Семинар по кристаллографии белков и малых молекул для самых маленьких
Коллеги, в субботу 15.08.20 в 20:00 по мск проводим семинар с двумя спикерами по введению в кристаллографию.
Соответственно, ведем себя как хорошие котики и разносим эту новость как чуму и СПИД.
Если ты еще не был на наших семинарах, то мы ждем тебя!
Коллеги, в субботу 15.08.20 в 20:00 по мск проводим семинар с двумя спикерами по введению в кристаллографию.
Соответственно, ведем себя как хорошие котики и разносим эту новость как чуму и СПИД.
Если ты еще не был на наших семинарах, то мы ждем тебя!
Forwarded from A Certain Scientific Impostor
Кстати говоря, если кому-то интересно поиграться, то у меня есть установленный ретросинтетический инструмент из статьи ребят из Astra Zeneka. Пишите, дам ссылку потестить, если не поставите сами. Как показывает практика, синтетикам это обычно интересно, а с чего начать и как пользоваться - непонятно, так что пусть будет такой тест-драйв.
Код здесь - GitHub
Код работает на основе алгоритма Монте-Карло поиска по дереву и нейронных сетей (алгоритм Segler-Waller). Утверждают, что это самая быстрая из существующих программ и для большинства соединений синтез ищется меньше чем за 10 секунд (группа в вк Тимура Маджидова)
Пока что реальная полезность для синтетика весьма сомнительна, хотя в качестве игрушки - замечательно, мне понравилось. В некоторых случаях прога выдает дичь (а ля, все 6 стадий типа снять защиту - поставить защиту - снять защиту - поставить защиту на одно и то же место, без какого-либо развития сюжета), но какие-то простые вещи решает адекватно.
Посоветуйте опенсорсные аналоги? Чтобы сравнить. @oikura
Код здесь - GitHub
Код работает на основе алгоритма Монте-Карло поиска по дереву и нейронных сетей (алгоритм Segler-Waller). Утверждают, что это самая быстрая из существующих программ и для большинства соединений синтез ищется меньше чем за 10 секунд (группа в вк Тимура Маджидова)
Пока что реальная полезность для синтетика весьма сомнительна, хотя в качестве игрушки - замечательно, мне понравилось. В некоторых случаях прога выдает дичь (а ля, все 6 стадий типа снять защиту - поставить защиту - снять защиту - поставить защиту на одно и то же место, без какого-либо развития сюжета), но какие-то простые вещи решает адекватно.
Посоветуйте опенсорсные аналоги? Чтобы сравнить. @oikura
ChemRxiv
AiZynthFinder: A Fast Robust and Flexible Open-Source Software for Retrosynthetic Planning
We present the
open-source AiZynthFinder software that can be readily used in retrosynthetic
planning. The algorithm is based on a Monte Carlo tree search that recursively
breaks down a molecule to purchasable precursors. The tree search is guided by
an artificial…
open-source AiZynthFinder software that can be readily used in retrosynthetic
planning. The algorithm is based on a Monte Carlo tree search that recursively
breaks down a molecule to purchasable precursors. The tree search is guided by
an artificial…
Семинар по молекулярному докингу
Господамы, в четверг 03.09.2020 в 20:00 по мск мы в зуме узнаем, что такое докинг, зачем он, поставим smina, openbabel, и задочим аналоги гливека.
Идём на семинар сами, зовём лучшего друга, врага и случайных прохожих.
Господамы, в четверг 03.09.2020 в 20:00 по мск мы в зуме узнаем, что такое докинг, зачем он, поставим smina, openbabel, и задочим аналоги гливека.
Идём на семинар сами, зовём лучшего друга, врага и случайных прохожих.
Для семинара потребуется установленная Anaconda или Miniconda. Это упростит установку openbabel.
Сам софт для докинга — smina — доступен по ссылке: https://sourceforge.net/projects/smina/
Прога работает только под линуксом и для его работы под Windows нужен либо WLS, либо Cygwin (https://www.cygwin.com/).
Семинар пройдет 03.09.2020 в 20:00 по мск в зуме.
Сам софт для докинга — smina — доступен по ссылке: https://sourceforge.net/projects/smina/
Прога работает только под линуксом и для его работы под Windows нужен либо WLS, либо Cygwin (https://www.cygwin.com/).
Семинар пройдет 03.09.2020 в 20:00 по мск в зуме.
SourceForge
smina
Download smina for free. Scoring and Minimization with AutoDock Vina. A fork of AutoDock Vina that is customized to better support scoring function development and high-performance energy minimization. smina is maintained by David Koes at the University of…
Кто уже подготовил свою рабочую машинку к семинару?
Anonymous Poll
18%
Я уже поставил openlabel и конду
34%
Поставлю все в последний момент
47%
Не пойду на семинар
Forwarded from A Certain Scientific Impostor
Релизная версия бота, который проверяет легален ли искомый химический реагент в РФ.
Например, если вы захотели заказать в Китае гамма-бутиролактон в качестве растворителя для изготовления солнечных батареек, то бот вас предупредит, что за такие дела к вам прибежит товарищ майор, и так лучше не делать в РФ.
@legal_chek_bot
Например, если вы захотели заказать в Китае гамма-бутиролактон в качестве растворителя для изготовления солнечных батареек, то бот вас предупредит, что за такие дела к вам прибежит товарищ майор, и так лучше не делать в РФ.
@legal_chek_bot
Forwarded from A Certain Scientific Impostor
Друзья и подписчики, обращаюсь к вам с просьбой посоветовать маркетолога, готового сделать маркетологическое исследование связанное с химической отраслью в РФ. За денюшку, разумеется. Пишите @radical_subject
Forwarded from Химическая свадьба Розенкрейцера (Rostislav)
Der Junge ist zurück. Und er ist wütend wie nie. Добро пожаловатьв новый сезон "Ноль по Хиршу"!
В новом выпуске подкаста мы с @quantum_forest поговорили о психологических проблемах в академии. Для того что бы не звучать полными лопухами мы позвали Марину Ветрову, психиатр-нарколог, научный сотрудник из Перовго Меда. Разговор получился классный, а Марина здорово заобьясняла нам, где в рамках позитивной ментал хелф тусовки булшит, а где правильные слова и действия. (Спойлер: получается что почти нигде не булшит).
/Soundcloud: https://soundcloud.com/user-863019305/mental-health
/ApplePodcasts (пока обрабатывается)
/ЯндексМузыка https://music.yandex.ru/album/10656095/track/74004697
/Castbox https://castbox.fm/app/castbox/player/id1304490/id330182655
В новом выпуске подкаста мы с @quantum_forest поговорили о психологических проблемах в академии. Для того что бы не звучать полными лопухами мы позвали Марину Ветрову, психиатр-нарколог, научный сотрудник из Перовго Меда. Разговор получился классный, а Марина здорово заобьясняла нам, где в рамках позитивной ментал хелф тусовки булшит, а где правильные слова и действия. (Спойлер: получается что почти нигде не булшит).
/Soundcloud: https://soundcloud.com/user-863019305/mental-health
/ApplePodcasts (пока обрабатывается)
/ЯндексМузыка https://music.yandex.ru/album/10656095/track/74004697
/Castbox https://castbox.fm/app/castbox/player/id1304490/id330182655
SoundCloud
Ноль по Хиршу #9 | гость: Марина Ветрова – ментальное здоровье, психика, депрессия в академии
Открываем новый сезон "Ноль по Хиршу" с подкаста, посвященного ментальному здоровью и психике. Сегодня у нас в гостях Марина Ветрова, психиатр-нарколог, научный сотрудник Санкт-Петербургского государс
Forwarded from Химическая свадьба Розенкрейцера (Rostislav)
Но это еще не все! В рамках подкаста мы затронули тему того, что вся доступная нам на данный момент информация о ментальных проблемах в академии характерна для западных студентов и ученых. Поэтому создали опросник на тему проблем ученых и студентов характерных для СНГ и постсоветского простравнства, что бы собрать побольше данных. Его можно заполнить тут: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLScuNj--GAU7N5gwwYJMV5GY9yxCoG01SN5w-PIp_sbZyq_6pQ/viewform
Google Docs
Мини-исследование постсоветской Академии
Здравствуйте!
В разговоре мы (ведущие подкаста "Ноль по Хиршу", Ростислав и Quantum Forest, и гость подкаста Марина Ветрова) затронули вопрос об устройстве академии в постсоветсвом пространстве и как у нас дела с психическим здоровьем людей в академии в России…
В разговоре мы (ведущие подкаста "Ноль по Хиршу", Ростислав и Quantum Forest, и гость подкаста Марина Ветрова) затронули вопрос об устройстве академии в постсоветсвом пространстве и как у нас дела с психическим здоровьем людей в академии в России…
Cеминар про порошковую рентгеновскую дифракцию вот-вот начнётся
Уже через 20 минут!
https://us02web.zoom.us/j/8060421718?pwd=N2FOYzE0MHZ2WHlZeWphOUNhUFBIZz09
Уже через 20 минут!
https://us02web.zoom.us/j/8060421718?pwd=N2FOYzE0MHZ2WHlZeWphOUNhUFBIZz09
Zoom Video
Join our Cloud HD Video Meeting
Zoom is the leader in modern enterprise video communications, with an easy, reliable cloud platform for video and audio conferencing, chat, and webinars across mobile, desktop, and room systems. Zoom Rooms is the original software-based conference room solution…
семинар по истории пигментов и красок в живописи. Уровень химии школьный. Сегодня в 6 по мск. Все
https://us02web.zoom.us/j/8060421718?pwd=N2FOYzE0MHZ2WHlZeWphOUNhUFBIZz09
https://us02web.zoom.us/j/8060421718?pwd=N2FOYzE0MHZ2WHlZeWphOUNhUFBIZz09
Zoom Video
Join our Cloud HD Video Meeting
Zoom is the leader in modern enterprise video communications, with an easy, reliable cloud platform for video and audio conferencing, chat, and webinars across mobile, desktop, and room systems. Zoom Rooms is the original software-based conference room solution…