آزمایشگاه پارس سیلیکو – Telegram
آزمایشگاه پارس سیلیکو
902 subscribers
245 photos
61 videos
91 files
212 links
اولین آزمایشگاه خصوصی بیوانفورماتیک کشور

Pars Silico is one of the leading Middle Eastern companies in the field of Chemoinformatics and Bioinformatics. Founded in 2013 ...
ParsSilico.com
ارتباط:
@bioinformatics1
Download Telegram
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🔔نخستین ساختار پروتئین Tardigrade در هفته جاری به دیتابیس PDB وارد شد.
t.co/APqVhA8aBp

✍️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
Building_a_virtual_ligand_screening.pdf
413.1 KB
🎁مقاله با موضوع غربالگری مجازی با کمک نرم افزار های رایگان
📄 Building a virtual ligand screening pipeline
using free software: a survey

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
دوره آموزشی زبان برنامه نویسی پایتون و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
▫️مدت: 12 جلسه 20 ساعت
▪️تاریخ شروع: 3 شهریور
▪️هزینه دوره: 450 هزار تومان

آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
◼️دوره آموزشی زبان برنامه نویسی پایتون و کاربرد آن در بیوانفورماتیک

▪️مدت دوره: 12 جلسه 20 ساعت

▪️هزینه دوره: 450 هزار تومان

▪️تاریخ جلسات: روزهای جمعه از ساعت 9 تا 13 به مدت 4 هفته برگزار می گردد

🏆آموختن برنامه نویسی بهترین نوع سرمایه گذاری است که شما می توانید برای پژوهش یا کارتان انجام دهبد. "پایتون برای زیست شناس ها"، یک دوره برنامه نویسی کامل برای مبتدیان است که مهارت های مورد نیاز شما را برای مواجهه با مسایل رایج زیستی و بیوانفورماتیکی فراهم می آورد.
@practicalbioinformatics
🔹چرا برنامه نویسی بیاموزیم؟
ممکن است دیده باشید که همکاران شما برای صرفه جویی در زمان و تعامل با مجموعه داده های بزرگ، برنامه نویسی می کنند.
ممکن است مسئول شما از شما خواسته باشد تا برای پروژه آینده تان برنامه نویسی بیاموزید.
ممکن است شما در میان آگهی های شغلی جستجو کرده باشید و متوجه شده باشید که چه تعداد از آنها مهارت های برنامه نویسی را از شما طلب می کنند.
ممکن است ، جهت ادامه تحصیل در رشته های مرتبط در ایران و دیگر کشور ها، داشتن مهارت برنامه نویسی یکی از ملزومات پذیرش دانشگاه باشد.

🔹فهرست مطالب
🔸در جلسات ابتدایی، شما خواهید آموخت که چرا پایتون انتخاب مناسبی برای زیست شناس ها و مبتدیان است. همچنین می آموزید که چگونه پایتون را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید و نیز چگونه محیط برنامه نویسی خود را تنظیم کنید. این جلسات با مرتبط کردن شما با تمام نرم افزارهای رایگان مورد نیاز شما تکمیل می شود.
🔸در ادامه، شما خواهید آموخت که چگونه می توانید مانند توالی های DNA و پروتئین را دستکاری کنید و چگونه اشتباهاتتان در برنامه نویسی را برطرف کنید. مثال: محاسبه ی محتوای GC و AT، تبدیل توالی DNA و RNA به یکدیگر و پروتئین. و..
🔸در بخش سوم، چگونگی خواندن و نوشتن داده ها در فایلها را فرا خواهید گرفت. همچنین می آموزید که چگونه با مسیرهای فایل ها و فرمت فایل FASTA دست و پنجه نرم کنید. مثال: تقسیم DNAی ژنومی، نوشتن یک فایل FASTA. و..
🔸در بخش پنجم، می آموزید که چگونه در یک برنامه واحد، قسمت های مختلف و زیادی از داده ها را پردازش کنید و با ابزارهای پیشرفته تری برای دستکاری توالی ها آشنا خواهید شد. مثال: مقایسه و الایمنت توالی ها، تریم کردن (پیرایش) توالی ها، الحاق اگزون ها. پیدا کردن موتیف ها و..
🔸همچنین، خواهید آموخت که چگونه با خلق دستورالعمل های شخصی خودتان، می توانید پایتون را مفیدتر کنید و نیز بهترین راه ارزیابی آن دستورالعمل ها در جهت بالا بردن سرعت کار را فرا می گیرید. مثال: تحلیل ترکیب آمینواسیدی توالی پروتئین. ابزار تحلیل متون و مقالات موجود در pubmed . و..
....
@practicalbioinformatics
🔹جامعه ی مخاطبان
این کارگاه برای تمام پژوهشگران و محققین و دانشجویان در زمینه ی زیست شناسی که می خواهند برنامه نویسی بیاموزند، طراحی شده است. سرفصل دروس برای افراد مبتدی تنظیم شده است، از افرادی که تجربه های قبلی در برنامه نویس دارند با افتخار دعوت می شود تا در این کارگاه جهت یادآوری حضور پیدا کنند، اما احتمالا سرعت پیشرفت کلاس برای این افراد کمی کند به نظر خواهد رسید. اگر هنوز مردد هستید جهت مشاوره و دریافت اطلاعات بیشتر با ما تماس بگیرید
👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻
📞 09106665590
🌐www.DrugDesign.ir
@practicalbioinformatics

🏴نشاني: خیابان طالقاني -خیابان سميه - بین مفتح و موسوی - پلاک 122-طبقه 4 - واحد 404
https://goo.gl/G1h8DX

🏳🔔مقاله ای که ادعا می کند قادر به پیش بینی چهره فرد از طریق ژنوم آن است

یک مقاله از کریگ ونتر پیشگام توالی یابی ژنوم که ادعا می کند از طریق DNA افراد امکان پیش بینی ویژگی های فیزیکی چهره آنها وجود دارد، طوفانی از انتقاد را براه انداخته است. داوران و حتی همکاران این مقاله می گویند که توانایی استفاده از ژن های یک شخص برای شناسایی فرد، که می تواند ترس های غیر ضروری برای حفظ حریم خصوصی ژنتیکی را افزایش دهد، بیش از حد است.

در مقاله1 که در تاریخ 5 سپتامبر در مجموعه آکادمی ملی علوم (PNAS) منتشر شده است، ونتر و همکارانش در شرکت ط Human Longevity, Inc. (HLI) ، که در سان دیگو کالیفرنیا مستقر هستند، کل ژنوم 1061 نفر از سنین و اقوام مختلف را توالی یابی کردند. با استفاده از داده های ژنتیکی، همراه با عکس های با کیفیت بالا 3D از چهره های شرکت کنندگان، محققان از روش هوش مصنوعی برای پیدا کردن تفاوت های کوچک در توالی های DNA، که SNP نامیده می شود، با ویژگی های چهره مانند طول استخوان گونه. استفاده کردند. این تیم همچنین SNP های که با عوامل مرتبط با قد، وزن، سن، ویژگی های صوتی و رنگ پوست ارتباط دارد، را مورد بررسی قرار دادند.

صحت این رویکرد برای شناسایی یک فرد را از یک گروه ده نفر که به طور تصادفی از پایگاه داده HLI انتخاب شده اند 74٪ بوده است. یافته های این مقاله نشان می دهد که سازمان های انتظامی، دانشمندان و دیگر افرادی که ژنوم انسان ها را اداره می کنند، باید از داده ها به دقت محافظت کنند.
اما سایر متخصصان ژنتیک، با مطالعه مقاله، می گویند که به نظر آنها، این ادعا بسیار غلو امیز است...
مارک شریور، یک انسان شناس در دانشگاه ایالتی پنسیلوانیا در دانشگاه پارک، می گوید: "من فکر نمی کنم که این مقاله خیلی نگران کننده باشد، زیرا آنها هیچ توانایی این فرد را از DNA نشان نمی دهند."
از طرفی محققان دیگری با بررسی های بروی داده های این مقاله و چاپ ان در bioRxiv اعلام می دارند که داده های پایگاه داده HLI بسیار کوچک بوده و افزودن اطلاعات جنس سن و نژاد در مطالعات این مقاله باعث بوجود امدن این نتایج شده است و دانستن این سه عامل به تنهایی خود میتواند نتایج 74٪ را بدست اورد.


آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔سخنرانی با موضوع :

کاربرد متن کاوی در بیوانفورماتیک
Text Mining in Bioinformatics
خانم دکتر تنوری

شنبه 25 شهریور ساعت 10 صبح

ثبت نام:goo.gl/ytir17

آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔گزارش تصویری سخنرانی در زمینه های :
1) کاربرد متن کاوی در بیوانفورماتیک
و
2) روش های شناسایی اینتراکنش هدف دارو

📆شنبه 25 شهریور

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📣 در چهارمین «نمایشگاه بین المللی زیست فناوری ایران» منتظر شما هستیم.

27 الی 29 شهریور ماه
📌تهران - مصلی بزرگ امام خمینی (ره) -درب44 جنوبي - غرفه 448

@Practicalbioinformatics
💠 غرفه آزمايشگاه پارس سيليكو در چهارمين نمایشگاه زیست فناوری ايران

📌غرفه ٤٤٨

@Practicalbioinformatics
🔔امروز سالگرد تولد انتونی کلارک است. کسی که در سال 1951 گوسفندی را تغییر داد تا الفا 1 انتی تریپسین را در شیر خود تولید کند
دارویی که برای درمان فیبروسیس به کار میرود.


@Practicalbioinformatics
خدمات داکینگ پارس سیلیکو :

داکینگ پروتئین-لیگاند
داکینگ پروتئین-پروتئین
داکینگ پروتئین-اسید نوکلئیک
داکینگ انتی ژن-انتی بادی
داکینگ پروتئین-پپتید

🌎 https://goo.gl/ZSbJM2

@practicalbioinformatics
Forwarded from Exirlabs
نظرسنجی اکونومیست درباره ی پیش بینی آینده ی صنعت سلامت از نظر 400 نفر از رهبران صنایع دنیای سلامت.
➡️ @ExirLabs
🌐www.Exirlabs.com
▪️میکروبیوم انسان

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▪️میکروارگانیسمهای روده را بیشتر بشناسید

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▪️میکروبیوتا سیستم گوارش در چه بیماری های نقش دارند.

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▪️بخش های مختلف بدن انسان با ترکیب های مختلفی از میکروبها پوشیده شده است.

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▪️میکروبیوتا در طول حیات یک انسان تغییر می کند.

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
▪️What is the human microbiome?

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
▪️میکروبهای تغییر دهنده ذهن : چگونه میکروبیوم برروی مغز و رفتار تاثیر می گذارد.!
🗣 Elaine Hsiao at TEDxCaltech
▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/qzMwai

▫️دوره های آموزشي فصل پاییز
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

▪️بیوانفورماتیک عمومی
🕰 زمان برگزاري : جمعه ها ۹ الی ۱۳:۳۰


▪️بیوانفورماتیک ساختاری
🕰 زمان برگزاري : پنجشنبه ۱۴:۳۰ الی ۱۹


▪️انالیز بیان ژن
🕰 زمان برگزاري : پنجشنبه ها ۹ الی ۱۳:۳۰

▪️طراحی دارو
🕰 زمان برگزاري : چهارشنبه ها ۱۴:۳۰ الی ۱۹



📞 شماره تماس ما:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
▫️اطلاعات بیشتر
🌍https://goo.gl/LaFC9o

@practicalbioinformatics
goo.gl/dNc8gU

✍️پنج شرکت پیشرو در آنالیز DNA

▫️همگام با پیشرفت تکنولوژی توالی یابی ژنی و کاهش هزینه های آن، شرکت های بزرگ این حوزه از علوم زیستی بیش از هر چیز به تجاری سازی این تکنولوژی می اندیشند. احتمالا شما هم تا کنون به تبلیبغات مشابه آزمایشات مختلف ژنتیکی؛ از شناسایی بیماری ها گرفته تا توالی یابی کامل ژنوم برخور کرده اید. در میان تمام شرکت های مرتبط با این تکنولوژی ما 5 تا از بهترین ها را برگزیده ایم و در ادامه به شما معرفی خواهیم کرد.
▪️23andMe
▫️این شرکت فعالیتش را در سال 2013 با انجام تست های ژنتیکی که بطور مستقیم در اختیار مشتری ها قرار می گیرد و بیماری ها را پیشگویی میکند، آغاز کرد اما تنها پس از مدت کوتاهی به علت احتمال جواب های اشتباه و گیج کننده به مشتری، ارایه این تست ها توسط سازمان غذا و دارو آمریکا متوقف شد. این شرکت در سال جاری با مجوز رسمی سازمان FDA مجددا فعالیتش را از سر گرفت و در حال حاضر شرکت 23andMe یکی از معتبرترین شرکت ها برای شناسایی برخی بیماری های، نه تمام بیماری های ژنتیکی است.
▪️Illumina
▫️اوایل سال جاری شرکت Illumina ؛ بزرگترین شرکت توالی یابی ژنوم در دنیا از به صرفه ترین و پرسرعت ترین دستگاه توالی یابی اش رونمایی کرد. طبق ادعای این شرکت ماشین توالی یابی جدیدش قادر است در تنها 2 روز و نیم تعداد 48 ژنوم انسان را توالی یابی کند. Illumina از محققان ژنتیک و علوم زیستی دعوت کرده تا با قیمتی فوق العاده به صرفه نادرترین جهش ها و واریانت ها در بیماری ها را با استفاده از این دستگاه شناسایی کنند.
▪️Oxford Nanopore
▫️شهرت جهانی این شرکت در علم ژنتیک از 12 سال پیش آغاز شد زمانی که دستگاه توالی یابنده دستی اش، با قابلیت جابه جایی را به دنیای تکنولوژی های زیستی عرضه کرد. حالا بعد از 12 سال دستگاه MinION تقریبا به تمام دنیا؛ از صحرای آفریقا تا شمال شرق برزیل سفر کرده است و توالی ارگانیسم های بیشماری؛ از جمله Ebola و Zika را با استفاده از این دستگاه قابل حمل شناسایی کردند. جالب است که بدانید که دانشمندان از MinION برای توالی یابی میکروارگانیسم های ایستگاه های فضایی و شرایط آب و هوایی غیرقابل تحمل انسان نیز تا به امروز بهره گرفته اند. قیمت این دستگاه تنها 1000 دلار است و همین امر یکی از عواملی است که باعث شده تا در بسیاری از تحقیقات علمی به کار گرفته شود.
▪️ Sophia Genetic
▫️به جرئت میتوان گفت شرکت سوییسی Sophia Genetic یکی از جالب ترین ایده ها در دنیای تکنولوژی زیستی را به خودش اختصاص داده است؛ تلفیقی از هوش مصنوعی و سیستم توالی یابی ژنومی که به شناسایی بیش از 100 هزار بیماری در بیمارستان ها دنیا منجر شده است. این شرکت با همکاری بیمارستان ها توالی میلیون ها فرد سالم و بیمار را جمع آوری کرده است و با استفاده از این داده ها و هوش مصنوعی قادر است احتمال بروز برخی بیماری های ژنتیکی را در افراد تشخیص دهد و به درمان و پیشگیری آن کمک کند.
▪️Veritas Genetics
▫️توالی یابی کل ژنوم افراد تنها با 1000 دلار! تکنیک توالی یابی کل ژنوم (WGS)قبل ازشروع فعالیت این شرکت تنها برای افراد با بیماری های خاص و آن هم به دستور پزشک معالج انجام می گرفت و یکی از پر هزینه ترین تکنیک های مهندسی ژنتیک به شمار میرفت. اما شرکت Veritas Genetics با شعار «دانستن اطلاعات DNA حق تمام افراد حتی افراد سالم است.» فعالیتش را آغاز کرد و حالا در کشور چین توالی ژنومی نوزادان تازه متولد شده را هم آنالیز می کند و در اختیار والدین قرار میدهد.

▫️پارس سیلیکو پیشرو در علوم زیستی
@practicalbioinformatics