💠 غرفه آزمايشگاه پارس سيليكو در چهارمين نمایشگاه زیست فناوری ايران

📌غرفه ٤٤٨

@Practicalbioinformatics

🔔امروز سالگرد تولد انتونی کلارک است. کسی که در سال 1951 گوسفندی را تغییر داد تا الفا 1 انتی تریپسین را در شیر خود تولید کند
دارویی که برای درمان فیبروسیس به کار میرود.


@Practicalbioinformatics

خدمات داکینگ پارس سیلیکو :

داکینگ پروتئین-لیگاند
داکینگ پروتئین-پروتئین
داکینگ پروتئین-اسید نوکلئیک
داکینگ انتی ژن-انتی بادی
داکینگ پروتئین-پپتید

🌎 https://goo.gl/ZSbJM2

@practicalbioinformatics

نظرسنجی اکونومیست درباره ی پیش بینی آینده ی صنعت سلامت از نظر 400 نفر از رهبران صنایع دنیای سلامت.
➡️ @ExirLabs
🌐www.Exirlabs.com

▪️میکروبیوم انسان

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▪️میکروارگانیسمهای روده را بیشتر بشناسید

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▪️میکروبیوتا سیستم گوارش در چه بیماری های نقش دارند.

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▪️بخش های مختلف بدن انسان با ترکیب های مختلفی از میکروبها پوشیده شده است.

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▪️میکروبیوتا در طول حیات یک انسان تغییر می کند.

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▪️What is the human microbiome?

▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▪️میکروبهای تغییر دهنده ذهن : چگونه میکروبیوم برروی مغز و رفتار تاثیر می گذارد.!
🗣 Elaine Hsiao at TEDxCaltech
▫️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

goo.gl/qzMwai

▫️دوره های آموزشي فصل پاییز
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

▪️بیوانفورماتیک عمومی
🕰 زمان برگزاري : جمعه ها ۹ الی ۱۳:۳۰


▪️بیوانفورماتیک ساختاری
🕰 زمان برگزاري : پنجشنبه ۱۴:۳۰ الی ۱۹


▪️انالیز بیان ژن
🕰 زمان برگزاري : پنجشنبه ها ۹ الی ۱۳:۳۰

▪️طراحی دارو
🕰 زمان برگزاري : چهارشنبه ها ۱۴:۳۰ الی ۱۹



📞 شماره تماس ما:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
▫️اطلاعات بیشتر
🌍https://goo.gl/LaFC9o

@practicalbioinformatics

goo.gl/dNc8gU

✍️پنج شرکت پیشرو در آنالیز DNA

▫️همگام با پیشرفت تکنولوژی توالی یابی ژنی و کاهش هزینه های آن، شرکت های بزرگ این حوزه از علوم زیستی بیش از هر چیز به تجاری سازی این تکنولوژی می اندیشند. احتمالا شما هم تا کنون به تبلیبغات مشابه آزمایشات مختلف ژنتیکی؛ از شناسایی بیماری ها گرفته تا توالی یابی کامل ژنوم برخور کرده اید. در میان تمام شرکت های مرتبط با این تکنولوژی ما 5 تا از بهترین ها را برگزیده ایم و در ادامه به شما معرفی خواهیم کرد.
▪️23andMe
▫️این شرکت فعالیتش را در سال 2013 با انجام تست های ژنتیکی که بطور مستقیم در اختیار مشتری ها قرار می گیرد و بیماری ها را پیشگویی میکند، آغاز کرد اما تنها پس از مدت کوتاهی به علت احتمال جواب های اشتباه و گیج کننده به مشتری، ارایه این تست ها توسط سازمان غذا و دارو آمریکا متوقف شد. این شرکت در سال جاری با مجوز رسمی سازمان FDA مجددا فعالیتش را از سر گرفت و در حال حاضر شرکت 23andMe یکی از معتبرترین شرکت ها برای شناسایی برخی بیماری های، نه تمام بیماری های ژنتیکی است.
▪️Illumina
▫️اوایل سال جاری شرکت Illumina ؛ بزرگترین شرکت توالی یابی ژنوم در دنیا از به صرفه ترین و پرسرعت ترین دستگاه توالی یابی اش رونمایی کرد. طبق ادعای این شرکت ماشین توالی یابی جدیدش قادر است در تنها 2 روز و نیم تعداد 48 ژنوم انسان را توالی یابی کند. Illumina از محققان ژنتیک و علوم زیستی دعوت کرده تا با قیمتی فوق العاده به صرفه نادرترین جهش ها و واریانت ها در بیماری ها را با استفاده از این دستگاه شناسایی کنند.
▪️Oxford Nanopore
▫️شهرت جهانی این شرکت در علم ژنتیک از 12 سال پیش آغاز شد زمانی که دستگاه توالی یابنده دستی اش، با قابلیت جابه جایی را به دنیای تکنولوژی های زیستی عرضه کرد. حالا بعد از 12 سال دستگاه MinION تقریبا به تمام دنیا؛ از صحرای آفریقا تا شمال شرق برزیل سفر کرده است و توالی ارگانیسم های بیشماری؛ از جمله Ebola و Zika را با استفاده از این دستگاه قابل حمل شناسایی کردند. جالب است که بدانید که دانشمندان از MinION برای توالی یابی میکروارگانیسم های ایستگاه های فضایی و شرایط آب و هوایی غیرقابل تحمل انسان نیز تا به امروز بهره گرفته اند. قیمت این دستگاه تنها 1000 دلار است و همین امر یکی از عواملی است که باعث شده تا در بسیاری از تحقیقات علمی به کار گرفته شود.
▪️ Sophia Genetic
▫️به جرئت میتوان گفت شرکت سوییسی Sophia Genetic یکی از جالب ترین ایده ها در دنیای تکنولوژی زیستی را به خودش اختصاص داده است؛ تلفیقی از هوش مصنوعی و سیستم توالی یابی ژنومی که به شناسایی بیش از 100 هزار بیماری در بیمارستان ها دنیا منجر شده است. این شرکت با همکاری بیمارستان ها توالی میلیون ها فرد سالم و بیمار را جمع آوری کرده است و با استفاده از این داده ها و هوش مصنوعی قادر است احتمال بروز برخی بیماری های ژنتیکی را در افراد تشخیص دهد و به درمان و پیشگیری آن کمک کند.
▪️Veritas Genetics
▫️توالی یابی کل ژنوم افراد تنها با 1000 دلار! تکنیک توالی یابی کل ژنوم (WGS)قبل ازشروع فعالیت این شرکت تنها برای افراد با بیماری های خاص و آن هم به دستور پزشک معالج انجام می گرفت و یکی از پر هزینه ترین تکنیک های مهندسی ژنتیک به شمار میرفت. اما شرکت Veritas Genetics با شعار «دانستن اطلاعات DNA حق تمام افراد حتی افراد سالم است.» فعالیتش را آغاز کرد و حالا در کشور چین توالی ژنومی نوزادان تازه متولد شده را هم آنالیز می کند و در اختیار والدین قرار میدهد.

▫️پارس سیلیکو پیشرو در علوم زیستی
@practicalbioinformatics

✍️The dynamics of molecular evolution over 60,000 generations
📃Nature (2017)
🔖doi:10.1038/nature24287
@practicalbioinformatics

✍️The dynamics of molecular evolution over 60,000 generations
📃Nature (2017)
🔖doi:10.1038/nature24287
@practicalbioinformatics

🔔 سمینار "زیست شناسی سامانه ای: از داده های اومیک تا ترسیم و آنالیز شبکه"

▫️زیست شناسی سامانه ای (systems biology) رویکردی است کل نگر در مطالعات زیست شناسی که از اطلاعات عظیم بدست آمده از مطالعات امیک (omics) همانند ژنومیک، ترنسکریپتومیک، پروتئومیک و متابولومیک برای درک فرآیندهای زیستی استفاده می کند. دانشمندان با استفاده از این رویکرد و با همکاری تخصص های متعددی همچون زیست شناسی، ریاضی، آمار و کامپیوتر در پی درک بیشتر، مدلسازی و پیش بینی فرآیندهای زیستی هستند.

این کنفرانس یکروزه شامل چهار بخش به شرح زیر خواهد بود:


1) رویکرد زیست شناسی سامانه ای و کاربرد آن در طراحی و آنالیز پروژه های علوم پایه پزشکی (ژنتیک، ایمنی شناسی، میکروب شناسی، علوم سلولی و مولکولی، پزشکی مولکولی) و علوم پزشکی و دارویی در سال های اخیر معرفی خواهد شد.

2) کاربرد و اهمیت روش های امیک (ژنومیک، ترنسکریپتومیک، پروتئومیک و متابولومیک) در تولید داده های عظیم در مطالعات زیستی بررسی خواهد شد.

3) نحوه ترسیم انواع مختلف شبکه های زیستی (پیام رسانی، متابولیکی، تنظیم بیان ژن و ...) با دو رویکرد مبتنی بر دانش و مبتنی بر داده شرح داده خواهد شد.

4) متدهای محاسباتی آنالیز شبکه های زیستی پیچیده با استفاده از نظریه گراف توضیح داده خواهد شد.

▫️مجری برگزاری :
پژوهشکده سیستم بیولوژی، مرکز تحقیقات آسیب های شیمیایی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)

▪️هزینه ثبت نام:

30000 تومان ارشد و دکتری
20000 تومان کارشناسی

▫️تاریخ برگزاری : پنج‌شنبه ۲ آذر 96.9.2


▫️از طریق لینک زیر می‌توانید در آن ثبت‌نام کنید.
https://evnd.co/re9OP
▫️پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▫️پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🍝🔹صفحه توييتر Protein Data Bank به مناسبت روز جهاني پاستا؛ ٢٥ اكتبر دامین هاي پروتئيني با نام PASTA را معرفی كرد. ‼️

@practicalbioinformatics

🎓تحصيل در مقطع دكترا در رشته سيستم بيولوژي در مركز تحقيقاتي Max-Delbrück برلين

📌زمينه هاي تحقيقاتي:

*  Bioinformatics, Computational Biology and Mathematical Modeling
* Gene Regulation: microRNAs,Epigenetics, Trannoscription, RNA Biology
* Genomics, Proteomics, Metabolomics, Single Cell Analysis and Imaging
* Cell Fate Conversion, Neuronal Differentiation, Reprogramming and
* Signaling, Developmental Biology

📎توضيحات:
The Berlin Institute for Medical Systems Biology at the Max-Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) offers an exceptional PhD Program to support interdisciplinary research projects and international PhD education. Training is based on our major spectrum of medical systems biology research and technologies. Candidates educated in disciplines such as computational sciences mathematics, physics, biochemistry or molecular biology and sharing our interest in gene regulatory networks are strongly encouraged to apply.

We also offer a Berlin based PhD Exchange Program together with the Center for Genomics and Systems Biology at New York University (NYU). The program is embedded into the research and training activities of the Helmholtz Graduate School Molecular Cell Biology (MDC) and the Department of Biology (NYU). Doctoral training with up to four year funded positions plus travel allowances and housing support is provided.

The program offers:

interdisciplinary research training in top ranking labs projects that are dually mentored by a group leader from MDC and NYU students are supported to spend up to fifty percent of their time at NYUaccess to and training in high-end technologies, such as deep sequencing,mass spectrometry, bioinformatics an extensive and comprehensive archive of animal model systems participation in interdisciplinary classes, soft skills courses, student focused seminars and specialized summer schools regular opportunities to present your research at the BIMSB Student Seminar and attend the Systems Biology Lecture Series.


✍️فرصت تکمیل فرم: ١دسامبر ٢٠١٧

⏱تاریخ شروع کلاس: September ٢٠١٨

🌍اطلاعات بيشتر در لينك:
http://systems-biology.org/jobs/2017/001201.html

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

🗣 سمينار "معرفي نرم افزار NAMD و كاربرد آن در ديناميك مولكولي"

💠ارائه دهنده: خانم دكتر فراهاني💠

⏱ زمان: سه شنبه ١٦ آبان
📍مكان: آزمايشگاه بيوانفورماتيك پارس سيليكو

@practicalbioinformatics

⬅️بازار تشخیص ژنتیکی پیش از لانه گزینی؛ پیش بینی سال 2022


بر اساس نوع (تشخیص ژنتیکی/غربالگری ژنتیکی)، تکنولوژی (NGS، PCR، FISH، CGH، SNP)، تولیدات و خدمات، کاربرد (آنیوپلوئیدی، ترانسلوکیشن ها)، مصرف کننده ی نهایی (کلینیک های باروری، پژوهش).

قسمت اول

✅بازار جهانی آزمایشات ژنتیکی پیش از لانه گزینی از رقم 344 میلیون دلار فعلی در سال 2017 به 542 میلیون دلار در سال 2022 خواهد رسید.

⬅️با افزایش نگرانی های عمومی و آگاهی های جمعی در رابطه با بیماری های ژنتیکی و همچنین افزایش تاکیدها بر بهبود نتایج بالینی فرایند های IVF و ART، نیاز بازار برای روش های تشخیص و غربالگری ژنتیکی پیش از لانه گزینی در دهه ی گذشته به طور چشمگیری افزایش یافته است. FISH یک تکنیک انالیز ژنتیکی است که در سطح جهانی مقبولیت دارد و بخاطر کارایی بالایش در مطالعات کروموزومی، دقت در آنالیز قطعات DNA، و نیاز کم به نمونه مورد استفاده قرار می گیرد. به همین ترتیب، PCR نیز به طور گسترده در روندهای تشخیص ژنتیکی پیش از لانه گزینی به طور گسترده ای مورد استفاده است، عمدتا به این دلیل که کارایی خوبی برای تکثیر DNA و زمان جوابدهی کوتاه دارد.

بازار جهانی تشخیص و غربالگری ژنتیکی پیش از لانه گزینی در سال 2022 از 336 دلار فعلی در 2017 به حدود 540 میلیون دلار می رسد. این بازار تحت تاثیر عواملی چون نرخ رو به رشد ناباروری در سرتاسر جهان، افزایش سرمایه گذاری های دولتی-خصوصی در زمینه ی آزمایشات ژنتیکی پیش از لانه گزینی، افزایش شمار کلینیک های ناباروری در سطح جهان، پیشرفت های فناورانه در زمینه ی آنالیز ژنتیکی و افزایش ریسک ناهنجاری های کروموزومی در جنین ناشی از سن بالای مادری است. از سوی دیگر هزینه های بالای فرایندهای مرتبط با تشخیص ژنتیکی پیش از لانه گزینی و عدم حمایت های قوانین دولتی عوامل اصلی محدود کننده ی رشد این بازار در دوره ی مورد پیش بینی است.

از سوی دیگر، نگرانی های اخلاقی مرتبط با آزمایشات جنینی و بکارگیری محدود تکنیک های جدید PGD&PGS مانند NGS و SNP در میان متخصصان چالش بزرگی برای سازندگان محصول بر سر راه رسیدن به رشد درآمدی هستند؛ بویژه در میان کشورهای حوزه آسیا پاسیفیک و و نیز کشور های دیگر. گرچه دولت های گوناگونی در میان بازارهای موجود و نوظهور تمرکز بیشتری بر روی تامین تسهیلات بهتر و موثرتری در بخش سلامت را برای درصد بیشتری از جمعیت خود به کار بسته اند. با شناخت مزایایی که توسط تکنیک های PGD و PGS در دسترس قرار گرفته اند و با در نظر گرفتن افزایش شیوع ناهنجاری های ژنومی، دولت های بیشتری در جهان بر روی افزایش بکارگیری عمومی تکنیک های PGD و PGS تمرکز کرده اند و تامین هزینه های پژوهشی برای توسعه ی تولیدات جدید برای روندهای PGD&PGS را افزایش داده اند.

بازار تشخیص و غربالگری ژنتیکی پیش از لانه گزینی بازاری رقابتی با شمار فزاینده ای از سازندگان محصولات و تامین کنندگان خدمات است. مانند سال 2016 بزرگترین سازندگان محصولات حاضر در بازار جهانی عبارتند از ایلومینا (آمریکا) کوپر سرژیکال (آمریکا)، ترموفیشر ساینتیفیک (آمریکا)، اجیلنت تکنولوجیز (آمریکا)، پرکین المر (آمریکا)، آزمایشگاه ای آبوت (آمریکا) ناترا (آمریکا)، جنیالینیتد (استرالیا)، روبیکون ژنومیکس (آمریکا)، آکسفوردجین تکنولوجی (بریتانیا) ییکون ژنومیکس (چین) و سایجین (آمریکا). در میان آنان همانند سال 2016 بزرگترین تامین کنندگان خدمات فعال در بازار جهانی شامل کامبی ماتریکس کرپوریشن (آمریکا)، گود استارت ژنتیک (آمریکا)، بی جی آی (چین) اینویکتاژنتیکس (لهستان) و پروجنسیس (آمریکا) است.

⬅️بر مبنای فناوری، تشخیص و غربالگری ژنتیکی پیش از لانه گزینی به دسته های زیر تقسیم بندی می شود: PCR، NGS، FISH، CGH و پلیمورفیسم تک نوکلئوتیدی یا SNP. بخش NGS بزرگترین سهم بازار را در سال 2016 اختیار داشت. این سهم بزرگ می تواند مدیون عوامل مختلفی مانند کاهش هزینه ها، توانایی بالاتر برای تشخیص جنین دارای موزائیسم، تشخیص بهتر ناهنجاری های ساختاری مانند کروموزوم های دارای قطعات حذف یا اضافه شده و کاهش اشتباهات انسانی با اتوماتیک شدن فرایندها باشد.

اما PCR دومین بخش بزرگ بازار را در سال 2016 به خود اختصاص داده بود. PCR چندین مزیت مانند افزایش حساسیت، بازده بالا، افزایش دقت، کاهش زمان واکنش ها، تخمین قطعی مولکول هدف، تولرانس بالا نسبت به اینهیبیتورها و توانایی بررسی میکسچرهای پیچیده را از خود نشان داده است و این عوامل پیشران رشد این بخش بوده اند.
https://goo.gl/5hNrBh
fa.exirlabs.com
@exirlabs