Бластим: курсы и работа в биотехе – Telegram
Бластим: курсы и работа в биотехе
9.12K subscribers
2.18K photos
175 videos
1 file
1.74K links
❤️ Наши курсы: agency.blastim.ru

🥨 Свежие вакансии в биотехе: blastim.ru

🧬 Курс «Анализ NGS-данных»: clck.ru/3R3P9s

🤝 По сотрудничеству и рекламе: @edu_blastim

📚 По вопросам о курсах: @varvara_blastim
Download Telegram
Forwarded from Skolkovo LIVE
Почему ИИ так развился за последнее время? Сильно ли он отличается от представлений фантастов и сможет ли мыслить как человек?

👆 Ответы на такие вопросы часто остаются за скобками. Пришло время пролить на них свет! Листайте карточки — Skolkovo LIVE пообщался с Дмитрием Безжовчим, ИИ-аналитиком, преподавателем курса «Ученый Будущего» компании «Бластим».

👋 Skolkovo LIVE — инновации тут
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
7🔥53🎉2👍1🥰1
Черная кожанка, толпы фанатов, автографы на капоте автомобиля. Кто это, рок-звезда? Нет, CEO компании Nvidia Дженсен Хуанг!

Во вторник 18 июня, потеснив Apple и Microsoft, Nvidia стала самой дорогой компанией на планете с капитализацией $3,34 триллиона. К воскресенью она потеряла первую строчку рейтинга, но это обычное дело на фондовом рынке. Зато скорость роста поражает: только с февраля 2024 стоимость компании увеличилась в 1,5 раза, тогда как 8 лет назад акции торговались за 1% от текущей цены. В чем секрет?

Конечно, дело в ажиотаже вокруг генеративного искусственного интеллекта. Но тут важны не только удачные обстоятельства, а прозорливость мистера Хуанга, который одержим ИИ и сделал на него ставку, когда никаким ChatGPT еще и не пахло. Nvidia была основана 31 год назад в Кремниевой долине и первоначально работала для нужд видеоигр на Xbox и PlayStation. Визитная карточка компании — графические процессоры (GPUs), задача которых — молниеносно рассчитывать цвет меняющихся пикселей на экране в ходе игры. GPUs распараллеливают вычисления, благодаря чему могут быстро выполнять триллионы простых и однообразных математических операций. Как раз такие лежат в основе машинного обучения.

Революция глубоких нейросетей и произошла, когда люди догадались заменить центральный процессор (CPU), который исполняет команды последовательно, на GPU. Это случилось в 2012 году с cозданием нейросети AlexNet, которую обучали на 2 графических процессорах, по преданию, купленных Ильей Суцкевером в интернет-магазине. Нейросеть вывела задачу классификации изображений на другой уровень. После появления AlexNet босс Nvidia сразу решил заниматься ИИ-направлением и продавать чипы не только геймерам, но и машинлернерам.

В наши дни прогресс нейросетей обеспечивается главным образом за счет масштабирования. Скажем, архитектурно GPT-3 мало отличается от GPT-4, вся разница — в увеличении числа параметров модели и количества обучающих данных, и соответственно, в росте требований к железу. Например, для GPT-4 понадобилось в 100 раз больше вычислительных ресурсов, чем для GPT-3! Чтобы делать ИИ-модели круче, нужны еще суперкомпьютеры и высокопроизводительные чипы, которые и создает Nvidia.

Разработчики ИИ-технологии испытывают «чиповый голод» и стоят в очереди за продуктами Nvidia. IT-гиганты, такие как Amazon и Google, спешно клепают свои микропроцессоры, но Nvidia, по некоторым оценкам, имеет фору в 10 лет и контролирует 80% рынка чипов для ИИ. В марте она представила флагманский чип Blackwell, с производительностью 20 петафлопс. Вероятно, капитализация Nvidia продолжит только расти.

В сети ходит шутка, что искусственный интеллект уничтожит «кожаных» (подразумеваются H. sapiens). Однако пока он возносит их на олимп.

#выходные_у_бластим
18👍7❤‍🔥4
Кто порождает научное знание: тот, кто готовит образцы или тот, кто анализирует? 🤔

🖥 Согласитесь, сейчас биоинформатики выглядят куда более успешными в академическом смысле: публикуются они больше благодаря зонтичному анализу нескольких наборов данных одновременно, сотрудничеству во множестве различных проектов и быстрому извлечению результатов с помощью своих «вычислительных конвейеров». 🧪 Экспериментальные биологи, напротив, выпускают статьи гораздо реже из-за трудоемкости «мокрых» исследований. Да и без последующего анализа больших данных со всякими хитмэпами и вулканоплотами качественная статья сегодня вряд ли получится — снова нужен биоинформатик! А если между биологами/химиками/врачами и программистами наблюдается непонимание из-за неспособности первых четко формулировать задачи в отсутствие представлений о биоинформатике? Тогда экспериментаторы в лучшем случае остаются в тени коллег-биоинформатиков, а в худшем — вообще без статей. Не очень радужные перспективы для будущего «мокрых» ученых. Какой выход? Анализировать самостоятельно?👇
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🥴18👍9🔥41
🌱Классические «естественники» сталкиваются с проблемами при работе с большими датасетами. Обычно у них нет формального образования в области датасайнс, что затрудняет использование инструментов для интерпретации и визуализации. Как же выйти из этого круга? Идти получать еще одно высшее техническое? Да, это даст фундаментальные знания, но потребует массу времени и вряд ли принесет релевантные скилы для естественнонаучной сферы.

🙊 Секрет: для эффективного анализа данных не обязательно знать высшую математику. Современные высокоуровневые тулы проще и доступнее: они как щит закроют вас от жесткого матана и необходимости разбираться, что у них под капотом. Команда Blastim в июне провела эксперимент и доказала, что даже довольно далекий от айти врач может освоить популярный язык программирования Python для решения научных задач за неделю! Да, путь сложный, однако карьерные перспективы того стоят. Но обязательно учиться так экспрессно?👇
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍9❤‍🔥3🔥2
🥳 Хорошие новости: нет необходимости изнурять себя таким марафоном. Комфортный вариант — полноценный курс Blastim «Python для анализа данных в науке». За месяц вы освоите «второй английский» для академии и индустрии. 4 недели по 3 занятия в понедельник, среду и субботу + недельный перерыв для перезагрузки — оптимальный формат для совмещения с работой или учебой. На занятиях будем писать программы для выполнения самых популярных задач биоинформатики: обработки матриц, поиска мотивов в последовательностях, расчета расстояний между гомологичными генами, визуализации результатов, создания command-line интерфейса.

После обучения вы сможете рассчитывать статистические показатели, решать рутинные задачи с помощью Python, понимать чужие скрипты и адаптировать их под себя, получать красивые картинки для визуализации данных. В результате курса — решение трех кейсов из мира актуальной науки, применяя полученные навыки. После такого забыть новые скилы невозможно — захочется использовать их на новых задачах снова и снова. А главное — не придется стоять с протянутой рукой у биоинформатиков: теперь вы на равных! 👇
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥6👍4
Рапид Био разрабатывает и производит иммунохроматографические и иммуноферментные тест-системы, а также работает в направлении создания POC тест-систем на основе микрофлюидики и электрохимии. Сейчас компания в поиске Технолога!

Обязанности:
🔹 разработка производственных документов
🔹 глубокое погружение в специфику работы производственных процессов

Необходимые знания и компетенции:
🔸 образование высшее (техническое), как преимущество биотехнологическое
🔸 опыт работы технологом, техническим писателем от 3-х лет (производство, медлаборатории)
🔸 знание производственных и лабораторных процессов (обязательно)
🔸 опыт работы на производстве, в лаборатории
🔸 опыт разработки и перевода производственной и лабораторной документации (СОП, инструкции)
🔸 скрупулезность и внимательность к деталям в работе с документами
🔸 умение работать в команде и готовность стать частью коллектива Рапид Био
🔸 внимательность, ответственность

Условия:
▫️ график работы: 5/2 с 9:00-18:00. Возможен гибкий и гибридный график
▫️ работа в Технопарке Сколково, офис в 7-ми минутах от станции МЦД «ИЦ Сколково»*
▫️ получение опыта работы в инновационной биотехнологической компании
▫️ изучение и совершенствование английского и обеды за счет компании
▫️ социальные гарантии

*Если добираться в Сколково неудобно, компания готова компенсировать 30% аренды жилья рядом с работой (от 1 года работы в компании по решению внутреннего жилищного комитета)

Откликнуться на вакансию: u.to/sgvAIA

#бластим_вакансии
👍8❤‍🔥21🔥1
🧵В дополнение к нашему вчерашнему треду: вот что говорят о курсе по пайтон те, кто его уже прошел. Смотрите на карточке скрины отзывов участников прошлых потоков!

Кстати, свободных мест всего 2️⃣

Успейте записаться сегодня до 23:59 мск: ссылка
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
11🔥1💯1
🐾 Оправдание „у меня лапки“ больше не прокатит: оказывается, у питона, в отличие от других, эволюционно более молодых змей (например, гадюк или кобр), сохраняются рудименты конечностей! И вы посмотрите каких успехов он добился в программировании :)

Зачем питону кодить? Возможно, ему пригодится скрипт на Python для автоматизации поиска лучшего места под солнцем. Пусть это мы не можем утверждать наверняка, зато мы точно знаем, для чего Python нужен нашим коллегам.

Читайте причины идти на курс от студентов Бластима на карточке!

Попасть на курс
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
12💯4👍2😁2
Врач-водолаз? Медицинский кибернетик? Или бизнесмен?

Друзья, сегодня делимся записью очень полезной и емкой лекции Ильи Нечаева про карьерные пути для людей с медицинским бэкграундом 🩺

Илья сам медик по образованию, прошел через науку и большую фарму, сейчас работает Medical Affairs Head в BostonGene. Поэтому он знает, о чем говорит. В своей презентации на конференции «Мир биомедицины» Илья поведал о разных направлениях, где может найти себя выпускник медицинского факультета: клиника, индустрия, наука или разворот на 180 градусов. А также разложил по полочкам все pros and cons того или иного выбора. Из лекции вы поймете, что в биомедицине невероятно много возможностей, и познакомитесь с инструментами развития карьеры. Илья оставил на слайдах массу полезных ссылок, в том числе на истории известных клиницистов, которые не побоялись сменить карьерный вектор и добились успеха.

Лекцию посмотрело не так много людей, между тем, в ней квинтэссенция многолетнего опыта и знаний эксперта отрасли. Поэтому рекомендуем видео всем-всем-всем!

👉 Ссылка: https://youtu.be/_Hr5hVHhyEo
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
16👍5💯3🔥1🤔1
🐹 Хватит тапать хомяка, лучше приходите на Питон!

Питон совсем не за горами, уже 1 июля, поэтому пришло время ответить на самые частые вопросы, которые нам задают про курс:

🎯 Возможно ли успешное прохождение курса с нулевыми знаниями в программировании?
Да, курс рассчитан на участников без навыков кодинга. На занятиях вы получите все необходимые материалы и помощь преподавателя и ассистентов

💻 Что нужно для комфортной учебы?

Компьютер или ноутбук, подходящий для просмотра видео в интернете

🌐 Нужен ли сервер для прохождения курса?
Нет, сервер не требуется

📝 Как проходит обучение?
Ключевые моменты обучения: занятия, где сочетаются теория и практика, с трансляцией в Discord и YouTube; выполнение коротких домашек и сдача итоговых проектов; доступ к памятке в Notion, где собраны все материалы; Telegram-чат для обсуждения вопросов и получения помощи от препода и учебных ассистентов

🏠 До какого числа можно сдать все проекты и домашние задания, чтобы успешно пройти курс?
Дедлайны будет указывать куратор в телеграм-чате

🛶 Будут ли записи занятий, если у меня параллельно летняя практика?
Да, все занятия будут доступны в записи. Вы получите материалы и сможете задать свои вопросы в чате

🧠 Что считается успешным прохождением курса?
Успешным прохождением курса считается освоение навыков программирования. Главное — знания и умения

📲 Что если я не смогу посетить все занятия или выполнить итоговое задание?
Вам будет нужно написать куратору курсов, он поможет найти индивидуальное решение

📜 Какой документ я получу в конце обучения?
Удостоверение о повышении квалификации — если у вас есть высшее образование и вы успешно сдали итоговое тестирование. Или сертификат (на английском) — если нет

🎓 Если я заканчиваю вуз в июне, смогу ли я получить удостоверение?
Да, если вы успешно завершите курс и сдадите итоговое тестирование, вы получите удостоверение о повышении квалификации гособразца, даже если диплома бакалавра у вас нет на руках

👛 Можно ли разделить стоимость курса и оплатить частями?
Есть несколько вариантов оплаты: 1. оплата банковской картой всей суммы. 2. в рассрочку: от 3 до 12 месяцев, проценты мы берем на себя. 3. через компанию на р/с: ваш работодатель может оплатить обучение. Если у вас затруднения, напишите нам — мы поможем

📎 Можно ли получить налоговый вычет за обучение?
Да, вы можете получить налоговый вычет за образование и вернуть до 13% стоимости. Подробности о необходимых документах можно найти на сайте

У нас осталось 2 свободных места и 3 дня до старта занятий 🔥
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥9👍7🥴3💯3😁1
ИИ «на массе»: машинлернерам нужны белки

🐿 Как всякий фанат ждет выхода очередной серии любимого сериала, так и каждый структуральщик хочет скорее увидеть новый AlphaFold. И вот в мае команда из Google DeepMind во главе с Джоном Джампером представила AlphaFold3. Модель предсказывает пространственную укладку белков еще точнее, чем AF2. Но главная фишка — это способность прогнозировать структуру белковых комплексов и взаимодействия между белками и малыми лигандами или ДНК/РНК. AF3 принимает на вход последовательности нескольких молекул и выдает совместные 3D-картинки.

Нейросеть превосходит как классические программы докинга (Vina), так и новаторские тулы прогнозирования структур мультибелковых комплексов (AlphaFold-Multimer). Обгоняет AF3 и аналогичную модель RoseTTAFold All-Atom — ее в марте выпустила конкурирующая лаборатория небезызвестного Дэвида Бэйкера. Чтобы добиться таких результатов, пришлось существенно доработать архитектуру нейросети AF2 🤖 Например, прибегнуть к диффузионным моделям. Однако в отличие от прошлого раза компания не открыла исходный код и веса модели, а только предоставила доступ к веб-сервису и поделилась «псевдокодом», поскольку не хочет, чтобы фармкомпании коммерциализировали инновацию. Сторонники open-source в бешенстве, энтузиасты пытаются воссоздать алгоритм и сделать его полностью доступным, были даже взломы сервера AF3 😱 На этом фоне DeepMind обещала поделиться кодом с академическими исследователями в течение 6 месяцев.

🧬 Если AlphaFold и другие структурные модели, требующие для обучения экспериментальные данные, — уже давно на слуху, то сейчас набирает популярность другой подход — искать скрытый смысл в аминокислотных последовательностях, подобно тому как ChatGPT постигает закономерности человеческих текстов. Речь про белковые языковые модели (pLM). Они уже показали очень любопытные результаты, в том числе для предсказания фолдинга и de novo дизайна белков. Так, недавно ученые из стартапа Profluent под руководством Али Мадани получили с помощью pLM первые искусственные CRISPR-ножницы ✂️ и даже «порезали» ими гены человека!

Известно, что для генно-инженерных целей наиболее удобен белок SpCas9, хотя в природе много и других систем, которые ученые продолжают интенсивно искать в сообществах микроорганизмов 🧫 Но машинлернерам из Беркли естественного разнообразия оказалось мало. Специалисты, проанализировав сотни известных микробных геномов и метагеномов, обнаружили более миллиона оперонов и создали целый Атлас CRISPR-Cas. Далее они дообучили белковую языковую модель ProGen, которая умеет предсказывать следующие аминокислоты в цепочке, на собранных данных и попросили сгенерировать миллионы новых Cas-нуклеаз. Потом 200 наиболее перспективных последовательностей они синтезировали в лаборатории и трансфицировали плазмидами с ними (+гидовой РНК) человеческие клетки линии HEK293T. Многие ИИ-редакторы эффективно отредактировали гены, а один, названный OpenCRISPR-1, показал даже меньшую офф-таргет активность, чем природный белок. Разработчики надеются, что ИИ CRISPR-системы будут точными и универсальными и однажды дойдут до клиники.

#выходные_у_бластим
👍31🔥149
🦅 Ну что, бердвотчеры, видели такую птицу? IBIS летит!

IBIS (Inference of Binding Specificities) — международное соревнование по использованию методов биоинформатики и машинного обучения для предсказания ДНК-паттернов, узнаваемых регуляторными белками человека.

Челлендж начался в марте, но сейчас еще можно присоединиться (дедлайны продлены). Подробности в свиттере Ивана Кулаковского: ссылка (надо VPN)

Для участия пригодятся навыки программирования, анализа данных и базовые знания биоинформатики. Организаторы соревнования — международный консорциум лабораторий из 🇨🇦-🇨🇭-🇩🇪-🇷🇺

📜 Победители станут соавторами публикации в престижном научном журнале, а лучшие методы определят стандарт поиска и представления новых ДНК-паттернов.

🔗 Соревнование полностью онлайн, подробности на сайте: ibis.autosome.org
📱 А вот телегруппа конкурса: https://news.1rj.ru/str/ibischallenge

P.S. Организаторы будут рады и благодарны ретвитам и репостам и ждут новых участников!

#бластим_рекомендует
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤‍🔥14🔥5👍31
Друзья, делимся радостной новостью: вчера вечером стартовал тот самый питон 🎉

Бластим невероятно рад видеть всех участников курса 👋 На первом занятии студентов ждала не только философия Python от Александра Ильина, но и зарядка мотивацией от коуча Инги Егоровой. И, конечно, дзшка!

Пусть небольшими, но осмысленными шажками при поддержке тим Бластим участники пройдут весь путь от «Hello, world» до весьма продвинутых биоинформатических тулов.

В следующий раз питонический курс состоится не раньше 2025 года, зато пока можно поучиться на других бластимовских программах. А если вы хотите следить именно за нашим летним пайтоном, то мы пообещали делать короткие видеотрансляции с места событий в уютном чатике. Тоже заходите: https://news.1rj.ru/str/+f5kx-_ISRnkzMjdi

И спасибо, что вы с нами! Не переключайтесь, скоро — еще интереснее
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🎉9👍6🔥21
🏖 Проект ImageNet известен по огромной базе данных аннотированных картинок, а также конкурсу по распознаванию изображений, где компьютерному зрению предлагалось определить, к какому из 1000 классов принадлежит объект. Как мы рассказывали ранее, в 2012 году соревнование безоговорочно выиграла сверточная нейросеть AlexNet.

До этого никто и подумать не мог, что глубокое обучение может опередить другие алгоритмы в такой задаче. Но вот смогло! Конечно, нейросеть AlexNet была несовершенна и допускала ошибки — около 16%. Люди на том же датасете ошибались только в 5% случаев 🤖

Однако спустя 3 года исследователи из Microsoft, многократно нарастив число слоев нейросетки, создали новый инструмент ResNet и довели процент ошибки до менее 4%, превзойдя человеческие способности! И правда: когда люди долго рассматривают картинки, они начинают отвлекаться, уставать и терять концентрацию, а машина нет.

Сейчас нейросети со сложной архитектурой умеют не только банально отличать «котиков» от «песиков», но и генерировать уже трудно отличимые от реальных фото картинки. А у нас число слоев зрительной коры так и не увеличилось 🧠

👀 Поэтому в горячую пору отпусков и каникул мы решили проверить, а вы еще можете невооруженным глазом распознать, где реальное фото с отдыха, а где ИИ-творение? Пишите в комментариях:) Правильные ответы — завтра.
12🔥4👍3🤩2