Кажется, что интересная возможность пополнить список публикаций статьей из ВАКовского журнала, с англоязычной версией на Springer. Коллеги говорят, что прошлогодние статьи за эти полгода уже цитируются. Ну еще и 1 млн выиграть можно 🙂 В общем, информация:
В рамках международной конференции AI Journey 2023 приглашаем принять участие
в отборе научных статей по AI/ML для публикации в журнале «Доклады Российской академии наук. Математика, информатика, процессы управления» и его англоязычной версии «Doklady Mathematics».
Журнал:
• Индексируется в крупнейших библиографических базах данных научного цитирования
• Доступен широкому кругу читателей на портале Springer (в английской версии)
• Публикуется на eLIBRARY – крупнейшей российской научной электронной библиотеке
• По рекомендациям ВАК – журнал относится к категории К1 для учета публикаций на соискание научных степеней
Помимо самой публикации, авторы получат возможность выступить с докладами
на AI Journey, а за лучшую статью предусмотрен денежный приз — 1 миллион рублей!
Ознакомиться с правилами и подать заявку можно на сайте AI Journey (https://ai-journey.ru/science/)
В рамках международной конференции AI Journey 2023 приглашаем принять участие
в отборе научных статей по AI/ML для публикации в журнале «Доклады Российской академии наук. Математика, информатика, процессы управления» и его англоязычной версии «Doklady Mathematics».
Журнал:
• Индексируется в крупнейших библиографических базах данных научного цитирования
• Доступен широкому кругу читателей на портале Springer (в английской версии)
• Публикуется на eLIBRARY – крупнейшей российской научной электронной библиотеке
• По рекомендациям ВАК – журнал относится к категории К1 для учета публикаций на соискание научных степеней
Помимо самой публикации, авторы получат возможность выступить с докладами
на AI Journey, а за лучшую статью предусмотрен денежный приз — 1 миллион рублей!
Ознакомиться с правилами и подать заявку можно на сайте AI Journey (https://ai-journey.ru/science/)
AI Journey
Конференция AI Journey 2025. Ключевые спикеры в сфере технологий искусственного интеллекта
Конференция AI Journey 2025. Ключевые спикеры в сфере технологий искусственного интеллекта.
Пока мы очень терпеливо отвечаем на вопросы рецензента о нашей модели Prostata для оценки стабильности белков с использованием трансформера, в Тунисе датасайнтисты уже выиграли хакатон, положив в основу наше решение и улучшив его. Хорошо что есть препринты и открытый код. Хорошо, когда результаты используются для решения задач. И вообще с современными темпами развития AI ну нельзя столько времени рецензировать работы… пока статья выйдет - уже состарится. Эх.
🔥9
На этой неделе столкнулась с критикой разработок нашей команды и меня лично. Но что можно сказать лучше, чем говорят цифры. Языковая модель ДНК GENA за последний месяц в 2-х архитектурах суммарно набрала более 1 000 скачиваний. А мы еще не успели статью дописать…https://huggingface.co/AIRI-Institute
🔥9❤🔥3
Друзья, пока мы досчитываем эксперименты с GENA на архитектурах Memup и RMT, быстро подготовили препринт по уже проделанной работе с остальными моделями семейства. Здесь вы найдете и подробное описание как обучали модели, и чем отличаются между собой, и сравнение на 5 задачах: поиск промоторов, аннотация сайтов сплайсинга, профилирование хроматина, полиаденилирование и определение энхансеров и дрозофилы. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.12.544594v1 .
bioRxiv
GENA-LM: A Family of Open-Source Foundational Models for Long DNA Sequences
The field of genomics has seen substantial advancements through the application of artificial intelligence (AI), with machine learning revealing the potential to interpret genomic sequences without necessitating an exhaustive experimental analysis of all…
👍8
Forwarded from Институт AIRI
Продолжаем рассказывать про выступления исследователей AIRI на ПМЭФ 👀
На сессии «AI Journey: путешествие в мир искусственного интеллекта», которая начнется завтра в 14:00, спикеры обсудят сразу несколько актуальных вопросов:
– Какие новейшие разработки и тренды можно выделить в области AI/ML?
– Какие результаты могут быть достигнуты в направлении AGI?
– Как применяется искусственный интеллект сегодня и как он влияет на нашу жизнь?
Подключайтесь к онлайн-трансляции📼
На сессии «AI Journey: путешествие в мир искусственного интеллекта», которая начнется завтра в 14:00, спикеры обсудят сразу несколько актуальных вопросов:
– Какие новейшие разработки и тренды можно выделить в области AI/ML?
– Какие результаты могут быть достигнуты в направлении AGI?
– Как применяется искусственный интеллект сегодня и как он влияет на нашу жизнь?
Подключайтесь к онлайн-трансляции
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤4💩1🌭1
Не могу не поделиться этой новостью. Вообще-то, это невероятный успех победить в таком соревновании. Часто пиарят разработки на основе ИИ, которые выглядят как что-то очень крутое, но если начинать вникать и копать - то находишь решения и получше, и в большом количестве. А тут ребята показали, что могут лучше, чем другие команды в мире решать задачи навигации роботов. Это очень круто! Возвращает к пониманию, что мы способны не догонять в своих разработках, а задавать тренды. Коллеги, поздравляю! https://news.1rj.ru/str/airi_research_institute/284
Telegram
AIRI Institute
Команда исследователей из AIRI, МФТИ и ФИЦ ИУ РАН под руководством Александра Панова и Алексея Староверова заняла первое место в международном соревновании по обучению роботов навигации внутри помещений🏆
В "Habitat Navigation Challenge 2023" участники соревновались…
В "Habitat Navigation Challenge 2023" участники соревновались…
❤5🔥1
Как же тяжело упрощать информацию в живой беседе. Нет-нет и случайно соврешь. Не потому, что хочешь обмануть, а лишь потому, что неудачно сократил или пример выбрал. И обычному слушателю это непонятно, а сама, когда переслушиваю, ловлю, что вот тут не совсем так, но близко. А вот тут могла бы и удачнее пример использовать. А вот здесь какое-то дурацкое слово: и не русское, и не английское. И отдельно озадачивает, когда после, на мой взгляд, максимально упрощенного и переформулированного материала для широкой публики после лекции подходят слушатели и говорят: «Спасибо, Ольга! Невероятно интересно. Но ничего не понятно)))» Ох, когда-нибудь натренирую навык и просто, и понятно, и не соврав ни разу. А пока делюсь крайним интервью о себе любимой, группе и наших проектах: https://news.1rj.ru/str/dl_stories/772
Интервью записывалось по заранее собранным вопросам в анонсе подкаста.
Интервью записывалось по заранее собранным вопросам в анонсе подкаста.
Telegram
DLStories | Нейронные сети и ИИ
Выпуск подкаста “S02E01: AI Research в генетике и биоинформатике" доступен на всех платформах!
#podcast
Гостья эпизода — Ольга Кардымон, научный сотрудник и руководитель группы «Биоинформатика» Института искусственного интеллекта AIRI.
С Ольгой поговорили…
#podcast
Гостья эпизода — Ольга Кардымон, научный сотрудник и руководитель группы «Биоинформатика» Института искусственного интеллекта AIRI.
С Ольгой поговорили…
👍8🤣1
Завтра вечером Вениамин с Юрой расскажут про семейство GENA на журнальном клубе биоинформатиков из discord. Приходите послушать: https://news.1rj.ru/str/airi_research_institute/287
Кстати, мы тут поняли, что Гена стал Джиной на английском) первое женское имя в названиях наших моделей
Telegram
AIRI Institute
Идеальный план на вечер пятницы – послушать доклад исследователей на OpenBioML Journal Club 👀
Научные сотрудники из групп «Биоинформатика» и «Обучаемый интеллект» расскажут про модели GENA-LM с открытым исходным кодом для длинных последовательностей ДНК.…
Научные сотрудники из групп «Биоинформатика» и «Обучаемый интеллект» расскажут про модели GENA-LM с открытым исходным кодом для длинных последовательностей ДНК.…
🔥7❤5
Сегодня к нам в гости приходил сам великий и прекрасный Антон Чугунов!!! Ученый-биолог, занимающийся моделированием белков в ИБХ, автор образовательных курсов, учредитель и главный редактор «Биомолекулы», а еще человек - «делать». Со студенческой скамьи восхищаюсь Антоном и очень рада, что появилась идея совместного проекта.
А еще Антон в этом году сделал совершенно новый классный курс на Физтехе "Новости компьютерного моделирования биосистем". Все лекции выложил на ютуб, чтобы как всегда хорошо было всем) а 7-8 лекции про современные AI - подходы. В общем, рекомендую очень! А Антону большое спасибо за проделанную работу и открытый доступ к знаниям.
Ссылки по темам лекций:
1. Моделирование рецепторов
2. Моделирование ионных каналов
3. Моделирование больших и сверхбольших систем
4. Без коронавируса не обошлось
5. Фолдинг и взаимодействие молекул
6. Новые технологии молекулярной динамики
7. AlphaFold и RoseTTAFold — нейросетевое шаманство?
8. Белковый дизайн — технология будущего
Или всё это в плейлисте
А еще Антон в этом году сделал совершенно новый классный курс на Физтехе "Новости компьютерного моделирования биосистем". Все лекции выложил на ютуб, чтобы как всегда хорошо было всем) а 7-8 лекции про современные AI - подходы. В общем, рекомендую очень! А Антону большое спасибо за проделанную работу и открытый доступ к знаниям.
Ссылки по темам лекций:
1. Моделирование рецепторов
2. Моделирование ионных каналов
3. Моделирование больших и сверхбольших систем
4. Без коронавируса не обошлось
5. Фолдинг и взаимодействие молекул
6. Новые технологии молекулярной динамики
7. AlphaFold и RoseTTAFold — нейросетевое шаманство?
8. Белковый дизайн — технология будущего
Или всё это в плейлисте
🔥18👍6❤3❤🔥2
Kardymonchik Channel
Завтра вечером Вениамин с Юрой расскажут про семейство GENA на журнальном клубе биоинформатиков из discord. Приходите послушать: https://news.1rj.ru/str/airi_research_institute/287 Кстати, мы тут поняли, что Гена стал Джиной на английском) первое женское имя в названиях…
Если вы вдруг пропустили семинар OpenBioML по семейству языковых моделей ДНК GENA-LM - не беда. Уже доступна запись на ютубе: https://youtu.be/AiVTdcdpq-g
YouTube
GENA-LM - a family of DNA language models
Veniamin Fishman and Yuri Kuratov present "GENA-LM: A Family of Open-Source Foundational Models for Long DNA Sequences" (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.12.544594) at the June 30th OpenBioML Journal Club.
👍8❤3
Меня часто спрашивают, где можно поучиться анализу геномов. Вот очень крутой курс придумали коллеги из Сколтеха. Осенью, по субботам, целый день с геномами растений и людьми, которые в этой теме точно глубоко и по-настоящему… что может быть лучше. И бесплатно. В общем, до 1 августа прием заявок здесь
🔥9❤1👍1
Пока некоторые кураторы программ в одном ведущем ВУЗе РФ считают, что студентов надо учить гуглить, я уверенно заявляю что студентов надо учить писать промты и после критически проверять полученный результат. Вот по первому пункту есть курс от создателей chatGPT. Намереваюсь пройти (хотя бы по диагонали). https://news.1rj.ru/str/dl_stories/780
Telegram
DLStories | Нейронные сети и ИИ
Если уж и проходить курс по промпт-инженирингу ChatGPT, то только такой:
Курс ChatGPT Prompt Engineering for Developers от DeepLearning.Ai в коллаборации с OpenAI. Преподаватели — сам Эндрю Ын и Isa Fulford (Member of Technical Staff, OpenAI).
#learning
…
Курс ChatGPT Prompt Engineering for Developers от DeepLearning.Ai в коллаборации с OpenAI. Преподаватели — сам Эндрю Ын и Isa Fulford (Member of Technical Staff, OpenAI).
#learning
…
❤9
Наконец-то, 8 июля 2023 вышла книга «Artificial Intelligence for Healthy Longevity» под редакцией А. Москалева, И. Стамблера и А. Жаворонкова. В начале 2021 Алексей Москалев пригласил нас поучаствовать в создании этой книги и написать главу про AI в геномике и эпигеномике. Пока раскачались, пока написали - уже начало 2022. Дальше больше года редакторской работы по объединению всех глав, структурированию материала и в 2023 книга вышла в свет. С нетерпением жду бумажный вариант, знаю кто с интересом ее прочитает и оценит. И я рада, что удалось поучаствовать в этом проекте.
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-031-35176-1_11
P.S. как верно подметил Никита Иванисенко, за это время пора уже новую главу писать. Что-то устарело, много нового появилось
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-031-35176-1_11
P.S. как верно подметил Никита Иванисенко, за это время пора уже новую главу писать. Что-то устарело, много нового появилось
SpringerLink
AI in Genomics and Epigenomics
GeneticsGenetics is an important factor determining the predisposition to the development of many diseases and influencing the overall life expectancy of a person. We have already discussed the geneticsGenetics bases of polygenic diseases; in this chapter…
❤14
Наткнулась на хороший пост, рассказывающий, что такое языковые модели и как они используются для работы с геномными данными. Для тех, кому надо «просто и понятно», рекомендую Large Language Models in Molecular Biology на Medium
Medium
Large Language Models in Molecular Biology
Deciphering the language of biology, from DNA to cells to human health
👍11❤1
Готовлюсь выступать на баттле «Биоинформатик vs ИИ» за сторону ИИ (хотя какой тут баттл… Мир, дружба, жвачка …и вместе в светлое будущее). И что я вижу? В Science вчера вышла статья про AlphaMissence - модель, для предсказания патогенности мутаций в кодирующих областях генома, объединившая в себе и Alphafold, и Enformer! Вот здесь ! Жду окончания баттла, чтобы дочитать спокойно об этой подающей надежды архитектуре.
Ps. Нет там никакого энформера, видимо померещилось перед докладом, где его упоминала. Evoformer в архитектуре.
Ps. Нет там никакого энформера, видимо померещилось перед докладом, где его упоминала. Evoformer в архитектуре.
Science
Accurate proteome-wide missense variant effect prediction with AlphaMissense
AlphaFold fine-tuned on human and primate population variant frequency databases predicts variant pathogenicity.
❤10
Так) Стартуем!!!👨💻 👩💻 🧑💻 👩💻 🧑💻
Второй год в рамках AIJ Contest наша команда предоставляет задачу по биоинформатике. В этом году задача подготовлена совместно с ИЦИГ СО РАН и под бдительным контролем Вениамина Фишмана (AIRI, ИЦИГ).
Предлагаем участникам попробовать свои силы в детекции хромосомных перестроек по Hi-C картам: увидите представление генома не по последовательностям букв, а по картинкам, отражающим 3D-укладку в ядре.
Что важно:
🍀 Уже можно регистрироваться здесь и изучать задачу. На следующей неделе можно начинать делать сабмиты первых решений. Срок конкурса - до 7 ноября
🍀 Все задачи в рамках AIJ Contest 2023 здесь . Вас никто не ограничивает только задачей по поиску хромосомных перестроек - можете испытать свои силы во всех задачах сразу и выиграть весь призовой фонд
🍀 Официальный пресс-релиз про соревнование здесь .
Всем участникам желаю удачи и до встречи на ознакомительном вебинаре!
Второй год в рамках AIJ Contest наша команда предоставляет задачу по биоинформатике. В этом году задача подготовлена совместно с ИЦИГ СО РАН и под бдительным контролем Вениамина Фишмана (AIRI, ИЦИГ).
Предлагаем участникам попробовать свои силы в детекции хромосомных перестроек по Hi-C картам: увидите представление генома не по последовательностям букв, а по картинкам, отражающим 3D-укладку в ядре.
Что важно:
Всем участникам желаю удачи и до встречи на ознакомительном вебинаре!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥13
С апреля GENA-LM скачивается около тысячи раз каждый месяц. А вот статистика за сентябрь - более 2-х тысяч скачиваний только с Hugging Face! 🤗
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤8🔥5👏3
Нобелевская премия по физиологии и медицине только что выдана Каталин Карико и Дрю Вейссман за мРНК вакцины от ковида. Очень быстро в этот раз награда нашла своих героев. И да, не все в этом мире делается при помощи ИИ. Хотя сколько моделей было натренировано для короновируса и ковида… плохих и … интересных)
🔥11🤔1👀1