پرایمر | Primer – Telegram
پرایمر | Primer
3.16K subscribers
306 photos
131 videos
51 files
829 links
📍رسانه علمی دانشجویی پرایمر
💠سردبیر: حورا اخوان‌فرید
@houra_akhavanfarid
💠مدیرمسئول: نیما عشقی
@nima_4718
@Primer_admin

💻http://primerjournal.sbu.ac.ir

🔗 انجمن علمی دانشجویی علوم و فناوری زیستی دانشگاه شهید بهشتی
https://news.1rj.ru/str/SBUBIOSOCIETY
Download Telegram
🛢🔋💵استفاده از بیومیمتیک در کاهش مصرف انرژی:


معماری 🏡

🔋🔌میزان زیادی انرژی در خانه های ما مصرف میشود و همینطور هدر میرود.

🏯🏗 استفاده از بیومیمتیک در معماری به ما کمک میکند تا سازه هایمان را تا حد امکان با طبیعت سازگار کرده و معماریمان را به بهترین حالت ممکن نزدیک کنیم.

💡محققین دو روش عمده را برای استفاده از بیمیمتیک در طراحی سازه ها معرفی کردند:

📍روش problem based (از طراحی سازه به بیولوژی):
در این روش طراح پس از ساخت سازه اش به مشکلی برمیخورد؛ مشکل یا ضعف سازه را شناسایی میکند و سپس به دنبال موجود زنده ای در طبیعت میگردد که مشکلی مشابه آن را حل کرده باشد و با الگوگیری از آن مسئله را حل میکند.

📍روش solution based (از بیولوژی به طراحی سازه):
در این روش محققین از دانش خود در زمینه ی زیست شناسی در معماری استفاده میکنند. یعنی به دنبال راه حلی برای مشکل به خصوصی نبودند اما از دانششان برای بهبود دادن سازه ها استفاده کردند. به طور مثال تحقیقاتی که بر روی برگ گل نیلوفر انجام شد نشان داد که آب روی آن میغلتد و باعث خاصیت self cleaning می شود. (STO lotusan) از این خاصیت در سازه ها استفاده کردند تا آنها را بهبود دهند.


🌳🏢 سطوح بیومیمتیک:
سه سطح در استفاده از بیومیمتیک مطرح است؛ فُرم(شکل)، فرآیند زیستی و اکوسیستم. با بررسی یکی از این سه سطح در طبیعت میتوانیم راه حلی برای حل مشکلاتمان مانند انرژی یا معماری بیابیم.

📢 به طور کلی مثال های بسیاری از استفاده از بیومیمتیک در معماری موجود است و این استفاده علاوه بر صرف جویی در مصرف انرژی منفعت های بسیاری را به دنبال دارد.
در ادامه این مثال ها را بررسی میکنیم.



#بیومیمتیک @primerSBU
"چگونه زیست شناسان یک رادیو را تعمیر میکنند؟"
📻📻📻📻📻📻🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬
دکتر Lazenbik جوان بعنوان یک Assistant professor تازه کار که مشغول set up آزمایشگاه در زمینه تحقیقاتی‌ خود،Apoptosis،بود از موضوعی به شدت هراس داشت.او از این موضوع می ترسید که تمام آنچه مربوط به آپاپتوزیس است قبل از set up آزمایشگاهش کشف شود و از قافله عقب بماند.
(کشف شدن فرآیندهای زیستی بصورت هفته ای،چاپ شدن حداقل یک مقاله درباره ی آپاپتوزیس در هرشماره از مجلات Nature,Science و Cell و ...شما به او حق نمی دادید؟😁)
او تصمیم گرفت دغدغه اش را با prof.David Papermaster در میان بگذارد.
پروفسور Papermaster تحلیل جالبی از شرایط تحقیقات بیولوژی تا آنروز به او ارائه داد که در ادامه میخوانیم:
تحقیقات بیولوژی در دهه های اخیر تقریبا روند مشابهی را طی کرده اند. در مرحله اول تعداد اندکی دانشمند به سراغ حل مشکل یا مسئله ای می رفتند.در نتیجه ی مشاهدات معدود آنها، یافته هایی درباره ی آن موضوع بدست می آمد.(مثلا کشف آپاپتوزیس)

در مرحله بعد انتشار این یافته ها، دانشمندان دیگر را ترغیب به ادامه کار در آن موضوع می کند.در نتیجه تحقیقات بیشتر موجب کشف رابطه ی آن پدیده با دیگر پدیده ها میشود(رابطه آپاپتوزیس با سرطان)

پس از دو مرحله فوق، ناگهان افقی روشن به سمت درمان سرطان باز شده و حجم انبوهی از مقالات تولید می شود‌‌.

در ادامه تمامی یا بیشتر این تحقیقات به بن بست یا تناقض می رسند، گویی هرچه اطلاعات بیشتر می شود، مجهولات بیشتر و بیشتر میشوند!
و اما راهکار
👈روش و دید خود را عوض کن👉

🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸

https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(02)00133-2

#System_Biology
#Computational_Biology
#Bioinformatic
#Synthetic_Biology
@PrimerSBU
#ادامه
فرض کنید دولت بودجه مناسبی را برای تعمیر یک رادیو به زیست شناسان اختصاص داد. زیست شناسان از کجا شروع میکنند؟
احتمالا الگوهای زیر را دنبال میکنند:
۱) جمع آوری تعداد زیادی رادیو مشابه و سالم
۲) باز کردن رادیوها به روش آزمون و خطا
۳) دسته بندی اجزای رادیو بر اساس رنگ، اندازه و توصیف هر چه بیشتر آنها
۴) بررسی اثر تغییر صفات اجزا(مثلا رنگ) بر عملکرد رادیو(فنوتیپ)
۵) رویکرد موفق تر، حذف اجزا بصورت جداگانه و بررسی تاثیر آن بر عملکرد رادیو
۶) لشگری از زیست شناسان از همین رویکرد حذف کردن(مشابه خاموش کردن ژن ها) برای شناسایی اجزای مهمتر استفاده میکنند.
۷) عده ای دیگر هم به بررسی تمام اجزای ریز و درشت میپردازند و نهایتا تمام اجزا و روابطشان را فهرست میکنند.
ولی یک سوال مهم:
"آیا این اطلاعات به تعمیر رادیو کمک میکند؟"
💊💊💊💊💊💊💊💊💊 💊💊💊💊
در موارد معدودی پاسخ مثبت است.شعار صنعت داروسازی از همین موفقیت های معدود ایجاد شده است:
🎯 هدف را به من نشان بده🎯

اما در شرایطی که اجزای تنظیم پذیر رادیو دچار اشکال شوند(مشابه آنچه در سلول های زنده رخ میدهد) این رویکرد موفقیت آمیز‌ نمی باشد.به عبارت دیگر در این شرایط رادیو کار نمیکند زیرا چندین جز بصورت ترکیبی از حالت تنظیمی خارج میشوند و این مشکل در شکل ظاهری و ارتباطات آنها لزوما مشخص نیست.در عین حال تعمیرکار رادیو در زمان کوتاه و با هزینه کمتر رادیو را تعمیر میکند و نیازی به این همه دردسر نیست!
ولی خب، این تفاوت از کجا منشا میگیرد؟
💡زبان یا نحوه ی مدلسازی💡
زیست شناسان عادت دارند نتایج خودشان را توسط دیاگرام ها نشان دهند.مثلا پروتئین مورد نظر را در مرکز دیاگرام‌ قرار داده و ارتباطات آنرا با سایر اجزا با پیکان نمایش میدهند. این نحوه نمایش کیفی برای داده های کمی قابل استفاده نیست و بطور کلی زبان زیست شناسان سنتی ابهام زیادی دارد.در مقابل زبان مهندسین یک زبان استاندارد،مورد توافق همگانی،کمّی و دارای قوانین ثابت است. بنابراین یک مهندس در رادیو دنبال پارامترهای کلیدی مانند ظرفیت خازن میگردد نه لزوما رنگ و شکل آن.
بطور کلی همین که تعداد متغیرها از حدی بیشتر میشود(اتفاقی که در بیشتر مطالعات زیستی و غیره می افتد) دیگر مغز انسان امکان تجزیه و تحلیل آنها را ندارند و ما نیازمند یکسری ابزار تحلیلی هستیم.
بطور خلاصه، با وجود پیچیدگی بسیار سیستم های زیستی دیگر استفاده از ابزارهای سنتی پاسخگوی نیاز ما نمیباشد لذا فعلا چاره ای جز قرض گرفتن آچارهای مهندسین برای مطالعات عمیق زیستی نداریم.👷🔧

🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸

#System_Biology
#Computational_Biology
#Bioinformatic
#Synthetic_Biology
@PrimerSBU
#استخدام

برنامه‌نویس (python ,django) در موسسه زیست بنیان

🔴 مهارت‌های لازم:
- آشنا با زبان برنامه‌نویسی python و فریم‌ورک django
- تجربه پیاده‌سازی API و وب‌سرویس‌های RESTful
- آشنایی با اصول معماری، زیرساخت‌ها و تکنیک‌های برنامه نویسی وب
- آشنایی با معماری MVC
- آشنایی مناسب با Git و کار گروهی
-داشتن روحیه کار تیمی

🔴 شرایط کاری:
- ساعت کاری شناور
- محل فعالیت: خیابان انقلاب، روبروی سردر دانشگاه تهران، ساختمان پارسا، طبقه ۴، موسسه زیست بنیان

🔹 ارسال رزومه به:
m.ranjabar2009@yahoo.com
@MoRanjbarDi
#laboratory_techniques 👨‍🔬
#crystallization
#precipitation

🤔 #تبلور فرآیندی است که اتمها یا مولکولها به منظور به حداقل رساندن حالت پر انرژی خود ، در یک شبکه کریستالی سفت و محکم و کاملاً تعریف شده قرار می گیرند. کوچکترین ماده شبکه #کریستال ، سلول واحد نامیده می شود که می تواند اتم یا مولکول دیگری را برای تشکیل یک بلور ماکروسکوپی بپذیرد. در طی تبلور ، اتمها و مولکول ها با زوایای کاملاً تعیین شده به هم متصل می شوند تا شکل کریستالی مشخص با سطوح و جوانب صاف را شکل دهند. تبلور در طبیعت نیز رخ می دهد ، همچنین کاربردهای گسترده ی صنعتی در مراحل جداسازی و تصفیه صنایع دارویی و شیمیایی دارد.

🔴 انتخاب شرایط عملیاتی برای فرآیند تبلور ، به طور مستقیم بر ویژگی های مهم محصول مانند اندازه بلور ، شکل کریستال و خلوص تأثیر می گذارد. با درک فرایند تبلور و انتخاب پارامترهای مناسب ، می توان بارها و بارها کریستال هایی با اندازه ، شکل و خلوص صحیح تولید کرد و همچنین در به حداقل رساندن مضرات بار فیلتراسیون طولانی یا خشک کردن نامناسب تأثیر به سزایی خواهد داشت.

#تکنیک_های_آزمایشگاهی

🆔 @PrimerSBU
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#laboratory_techniques 👨‍🔬
#crystallization
#precipitation

#تبلور و #رسوب_دهی هر بخشی از زندگی ما ، از غذا و داروهایی که مصرف می کنیم ، تا صنایع مرتبط با تأمین سوخت را در بر می گیرد. اکثر محصولات شیمیایی کشاورزی و دارویی، مراحل مختلف تبلور را در سیر مراحل توسعه و ساخت خود طی می کنند. مواد اصلی کلیدی مانند لاکتوز و لیزین با استفاده از فرایند متبلورسازی تولید می شوند و تبلور ناخواسته هیدرات های گازی در خطوط لوله های انتقال در بخش های عمیق دریا، مهمترین دغدغه و چالش ایمنی برای صنعت پتروشیمی است.

🚩 تبلور هنگامی رخ می دهد که #حلالیت یک ماده جامد در محلول تحت تأثیر عواملی کاهش می یابد. روشهای متداول برای کاهش حلّالیت شامل موارد زیر است:

♦️ کاهش دمای محلول
♦️ افزودنی ضد حلّال
♦️تبخیر
♦️ واکنش (رسوب دهی)

✴️ انتخاب روش تبلور بستگی به تجهیزات موجود ، اهداف فرآیند تبلور و حلّالیت و ثبات حل شونده در حلال انتخابی دارد.

#تکنیک_های_آزمایشگاهی

🆔 @PrimerSBU
#biopharmaceutical 💊💉
#freeze_drying
#lyophilization

✴️ تاریخچه کاربرد خشک کردن انجمادی به عهد امپراطوری Inca باستان باز می گردد ، که مواد غذایی خود را در فصل زمستان با انجماد آنها در کوهستان حفظ می کردند، در زمانی که ، قطرات آب یخ زده تحت فشار کم بخار آب موجود در هوای اطراف کوه ها تجمع یافته و مرتفع می شود. البته این روند ، نسبتاً کند بود ، اما در طی فرآیند خشک شدن ، کیفیت مواد غذایی مانند سیب زمینی و سبزیجات به دلیل حالت انجماد آن ، حفظ می شد. فقط از زمان جنگ جهانی دوم، روش صنعتی خشک کردن برای حفظ مواد ، کاربرد یافت. به خصوص که نیاز به افزایش مدت زمان ماندگاری مواد دارویی مانند پنی سیلین و همچنین حفظ پلاسمای خون در زمان جنگ ، موجب توسعه و تولید محفظه مدرن #lyophilizer شد، به طوری که امروزه در بسیاری از صنایع مورد استفاده قرار می گیرد. یکی دیگر از کاتالیزورهای توسعه فناوری خشک کردن انجمادی ،نیاز به یافتن راه چاره ای برای افزایش مدت زمان نگهداری قهوه مازاد تولیدی ، در کشورهایی مانند برزیل در اواخر دهه 30 قرن گذشته بود. بدین منظور به وسیله محفظه ی خشک کن انجمادی ، قطرات آب یخ زده از دانه های قهوه منجمد شده جداسازی می شود. توسعه این فناوری موجب ظهور و تأسیس نامهای تجاری مانند Nescafe شد. قهوه فوری در حال حاضر شناخته شده ترین محصول تولیدی با استفاده از این فناوری است.

پس از دوره جنگ ، کاربرد این فناوری به دلیل حفظ و نگهداری بسیاری از مواد حساس به دما ، مانند مواد دارویی و مواد غذایی به محبوبیت فعلی خود رسید. در حال حاضر به تنهایی 400 ماده غذایی با استفاده از این فناوری تولید شده است.
#بیوفارما
🆔 @PrimerSBU
#biopharmaceutical 💊💉
#freeze_drying
#lyophilization

🧐 محفظه های بزرگ خشک کن انجمادی نیاز به پمپ خلأ برای از بین بردن رطوبت برای فرایند انجماد دارند. در محفظه ، ماده ای که قرار است خشک شود قرار می گیرد و سینی ها روی قفسه های خنک کننده / گرمایشی قرار می گیرند. ابتدا مواد با پایین آمدن دمای قفسه ، منجمد می شوند. مواد با تشکیل یک لایه جامد یخ زده ، منجمد می شوند. پس از انجماد ، محصول ، با بستن محفظه خشک کن ، در خلأ قرار می گیرد. این امر باعث می شود که حلّال منجمد شده ی موجود در محصول بدون عبور از فاز مایع ، تبخیر شود-فرایندی که به عنوان تصعید شناخته می شود- میزان فشار خلأ معمولی در حین خشک کردن بین 0.01-1 (mbar) است. ( نمونه آن زمانی است که آب در چنین سطوح خلأ عمیقی قرار می گیرد ؛ و وجود خلأ ، حفظ دمای بالاتر از ۲۰- درجه سانتیگراد یا پایین تر را تضمین می کند.) ضمن اینکه گرما از طریق قفسه ها به محصول یخ زده داده می شود تا روند فرایند تصعید سریعتر انجام شود. با این حال ، با گذشت زمان ، تشکیل یک لایه خشک از محصول ، به طور چشمگیری مانع این تصعید خواهد شد. این باعث می شود خشک شدن ماده منجمد شده روند نزولی داشته باشد. بنابراین در این سیستم ، یک کندانسور سرد ، تعبیه شده است که حلّال تبخیر شده را ضمن انجماد آن ، از محفظه خلأ خارج می کند. این فرآیند ، جداسازی حلّال موجود در ماده را کامل می کند. پس از اتمام مراحل خشک کردن ، سینی ها از محفظه خشک کن خارج شده و ماده خشک شده از سینی خارج می شود ، اغلب ، مقداری از ماده خشک شده با خرد کردن به پودر ریز تبدیل می شود. تاسیسات در مقیاس بزرگ می تواند صدها سینی را در خود جای دهد. بنابراین علاوه بر مدت زمان طولانی خشک شدن ، رسیدگی و مواظبت دائمی و فشرده ، لازمه اصلی استفاده بهینه از این فناوری محسوب می شود.
#بیوفارما
🆔 @PrimerSBU
Forwarded from بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
✴️شاید تا حالا کلمه ی بیوتکنولوژی به گوشت نخورده باشه... یا شایدم شنیدی و چیز زیادی راجبش نمیدونی‼️
اگر‌ میخوای به صورت مختصر راجبش بدونی این کلیپ ۳ دقیقه ای رو اصلا از دست نده
✴️کاری از انجمن علمی بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی
❇️گوینده : موژان اسماعیل لو
Forwarded from بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی
🧬🔬🦠 شرحی از رشته ی بیوتکنولوژی:

بیوتکنولوژی ، به عنوان یکی از چهار رشته پیشتاز علمی در جهان با الهام از فرآیندهای بیولوژیک به حل مسائل و مشکلات از طریق خلاقانه ترین روش های ممکن می پردازد و سعی دارد زندگی بهتری را در این کره ی خاکی میسر سازد

🔶بیوتکنولوژی دکتری پیوسته:


🔹قبولی:

داوطلبان با شرایط رتبه کشوری زیر پانصد کنکور سراسری درصورت موفقیت در مصاحبه حضوری دکترای پیوسته بیوتکنولوژی، می توانند به مدت هشت سال در دانشگاه تهران به علم اندوزی در این رشته پیشرو در جهان بپردازند.


🔶زیست فناوری:


🔹دانشگاه ها:

از سال ۱۳۹۴ طبق مصوبه وزارت علوم ، بیوتکنولوژی با عنوان " زیست فناوری " در مقطع کارشناسی نیز در دانشگاه های برتر کشور مثل شهیدبهشتی ، تهران ، الزهرا ، خوارزمی و .. ارائه می گردد.


🔹تفاوت با رشته ی دکتری پیوسته بیوتکنولوژی:

دروس مصوب این رشته تا انتهای دوره کارشناسی با دانشجویان دکترای پیوسته بیوتکنولوژی تفاوت چندانی ندارد مگر در چند واحد اختیاری. هم چنین دانشجویان زیست فناوری پس از اخذ مدرک کارشناسی باید مجددا در آزمون کنکور برای ورود به مقطع کارشناسی ارشد شرکت کنند.


🔹مقاطع کارشناسی ارشد و دکترا :

علاقه مندان به نوآوری می توانند با شرکت در آزمون های سراسری برای ادامه تحصیل در مقاطع بالاتر و گرایش های گوناگون بیوتکنولوژی مثل بیوتکنولوژی دریایی ، بیوتکنولوژی میکروبی ، بیوتکنولوژی سلولی ، بیوتکنولوژی کشاورزی ، بیوتکنولوژی صنعتی ، نانوبیوتکنولوژی و یا رشته های مختلف مدیریت یا رشته های مرتبط با وزارت بهداشت مانند بیوتکنولوژی پزشکی‌ و بیوتکنولوژی دارویی اقدام نمایند .


🔹پایه و اساس بیوتکنولوژی:

بیوشیمی ، میکروبیولوژی و زیست سلولی-مولکولی ، بیوتکنولوژی را ساخته و نحوه به کارگیری و دگراندیشی به این علوم است که با حل مسائل و دغدغه های زندگی روزمره بشر ، به بیوتکنولوژی معنا می بخشد.


🔹مزیت ها نسبت به سایر رشته های علوم پایه:

گستردگی و جذابیت بالای گرایش های بیوتکنولوژی در مقاطع ارشد و دکترا که از مزیت های ‌شاخص این رشته است ، دستاوردهای بلندمدت متنوعی را برای علاقمندان به پژوهش‌ و آگاهی، مهیا می سازد . البته این به معنی فقدان فرصت های شغلی در مقطع کارشناسی نیست؛ رویای تبدیل ایده های نوین به محصول یا خدمت، در قالب شرکت های فناور دانش بنیان، با برقراری پیوندی عمیق میان دانش پایه ی زیست شناسی و بینش مهندسی، با هر مدرک تحصیلی بیوتکنولوژی درسراسر جهان امکان پذیر است .

🔹ارزش بازار:

رشد چشمگیر بازار بیوتکنولوژی توجه بسیاری از سرمایه گذاران را به خود جلب نموده است.
طبق آمار منتشر شده از سوی Grand View Research، ارزش تجاری بیوتکنولوژی تا سال ۲۰۲۵ میلادی ، به بیش از ۷۲۷ میلیارد دلار خواهد رسید که بیانگر رشد قابل توجه ۷ درصدی این صنعت نوین اما پویاست.
درحال حاضر بیوتکنولوژی تنها در زمینه دارویی ، ۱۴۰ میلیارد دلار از بازار تجاری ایالات متحده آمریکا را به خود اختصاص داده است.


🔹آینده و فرصت های شغلی:

اشتغال در آزمایشگاه های تشخیصی سلامت، آزمایشگاه های کنترل کیفی غذا و دارو، پژوهشکده ها و موسسات تحقیقاتی کشاورزی و محیط زیست، مراکز مربوط به پرورش دام و طیور و جانوران آبزی، پروژه های علمی – پژوهشی و فعالیت در چارچوب هیئت علمی دانشگاه ها از دیگر فرصت های شغلی فارغ التحصیلان بیوتکنولوژی به شمار می آیند.
پپتیدهای ضدمیکروبی و ضدسرطانی (#ادامه)

🔸سیکلوتیدها

❇️اینها پپتیدهای ماکرسایکلیک هستند که حدود 30 اسیدآمینه طول دارند و به طور معمول از گیاهان خانواده‌ Rubiaceae و Violaceae خالص‌سازی می‌شوند و گره سیستئینی در ساختار خود دارند. این گره پایداری شیمیایی و زیستی زیادی را به سیکوتیدها می‌دهد، که در فرآیند توسعه یافتن داروها و در طراحی بخش‌های دارویی بسیار قابل ملاحظه است.💊
🔺گفته می‌شود که سیکلوتیدها در سیستم دفاعی میزبان دارای اهمیت هستند و تا g/kg 1 از محتوی مواد سیکلوتید برگ را می‌توان بیان کرد. سیکلوتیدها برای درمان بیماری HIV، داروی ضد کرم، حشره‌کش کاربرد دارند.

🌡درمان‌ها با پایه پروتئینی یا آنتی‌بادی، بازار دارو برای درمان بیماری‌های ایمنی و عفونی را دربرگرفته‌اند. بیش از 30% از محصولات دارویی به صورت زیستی هستند که بیماری‌های خودایمنی و عفونی و سرطان را هدف گرفته‌اند. هرچند، بخش بزرگی از این موارد با ایمنی مرتبط با هشدارهای سلامتی همراه است.

📌بیش از 60 داروی تایید شده با پایه پپتیدی در بازار وجود دارد و در حدود 140 عدد در مرحله آزمایش‌های بالینی می¬باشند. چیزی در حدود 100 ایمن سازی بیماری خودایمنی به وسیله پپتیدها درحال حاضر وجود دارد و شبیه‌سازی پپتید حوزه¬ای است که پتانسیل بسیار بالایی دارد.
🔻پپتیدهای شبیه‌سازی شده ترکیباتی هستند که مولفه‌های حیاتی یا فارماکفور آنها یک پپتید طبیعی یا پروتئین را شبیه‌سازی می‌کند اما توانایی برقراری ارتباط با هدف زیستی را حفظ کرده و تاثیر بیواکتیوی مشابهی را تولید می‌کند.✳️

#پپتید
@Primersbu
#اخبار_هفته
چگونه انسان اولیه از ابتلا به ایدز بر حذر بود
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190822141901.htm


چند توانی: "اثر پروانه‌ای" کشف شد🦋

💡 اثر پروانه‌ی: ارتباط بین پدیده‌های چند توانی و ساختار های محافظت کننده‌ی تلومرها در انتهای کروموزوم‌ها، نوعی اثر پروانه‌ای را پیشنهاد میدهد که در ان پروتئنی خاص در محل تلومر در انتهای کروموزوم، یک نقش بسیار جامع در ژنوم دارد.
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190820101431.htm


پلاسمودیوم فالسی پاروم، همچنان با اثرات جانبی خود موفقیت درمان مالاریا در آفریقا را تهدید می‌کند🦟
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190822141916.htm

یک تک‌ژن که تعیین کننده‌ی حس بویایی یا بینایی خوب در مگس است🦟👃👀
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190822141950.htm
🏯🌿💡 استفاده از بیومیمتیک در معماری:


🔶 The Eiffel tower & Bones:


💡 استخوان های ما چه شباهتی به برج ایفل دارند؟

🔻برج ایفل ۳۲۴ متر ارتفاع و ۱۲۵ متر عرض دارد.

❗️با این وجود حدس میزنید اگر این برج را منسجم کرده به صورت یک کره، شعاع کره چند متر میشود؟

کره ای به شعاع ۶ متر!!

✖️ و در لینک زیر محاسبات ریاضی آن را میابید:
https://www.wired.com/wp-content/uploads/2015/03/eiffel-tower-ball-diameter.png?intcid=inline_amp

❗️و همینطور اگر استوانه ای در اطراف این برج تصور کنید که کاملا انتهای آن را در بر بگیرد و تا بالا ادامه یابد هوای داخل استوانه وزنش از فلز موجود داخل آن (یعنی کل فلز برج) سنگین تر خواهد بود!!

✖️ در لینک زیر محاسبات ریاضی آن را میابید.
https://www.wired.com/wp-content/uploads/2015/03/eiffel-tower-air-weight-calculation.png?intcid=inline_amp

🔻با توجه به این محاسبات میبینید که برج ایفل به نسبت ابعادش بسیار بسیار سبک است.

چطور چنین چیزی امکان پذیر است؟

🇫🇷 منتقدان فرانسوی آن زمان ایفل را به باد انتقاد بستند و برج او را به اسکلتی پوچ و توخالی تشبیه کردند.

🔸 البته آنها به عنوان انتقاد این تشبیه را میکردند اما در حقیقت تمام نبوغ این سازه در این واژه خلاصه میشود.

👫 استخوان های ما در خارج محکم و در داخل اسفنجی اند و از دوایر متحدالمرکزی تشکیل شدند به نام osteon. وقتی بیشتر زوم کنیم میبینیم که osteon ها نیز از از رشته هایی به نام فیبریل تشکیل شده اند و خود این رشته ها نیز از فیبر تشکیل شده اند که ۳ رشته ی مستقل است که اگر اینها را نیز از هم باز کنیم به ابتدایی ترین جزء تشکیل دهنده ی استخوان هایمان میرسیم؛ یعنی رشته های طویل کلاژن.

این برج هم با همین فلسفه ساخته شده:

🔶Structural hierarchy.

🔺یعنی ساختن چیزی با شکل ها و موادی که به مرور ریز شدن در آن، همانند یکدیگرند.

برج ایفل نیز دقیقا به همین صورت مثلث در مثلث در مثلث است و در نهایت بیش از فلز در این ساختار حفره وجود دارد.

حال برایمان سوال میشود که چنین ساختار سبکی چطور وزن خود و فشار باد را تحمل میکند؟

🔻برای یافتن پاسخ به این سوال نیز به استخوانهایمان مینگریم.
به استخوان های ما فشار و وزن زیادی وارد است؛ اما به بخش هایی فشار بیشتر و به بخش هایی دیگر فشار کمتری وارد میشود و استخوان ها بر اساس این فشارها و نیروها ساخته میشوند.
در بخش هایی که نیروی بیشتری وارد است محکم تر و در بخش هایی که نیروی کمتری وارد میشود توخالی تر و سبک تر میشوند.

🌬 برج ایفل نیز توسط باد شکل گرفته.

🔻در بخش هایی که نیروی باد بیشتر بوده این ساختار سبک و توخالی، منسجم تر شده و براساس شدت نیروی بادی پس از سالها انحنایش کاملا با نیروهای وارده بر آن سازگاری پیدا کرده و اکنون سالهاست که استوار در مقابل باد قرار گرفته.

#بیومیمتیک @PrimerSBU
طرح اولیه ی ایفل توسط maurice koechlin.
ساختارهای مثلث در مثلث در مثلث برج ایفل.
حدود ۲۷ سال پیش چندین کشور تصمیم گرفتند تا نقشه ی ژنوم انسان را تهیه کنند. تهیه ی این نقشه ژنی اهمیت بسزایی داشت چرا که میتوان از آن در درمان بیماری ها و یافتن محل جهش ها کمک گرفت. روش پایه ای که در این پروژه بکار گرفته شد، روش توالی یابی Sanger بود. این روش در ۱۹۷۷ توسط Peter Sanger و همکارانش ابداع شد. این پروژه با استفاده از این روش حدود ۱۳ سال طول کشید که در سال ۲۰۰۱، draft ژنوم و در ۲۰۰۳ نسخه ی کامل آن عرضه شد. مجموع هزینه های این پروژه حدود ۳ میلیارد دلار برآورد شده است.
طی سالها تحقیقات فراوان، مجموعه روشهایی ابداع شد که مدت زمان توالی یابی ژنوم انسان را به یک روز و هزینه های آنرا به حدود ۱۰۰۰ دلار کاهش داد. مجموعه ی این روشهای شگفت انگیز، NGS* یا توالی یابی نسل آینده نام دارند.

تکنیک های NGS پلتفرم های مختلفی دارند ولی بطور کلی اساس کار آنها تهیه قطعات کوچک و بسیار زیاد(reads) از یک ژنوم مرجع(Refrence genome)، و آنالیزهای بیوانفورماتیکی با استفاده از تطابق این قطعات با ژنوم مرجع میباشد. طیف عملکرد NGS توالی یابی کل ژنوم یا صرفا قطعات اگزون یا یک یا چند ژن خاص را در بر میگیرد.
مجموعه تکنیک های NGS شامل :
Sequencing by Synthesis

Sequencing by Ligation

lon semiciductor, ...
می باشد. اما آنچه امروزه در ژنتیک انسانی استفاده میشود روش

"Sequencing by Synthesis"

است که توسط شرکت illumina توسعه یافته است.

آنچه هر دو تکنیک Sanger و NGS از آن الهام گرفتند استفاده از ماشین کپی DNA** طی تقسیم هر سلول بود. نکته کلیدی در هر دو روش استفاده از نوعی باز آلی میباشد که با ماده فلوئورسنت برچسب گذاری شده و پس از اتصال به DNA بصورت نوعی قفل عمل کرده و مانع اتصال بازهای آلی دیگر میشود. مجموعه این نوع بازهای آلی"ddNTPs"*** نام دارند. البته تفاوت این دو روش در آن است که در روش Sanger حدود ۱٪ بازهای آلی محیط ddNTP بودند ولی در NGS همه بازهای آلی در دسترس ddNTP هستند که همین موجب تولید میلیون ها قطعات خوانده شده کوچک(Reads) خواهد شد.
امروزه شرکت هایی دستگاه های NGS را برای ما میسازند تا این تکنیک ها را بهتر و سریعتر انجام دهیم. از جمله این شرکت ها
illumina

Thermofisher Scientific

BGI Genomics, ...
میباشند.

ادامه دارد...
🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸🌸

* Next Generation Sequencing

**DNA Replication Machinary

*
** Dedeoxy nucleotides triphosphates



📚 مراجع و مطالعه بیشتر:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4633438/


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3841808/


#NGS
#Bioinformatic
#Sequencing

@PrimerSBU
♨️ اختتامیه رویداد #ره_زیست
🧬 نخستین مسابقه تخصصی کاربرد علوم مهندسی در زیست‌فناوری

🗓 چهارشنبه، ۶ شهریور، ساعت ۱۴
🏠 سالن آمفی تئاتر دانشکده مکانیک دانشگاه علم و صنعت

♦️ معرفی و تقدیر از تیم‌های برگزیده ارائه پروژه‌های برتر
🔸 همراه با سخنرانی آقای دکتر قانعی، دبیر ستاد توسعه زیست فناوری
🔹 با حضور شتاب‌دهنده‌ها، صندوق‌ها، شرکت‌ها و مراکز فعال در حوزه زیست فناوری

علاقه‌مندان جهت شرکت در این برنامه می‌توانند به آیدی تلگرامی @rahzistadmin پیام دهند.

🆔 @rahzist