ویدیو مقاله
The neurobiological foundation of memory retrieval

بررسی تئوری Tulving در مورد Availability و Accessibility حافظه
بررسی مکانیزم های نوروبیولوژیک توضیح دهنده این پدیده
سوالاتی که مورد بررسی قرار میگیرند در این ارائه/مقاله:

🟡 Is it possible to prevent ecphory in the presence of external sensory retrieval cues?

🟡 Is it possible to induce memory expression in the absence of sensory retrieval cues via direct stimulation of a tagged engram?

🟡 Is it possible to create an engram by artificial means and then probe ecphory using natural cues?

ارائه دهنده: زهرا برداغی - دانشجوی کارشناسی ارشد فیزیولوژی پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد

بانظارت سامان عباس‌پور (دانشجوی دکتری علوم اعصاب سیستمی دانشگاه وندربیلت آمریکا)

#Video #Advanced_Neuroscience

درود بر اعضای محترم کانال

در صورتی که انتقاد و یا پیشنهادی برای آکادمی نوروسینتکس دارید، میتوانید با استفاده از بات زیر آنرا با ما به اشتراک بگذارید.

توضیحاتی اجمالی درباره رسالت آکادمی و بیوگرافی افراد حاضر در گروه که محتوا را تولید میکنند به زودی در کانال قرار خواهد گرفت.

@neurosyntax_bot

جلسه دوم آمار - توزیع نرمال: یک رویکرد تاریخی

از نظر من برای درک مسائل باید رویه تاریخی اونها رو دنبال کنیم. برای من این کار بسیار شیرین هست. به همین دلیل در این جلسه مبانی آمار به سراغ یکی از مفاهیم گسترده در آمار و احتمال رفتم بنام خانواده توزیع های نرمال و سعی کردم با یک دید تاریخی شما رو با چگونگی رسیدن به فرمولاسیون این توزیع همراه کنم. از بازی شانس صحبت میکنم و توزیع برنولی و باینومیال، و بعد از گذر از بسط دو جمله ای به سراغ کارهای آبراهام دِ مویر، لاپلاس و گاوس میرم و درباره تلاش های اونها صحبت میکنم.

در ادامه درباره برخی از خواص توزیع های احتمالی به صورت مختصر صحبت میکنم و به سمت ارائه مفاهیم Kurtosis و Skewness میرم.

امیدوارم از این جلسه لذت ببرید.

سامان عباس‌پور - دانشجوی دکتری علوم اعصاب دانشگاه وندربیلت آمریکا

#Statistics #Video

جلسه نخست مکانیزم های نورونی تصمیم گیری

🔸 Signal Detection Theory and Binary Classification Problem

🔸 Signal Detection Theory and Decision Making

🔸 Perceptual Discrimination Tasks and Theory of Decision Making

🔸 Evidence Accumulation Model of Decision Making

مطالب این جلسه در حوزه مکانیزم های نورونی تصمیم گیری برگرفته از کتاب مبانی علوم اعصاب اریک کندل می باشد.

ارائه دهنده: سامان عباس‌پور - دانشجوی دکتری علوم اعصاب سیستمی دانشگاه وندربیلت آمریکا

#Video #Decision #Advanced_Neuroscience

جلسات آکادمی به صورت هفتگی و روز جمعه برگزار میشوند و ویدیو جلسه یک روز بعد در کانال قرار میگیرد.

ارائه مقاله
The neural basis of decision making

در این ارائه ابتدا مدل ریاضیاتی تصمیم گیری بر مبنای فرمی از آمار تحلیلی ارائه میشود و پارامترها و متغیر های این مدل توضیح داده میشود. سپس این مدل در چارچوب Signal Detection Theory و Sequential Analysis بررسی می شود. در بخش دوم ارائه، سعی می شود آزمون های رفتاری مختلفی که بر روی نخستیان غیرانسانی برای مطالعه مکانیزم های تصمیم گیری انجام شده است ارائه شود و متغیر های مختلف مدل ریاضیاتی در پرتو فعالیت عصبی مورد بررسی قرار گیرد.

A model of Decision Making as a form of statistical inference,
Signal Detection Theory and Sequential Analysis,
Vibrotactile frequency discrimination task,
Heading direction task,
Disparity Discrimination Task,
Face/Object Discrimination Task,
Detection Task,
A simple mathematical model of reaction times in go tasks

ارائه دهندگان:
سامان عباس‌پور - دانشجوی دکتری علوم اعصاب سیستمی دانشگاه وندربیلت آمریکا
رویا محمدصادق - دانشجوی کارشناسی ارشد علوم شناختی گرایش روان‌شناسی شناختی دانشگاه تربیت مدرس

#Advanced_Neuroscience #Video

#DataBlitz #Advanced #Video

با تصمیم گیری های جدیدی که صورت گرفت، ساختار جلسات آکادمی رو تغییر دادیم. طی چندین جلسه آینده جلسات به صورت Data Blitz ارائه میشود. در این حالت هر ارائه دهنده زمان محدودی در اختیار دارد تا محتوای مدنظر خود را ارائه دهد. این زمان 15 دقیقه در نظر گرفته شده است. در Data Blitz این هفته مقالات زیر ارائه شدند:


1.Dendritic plasticity of CA1 pyramidal neurons after transient global ischemia
ارائه دهنده: غزل طیرانیان - دانشجوی کارشناسی بیوتکنولوژی دانشگاه آزاد مشهد

2.Tolerance to ambiguous uncertainty predicts prosocial behavior
ارائه دهنده: رویا محمدصادق - دانشجوی کارشناسی ارشد علوم شناختی گرایش روان‌شناسی شناختی دانشگاه تربیت مدرس

3.Vision Substitution by Tactile Image Projection
ارائه دهنده: سارا فرودی - دانشجوی کارشناسی زیست‌شناسی سلولی و مولکولی دانشگاه فردوسی مشهد

4.Systemic infections and inflammation affect chronic neurodegeneration
ارائه دهنده: زهرا برداغی - دانشجوی کارشناسی ارشد فیزیولوژی پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد

5.Attention as an effect not a cause
ارائه دهنده: زینب حقیان - کارشناسی روان‌شناسی دانشگاه شهید بهشتی

6.The cognitive neuroscience of remote episodic, semantic and spatial memory
ارائه دهنده: نورا عربشاهی - کارشناسی زیست‌شناسی سلولی و مولکولی دانشگاه فردوسی مشهد

7.Brain neural patterns and the memory function of sleep
ارائه دهنده: سامان عباس‌پور - دانشجوی دکتری علوم اعصاب سیستمی دانشگاه وندربیلت آمریکا

افرادی که علاقه مند هستن در آکادمی Data Blitz
(ارائه های کوتاه 15 دقیقه ای) بدن میتونن عنوان و لینک مقاله موردنظر خودشون رو برای آیدی زیر ارسال کنن. سعی کنید مقالاتی که انتخاب میکنید یک نگاه کلی به افراد غیر متخصص بده. موضوعاتی که انتخاب میکنید باید در سطح نورونی و/یا سطح رفتاری ارگانیسم ها باشه.

** پذیرش ارائه شده به معنای حضور دائمی در گروه نخواهد بود. در صورتی که عملکرد شما در ارائه مورد قبول باشد و علاقه مند باشید میتوانید برای حضور در آکادمی اقدام کنید.

این جمعه جلسه دیتابلیز برگزار خواهد شد. شما میتوانید برای این هفته و یا هفته های آینده برنامه ریزی کنید.

@neurosyntax_bot

علاقه مند هستم یک سری جلسات صمیمانه و غیررسمی برای آموزش تحلیل داده های الکتروفیزیولوژی خارج سلولی (Spike و LFP) برگزار کنم. جلسات رایگان خواهد بود. محتوای جلسات تخصصی هستن و عملکردی با استفاده از برنامه نویسی متلب. البته با توجه به اینکه تئوری ها رو هم پوشش خواهم داد و بحث خواهم کرد شاید برای افرادی که حتی میخوان تئوری رو بفهمن خوب باشه. بخش LFP برای افرادی که با EEG کار میکنن هم مناسب خواهد بود.

جلسات در این دوره ضبط نخواهد شد و به اشتراک گذاشته نخواهد شد. شاید مجدد زمانی که مطالب رو سازمان بندی کنم و مرتب و منظم کنم ضبط کنم و بذارم. اگر در این حوزه کار میکنید و یا علاقه مند هستید برای مقاطع بالاتر کار کنید لطفا در نظرسنجی پایین شرکت کنید. برای شرکت در کارگاه نیاز به ارسال رزومه و یا انگیزه نامه خواهد بود. پس لطفا اگر پیش زمینه ای در این حوزه ندارید و علاقه ای هم ندارید شرکت نکنید. ( یک عده کلا دوست دارن همه جا باشن. لطفا اگر جزو این عده هستید در نظرسنجی شرکت نکنید.)

سامان عباس‌پور - دانشجوی دکتری علوم اعصاب سیستمی دانشگاه وندربیلت آمریکا

افرادی که علاقه مند هستن لطفا به آیدی پایین رزومه و یا انگیزه نامه ارسال کنن. اولویت با افرادی هست که در حال کار با چنین داده ای هستن و میخوان بیشتر بیاموزن. در صورتی که در این گروه قرار دارید لطفا در رزومه خودتون حتما ذکر کنید. این دسته شامل افرادی میشن که دارن از انسان EEG ثبت میکنن، و یا در مدل های جانوری مثل جوندگان و یا پریمات های غیرانسانی مشغول ثبت خارج سلولی هستن و یا به چنین داده ای دسترسی دارن و پروژه ای رو این حوزه دارن. ذکر کنید در کدام آزمایشگاه مشغول هستید.

افرادی که تجربه کار با این نوع داده ندارن ولی علاقه مند هستن، لطفا انگیزه نامه ارسال کنن و توضیح بدن چرا علاقه مند هستن و در آینده میخوان در چه مسیری گام بردارن. در صورت امکان پرسش پژوهشی که بهش علاقه مند هستن رو هم قرار بدن.

* لطفا در رزومه و یا انگیزه نامه خودتون قید کنید که تجربه شما در برنامه نویسی با متلب چقدر هست.

—————————————

با توجه به اینکه دوره در متلب خواهد بود نیاز هست برای انجام تمرینات با این زبان برنامه نویسی آشنا باشید. ما مقدمه ای روی این زبان نخواهیم داشت. به غیر از مبانی متلب به هیچ چیز دیگری نیاز ندارید برای ورود به دوره. دوره بعد از 28 دسامبر آغاز خواهد شد ولی شاید یک جلسه قبل 10 دسامبر بذارم که توضیح بدم چه مسائلی لازم هست تا مطالعه کنید.

لطفا دقت کنید این دوره تخصصی هست و برای افرادی که با انواع داده های دیگر کار میکنن مناسب نیست. افرادی که با داده های رفتاری، fMRI و یا تصویر برداری کلسیمی کار میکنن مطالب مرتبط در این دوره نخواهند آموخت.

در دوره تئوری و عملی با هم هست. من تئوری رو خواهم گفت و در ملتب روش پیاده سازی رو مطرح میکنیم. در بخش تئوری مبانی و مفاهیم متد ها بحث خواهد شد، تا حدودی پیشینه استفاده از متدها، محدودیت ها، و تئوری هایی که از عملکرد مغز بر اساس هر کدوم از این رویکرد ها میتونیم داشته باشیم هم تا حدودی بحث خواهد شد.

سرفصل دقیق در آینده ارائه خواهد شد.

ظرفیت 30 نفر هست.

—————————————————————————

در پیام نخست نوشتم غیررسمی به این دلیل هست که من معمولا پیش از دوره هام سعی میکنم محتوا رو جمع آوری کنم، اسلاید ها آماده باشه و ... در این دوره فرصت نمیکنم و برای نخستین بار هم هست برگزار میکنم. به همین دلیل شاید کمی از نظر ساختمان بندی از حالت ایده آل فاصله داشته باشه.


@neurosyntax_bot

جلسات آموزشی مبانی متلب من رو میتونید از کانال زیر دریافت کنید:
https://news.1rj.ru/str/SophyPhiliaAcademy

با هشتگ #Matlab

سرفصل های دوره:

1️⃣ Fundamentals of Electrophysiological recordings and data type

2️⃣ Spike Analysis

- Fundamentals of the neurobiological origin of spiking activity
- Fundamentals of Spike sorting for single channel recordings and high-density probe recordings (We will cover Wave_clus, Kilosort, and Phy)
- Cross/autocorrelogram (CCG/ACG) and interspike interval (ISI) plots and their interpretation for Spike sorting quality control, burst index, and cell-cell interaction and oscillatory modulation
- Raster plots, and peristimulus time histograms (PSTH)
- Population vector analysis
- State-space analysis, reactivation, and replay

3️⃣ Local Field Potentials (LFP) Analysis
For LFP analysis, we will develop our own codes using Mike X Cohen tutorials, and in addition we will learn how to use MATLAB built-in signal-processing functions, and Fieldtrip

- Fundamentals of the neurobiological origin of LFP
- Signal preprocessing: conversion, artifact rejection
- Filters: When, Why, and How (Not) to Use Them
- Fourier transform, power analysis
- Time-frequency decomposition: Short-time Fourier transform, Hilbert transform, and wavelet analysis
- Oscillatory bout detection
- Parameterizing neural power spectra into periodic and aperiodic components
- Cycle-by-cycle analysis of neural oscillations
- Analysis of asymmetric oscillatory activity
- Phase analysis: phase concentration, cross-frequency phase coupling (phase-phase, phase-amplitude, amplitude-amplitude)
- Laminar profile: Current-source density
- Functional connectivity analysis: Granger causality, Information theoretic approaches

4️⃣ Spike-LFP Analysis
- spike-triggered average LFP (stLFP)
- Phase Locking, Spike-LFP Coherence
- Pairwise phase consistency


5️⃣ Behavioral Analysis
- Learning curves

برخی از منابعی که متناسب با سرفصل کارگاه هستند:

1.CellExplorer: A framework for visualizing and characterizing single neurons

2.Framework for analyzing single cells

3.Spike sorting for large, dense electrode arrays

4.Past, present and future of spike sorting techniques

5.Filters: When, Why, and How (Not) to Use Them

6.Investigating large-scale brain dynamics using field potential recordings: analysis and interpretation

7.The origin of extracellular fields and currents — EEG, ECoG, LFP and spikes

8.Methodological considerations for studying neural oscillations

9.Local Field Potentials: Myths and Misunderstandings

10.Parameterizing neural power spectra into periodic and aperiodic components

11.Cycle-by-cycle analysis of neural oscillations

12.Data analysis lecturelets by Mike X Cohen

13.What does gamma coherence tell us about inter-regional neural communication?

14.MATLAB for Brain and Cognitive Scientists 📚

15.Analyzing Neural Time Series Data: Theory and Practice 📚

16.Spectral fingerprints of large-scale neuronal interactions

17.Large-scale cortical correlation structure of spontaneous oscillatory activity

18.A mechanism for cognitive dynamics: neuronal communication through neuronal coherence

19.Rhythms for Cognition: Communication through Coherence

20.Neuronal Oscillations in Cortical Networks

21.Rhythms of the Brain 📚

22.The Brain from Inside Out 📚

23.Mechanisms of Gamma Oscillations

24.Synchronization of Cortical Activity and its Putative Role in Information Processing and Learning

25.Dynamic predictions: Oscillations and synchrony in top–down processing

26.Neuronal Synchrony: A Versatile Code for the Definition of Relations?

27.Neural synchrony in cortical networks: history, concept and current status

28.Measuring fundamental frequencies in local field potentials

29. Handbook of Neural Activity Measurement 📚

دوستان دیگه لطفا رزومه ارسال نکنید. ظرفیت کارگاه تکمیل شد. با تشکر

Mechanisms and Functions of Theta Rhythms

ارائه دهنده: زینب حقیان - کارشناسی روان‌شناسی دانشگاه شهید بهشتی

Decision Making Under Uncertainty

ارائه دهنده: رویا محمدصادق - دانشجوی کارشناسی ارشد علوم شناختی گرایش روان‌شناسی شناختی دانشگاه تربیت مدرس


بانظارت سامان عباس‌پور (دانشجوی دکتری علوم اعصاب سیستمی دانشگاه وندربیلت آمریکا)

#Video #Advanced_Neuroscience

Make war not love: The neural substrate underlying a state-dependent switch in female social behavior


ارائه دهنده: هدیه صابری - دانشجوی کارشناسی ارشد علوم شناختی دانشگاه فردوسی مشهد

#Video #Advanced_Neuroscience