Хочешь разрабатывать модели машинного обучения, которые помогут быстрее и дешевле создавать новые лекарства, снизить риски побочных эффектов, а также сократить использование в экспериментах животных?

Этим занимались участники нашего хакатона с платформой искусственного интеллекта «Синтелли» и Московским центром инновационных технологий в здравоохранении (Медтех).

👉 Этому же, в том числе, мы будем обучать в новой онлайн-магистратуре «Химический софт». Прямо сейчас идет набор, не упусти свой шанс: https://abit.itmo.ru/program/master/chemistry_soft 🦾

Чтобы разрабатывать безопасные лекарства, важно изучать токсичность молекул, из которых создают препараты. Токсичность описывается различными параметрами химических соединений. Среди них ― мутагенность, канцерогенность, повторяющееся воздействие химического агента, медикаментозное повреждение печени и многое другое. Предсказать эти параметры можно с помощью SMILES — системы правил однозначного описания состава и структуры молекулы химического вещества. На основании SMILES-описаний молекул с помощью графовых представлений, языковых моделей и химических свойств можно определить различные признаки токсичности вещества.

Сейчас, чтобы исследовать токсичность молекул, ученые используют искусственный интеллект. Например, платформа «Синтелли» позволяет химикам-синтетикам прогнозировать физико-химические, биологические и токсикологические свойства органических соединений, визуализировать массивы химических данных.

💬 По словам доктора химических наук, члена-корреспондента РАН и сооснователя платформы «Синтелли» Максима Федорова, сегодня ученым удалось исследовать токсичность только для порядка 200–300 тысяч соединений — при том, что на планете их известно около 200 млн, и количество соединений постоянно растет.
Модели машинного обучения помогут сократить время и средства на разработку и внедрение новых лекарственных препаратов, а также уменьшить количество лабораторных животных в экспериментах и снизить риски побочных эффектов лекарств.

Подробнее – в карточках 👇 и статье 👉 https://news.itmo.ru/ru/science/life_science/news/13229/

#Читать далее#

Рассказываем в видео, в чем разница между нашими тремя магистерскими программами:

🎓 «Инфохимия / Infochemistry» (https://abit.itmo.ru/program/master/infochemistry)

Очная, направлена на науку и академическую карьеру. Можно сразу выбрать трек «2 х 2». Это значит, что еще в магистратуре вы резервируете за собой место в аспирантуре, а мы понимаем, что вы хотите продвигаться в научной сфере и однажды стать профессором, организовать свою научную группу и вести исследования на уровне мировых лабораторий. 👉 Подробнее о сквозном треке: https://vk.com/infochemistry?w=wall-188764969_896

🎓 «Роботизация химических технологий» (https://abit.itmo.ru/program/master/chemtech_robotics)

Очная, помогает не только развить знания в области научной методологии, но и начать свой собственный проект, создавать роботов для производств и лабораторий, внедрять свои разработки вместе с нашими индустриальными партнерами.

🎓 «Химический Софт / Chemistry Soft» (https://abit.itmo.ru/program/master/chemistry_soft)

Онлайн, позволяет учиться из любой точки мира, дает доступ к опытным специалистами в области искусственного интеллекта, машинного обучения и химических вычислений. Вам будет проще совмещать учебу с работой, а также трудоустроиться к партнерам центра.

#Читать далее#

#НаучныеГруппыНОЦинфохимии: Структурированная и динамическая мягкая материя

Татьяна Орлова ー научный сотрудник, доцент, групп-лидер Центра инфохимии ИТМО.

В 2007 году исследовательница получила степень PhD по направлению «Физика молекулярных и жидких кристаллов» в Институте физики Национальной академии наук Украины и с тех пор успела поработать в разных странах Европы ― сотрудничала с университетом Страсбурга и университетом Бордо во Франции, университетом Твенте в Нидерландах, а также университетом Саутгемптона в Великобритании.

В декабре 2020 года Татьяна Орлова присоединилась к научно-образовательному центру инфохимии в рамках программы ITMO Fellowship & Professorship и вместе с другими сотрудниками организовала научную группу «Структурированная и динамическая мягкая материя».

🧪Среди ключевых проектов — создание умных упаковок, разработка новых методов синтеза молекул, обладающих свойствами селективных флуоресцентных зондов.

📲Подробнее читайте в интервью: https://news.itmo.ru/ru/science/new_materials/news/12363/
и CV: https://infochemistry.ru/media/employees/cv/Orlova_CV_Mar_2023.pdf

К проектам можно присоединиться, будучи магистрантом или бакалавром Центра инфохимии. С первого же семестра мы знакомим студентов с научными исследованиями наших групп-лидеров и включаем в работу 🧑‍🔬

#Читать далее#

Зачем изучать доставку лекарств, учиться выращивать кости и наблюдать за клеточной коммуникацией?

💬 Одно из направлений Центра инфохимии – биомиметические материалы. Лидер этой научной группы Светлана Уласевич рассказала, чем занимается ее команда.

🎓 Присоединиться к исследованиям можно, поступив на нашу магистерскую программу «Инфохимия / Infochemistry» (https://abit.itmo.ru/program/master/infochemistry)

#Читать далее#

Мы можем рассказывать истории наших стажеров вечно, потому что они всегда вдохновляющие!

Сегодня своим опытом делится Ольга Дубовицкая:

– Я обучаюсь на факультете промышленной технологии лекарств по направлению химии в СПХФУ и решила отправиться на стажировку в Центр инфохимии с целью получить опыт работы в лаборатории и применить свои знания на практике.

Моя область – органическая химия, и ментор Евгений Смирнов показал мне, насколько многообразной она бывает. Он представил неожиданный раздел органической химии – полимеры.

Моя основная задача во время стажировки заключалась в изучении влияния молекулярной массы полиэлектролитов на их сорбцию на поверхности золотого электрода.

Полиэлектролиты, такие как полиэтиленимин (PEI) и полистиролсульфонат (PSS), представляют собой прекрасную среду для сохранения активности ферментов. За время недельной стажировки мне удалось познакомиться с различными методами, такими как кварцево-кристаллический микровесовой резонатор (QCM), атомно-силовая микроскопия (AFM), а также получить возможность работать с фотонным корреляционным спектрометром.

Я глубоко признательна за прошедшую стажировку, которая, несмотря на недолгую недельную продолжительность, позволила мне значительно расширить свои знания и умения.

Сейчас я рассматриваю возможность поступления в магистратуру, чтобы продолжить свое образование и развитие в этой захватывающей области науки.

Ольга Волкова, аспирант Центра инфохимии, которая также помогала стажеру, тепло отзывается о стажировке:

– Наша подопечная всегда старалась разобраться в работе. За неделю научилась работать с новыми методами, которые изначально были даже не из ее области, что на самом деле круто. Также она спокойно исправляла ошибки (не все хотят переделывать). По результатам – их нужно еще доработать – планируем выпустить научную статью. Мы предложили Ольге и ее одногруппнице, которая тоже у нас стажировалась, летом продолжить работу

#Читать далее#

‌Ученые Центра инфохимии представили первую в России мобильную лабораторию для создания искусственного сердца 🫀

🧑‍🎓 В разработке приняли участие магистранты программы «Роботизация химических технологий» Мария Рудакова, Александр Семёнов и Владимир Потапов. Студенты уже год вместе с нами создают и обучают роботов для лабораторий и предприятий. Ребятам помогает их научный руководитель – Алексей Мешков, лидер группы «Роботизация химических технологий».

Новый лабораторный куб со стороной 3 метра прозрачен, снабжен системами автономной вентиляции и дополнительной стерилизации, а еще в нем есть роборука, которая заменяет лаборанта и позволяет автоматизировать часть экспериментов (смотрите на гифке, как она ловко управляется с работой 🦾).

🧫 Здесь будут выращивать клеточные культуры, формировать с помощью ИИ базы данных на основе клеточных реакций на различные материалы. Эти данные будут использованы в исследованиях в области регенеративной медицины, клеточной биологии и материаловедении. В перспективе ученые планируют выращивать клетки миокарда, чтобы создать полноценное искусственное сердце.

🧼 Для работы с клетками нужны особые условия: чистота, определенный уровень температуры и влажности. Чтобы их поддерживать, обычно используют стационарные конструкции, но лабораторию инфохимиков легко перемещать и адаптировать под различные научные задачи. В кубе установлены дополнительная система вентиляции и стерилизации (HEPA-фильтры задерживают все частицы и бактерии в воздухе), ламинарный шкаф (для стерильной работы), микроскоп, СО2-инкубатор (углекислый газ, повышенная влажность, температура 37,7 градусов ― необходимые условия для работы с ядерными клетками) и вспомогательное оборудование ― водяная баня, центрифуга, холодильник.

🗯«В лаборатории мы будем получать различные биополимеры, готовить образцы для исследований in vitro (в пробирке) и разрабатывать системы "орган на чипе". Это специальные устройства для выращивания клеточных культур, они в миниатюре повторяют органы и ткани. С помощью таких систем будем подбирать материалы и «тренировать» клетки, заставлять их сокращаться подобно миокарду, мышечной сердечной ткани. Это важно для нашей глобальной цели ― в перспективе создать полноценную искусственную ткань сердца», – объяснила Екатерина Шишацкая, руководитель проекта, профессор НОЦ инфохимии ИТМО.

Пока автоматизирована только часть операций куба. В будущем наблюдать за ростом клеток можно будет дистанционно — при помощи специальных систем 🚀👁

В проекте принимают участие также СФУ, Фонд инфраструктурных и образовательных программ и «Научно-производственное объединение Пролаб». А представили куб в Центре Алмазова.

Статья ITMO.NEWS: https://news.itmo.ru/ru/science/life_science/news/13319/

📲 Подробнее о магистратуре «Роботизация химических технологий»: https://vk.cc/cpzGh7

#Читать далее#