InfoChemistry | ITMO – Telegram
InfoChemistry | ITMO
1.46K subscribers
1.72K photos
114 videos
16 files
638 links
Следите за новостями Научно-образовательного центра инфохимии Университета ИТМО!
Download Telegram
Рассказываем, как молодым ученым найти научного руководителя и создать разработку, которой будут пользоваться 🧪

Из интервью Екатерины Скорб, директора и ведущего профессора центра инфохимии ИТМО вы узнаете:

03:34 — Что такое инфохимия
04:33 — Как Екатерина начала заниматься наукой
11:58 — Как действовать молодому учёному, чтобы найти наставника
13:19 — Как попасть к самому цитируемому химику современности
16:13 — Что даёт участие во многих химических проектах
19:33 — Что будет выдающимся профессиональным результатом в инфохимии
24:00 — Как сделать проект / разработку, которой будут пользоваться
26:53 — База данных химика: как выглядит и какие задачи помогает решать
31:13 — Творческие и рутинные задачи в инфохимии
35:41 — Эффективные и неэффективные методы исследований
40:16 — Как организовать эффективную работу коллектива на международном уровне
45:10 — Как привлекать ведущих учёных к работе со студентами
48:47 — Рабочий день руководителя научного коллектива
52:08 — Как отдыхать учёному
53:18 — Свободные ниши и вызовы в инфохимии

Смотреть: https://youtu.be/TAKKePVPEuU

#Читать далее#
Смотрите лекцию Павла Зуна "Компьютерное моделирование материалов в биомедицине" на нашем ютуб-канале 🎬

Павел Зун – директор лаборатории моделирования материалов для регенеративной медицины ИТМО, преподаватель дисциплины “Предсказательное моделирование в медицине и здравоохранении”.

В 2018 году вместе с учеными из Амстердама представил концепцию “виртуальной артерии”. Модель помогает понять, почему в некоторых случаях ткани слишком интенсивно прорастают сквозь стент и сосуд повторно сужается, то есть происходит рестеноз. Воспроизводя этот процесс, ученые научились моделировать клеточный рост артериальной стенки, физические взаимодействия, возникающие из-за того, что стент растягивает сосуд, а также то, как лекарственные вещества со стента проникают вглубь тканей.

По мнению ученых, все это пригодится при создании мультимасштабной модели виртуальной артерии. Такая артерия позволит избежать длительных тестов и позволит разрабатывать препараты без вреда для живых существ, и, возможно, даже уменьшит роль испытаний на людях.

Премьера через час: https://youtu.be/ldvVcqXGMGI

Весь апрель и май делимся выступлениями ученых январской конференции «Инфохимия: методы IT и математического моделирования в химии». Полное расписание: https://vk.com/infochemistry?w=wall-188764969_914

#Читать далее#
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Каждые 3 минуты от пестицидов умирает 1 человек

Казалось бы, в наше время это немыслимо, но токсичные вещества все еще – большая проблема, особенно для развивающихся стран.

Проект, над которым работает Арина Павлова в центре инфохимии, позволяет создать подложки из наночастиц, которые значительно усиливают чувствительность анализа на пестициды

Подробнее – в выступлении студентки на ITMO Rocks.

#Читать далее#
Стажер центра инфохимии Юлия Качина в апреле строила 3D-модель сосуда, пораженного стенозом

💬 Девушка поделилась с нами впечатлениями о стажировке.

– Я учусь на химической технологии природных энергоносителей, поэтому биология и медицина от меня очень далеки. Шла на стажировку с надеждой получить опыт работы в лаборатории, а оказалась у ребят, занимающихся моделированием. Я сперва расстроилась, но практика в центре все же оказалась полезной.

Мой ментор Алексей Фотин дал задание: создать идеализированную модель пораженного стенозом сосуда и проанализировать ее. За неделю я приобрела некоторые навыки моделирования в пакете FeBio и научилась создавать проекты в программе FreeCAD.

Мне понравилось разбираться в разных программах, самостоятельно искать инструкции по установке, смотреть туториалы на английском. Я очень благодарна Алексею за помощь и за его терпение, потому что я донимала его вопросами каждую секунду 🥹

Возможно, если столкнусь с применением компьютерных методов, то продолжу изучать их. Можно моделировать клеточный рост артериальной стенки, физические взаимодействия, возникающие из-за того, что стент растягивает сосуд, а также то, как лекарственные вещества со стента проникают вглубь тканей. Это пригодится при создании мультимасштабной модели виртуальной артерии. Такая артерия позволит избежать длительных тестов и позволит разрабатывать препараты без вреда для живых существ, и, возможно, даже уменьшит роль испытаний на людях.

🤖Алексей рассказывает:

– Исследование патологий и различных процессов в сердечно-сосудистой системе является основным для нашей лаборатории. Конкретно моя работа заключается в мультимасштабном моделировании коронарных артерий со стенозом, а также в верификации существующей модели рестеноза ISR3D. Как результат работы я вижу систему диагностики, которая позволит с высокой точностью определить необходимость установки стента в поврежденный сосуд.

👩🏻‍🔬Юлия работает в научном центре Горного университета по направлению «Производство биотоплива». Из учебных дисциплин больше всего предпочитает математику, процессы и аппараты химической технологии и, конечно же, всевозможные вариации химии (общая и неорганическая, органическая, физическая, химия нефти и газа). Мечтает быть частью реального исследования. Летом 2022 года опубликовала свой первый патент на изобретение.

#Читать далее#
Совсем скоро начинаем ДОД магистратуры "Химический софт / Chemistry Soft"

Подключайтесь по ссылкам:

👉 https://vk.com/video-188764969_456239439

👉 https://www.youtube.com/live/r563eso1JV8?feature=share

Кто внимательно следил за Хакатоном по цифровой фармакологии в Центре инфохимии ИТМО с Синтелли и Medtech.Moscow
и хочет узнать о подходах, применяемых участниками для моделирования побочных эффектов лекарственных и биоактивных соединений?

Узнать ответ на вопрос: как и зачем используется искусственный интеллект для создания химического поисковика?

И как можно стать разработчиком таких систем?

🔥 Когда? Сегодня, в понедельник, 15 мая, в 16:00. Не пропустите! 👈

Спикеры:

Максим Федоров – профессор, д.х.н., член корреспондент РАН, сооснователь компании «Синтелли».

Екатерина Скорб – профессор, директор научно-образовательного центра инфохимии, основоположник направления "Инфохимия" и руководитель программы "Химический софт".

Тимур Алиев – научный сотрудник образовательного центра инфохимия, участник экспертной комиссии хакатона, специализирующийся на вычислительных методах, системах искусственного интеллекта и методах обработки больших данных в химии.

Родион Головинский – бакалавр образовательной программы "Инфохимия", участник ITMO.COLLAB и проекта в рамках программы развития 2030 по созданию химического поисковика.

А также участники хакатона для открытой дискуссии на тему: зачем химикам программирование и как применить свои навыки IT в химических науках.
Химический хакатон, или как в Школе №619 помогают обучить нейросеть

🧬 11 мая в 9 утра в Школе 619 стартовала Стратегическая сессия «Генерация данных для инфохимического поисковика», которая проводится под эгидой Университета ИТМО.
В работе сессии приняли участие более 40 учеников старших классов, а также студенты ИТМО Родион Головинский, Елена Щербакова, Илья Тонкий, Алина Лузанова, Иван Малышев. Итоги этой работы вечером подвела директор, ведущий профессор Научно-образовательного центра инфохимии ИТМО Екатерина Скорб.

👉 Перед учениками поставили реальную задачу – собрать данные для обучения нейросети, которая способна переводить изображения молекул в единый стандартный формат химических формул.

О корне проблемы, над которой работают ребята, доступно и интересно рассказывает сайт colab.ws. «К сожалению, описания молекул из работ до компьютерной эры остались на бумаге в виде разномастных рисунков, - говорится в источнике. - Их слишком много, а потому обработка вручную займет неоправданно много времени. На помощь могут прийти технологии искусственного интеллекта.

Именно такую систему предложили в компании «Синтелли». Она способна преобразовывать изображения органических молекул в SMILES-строку. Такой способ представления однозначно описывает даже циклическую молекулу как цепочку атомов с указанием типа связей и того, какие группы атомов к ней прикреплены.

Для обучения нейросети также был разработан генератор данных, который случайным образом моделирует различные стили рисования, функциональные группы и возможное художественное оформление, мешающее компьютеру выделить то, что необходимо.
Представленная нейросеть может стать основой для быстрого и эффективного извлечения информации из рисунков молекул, что окажется полезным для пополнения общей базы химических структур».

Статья полностью: https://colab.ws/news/92

#Читать далее#
Смотрите лекцию Екатерины Козловой "Разработка методов синтеза g-C3N4 для процессов альтернативной энергетики" на нашем ютуб-канале 🎬

Екатерина Козлова – доктор химических наук, ведущий научный сотрудник Института катализа СО РАН, с недавнего времени профессор РАН. Екатерина возглавляет научный коллектив по альтернативной энергетике. Под ее руководством разработаны активные и стабильные фотокатализаторы, работающие под действием видимого света. Кроме того, Екатерина заведует отделом аспирантуры Института катализа СО РАН и является заместителем руководителя по образовательному направлению Центра компетенций Национальной технологической инициативы «Водород как основа низкоуглеродной экономики».

Научная работа профессора нацелена на развитие фотокаталитических процессов, в частности, процессов расщепления воды с выделением водорода и восстановления углекислого газа. Эти процессы перспективны с точки зрения преобразования солнечной энергии в энергию химических связей, и, соответственно, важны для освоения доступных возобновляемых источников энергии. В настоящее время ведет работу по масштабированию и внедрению процесса фотокаталитического получения водорода. Екатерина Козлова – соавтор более 80 статей, индексируемых WoS и Scopus, и девяти патентов РФ.

Премьера: https://youtu.be/lmLu4KNOPik

Весь апрель и май делимся выступлениями ученых январской конференции «Инфохимия: методы IT и математического моделирования в химии». Полное расписание: https://vk.com/infochemistry?w=wall-188764969_914

#Читать далее#