"میکروبیوم" (Microbiome)، مجموع ژنوم تمامی میکروبهایی که بدن انسان میزبان آنها است.
بدن یک فرد معمولی میزبان 100 تریلیون میکروب است که این تعداد 10 برابر کل سلولهای موجود در بدن انسان است.
این میکروارگانیزمها از 22 دسته تشکیل شده اند که بیش از 600 گونه مختلف آنها در دهان و 150 گونه از آنها در هر کف دست زدگی می کنند. در مجموع این تنوع گونه ها مجموعه ای وسیع از تنوع ژنتیکی را به وجود می آورد به صورتی که دی ان ای انسان حاوی تقریبا 23 هزار ژن است در حالیکه میکروبیوم 23 میلیون ژن است. از آنجایی که این میکروبها معمولا تغییر مکان نمی دهند، تعداد آنها ثابت باقی می ماند و آنچه از دیدگاه انسانی به اهمیت آنها می افزاید، کمکهایی است که در راستای بهبود عملکرد سلولهای بدن انجام می دهند. در واقع انسان بدون وجود میکروبیومها قادر به ادامه زندگی نخواهد بود.

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

🚩 @PracticalBioinformatics

💎میکروبیوم هر فرد، کلید درمان سرطان 💊

تحقیقات جدید نشان می‌دهد که باکتری‌های موجود در داخل و اطراف بدن، کلید درمان موثر سرطان محسوب می‌شوند.روش‌های مختلفی، از آنتی‌بادی‌ها تا واکسن‌های گوناگون و شکستن کدهای ژنتیکی برای مقابله با سرطان مورد آزمایش قرار گرفته‌اند که تاحدودی در مهار این بیماری مهلک موفق بوده‌اند؛ اما باکتری‌هایی که بدن انسان میزبان آنهاست، می‌توانند نقش موثرتری در مقابله با سرطان در آینده نزدیک ایفا کنند. بسیاری از باکتری‌ها تکامل یافته‌اند تا دی‌ان‌ای سایر سلول‌ها را بعنوان یک مکانیسم دفاعی تغییر دهند که این مسأله می‌تواند به شروع یا درمان سرطان منجر شود.
برخی باکتری‌ها در شرایط خاص منجر به بروز سرطان می‌شوند؛ این در حالیست که برخی از انواع خاص باکتری‌ها می‌توانند نقش حفاظتی ایفا کرده و خاصیت سرطان‌زایی پیدا کنند.باکتری‌ها از سه طریق می‌توانند سرطان را تحت تأثیر قرار دهند: نخست از طریق تغییر دادن تعداد سلول‌های تکثیر شده، دوم از طریق اثرگذاری بر سیستم ایمنی و سوم از طریق اثرگذاری بر متابولیسم سلولی. در یک محیط جدید، باکتری می‌تواند پاسخ ایمنی سلول‌ها را غیرفعال کند یا بصورت غیرضروری این پاسخ را فعال کند که باعث بروز التهاب و شرایط خودایمنی و در نهایت فروپاشی بافت می‌شود.در حال حاضر متخصصان می‌توانند با دستکاری باکتری‌ها، به سیستم ایمنی برای مقابله با انواع خاصی از سرطان یا باکتری‌های عامل بروز سرطان، کمک کنند.عملکرد درمان‌هایی که مانند یک موشک، تنها منطقه سرطانی را هدف قرار داده و کل بدن را درگیر نمی‌کند، از طریق تقویت میکروبیوم محلی تقویت می‌شوند.محققان قصد دارند در تحقیقات آتی خود، چگونگی استفاده از باکتری‌ها برای تشخیص سرطان و شناسایی مستعد ابتلا به عوارض جانبی را مورد بررسی قرار دهند که برای درمان طیف وسیعی از سرطان‌ها کاربرد خواهد داشت.

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

🚩 @PracticalBioinformatics

📽 ویدئو دیدنی ، درباره نحوه رشد کلنی باکتری ها در محیط کشت نقشه


برنده بهترین کلیپ در مسابقات کنفرانس مجامع زیست شناسی سال ۲۰۱۵

کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📽 ویدئو های دیدنی
مجموعه ای از جذابترین، مهیج ترین و بهترین کلیپ ها در زمینه ها مختلف علوم زیستی 👇👇

کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📽
۱- تعقیب کردن باکتری توسط ماکروفاژ

کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📽
۱- انگشت یخی مرگبار
تشکیل قندیل یخی در زیر آب دریا در قطب جنوب
که با برخورد به هر موجود زنده ای آن را به سرعت منجمد می کند.
در این کلیپ شما می توانید تلاش ستاره ها و توتیا های دریایی را برای فرار و قرار نگرفتن بر سر راه این قندیل یخی ببینید.

کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📽
۱- قدم زدن پروتئین موتور سلولی(کینزین) حامل وزیکول برروی رشته های میکروتوبولی+جابجایی میتوکندری در سلول

کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📽
۳- حمله سلول های خونی ائوزینوفیل به کرم الگانس

کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📂در مطالب گذشته اشاره ای به میکروبیوم داشته ایم .در این مطلب می خواهم مقاله ای را به شما معرفی کنم که در آن نقش میکروبیوم بروی متابولیسم میزبان بررسی شده.
تیتر مقاله مورد نظر که در اخرین شماره مجله Molecular Systems Biology به چاپ رسیده به شرح زیر می باشد:

📚 The gut microbiota modulates host amino acid and glutathione metabolism in mice
Adil Mardinoglu, Saeed Shoaie, Mattias Bergentall, Pouyan Ghaffari, Cheng Zhang, Erik Larsson, Fredrik Bäckhed, Jens Nielsen
در خلاصه مقاله آمده است که : پیشنهاد شده که باکتری های روده به عنوان یک فاکتور محیطی می تواند عامل تسریع دهنده بیماری های متابولیکی باشند: از این رو ما ( نویسندگان مقاله ) با استفاده از دیتا های بیان ژنی و شبکه های متابولیکی سلولها و باکتری های موجود در چند منطقه از روده و کبد موش به این نتایج دست یافتیم که "باکتری های موجود در روده می تواند برروی متابولیسم اسید های امینه میزبان تاثیر گذاشته و باعث تغییر در متابولیسم گلوتاتیون می شود".
لینک دسترسی به مقاله:👇
http://msb.embopress.org/content/11/10/834

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

📚کتاب این هفته:
📎 Computational Biology
Author(s): Niranjan Nagarajan, ...
Year: 2010
Size: 8 MB
🚩 @PracticalBioinformatics

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

خرس آبی یا جانور تنبل یک ابر حیوان!!


آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

ابن جانوران کوچک با طولی برابر نیم میلی متر می توانند در هر شرایطی زندگی کنند. آن ها را در هر جای از کره زمین می توان یافت از بلندترین قله های کوه ها تا کف دریا در عمیق ترین بخش های اقیانوس، از مناطق قطبی تا مناطق گرم سیری . آنها حتی می توانند در خارج از جو زمین تا ده روز زنده بمانند.
یه سری حقایق درباره خرس آبی بدانیم:
✔️آنها می توانند در شرایط دمایی شدیدی زنده بمانند: آنها حتی در دمای یک درجه بالا صفر مطلق نیز حیات دارند.
✔️آنها شرایط بی آبی را برای ده سال تحمل می کنند
✔️آنها در شرایط فشار بالا نیز زنده میمانند. حتی در فشار بیشتر از فشار عمیقترین اقیانوس ها .
✔️میزان مقاوت آنها نسبت به اشعه رادیو اکتیو 100 برابر بیشتر از دیگر حیوانات می باشد.
✔️تعداد سلولهای خرس های آبی بالغ با یکدیگر برابر هستند

قطع به یقین تعدای از باکتری ها وجود دارند که شرایط بسیار بدتری را نیز تحمل می کنند. اما خرس آبی از این جهت اهمیت دارد که یک حیوان پیچیده دارای مغز می باشد.

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics

تفاوت بین بیولوژیست آزمایشگاهی با بیولوژیست محاسباتی 😄😄

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🚩 @PracticalBioinformatics