#سلولهای_بنیادی
🔎سلول های بنیادی پرتوان القایی( ipsc ) چیست ؟📎#ipsc مخفف induced pluripotent stem cellاست.
سلول های بنیادی پرتوان مشتق از جنینی با اینکه خاصیت خودنوزایی نامحدود و تمایز به انواع بافت های اکتودرم و مزودرم و آندودرم را دارد اما با مشکل رد پیوند مواجه هست.⁉️ ipsc با چه جریانی کشف شد ؟💉💊🔬
⭕️در سال 2006 میلادی، پژوهشگران ژاپنی ( یاماناکا و تاکاهاشی) تولید نوع جدیدی از سلول‏های بنیادی پرتوان را گزارش کردند که مشکل ایمونولوژیک سلول‏های بنیادی جنینی در مورد آن‏ها مطرح نبود، زیرا از سلول‏های خود فرد دهنده تولید می‏شدند.
🔺آن‏ها این سلول‏ها را که با بیان ویروسی چهار ژن مهم پرتوانی ( oct4 , sox2,klf4,CMYc) در سلول‏های سوماتیک تولید شده بودند، سلول‏های بنیادی پرتوان القایی ( ipsc ) نام دارند.🔻این سلول‏ها تمام قابلیت‏های سلول‏های بنیادی جنینی از جمله توانایی تولید یک جاندار کامل را دارند، از این رو در ضمن نداشتن مشکل ایمونولوژیک، دارای تمامی کاربردهای «بالقوه»‏ی سلول‏های بنیادی جنینی شامل غربالگری داروها و مدل‏سازی بیماری‏ها هستند.
📌روش تولید ipsc توسط تیم یاماناکا

آنها فیبروبلاست کشته شده ی موش را تحت شرایط خاصی به سلول های جنینی ES تبدیل کردند که خواص سلول های بنیادی پرتوان را دارد که مشکل ایمونولوژیکی رد پیوند هم ندارد .در کل این تیم ژاپنی با عدم استفاده از خود سلول های جنینی و در عوض تبدیل سلول های غیر جنینی مثل فیبروبلاست های خود فرد بیمار تحت شرایط خاصی به سلول های بنیادی پرتوان همان ویژگی ها و کاربرد را برای درمان خود فرد تولید میکنند ‌.آنها با آزمون و خطا ۲۴ ژن دخیل در پرتوانی و ورود آنها به نمونه های موش و بررسی سیگنال های نولید شده و عملکرد سلول ها به ۴ ژن اصلی که نام برده شد رسیدند.
🔵یک سری فاکتور های رونویسی مهمی برای ایجاد وضعیت پرتوانی در سلول هایی با منشا غیر جنینی که پروتیینی هستند بیان۴ نوع ژن های خاصی که #یاماناکا معرفی کرده بود را منجر میشوند عضو اصلی این گروه فاکتورها ، فاکتور رونویسی ژن oct4 است که pou domain نامیده میشود ، که این فاکتور از homeodomain ها که توالی هایی از DNA با حدود ۱۸۰ bp تشکیل شده است که در توسعه الگوهای آناتومی دخیل هستند محافظت میکنند.
💡💊💉ترکیبی که انتظار میرود در تمام سلول های بنیادی یافت شود مجموعه ای از #تلومرازها است .تلومرازها در پایانه DNA دورشته ای یک توالی ۱۴ تا ۱۶ نوکلوتیدی به این صورت TTAGGG که #تلومر نام دارد و با ناحیه ی داخلی تر DNA ساختار حلقه ای T loop تشکیل میدهد .انتهای مولکول های خطی معمولا چسبنده هست اما🔹 وجود تلومر چسبندگی را کاهش میدهد 🔸 از تخریب کروموزوم توسط آنزیم های #اگزونوکلاز( شکستن پیوند های فسفودی استر) جلوگیری میکند🔹جایگیری کروموزوم در هسته را انجام میدهد🔸ژن های انتخابی مجاور خود را خاموش میکند .
✳️در طول تقسیمات با کاهش تدریجی طول تلومر مواجه میشویم چون تلومر توانایی تولید تلومراز را در طول تمایز از دست میدهد طول آن کاهش میابد که این اتفاق باعث مرگ سلولی میشود .
✅در نتیجه وجود تلومراز ها برای پرتوان کردن سلول های بنیادی در واقع از مرگ برنامه ریزی شده ی سلول میتواند جلوگیری کند البته باید توجه داشت که تولید بیش از حد آنزیم های تلومراز باعث #سرطان میشود .
🖋و اما برای وارد کردن این ژن های عامل پرتوانی از چندین روش استفاده میکنند که بهترین و کم هزینه ترین روش آن از طریق وکتورهای ویروسی هست برای مطالعه بیشتر در ارتباط با نقش #وکتورهای_ویروسی نشریه را مطالعه بفرمایید.
📌@PrimerSBU

#سلولهای_بنیادی
✅آنچه درباره سلول های بنیادی باید بدانیم ‼️
@PrimerSBU

#بیوتکنولوژی_مولکولی
🔺️جلسه دوم بیوتکنولوژی مولکولی
🔸️ بعد از آشنایی با پروژه ژنوم انسانی و همچنین کلونینگ DNA میخواهیم به کتابخانه ژنی بپردازیم.
🔎 کتابخانه ژنی چیست؟
در لغت واژه کتابخانه به محلی گفته میشود که محل جمع آوری انواع کتاب ها و دانشنامه ها و... است. کتابخانه ژنی هم دقیقا همین معنی را می دهد. کتابخانه ژنی به دو قسم است:
1)کتابخانه ژنومی
2)کتابخانه cDNA
🔎تفاوت این دو کتابخانه ژنی چیست؟
کتابخانه ژنومی حاوی تمامی قطعات DNA در مجموع ژنوم جاندار است و کتابخانه cDN ، مجموع mRNAهای بیان شده هستند که دوباره ترجمه و به cDNA تبدیل شده اند.لازم به ذکراست که کتابخانه ژنومی هم به دو دسته:1) کتابخانه ژنومی هسته ای و 2) کتابخانه ژنومی اندامی تقسیم میشوند.
🔬این کتابخانه ژنی برای شناسایی ژن های متفاوت و بیان کردن این ژن ها و آزمایش پروتئین های متفاوت و ... کاربرد دارد.
🔎چگونه کتابخانه ژنی ساخته میشود؟
اولین قدم این کار و یکی از موضوعات اساسی بیوتکنولوژی مولکولی، ایزوله کردن ژن هایی است که پروتئین های متفاوت را رمز گذاری میکنند.این پروتئین ها در صنعت، کشاورزی و پزشکی استفاده میشوند. در پروکاریوت ها ژن های ساختاری یک زنجیره بلندی از کدهای DNA های ژنومی می سازند، در حالیکه در یوکاریوت ها مناطق کد گذاری شده(اگزون ها) ژن های ساختاری از مناطق کدگذاری نشده (اینترون ها ) جدا شده اند. در نتیجه روش های متفاوت کلونینگ برای یوکاریوت ها و پروکاریوتها لازم است. در پروکاریوت ها، توالی مطلوب عموما یک بخش خیلی کوچک است (تقریبا 0.02 % ) از کل مجموعه DNA کروموزومی است.
📌حال مشکل اینجاست که چطور توالی هدفDNA انتخاب و کلون شود؟برای این کار، DNA کامل جاندار،ژنوم، توسط اندونوکلئاز محدودکننده (آنزیم محدود کننده) بریده می شود و هر قطعه به یک وکتور وارد می شود، سپس کلون خاصی که توالی هدف DNA را حمل میکند باید شناسایی، ایزوله و مشخص شود.پروسه تقسیم کردن DNA به عناصر قابل کلون و وارد کردن آنها به سلول میزبان ساختن کتابخانه است. یعنی کتابخانه ژنی شامل کلون های متفاوت از قطعات متفاوت DNA است. یکی از راه های ساخت کتابخانه ژنی این است که ابتدا DNA توسط آنزیم محدود کننده با توانایی ایجاد چهار برش مانند Sau3AI بریده شود، در این حالت DNA تقریبا هر 256 bp برش داده میشود. شرایط طوری است که دقیقا همه ی مولکول های DNA برش نمی خورند بنابر این سایز های متفاوتی از قطعات DNA تولید میشود. هرچه دوره این واکنش ها (قطع کردن ها، در متن اصلی از کلمه هضم استفاده شده که به معنی تجزیه زنجیره های DNA است و دراین متن از کلمه"برش" استفاده کرده ایم) گسترش یابد، قطعات کوچکتر میشوند.
برای اینکه مطمئن شویم تمامی ژنوم و یا بیشتر آن در کلون ها ی کتابخانه هستند باید مجموع DNA وارد شده به کلون ها 3 یا 4 برابر اندازه کل DNA ژنوم باشد برای مثال اگر ژنوم 6^4*10 bp باشد و سایز متوسط ژن های ورودی به وکتور ها 1000 bp باشد، 12000 کلون نیاز است تا 3 برابر کل ژنوم، قطعات کلون شده داشته باشیم یعنی 3[(6^4*10)/3^10] برای ژنوم انسانی (9^3.3*10 bp) تقریبا 80000 کلون کروموزوم مصنوعی باکتریایی که سایز متوسط ژن ورودیشان 150000 bp است کتابخانه ای 4 برابر ژنوم میسازند. چون آنزیم های محدود کننده رندوم انتخاب نمیشوند و فقط قطعات خاصی را برش می دهند ممکن است گاهی قطعاتی ساخته شوند که بسیار بزرگ باشندو نتوانند وارد وکتور شوند. پس ممکن است گاهی پیدا کردن ژن مورد نظر سخت و یا حتی غیر ممکن باشد.چون کتابخانه ژنی کامل نیست و برای حل این مشکل دانشمندان از آنزیم های محدود کننده متفاوت در ساخت کتابخانه استفاده می کنند.
📌 گفتیم ازاهداف کتابخانه ژنی بررسی عملکرد ژن های متفاوت و دسترسی به قطعات متفاوت مورد نظر ما است
🔬 با تمام این ها یکسری از توالی ها هیچ گاه شناسایی نشده اند حتی با آزمایش های متفاوت دانشمندان این توالی ها را شناسایی نکرده اند... در ادامه کلیپی راجع به این DNA های سیاه (Dark DNA) میبینیم.
@primersbu

#بیوتکنولوژی_مولکولی
🔺️در مورد DNAسیاه چی میدانید؟! ژن های گمشده یا از بین رفته ؟!
@primersbu

این همه آدم رفتند و نیامدند
فقط یک نفر است که رفت و هنوز هم در تاریخ میگویند : نیامد نیامد
ای اهل حرم میر و علمدار نیامد ...

فرا رسیدن تاسوعای حسینی را به شیفتگان حضرتش تسلیت عرض میکنیم.
@primersbu

#کارگاه_آموزشی
📌نمایشگاه ایران فارما مصلی تهران
💰۱۵۰ هزار تومان
🗓سه شنبه ۹۷/۷/۳
⏰۹تا۱۲....۱۴ تا۱۷
@PrimerSBU

#فناوری_های_همگرا

📋قسمت چهارم
📕#نقش_علوم_شناختی_و_فناوری_اطلاعات_همگرایی

🔶فناوری اطلاعات با کمک روش‌های جدید رایانه‌ای برای پردازش اطلاعات و اجرای مدل‌ها، به کمک فناوری‌های نانو، بیو و علوم شناختی می‌آید. این روش‌ها برای هر سه فناوری بسیار حیاتی هستند، به‌طوری‌که با کنترل دقیق الگوسازی و برخورد مولکول‌ها باعث ارتقای فناوری نانو شده و به کمک مدل‌سازی واکنش‌های شیمیایی بیوفناوری را ارتقا می‌دهد.

🔶علوم شناختی می‌توانند از طرق مختلف فناوری‌ها و علوم دیگر را ارتقا دهند. ازجمله آشناترین کاربردهای این علوم در سایر فناوری‌ها می‌توان به استفاده از تئوری بازی برای ماکزیمم‌سازی سود و کاهش هزینه‌ها و یا استفاده از مدل‌های مختلف برای توجیه مسائل اقتصادی اشاره کرد. این علوم در حقیقت با تکیه‌بر علوم آماری و احتمال به تحقیقات کمی و درک بهتر دینامیک اجتماعی کمک می‌کنند.

T.me/primerSBU
🔍 دیگه نمیخواد برین چیز جدیدی ببینین صرفا منبع زدم👇
🔗 http://nbic.isti.ir/index.php?ctrl=paper&actn=paper_view&lang=1&id=3516

#فناوری_های_همگرا

📋قسمت پنجم
📕#تاریخچه_علوم_همگرا_در_کشور_های_پیشرفته

T.me/primerSBU

منبع : سایت ستاد توسعه علوم همگرا ، معاونت علمی ریاست جمهوری

#سلولهای_بنیادی_پرتوان_القایی
⭕️معرفی پایه ای ipscs
@PrimerSBU

#سلولهای_بنیادی
📄معرفی مقاله
📌روش های پرتوان کردن سلول های بنیادی
#رتروویروس

Derivation of induced pluripotent stem cells by retroviral gene transduction in mammalian species. - PubMed - NCBI
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubmed/22907488/

✳️برای کسب اطلاعات بیشتر درباره وکتور های ویروسی به شماره دوم نشریه دانشجویی پرایمر مراجعه کنید .

🔅با ما همراه باشید🔆
@PrimerSBU

🍎🍏
#سیب_نوین
#سیب_آرکتیک
#سیب_قهوه_ای_نشونده
#خاموشی_آنزیم
#بیوتک_کشاورزی
در شماره دوم پرایمر از این موضوع بیشتر خواهیم خواند ..
🍏🍎
@primersbu

#کارگاه_عملی

💰 ۱۹۰۰۰۰ تومان

جمعه ۲۰ مهر ۹۷

محل برگزاری : #کرج - #پژوهشگاه_مواد_و_انرژی

http://T.me/primerSBU


#بیوتک_پزشکی
🔍💊💉🌡🔬
📢محققان دانشگاه کمبریج دریافتند در کبد نوعی کوسه ماهی موسوم به سگ ماهی، ترکیباتی وجود دارد که امکان درمان پارکینسون را فراهم می کند.‼️

✅بر اساس مطالعات ترکیبی موسوم به squalamine که در کبد سگ ماهی یافت می شود، علاوه بر این که مانع تشکیل پلاک های سمی موسوم به Lewy Bodies در مغز بیماران مبتلا به پارکینسون می شود، از آسیب رسانی پلاک های موجود در مغز نیز جلوگیری می کند. 

🔹🔸
آزمایشات بالینی این ترکیبات به عنوان دارویی برای مقابله با سرطان و بیماری های چشمی در آمریکا در حال انجام است. یکی از محققان انگلیسی نیز در تلاش است تا آزمایشات بالینی اولیه این ترکیب را به عنوان داروی پارکینسون آغاز کند. 
🔸🔹
آزمایشاتی که تاکنون روی سلول های انسان و کِرم ها صورت گرفته نشان می دهد که squalamine می تواند داروی ارزشمندی برای درمان بیماری پارکینسون باشد. 
ترکیب squalamine خاصیت ضد میکروبی دارد و در دهه 1990 میلادی توسط متخصصانی که به دنبال علت توانایی بسیار زیاد سگ ماهی در مبارزه با عفونت ها بودند، در بافت کبد این نوع کوسه ماهی شناسایی شد. در حال حاضر محققان قادرند squalamine را به طور مصنوعی در آزمایشگاه تولید کنند.
🔸🔹
پارکینسون پس از آلزایمر شایع ترین بیماری سیستم اعصاب است که بر اثر کاهش دوپامین و اختلال جسم سیاه مغز ایجاد می شود. جسم سیاه پیام های عصبی را از طریق نخاع به عضلات مختلف ارسال می کند و این فرآیند از طریق ماده شیمیایی دوپامین صورت می گیرد و باعث اختلال در تعادل و کنترل عضلات می شود. روش های رایج کنترل این بیماری، داروی هایی هستند که با تحریک مغز، به ترشح دوپامین کمک می کنند. این روش ها بیماری را درمان نمی کنند، بلکه علایم را کاهش می دهد و پاسخ آن روی افراد مختلف، متفاوت است. 
بیماری پارکینسون معمولا با لرزش یک دست آغاز می شود و به تدریج اکثر اندام را درگیر می کند. حدود 10 میلیون نفر در سراسر جهان به این اختلال مبتلا هستند. 
🔸🔹
به گزارش مرکز پیشگری و کنترل بیماری آمریکا، در این کشور از هر 500 نفر یک نفر به این بیماری مبتلا است. احتمال ابتلا به پارکینسون در مردان 1.5 برابر زنان است.
گزارش کامل این تحقیقات در نشریه Proceedings Of The National Academy Of Sciences منتشر شده است. 

#بیوتکنولوژی_پزشکی
🔍🔬💊🌡

@PrimerSBU

#بیوتک_پزشکی
💊🔬🌡💉

📌📋مطالعات جدید انجام شده راجع به منشا و دلیل بیماری پارکینسون نشان می دهد که علم پزشکی تا به حال در مورد منشا بیماری پارکینسون اشتباه بزرگی مرتکب شده است،این مطالعات نشان می دهد که منشا شروع بیماری پارکینسون دستگاه گوارشی انسان می باشد و نه مغز او.
🔹🔸
به گزارش کلیک،تا به امروز پزشکان برای مطالعه بر روی دلایل و عوامل موثر در بیماری پارکینسون به سراغ مطالعه مغز فرد می رفتند و این در حالی است که مطالعات جدید انجام گرفته بر روی موش های آزمایشگاهی ثابت می کند که هر آنچه که پزشکان تا به حال به دنبال آن می گشتند را از این به بعد باید در دستگاه گوارشی افراد دنبال کرد
🔹🔸
در واقع این یافته جدید می تواند خیلی از نقاط مبهم مرتبط با پارکینسون را توضیح دهد،از جمله این مسائل مشکلات مشترکی است که همه مبتلایان به پارکینسون به آن اشاره می کنند،یکی از این مسائل مشترک بروز مشکل یبوست است که اکثر بیماران پارکینسون یک دهه قبل از شروع علائم پارکینسون آن را تجربه می کنند.
@primerSBU

#آزمایشگاهی 💉🔬
⭕️تست سمیت : MTT assay

این روش بررسی اثر cytotoxisity توسط رنگ سنجی است .و جایگزینی برای روش رادیواکتیو است و برای بررسی اثر یک سری شرایط و ماده که ممکن است اثر تحریکی یا مرگ و میر بر روی سلول داشته باشد استفاده میشود .
🔧🔬💉💊🌡
پودر MTT یک نمک تترازولیوم محلول در آب است .وقتی این ترکیب در محیط کشت فاقد فنول red یا بافر PBS حل شود ترکیب زردرنگی ایجاد میکند .

💭اساس این تست: شکستن نمک MTT توسط آنزیم سوکسینات دهیدروژناز میتوکندریایی سلول های زنده است .در اثر این شکست بلور های کریستال نامحلول فورمازان ارغوانی رنگ ایجاد میشود که توسط DMSO ( دی متیل سولفوکساید) یا ایزوپروپانول به صورت محلول در می آید .
🔧🔬💉💊🌡
📎هر چه سلول سالم تر و سمیت کمتری داشته باشد رنگ ارغوانی تولید شده حاصل از تولید فورمازان بیشتر است .

📌با استفاده از دستگاه ELISA reader جذب نوری رنگ ارغوانی حاصل از فورمازان را در طول موج های 490 تا 540 nm اندازه میگیرند البته بهترین طول موج برای جذب 570 nm است .

✳️برای دریافت پروتکل انجام این تست به سایت مراجعه کنید 👇👇👇
https://www.abcam.com/kits/mtt-assay-protocol

#آزمایشگاهی
#تست MTT
@PrimerSBU

#بیوتکنولوژی_مولکولی
#جلسه_سوم
#بخش_اول
🔸️ اپی ژنتیک موضوعی است که تغییرات توارثی در بیان ژن را مطالعه میکند که در تغییر توالی DNA دخیل نیستند.در یک دهه گذشته، محققان نشان داده اند که تنظیمات اپی ژنتیک نقش مهمی در رشد سلولی، تمایز زدایی، بیماری های خود ایمنی، و سرطان دارد. مکانیزم اصلی اپی ژنتیک شامل پدیده شناخته شده: متیله کردن DNA، اصلاح هیستونی، و تنظیم از طریقRNA های کد نشده، نوعی تنظیم که اخیرا شناسایی شده است و حوزه تحقیق های مداوم و متمرکز است.عموما تصور میشود که اکثریت نسخه های انسانی ترجمه نشده اند ولی تعداد کثیری از آنان با این وجود عملکرد های حیاتی را برعهده دارند. RNA های کد نشده دسته ای از RNA ها هستند که پروتئین های عملکردی را کدگذاری نمی کنند و اساسا برای تنظیم بیان ژنی در مرحله پسارونویسی نظر گرفته میشوند. اگرچه، در مجموع ، آزمایشات متنوع سال های اخیر بیان میکند که miRNA, piRNA, siRNA ,lncRNA ها، رایج ترین RNAهای تنظیمی هستند، و قابل توجه اینکه شواهد زیادی در حال به وجود آمدن است که بیان میکند:RNAهای کد نشده نقش مهمی در کنترل اپی ژنتیک برعهده دارند. بنابر این RNAهای کد نشده نقش حساس RNA درتنظیم بیان ژنی را برجسته میکند.

🔎 اپی ژنتیک چیست؟
📌 مطالعه اختلافات سلولی و فیزیولوژیکی است که به خاطر تغییر در توالی DNA پدید نمیآید، اپی ژنتیک اصولا مطالعه عوامل خارجی یا محیطی است که ژن ها را روشن و یا خاموش میکند و بر روی چگونگی خوانده شدن ژن ها اثر میگذارد.
مهمترین مکانیزم های اپی ژنتیک شامل: متیله کردن DNA، اصلاح هیستونی و فرآیند های غیر مستقیم توسط روش تازه کشف شده RNA های کدگذاری نشده است.
@primerSBU
#ادامه👇

#بیوتکنولوژی_مولکولی
#جلسه_سوم
#بخش_دوم
🔺️lncRNAs

در سلول های جانوری، بخش عمده ای از فرآورده های RNAی تولید شده، RNA غیر کدکننده پروتئین یا ncRNA ها هستند که ظاهرا هیچ پروتئینی را کد نمیکنند. بسیاری از ncRNAها برای تولید RNAهای کوچک و فعال مانند:
miRNA,siRNA,piRNA,snoRNA,tiRNA
مورد پردازش مولکولی قرار میگیرند. به طور کلی رده های متفاوت ncRNA ها از طریق میان کنش های مولکولی با DNA,RNAو پروتئین ها در مراحل حیاتی کنترل بیان ژن، مانند تغییر در ساختمان کروماتین،تنظیم رونویسی، پیرایش pre-mRNA در سلول و نیز کنترل تعیین زمان گردشmRNAدر سلول نقش مهمی دارند. برخی از ncRNAها طولی به اندازه 200 نوکلوئوتید (وبیشتر) که به مولکول های کوچکتر شکسته نمیشوند. این RNAها تحت عنوان
lncRNAs (long non-coding RNAs)
شناخته میشوند.

📌 مطالعات انجام شده دررابطه با نقش lncRNA ها در تنظیم اللگوی بیان ژن، نشان دهنده ی پیچیده بودن ساز و کار کنترلی آن ها است،به نحوی که فرایند رونویسی lncRNAها میتواند تعیین کننده رونویسی باشد و lncRNA های به وجود آمده میتوانند در تنظیم رونویسی یا اصلاح کروماتین عمل کنند.lncRNA# ها میتوانند به مکمل RNA خود متصل شوند و در فرایند RNAها تاثیر بگذارند. میان کنش های بین lncRNA ها و پروتئین ها میتواند بر عملکر پروتئین ها و محل قرار گیری آنها به اندازه تسهیل ساخت ریبوپروتئین ها اثرگذار باشد.

🔺️miRNAs (micro-RNA)

نوعی RNA کوچک و درونی از 19-24 نوکلئوتید هستند. آنها نقش تنظیمی مهمی در گیاهان و جانوران برعهده دارند که ازطریق انتخاب mRNA خاص برای ازبین بردن ویا سرکوبی ترجمه،نقش خود را انجام میدهند.تنظیم وابسته به miRNA# در بروز بیماری ها دخیل است و این موضوع برای پیدا کردن درمان بیماری ها مطالعه شده است.
🔺️siRNAs

درفرایند تنظیمی سلول ازطریق ‌‌ RNAi(RNA interference) دخالت دارند. siRNA ها با توجه به توانایی بازداری از تقسیم ژنهادر بسیاری از بیماری ها ی ژنتیکی به عنوان معرف درمانی قوی درنظر گرفته میشوند. siRNA ها دوسیستم دلیوری دارند: ویروسی و غیرویروسی. سیستم غیرویروسی که ازلیپیدها و پپتیدها استفاده میکند مهم و در بسیاری موارد محققان در حال مطالعه آن ها هستند.
🔺️piRNAs

انواعی از RNA های کوچک به اندازه 26-31 نوکلئوتید هستند.آنها با تعامل پروتئینهایpiwi مجموعه ای را به نام مجموعه خاموش کننده القایی piRNA# تشکیل میدهند و این مجموعه ترنسپوزون ها را توسط مکانیزم های درحین رونویسی و پس از رونویسی فشرده سازی میکند و یکپارچگی خط جرمی ژنوم را حفظ میکند.

💡در مقاله زیر با عملکرد و واکنشهای بین این چند مولکول آشنا میشویم.
@primerSBU

#بیوتکنولوژی_مولکولی
🔺️عملکرد تنظیمی long non-coding RNAs

@primerSBU

🔸چه چیزی میتواند جذاب تر از این باشد که فرآیندهای آزمایشگاهی را روی تراشه ای چند سانتی متر مربعی جای داد؟ مقیاس بسیار کوچک مواد میتواند در سرعت آنالیز و سنتز مواد انقلاب کند! رفتار یکنواخت سیالات در مقیاس میکرونی می تواند تعاملات مولکولی را افزایش دهد، از هزینه‌ها بکاهد و شر برون ریزهای شیمیاییِ پس از آزمایش را از سرمان کم کند❗️


آز-تراشه (Lab on a chip) دقیقاً چیست؟
📝آز-تراشه به وسیله ای گفته می شود که توسط آن بتوان فرآیندهای آزمایشگاهی را روی یک مدار مجتمع (تراشه) انجام داد که مساحتی کمتر از تنها یک کف دست را دارد. آز-تراشه ها بیشترین بنا را بر روی علوم میکروفلوئیدیک ها دارند.

ولی واقعاً منشأ این فناوری خیره کننده کجاست؟
🔸با صرف نظر از معدود اقداماتی که در گوشه کنار دنیا در حوزه های غیر آزمایشگاهی در حوزه میکروتراشه ها انجام می‌شد، مهمترین گام های توسعه این فناوری از اوایل دهه 1990 شروع شد که «سامانه های میکروآنالیز» در حوزه های ژنومیک، همانند سازی DNA، الکتروفورز و ... را انجام می دادند. با گذشت زمان و انجام تحقیقات بیشتر که این سامانه ها عملکردهایی فراتر از آنالیز را انجام دادند، واژه آزمایشگاه روی تراشه یا آز تراشه را به خود گرفتند.
کاربردها: آزتراشه ها کاربردهای بسیاری در زیست شناسی مولکولی، پروتئومیک، شیمی و... دارند. به عنوان نمونه در حوزه پروتئومیکس می توان به فرآیندهایی مانند استخراج پروتئین از سلول، جداسازی توسط الکتروفورز و... اشاره کرد که همگی روی همین تراشه انجام می گیرند.

🔹از مزایای این تکنولوژی ها می‌توان به هزینه کم، سهولت کاربرد، کاهش خطای انسانی، تسریع تشخیص و پاسخ دهی، کم حجم شدن نمونه ها و... اشاره کرد؛ البته چالش‌هایی نیز در مقابل این فناوری وجود دارند که از مهمترین آنها به مشکلات مربوط به تجاری سازی، هزینه های بالای ساخت و... می توان اشاره کرد که صد البته امکان برطرف شدن آن ها در آینده وجود دارد.⚡️


برای آشنایی بیشتر با این فناوری و تفصیل کاربردها و چالش های آن به گاهنامه پرایمر، شماره 2، مهر 97، مقاله Lab on chip، مراجعه نمایید.
#nano
#LOC
@primerSBU

گاهنامه پرایمر، شماره دوم. بزودی...

#آزمایشگاهی
#MTT 💉🔬
⭕️برای بررسی قدرت تقسیم سلولی از تست هایی از جمله : MTT , ATP , Cell Titer Blue, Trypan blue exclusion, استفاده میشود .

‼️در حالتی که سلول زنده باشد و همه چیز درون میتوکندری خوب پیش برود ؛ درون میتوکندری مجموعه ای از آنزیم ها موجود است .حضور میتوکندری برای سلول بسیار اهمیت دارد به این علت که همه ی مسیر های متابولیکی در میتوکندری انجام میشود .

✅گروهی از آنزیم های میتوکندریایی (NADPH وابسته به اکسیدوردوکتاز) است که توسط خود میتوکندری تولید میشود و به خارج سلولی ترشح میکند . توجه داشته باشیم که سلول تا زمانی زنده میماند که توان تقسیم شدن داشته باشد و این آنزیم درون سلولی یافت میشود که زنده است و قابلیت تقسیم دارد .

🔦این آنزیم میل تبدیل رنگ نمک #تترازولیوم ( MTT ) که دارای بار مثبت است ، به محتوایی با رنگ ارغوانی دارد .رنگی است که با چشم قابلیت تشخیص آسان دارد .
💉💊🔬
برای تشخیص سلامت سلولی نمک تترازولیوم را به محلول سلولی اضافه کرده اگر سلول سالم باشد این نمک با توجه به واکنش های میتوکندریایی که به همراه آنزیم NADPH وابسته به اکسیدوردوکتاز انجام میدهد تولید ماده ای ارغوانی به نام #فورمازان کرده و سلامت سلول را مشخص میکند اما اگر سلول قابلیت تقسیم نداشته باشد فاقد آنزیم مورد نظر بوده و با اضافه کردن MTT رنگ ارغوانی ایجاد نمی کند .فورمازان تولید شده در داخل سلولی نزدیک سطح سلول رسوب میکند و برای بررسی آن از #اسپکتروفوتومتری استفاده میکنند.

✴️تست MTT برای درست انجام شدن نیاز به یک مسیر متابولیکی میتوکندریایی درست میباشد در نتیجه بک تست متابولیسمی سلول هست نه تست تکثیر .
#آزمایشگاهی
@PrimerSBU