم معادلات دیفرانسیل و سامانه های پویا

Geometric Interpretation (the qualitative theory of) of Dynamical Systems
Phase Portrait
Terminology: Fixed point, Steady State, Equilibrium
Terminology: Nullcline
Fixed points and stability
Linear Stability Analysis
Terminology: Vector fields - Trajectories
A quick guide to sketching phase planes and qualitative Analysis
Classification of Phase Portraits

#CODAC
COmplex Dynamics And Control

#neurosyntax

#ComplexityDynamicsControl

درود، میخوام یک بازی فکری-پژوهشی در کانال راه اندازی کنم. فکر کنید که تعدادی آدم فضایی با امکانات مهندسی بالایی به زمین آمدن و از جمعیت پژوهشگران علوم اعصاب میخوان که بهشون 10 گزاره بنیادی درباره ساختار-عملکرد-دینامیک سیستم عصبی/بدن ارائه بدن تا این آدم فضایی ها بتونن چیزی مشابه سیستم های عصبی ارگانیک بسازن. بیش از 10 گزاره نمیشه به اینها داد.

امروز داشتم قدم میزدم و به این پرسش فکر میکردم که چه 10 گزاره ای به اینها خواهم داد و هنوز درباره انتخاب هام مطمئن نیستم. اما ایده ای که به ذهنم رسید این بود که گزاره هایی که اگر برقرار بشن بتونن تعداد بیشتری اصول دیگر رو درباره مغز پدیدار بیارن احتمالا مقدم هستند بر گزاره های سطح بالایی که این قدرت رو ندارن. برای مثال به دو گزاره پایین فکر کنید:

Neural circuits oscillate in different ranges of frequencies.

من میتونم این گزاره رو بدم ولی خب گزاره دیگری وجود داره که اگر بدم این سطح رو هم در بر میگیره در کنار اطلاعات دیگری که میده. این گزاره است:

In the nervous system, inhibitory and excitatory neurons have domain-specific (compartmentalized) synaptic connectivity.

از نظر من برای این هدفی که داریم، گزاره دوم بر گزاره نخست مقدم هست. چون اگر نورون های مهاری-تهییجی مختلف رو به شکل های مختلف به هم وصل کنیم نوسانات ازش به صورت ویژگی ای پدیداری بروز میکنه.


حالا بازی این هست که این گزاره ها رو پیشنهاد کنیم و در طول زمان به گزاره های بنیادی تری برسیم که گستره بیشتری از ویژگی های سیستم عصبی رو در خودشون قرار میدن. به صورتی که اگر سیستم با این ده ویژگی بسازیم بسیاری از ویژگی های دیگر مغز ازش بروز کنه. حالا من چندین گزاره مینویسم. این گزاره ها اولویت بندی نیستن و به عنوان پایه ای هستن که تغییر کنن. میتونید گزاره های خودتون رو پیشنهاد کنید و یا گزاره های جایگزین دربرگیرنده بهتری ارائه بدید.

هر هفته بر مبنای پاسخ هایی که ارائه بدید من این گزاره ها رو بروزرسانی میکنم.

1 - The brain operates as a modular network.

2 - The nervous system is composed of a variety of cell types such as different types of neurons and glia, each characterized by unique genetic and molecular identities.

3 - There are two broad categories of neurons, inhibitory and excitatory, which have unique domain-specific (compartmentalized) synaptic connections with each other in different circuits.

4 - Neurons have broadly two modes of activity, a continuous subthreshold voltage fluctuation, and a discrete spiking activity.

5 - Neurons exhibit various patterns of spiking activity, such as bursting and regular spiking, constrained by their refractory periods.

6 - The synaptic connectivity profile between neurons can change (synaptic plasticity) leading to the strengthening or weakening of the direct interaction

7 - To maintain stability, the nervous system regulates synaptic plasticity through homeostatic mechanisms.

8 - Brain activity is predominantly self-organized, driven by the system's intrinsic biophysical properties to spontaneously generate activity, though it can also be influenced by external stimuli.

9 -The brain functions as a control system organized in both hierarchical and heterarchical manners, featuring extensive feedback loops.

10 - The brain is embedded and embodied (brain functionality is integrated with bodily dynamics, demonstrating coordination between neural and physical actions.)


با این هشتگ میتونید پست های بروزرسانی شده رو دنبال کنید.

#NeuralPrinciples #Part1