#بیوتکنولوژی_مولکولی
🔺️در مورد DNAسیاه چی میدانید؟! ژن های گمشده یا از بین رفته ؟!
@primersbu

این همه آدم رفتند و نیامدند
فقط یک نفر است که رفت و هنوز هم در تاریخ میگویند : نیامد نیامد
ای اهل حرم میر و علمدار نیامد ...

فرا رسیدن تاسوعای حسینی را به شیفتگان حضرتش تسلیت عرض میکنیم.
@primersbu

#کارگاه_آموزشی
📌نمایشگاه ایران فارما مصلی تهران
💰۱۵۰ هزار تومان
🗓سه شنبه ۹۷/۷/۳
⏰۹تا۱۲....۱۴ تا۱۷
@PrimerSBU

#فناوری_های_همگرا

📋قسمت چهارم
📕#نقش_علوم_شناختی_و_فناوری_اطلاعات_همگرایی

🔶فناوری اطلاعات با کمک روش‌های جدید رایانه‌ای برای پردازش اطلاعات و اجرای مدل‌ها، به کمک فناوری‌های نانو، بیو و علوم شناختی می‌آید. این روش‌ها برای هر سه فناوری بسیار حیاتی هستند، به‌طوری‌که با کنترل دقیق الگوسازی و برخورد مولکول‌ها باعث ارتقای فناوری نانو شده و به کمک مدل‌سازی واکنش‌های شیمیایی بیوفناوری را ارتقا می‌دهد.

🔶علوم شناختی می‌توانند از طرق مختلف فناوری‌ها و علوم دیگر را ارتقا دهند. ازجمله آشناترین کاربردهای این علوم در سایر فناوری‌ها می‌توان به استفاده از تئوری بازی برای ماکزیمم‌سازی سود و کاهش هزینه‌ها و یا استفاده از مدل‌های مختلف برای توجیه مسائل اقتصادی اشاره کرد. این علوم در حقیقت با تکیه‌بر علوم آماری و احتمال به تحقیقات کمی و درک بهتر دینامیک اجتماعی کمک می‌کنند.

T.me/primerSBU
🔍 دیگه نمیخواد برین چیز جدیدی ببینین صرفا منبع زدم👇
🔗 http://nbic.isti.ir/index.php?ctrl=paper&actn=paper_view&lang=1&id=3516

#فناوری_های_همگرا

📋قسمت پنجم
📕#تاریخچه_علوم_همگرا_در_کشور_های_پیشرفته

T.me/primerSBU

منبع : سایت ستاد توسعه علوم همگرا ، معاونت علمی ریاست جمهوری

#سلولهای_بنیادی_پرتوان_القایی
⭕️معرفی پایه ای ipscs
@PrimerSBU

#سلولهای_بنیادی
📄معرفی مقاله
📌روش های پرتوان کردن سلول های بنیادی
#رتروویروس

Derivation of induced pluripotent stem cells by retroviral gene transduction in mammalian species. - PubMed - NCBI
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubmed/22907488/

✳️برای کسب اطلاعات بیشتر درباره وکتور های ویروسی به شماره دوم نشریه دانشجویی پرایمر مراجعه کنید .

🔅با ما همراه باشید🔆
@PrimerSBU

🍎🍏
#سیب_نوین
#سیب_آرکتیک
#سیب_قهوه_ای_نشونده
#خاموشی_آنزیم
#بیوتک_کشاورزی
در شماره دوم پرایمر از این موضوع بیشتر خواهیم خواند ..
🍏🍎
@primersbu

#کارگاه_عملی

💰 ۱۹۰۰۰۰ تومان

جمعه ۲۰ مهر ۹۷

محل برگزاری : #کرج - #پژوهشگاه_مواد_و_انرژی

http://T.me/primerSBU


#بیوتک_پزشکی
🔍💊💉🌡🔬
📢محققان دانشگاه کمبریج دریافتند در کبد نوعی کوسه ماهی موسوم به سگ ماهی، ترکیباتی وجود دارد که امکان درمان پارکینسون را فراهم می کند.‼️

✅بر اساس مطالعات ترکیبی موسوم به squalamine که در کبد سگ ماهی یافت می شود، علاوه بر این که مانع تشکیل پلاک های سمی موسوم به Lewy Bodies در مغز بیماران مبتلا به پارکینسون می شود، از آسیب رسانی پلاک های موجود در مغز نیز جلوگیری می کند. 

🔹🔸
آزمایشات بالینی این ترکیبات به عنوان دارویی برای مقابله با سرطان و بیماری های چشمی در آمریکا در حال انجام است. یکی از محققان انگلیسی نیز در تلاش است تا آزمایشات بالینی اولیه این ترکیب را به عنوان داروی پارکینسون آغاز کند. 
🔸🔹
آزمایشاتی که تاکنون روی سلول های انسان و کِرم ها صورت گرفته نشان می دهد که squalamine می تواند داروی ارزشمندی برای درمان بیماری پارکینسون باشد. 
ترکیب squalamine خاصیت ضد میکروبی دارد و در دهه 1990 میلادی توسط متخصصانی که به دنبال علت توانایی بسیار زیاد سگ ماهی در مبارزه با عفونت ها بودند، در بافت کبد این نوع کوسه ماهی شناسایی شد. در حال حاضر محققان قادرند squalamine را به طور مصنوعی در آزمایشگاه تولید کنند.
🔸🔹
پارکینسون پس از آلزایمر شایع ترین بیماری سیستم اعصاب است که بر اثر کاهش دوپامین و اختلال جسم سیاه مغز ایجاد می شود. جسم سیاه پیام های عصبی را از طریق نخاع به عضلات مختلف ارسال می کند و این فرآیند از طریق ماده شیمیایی دوپامین صورت می گیرد و باعث اختلال در تعادل و کنترل عضلات می شود. روش های رایج کنترل این بیماری، داروی هایی هستند که با تحریک مغز، به ترشح دوپامین کمک می کنند. این روش ها بیماری را درمان نمی کنند، بلکه علایم را کاهش می دهد و پاسخ آن روی افراد مختلف، متفاوت است. 
بیماری پارکینسون معمولا با لرزش یک دست آغاز می شود و به تدریج اکثر اندام را درگیر می کند. حدود 10 میلیون نفر در سراسر جهان به این اختلال مبتلا هستند. 
🔸🔹
به گزارش مرکز پیشگری و کنترل بیماری آمریکا، در این کشور از هر 500 نفر یک نفر به این بیماری مبتلا است. احتمال ابتلا به پارکینسون در مردان 1.5 برابر زنان است.
گزارش کامل این تحقیقات در نشریه Proceedings Of The National Academy Of Sciences منتشر شده است. 

#بیوتکنولوژی_پزشکی
🔍🔬💊🌡

@PrimerSBU

#بیوتک_پزشکی
💊🔬🌡💉

📌📋مطالعات جدید انجام شده راجع به منشا و دلیل بیماری پارکینسون نشان می دهد که علم پزشکی تا به حال در مورد منشا بیماری پارکینسون اشتباه بزرگی مرتکب شده است،این مطالعات نشان می دهد که منشا شروع بیماری پارکینسون دستگاه گوارشی انسان می باشد و نه مغز او.
🔹🔸
به گزارش کلیک،تا به امروز پزشکان برای مطالعه بر روی دلایل و عوامل موثر در بیماری پارکینسون به سراغ مطالعه مغز فرد می رفتند و این در حالی است که مطالعات جدید انجام گرفته بر روی موش های آزمایشگاهی ثابت می کند که هر آنچه که پزشکان تا به حال به دنبال آن می گشتند را از این به بعد باید در دستگاه گوارشی افراد دنبال کرد
🔹🔸
در واقع این یافته جدید می تواند خیلی از نقاط مبهم مرتبط با پارکینسون را توضیح دهد،از جمله این مسائل مشکلات مشترکی است که همه مبتلایان به پارکینسون به آن اشاره می کنند،یکی از این مسائل مشترک بروز مشکل یبوست است که اکثر بیماران پارکینسون یک دهه قبل از شروع علائم پارکینسون آن را تجربه می کنند.
@primerSBU

#آزمایشگاهی 💉🔬
⭕️تست سمیت : MTT assay

این روش بررسی اثر cytotoxisity توسط رنگ سنجی است .و جایگزینی برای روش رادیواکتیو است و برای بررسی اثر یک سری شرایط و ماده که ممکن است اثر تحریکی یا مرگ و میر بر روی سلول داشته باشد استفاده میشود .
🔧🔬💉💊🌡
پودر MTT یک نمک تترازولیوم محلول در آب است .وقتی این ترکیب در محیط کشت فاقد فنول red یا بافر PBS حل شود ترکیب زردرنگی ایجاد میکند .

💭اساس این تست: شکستن نمک MTT توسط آنزیم سوکسینات دهیدروژناز میتوکندریایی سلول های زنده است .در اثر این شکست بلور های کریستال نامحلول فورمازان ارغوانی رنگ ایجاد میشود که توسط DMSO ( دی متیل سولفوکساید) یا ایزوپروپانول به صورت محلول در می آید .
🔧🔬💉💊🌡
📎هر چه سلول سالم تر و سمیت کمتری داشته باشد رنگ ارغوانی تولید شده حاصل از تولید فورمازان بیشتر است .

📌با استفاده از دستگاه ELISA reader جذب نوری رنگ ارغوانی حاصل از فورمازان را در طول موج های 490 تا 540 nm اندازه میگیرند البته بهترین طول موج برای جذب 570 nm است .

✳️برای دریافت پروتکل انجام این تست به سایت مراجعه کنید 👇👇👇
https://www.abcam.com/kits/mtt-assay-protocol

#آزمایشگاهی
#تست MTT
@PrimerSBU

#بیوتکنولوژی_مولکولی
#جلسه_سوم
#بخش_اول
🔸️ اپی ژنتیک موضوعی است که تغییرات توارثی در بیان ژن را مطالعه میکند که در تغییر توالی DNA دخیل نیستند.در یک دهه گذشته، محققان نشان داده اند که تنظیمات اپی ژنتیک نقش مهمی در رشد سلولی، تمایز زدایی، بیماری های خود ایمنی، و سرطان دارد. مکانیزم اصلی اپی ژنتیک شامل پدیده شناخته شده: متیله کردن DNA، اصلاح هیستونی، و تنظیم از طریقRNA های کد نشده، نوعی تنظیم که اخیرا شناسایی شده است و حوزه تحقیق های مداوم و متمرکز است.عموما تصور میشود که اکثریت نسخه های انسانی ترجمه نشده اند ولی تعداد کثیری از آنان با این وجود عملکرد های حیاتی را برعهده دارند. RNA های کد نشده دسته ای از RNA ها هستند که پروتئین های عملکردی را کدگذاری نمی کنند و اساسا برای تنظیم بیان ژنی در مرحله پسارونویسی نظر گرفته میشوند. اگرچه، در مجموع ، آزمایشات متنوع سال های اخیر بیان میکند که miRNA, piRNA, siRNA ,lncRNA ها، رایج ترین RNAهای تنظیمی هستند، و قابل توجه اینکه شواهد زیادی در حال به وجود آمدن است که بیان میکند:RNAهای کد نشده نقش مهمی در کنترل اپی ژنتیک برعهده دارند. بنابر این RNAهای کد نشده نقش حساس RNA درتنظیم بیان ژنی را برجسته میکند.

🔎 اپی ژنتیک چیست؟
📌 مطالعه اختلافات سلولی و فیزیولوژیکی است که به خاطر تغییر در توالی DNA پدید نمیآید، اپی ژنتیک اصولا مطالعه عوامل خارجی یا محیطی است که ژن ها را روشن و یا خاموش میکند و بر روی چگونگی خوانده شدن ژن ها اثر میگذارد.
مهمترین مکانیزم های اپی ژنتیک شامل: متیله کردن DNA، اصلاح هیستونی و فرآیند های غیر مستقیم توسط روش تازه کشف شده RNA های کدگذاری نشده است.
@primerSBU
#ادامه👇

#بیوتکنولوژی_مولکولی
#جلسه_سوم
#بخش_دوم
🔺️lncRNAs

در سلول های جانوری، بخش عمده ای از فرآورده های RNAی تولید شده، RNA غیر کدکننده پروتئین یا ncRNA ها هستند که ظاهرا هیچ پروتئینی را کد نمیکنند. بسیاری از ncRNAها برای تولید RNAهای کوچک و فعال مانند:
miRNA,siRNA,piRNA,snoRNA,tiRNA
مورد پردازش مولکولی قرار میگیرند. به طور کلی رده های متفاوت ncRNA ها از طریق میان کنش های مولکولی با DNA,RNAو پروتئین ها در مراحل حیاتی کنترل بیان ژن، مانند تغییر در ساختمان کروماتین،تنظیم رونویسی، پیرایش pre-mRNA در سلول و نیز کنترل تعیین زمان گردشmRNAدر سلول نقش مهمی دارند. برخی از ncRNAها طولی به اندازه 200 نوکلوئوتید (وبیشتر) که به مولکول های کوچکتر شکسته نمیشوند. این RNAها تحت عنوان
lncRNAs (long non-coding RNAs)
شناخته میشوند.

📌 مطالعات انجام شده دررابطه با نقش lncRNA ها در تنظیم اللگوی بیان ژن، نشان دهنده ی پیچیده بودن ساز و کار کنترلی آن ها است،به نحوی که فرایند رونویسی lncRNAها میتواند تعیین کننده رونویسی باشد و lncRNA های به وجود آمده میتوانند در تنظیم رونویسی یا اصلاح کروماتین عمل کنند.lncRNA# ها میتوانند به مکمل RNA خود متصل شوند و در فرایند RNAها تاثیر بگذارند. میان کنش های بین lncRNA ها و پروتئین ها میتواند بر عملکر پروتئین ها و محل قرار گیری آنها به اندازه تسهیل ساخت ریبوپروتئین ها اثرگذار باشد.

🔺️miRNAs (micro-RNA)

نوعی RNA کوچک و درونی از 19-24 نوکلئوتید هستند. آنها نقش تنظیمی مهمی در گیاهان و جانوران برعهده دارند که ازطریق انتخاب mRNA خاص برای ازبین بردن ویا سرکوبی ترجمه،نقش خود را انجام میدهند.تنظیم وابسته به miRNA# در بروز بیماری ها دخیل است و این موضوع برای پیدا کردن درمان بیماری ها مطالعه شده است.
🔺️siRNAs

درفرایند تنظیمی سلول ازطریق ‌‌ RNAi(RNA interference) دخالت دارند. siRNA ها با توجه به توانایی بازداری از تقسیم ژنهادر بسیاری از بیماری ها ی ژنتیکی به عنوان معرف درمانی قوی درنظر گرفته میشوند. siRNA ها دوسیستم دلیوری دارند: ویروسی و غیرویروسی. سیستم غیرویروسی که ازلیپیدها و پپتیدها استفاده میکند مهم و در بسیاری موارد محققان در حال مطالعه آن ها هستند.
🔺️piRNAs

انواعی از RNA های کوچک به اندازه 26-31 نوکلئوتید هستند.آنها با تعامل پروتئینهایpiwi مجموعه ای را به نام مجموعه خاموش کننده القایی piRNA# تشکیل میدهند و این مجموعه ترنسپوزون ها را توسط مکانیزم های درحین رونویسی و پس از رونویسی فشرده سازی میکند و یکپارچگی خط جرمی ژنوم را حفظ میکند.

💡در مقاله زیر با عملکرد و واکنشهای بین این چند مولکول آشنا میشویم.
@primerSBU

#بیوتکنولوژی_مولکولی
🔺️عملکرد تنظیمی long non-coding RNAs

@primerSBU

🔸چه چیزی میتواند جذاب تر از این باشد که فرآیندهای آزمایشگاهی را روی تراشه ای چند سانتی متر مربعی جای داد؟ مقیاس بسیار کوچک مواد میتواند در سرعت آنالیز و سنتز مواد انقلاب کند! رفتار یکنواخت سیالات در مقیاس میکرونی می تواند تعاملات مولکولی را افزایش دهد، از هزینه‌ها بکاهد و شر برون ریزهای شیمیاییِ پس از آزمایش را از سرمان کم کند❗️


آز-تراشه (Lab on a chip) دقیقاً چیست؟
📝آز-تراشه به وسیله ای گفته می شود که توسط آن بتوان فرآیندهای آزمایشگاهی را روی یک مدار مجتمع (تراشه) انجام داد که مساحتی کمتر از تنها یک کف دست را دارد. آز-تراشه ها بیشترین بنا را بر روی علوم میکروفلوئیدیک ها دارند.

ولی واقعاً منشأ این فناوری خیره کننده کجاست؟
🔸با صرف نظر از معدود اقداماتی که در گوشه کنار دنیا در حوزه های غیر آزمایشگاهی در حوزه میکروتراشه ها انجام می‌شد، مهمترین گام های توسعه این فناوری از اوایل دهه 1990 شروع شد که «سامانه های میکروآنالیز» در حوزه های ژنومیک، همانند سازی DNA، الکتروفورز و ... را انجام می دادند. با گذشت زمان و انجام تحقیقات بیشتر که این سامانه ها عملکردهایی فراتر از آنالیز را انجام دادند، واژه آزمایشگاه روی تراشه یا آز تراشه را به خود گرفتند.
کاربردها: آزتراشه ها کاربردهای بسیاری در زیست شناسی مولکولی، پروتئومیک، شیمی و... دارند. به عنوان نمونه در حوزه پروتئومیکس می توان به فرآیندهایی مانند استخراج پروتئین از سلول، جداسازی توسط الکتروفورز و... اشاره کرد که همگی روی همین تراشه انجام می گیرند.

🔹از مزایای این تکنولوژی ها می‌توان به هزینه کم، سهولت کاربرد، کاهش خطای انسانی، تسریع تشخیص و پاسخ دهی، کم حجم شدن نمونه ها و... اشاره کرد؛ البته چالش‌هایی نیز در مقابل این فناوری وجود دارند که از مهمترین آنها به مشکلات مربوط به تجاری سازی، هزینه های بالای ساخت و... می توان اشاره کرد که صد البته امکان برطرف شدن آن ها در آینده وجود دارد.⚡️


برای آشنایی بیشتر با این فناوری و تفصیل کاربردها و چالش های آن به گاهنامه پرایمر، شماره 2، مهر 97، مقاله Lab on chip، مراجعه نمایید.
#nano
#LOC
@primerSBU

گاهنامه پرایمر، شماره دوم. بزودی...

#آزمایشگاهی
#MTT 💉🔬
⭕️برای بررسی قدرت تقسیم سلولی از تست هایی از جمله : MTT , ATP , Cell Titer Blue, Trypan blue exclusion, استفاده میشود .

‼️در حالتی که سلول زنده باشد و همه چیز درون میتوکندری خوب پیش برود ؛ درون میتوکندری مجموعه ای از آنزیم ها موجود است .حضور میتوکندری برای سلول بسیار اهمیت دارد به این علت که همه ی مسیر های متابولیکی در میتوکندری انجام میشود .

✅گروهی از آنزیم های میتوکندریایی (NADPH وابسته به اکسیدوردوکتاز) است که توسط خود میتوکندری تولید میشود و به خارج سلولی ترشح میکند . توجه داشته باشیم که سلول تا زمانی زنده میماند که توان تقسیم شدن داشته باشد و این آنزیم درون سلولی یافت میشود که زنده است و قابلیت تقسیم دارد .

🔦این آنزیم میل تبدیل رنگ نمک #تترازولیوم ( MTT ) که دارای بار مثبت است ، به محتوایی با رنگ ارغوانی دارد .رنگی است که با چشم قابلیت تشخیص آسان دارد .
💉💊🔬
برای تشخیص سلامت سلولی نمک تترازولیوم را به محلول سلولی اضافه کرده اگر سلول سالم باشد این نمک با توجه به واکنش های میتوکندریایی که به همراه آنزیم NADPH وابسته به اکسیدوردوکتاز انجام میدهد تولید ماده ای ارغوانی به نام #فورمازان کرده و سلامت سلول را مشخص میکند اما اگر سلول قابلیت تقسیم نداشته باشد فاقد آنزیم مورد نظر بوده و با اضافه کردن MTT رنگ ارغوانی ایجاد نمی کند .فورمازان تولید شده در داخل سلولی نزدیک سطح سلول رسوب میکند و برای بررسی آن از #اسپکتروفوتومتری استفاده میکنند.

✴️تست MTT برای درست انجام شدن نیاز به یک مسیر متابولیکی میتوکندریایی درست میباشد در نتیجه بک تست متابولیسمی سلول هست نه تست تکثیر .
#آزمایشگاهی
@PrimerSBU

#آزمایشگاهی
#MTT
پروتکل ساده ای از تست سمیت
@PrimerSBU

#سلولهای_بنیادی
#ipsc
✴️پرتوان کردن سلول های بنیادی با استفاده از microRNAs :

⭕️سلول های بنیادی پرتوان بیان خاصی از miRNA ها را نشان میدهند ‌.تقریبا ۲۲ نوکلوتید کد گذاری نشده ی RNA نقش خاصی در کنترل بیان ژن سلول های بنیادی پرتوان در مراحل پس از رونویسی ایفا میکنند .
💉💊🌡🔬🔎
مطالعات اخیر پیشرفت های زیادی را در زمینه ی شناسایی فرآیند های تنظیمی miRNA ها مثل متیلاسیون de novo DNA و تنظیم سرنوشت سلولی را نشان میدهد.

🔴و اما miRNA ها توانایی برنامه ریزی سلول های سوماتیک بدن به سلول های بنیادی پرتوان را دارند .اثر این مولکول به فاکتور های برنامه نویسی دوباره ی سلول های سوماتیک بستگی دارد .در طی این انتقال حالت از سوماتیک به بنیادی miRNA ها سطوح مختلف رونویسی را تنظیم میکنند و باعث استحکام فرآیند های تمایز میشود .
💉💊🌡🔬🔎

🔵این مولکول میتواند خود را برای هدف که دارد تنظیم کند .بر اساس پیشگویی های بیوانفرماتیکی هر miRNA دارای بیش از ۱۰۰ ژن هدف مشخص است که باعث شده درک رابطه ی بین miRNA و مولکول های هدفش به چالش کشیده شود.

⚫️پرتوان شدن سلول های بنیادی توسط فاکتورهای رونویسی و آنزیم های اصلاح کننده ی کروماتین و اکنون توسط microRNA ها تنظیم میشود .
💉💊🌡🔬🔎

⚪️این مولکول ها ابتدا از Caenorhabditis elegans یافت شده اند.در یوکاریوت ها در مناطق اگزون یا اینترون ها موجود است .
بیشتر این مولکول ها توسط آنزیم پلیمراز || رونویسی میشود .که pri_miRNA را تولید کرده یعنی پیش سازهای مولکول اصلی و بعد در چند مرحله ی پیچیده به مولکول اصلی بالغ پردازش می شود ‌.

📌در ادامه همراه ما باشید
#سلولهای_بنیادی
@PrimerSBU

دستکاری ژنتیکی علاوه بر افزایش سرعت رشد حیوانات،باعث بهبود ارزش غذایی و سلامت آنها می شود.
در سالهای اخیر،از این حیوانات بعنوان واکنشگر های زنده برای تولید انواع پروتئین های نوترکیب استفاده شده است.