ComputAgeChannel – Telegram
ComputAgeChannel
393 subscribers
28 photos
2 videos
20 files
36 links
The community of computational aging researchers.

A channel for sharing seminars, materials and thoughts of ComputAge participants.

Link to a big chat: https://news.1rj.ru/str/agingmath
Our website: https://computage.org
Download Telegram
Channel created
Update: Решили перенести заседание на следующую неделю, по организационным причинам.
Запись сегодняшнего заседания (ничего не вырезано, не перекодировано).
А также презентация к докладу
Article::
Кажется вполне заслуженный хайп вокруг этой статьи: ищем докладчика по ней (и может быть парабиозу в целом) на наш семинар :
https://www.nature.com/articles/s43587-021-00143-2#Fig7
Art::
by Ekaterina Kuzmina

EpiHisteria
or epigenetic rejuvenation by pluripotent reprogramming factors
👍1
Channel photo updated
agingmodels.pdf
2.5 MB
Review::
Обзоры по матметодам в старении являются, увы, не часто. Но этот в своё время оказался приятным.
Code::
by Vladimir Shakirov
Полезные скрипты для начала работы с базой биомедицинских данных NHANES
https://github.com/Schakirov/nhanes
Article::
Майская статья Calico о том как именно репрограммирование омолаживает клетки на уровне single-cell. Читая её в мае, я конечно не оценил масштаба катастрофы (плохо соображал тогда). Работа конечно шикарная, наверное лучшая работа по математике и биологии старения, которую мне приходилось видеть. Приведу просто несколько тэгов о том, что вас ждёт внутри: Single-cell RNA-seq, AutoEncoder, Dynamical systems modeling, Yamanaka factors combinations, GAN, RNA velocity, GSEA, Gene Regulatory Networks...

В общем, цените сами:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.21.444556v2
Course::
Хочу порекомендовать курс по динамическим системам в биологии. Сам прослушал уже 8 лекций и полностью доволен подачей, уровнем сложности и качеством материала.

https://www.youtube.com/channel/UCEtVHpLOWhaelIoDRP9nt4w/videos
АНОНС: В это воскресенье на нашем семинаре выступит Владимир Алипов с докладом на тему: Память, её изменение и стирание. Перенос памяти на электронные носители. Цифровое бессмертие. - крайне щепетильная трансгуманистическая тема.
Доклад состоится в это воскресенье (16.01.22) в сити в 14.00.
Будем также транслировать доклад в телеграм (в основном чате).
Запись затем будет добавлена на YouTube канал.
Память.pptx
28.9 MB
Ссылка на запись сегодняшнего семинара. Также прикрепляю презентацию. Благодарим Владимира Алипова за доклад.
garfinkel2017.pdf
17.1 MB
Book:
Подсказали очень неплохую книгу про мат. моделирование жизни. A. Garfinkel et. al. Modelling Life. Внутри куча динамических систем с необходимыми математическими выкладками. Рабочий язык программирования учебника - SageMath (обёртка над питоном, как я понял).
👍1
АНОНС:
В эту пятницу в 19.30 (время МСК) с докладом выступит Александр Фединцев.
Тема: Кривые дожития, Закон Гомпертца и корреляция Стрелера—Милдвана
Доклад будет транслироваться онлайн в этом телеграмм чате (запись будет загружена на наш youtube канал).
👍2