Как я почти ушла из физики. Продолжаю раскапывать осколки моего очень нелинейного пути к точке, где я есть сейчас.

Ещё про пертурбации в моей научно-обоазовательной жизни. Начнём с самого смешного. Поступая в вышку, я была уверена, что вырасту теоретиком. Вокруг была большая концентрация друзей и старших товарищей-преподавателей теоретиков, это сформировало видение профессии-физика у меня в голове. В середине второго курса у меня случился личный кризис, благодаря которому я окончательно поняла, что теорфиз это не мой путь. И всё вокруг резко потеряло смысл. Скоро было пора выбирать кафедру, теоретическую я перестала рассматривать, а что такое эксперимент и представить не могла.

Выбрать экспериментальную работу очень сложно, надо попробовать и понять, подходит ли, нравится ли. А попыток пробовать никто особо не раздавал. Я ушла в отрицание))0 как раз тогда проходила майнор (двухгодичный непрофильный курс в вышке) по биоинформатике, вспомнила свои прошлые интересы и занырнула туда поглубже. Просилась на работу в Генотек, поступила в Институт биоинформатики. В это же время случился первый локдаун и я методом исключения выбрала кафедру, на которой ни разу не была.

Семестр, когда я училась в двух местах одновременно и закрывала две сессии синхронно, был невероятно тяжёлым. Представьте: на факфизе это кванты-2, две пачки лаб и поездки в черноголовку на базовый день. Добавим 35 часов биоинформатики в неделю))

С продвижением по биоинфопути стал вырисовываться план. Окончить факфиз, параллельно найти себе биоинфомагу/позицию PhD и жить дальше. План был хорош, но для достойных результатов надо было выбрать. Забросить физику и подтянуть прогу там, где не хватало? Стать настолько классной, что моё физическое образование перестанет быть менее выигрышным в сравнении с любым фкновцем?

План был надёжный как швейцарские часы. Но я поняла, что если сейчас сорву все флаги и быстро переориентируюсь в биоинфо, я потеряю возможность в физику не только вернуться, но и попробовать в ней что либо.

Двойная сессия с неделей без сна и защитой семестрового проекта ценой моей жопы стали последней каплей. Я ушла в академ в Институте биоинформатики. План поменялся: даю себе полгода на поиск себя в физике. Получается? Супер. Нет? Возвращаюсь в биоинфо и успеваю доучиться и попасть в магу.

Чем всё кончилось, вы знаете. Я познакомилась с моим научным руководителем и попала в лучшую лабу ever. Там поныне и обитаю.

#путьсамурая

Соре, что я так хаотик врываюсь.
Приснился сон, что нас забанили в журнале PRB. И не то чтобы нас перестали там публиковать или подписку отжали, нет. У нас забрали числа. Все числительные, временные понятия, все вот эти "завтра", "через пятнадцать минут" — всё смыло. Концепт исчислять время исчез, как будто его никогда не было. Лежу в кровати, осознаю, что концепт измерять время был, но сейчас он как будто заблокирован. И я не могу подняться. Не могу измерить, сколько я сплю, пора ли вставать. Как только пытаюсь прикинуть, меня ещё глубже погружает в сонный паралич (?) и я продолжаю лежать.

Апд: сейчас все хорошо, я выбралась из бесчисленного плена. Мне даже успели рассказать, что есть нелегальные числа :)

Принимаю поздравления, друзья, у меня наконец появилось больше работы)

Пока вы задаётесь вопросом, в своем ли я уме, расскажу, почему это так классно.

В нашем институте есть своя чистая зона, подробно про то, что это за зверь и с чем ее едят, рассказала в этом посте. Коротко: чистая зона позволяет изготавливать образцы и делать все промежуточные шаги до самих измерений.

До работы в чистой допускаются не все: прежде всего нужно пройти обучение и сдать экзамен. После этого тебя посвящают в чистокомнатную фею и спектр твоих возможностей становится сильно шире.

В прошлом году у нас был теоретический курс по работе в чистой комнате. Было очень познавательно, но, честно, этот курс так же полезен, как обсуждение вкусоароматической картины блюд французской кухни. Пробовать ничего нельзя, только смотреть и слушать. Так что представление о работе в чистой мы получили, но все-таки отдаленное.

На прошлой неделе снова вспомнила, каково уходить с работы в десятом часу. Настолько, что пришлось не только закрывать лабу после себя, но и открывать её, потому что ребята, ушедшие раньше, про меня забыли, пока я была в другом корпусе.

Спонсор моей большой радости по этому поводу — начало обучения в чистой зоне. Теперь я наконец-то смогу делать свои собственные образцы и стану еще более многопрофильным юнитом.

Что я имею в виду, когда говорю "делать образцы"? Полупроводниковая структура проходит много преобразований, прежде чем я измеряю на ней интересные эффекты. Первое, что нужно сделать — вырастить структуру. Получить качественную структуру нужной архитектуры это отдельная наука, которой люди занимаются годами. Поэтому мы коллаборируемся с группами ростовиков (людей, которые занимаются исключительно ростом) и получаем образцы. В нашем случае самой распространённой технологией роста является MBE — сверхточная и дорогая история, которая позволяет получать многослойные структуры с атомарно точными границами между слоями.

На этапе получения образцов от ростовиков мы имеем большую полупроводниковую "шайбу", из которой уже будут нарезаться кусочки для измерений (во вставку криостата мы можем засунуть образец ограниченного размера, скажем, квадратик 0.5 см на 0.5 см). После нарезки мы делаем свой процессинг (обработку) образца и прикручиваем нужные фичи. Хотим напылить сверху/снизу слой металла как затвор — пожалуйста, вытравить структуру в форме котёнка — тоже. Помимо прочего, в зависимости от методики могут понадобиться ещё добавки: нам всегда нужны контакты, чтобы мерить транспортной методикой, их напыляют сверху из состава под конкретную задачу. Если вы оптик, то ничего не надо, свети, световодом собирай и готово. Все эти доработки делаются штучно под конкретный запрос и, конечно, они делаются в чистой.

Обучение работе в чистой — как очередной кусочек пазла, который позволяет мне делать более завершенную и независимую работу, а также развеять черный ящик, который раньше скрывал от меня процессинг за кадром.

Работа в лабе так или иначе включает в себя компонент общажного флёра.

У вас есть общее пространство, приборы, инструменты. Что-то из этого может быть личным, например, у каждого есть свое рабочее место в офисной части и у нашей маленькой группы есть свой криостат (помимо двух общих, на которых мы регулярно зависаем), свое пространство в лабе, свои ценные и очень ценные материалы для работы. Но иногда что-то теряется или оказывается неожиданно нужным и не находится под рукой. Тогда ты совершаешь крестовый поход к коллеге и договариваешься одолжить что-то. Таким образом всё и вся постоянно мигрирует со своих мест, всё время повышая энтропию. Если с этим не бороться, оно тебя сожрет, поэтому время от времени я выделяю немножко внимания на дополнительную уборку рабочих мест (помимо того, что стараюсь все возвращать на свои места сразу, но знаете как это бывает)). Иногда смотришь на стол: вроде возмутительного срача нет, можно работать. Провалился работать, оглядываешься: везде какой-то мусор, что-то лежит не на своих местах, пылится. Начинаешь убираться, партиями разносишь вещи по своим местам и насчитываешь, что за 5-10 минут около пятнадцати мелочей привел в порядок (считаю я это исключительно для внутренней мотивации).

Пыль это отдельный враг в лабе, с которым борется не только уборщица, но и мы сами. Самую большую из последних уборок мы устроили, когда уронили образец и полтора часа втроём ползали в монтажной в коленно-локтевой и снимали линолеум. Про этот случай будет отдельный пост, такого травматичного опыта у меня в лабе еще не было. 

Обожаю, когда люди думают и делают доказательные графики. Да, это никак не связано с физикой, но пусть эти картинки здесь будут. Кусочки из книги прекрасной Ann Reardon, зависимость текстуры бисквита от количества сахара в рецепте при прочих равных (зависимости от всего остального смотрите в первом комментарии). Очень показательные картинки, сразу понятно, почему пропорции в рецепте такие.

Хочу, чтобы люди во всех сферах так подходили к своей работе ♥️

Сегодня хочу рассказать про очень классный проект, который проделали в издательстве Elsevier.

Какая задача?

Когда вы хотите опубликовать статью и поделиться своим исследованием с миром (а это в общем-то один из немногих показателей вашей продуктивности как научного сотрудника), вы посылаете её в журнал. Редактор проверяет вашу работу и отправляет нескольким (чаще всего 2) рецензентам, относительно близким к вашей научной теме. Рецензенты анонимно изучают вашу работу и пишут отзыв. На основе совокупности рецензий редактор принимает решение: отказать вам, торжественно опубликовать или отправить восвояси доделывать недочёты, указанные в отзывах.

Спустя конечное число подобных  итераций, статья либо отклоняется окончательно, либо принимается к публикации. В случае отклонения, статью можно направить в другой журнал и проходить процедуру снова. Но направлять статью в несколько журналов одновременно запрещено и является нарушением публикационной этики.

В издательстве Elsevier, которое объединяет в себе десятки журналов по разным тематикам, решили узнать, есть ли у них дубликаты статей, которые многократно проходят процедуру проверки. Чтобы вы понимали, при быстром обзоре среди 5 млн статей нашли 10% параллельных переподач в разные журналы.

Почему это может быть проблемой, и кто такие рецензенты?

Рецензирование в научных журналах устроено по принципу peer review. Если вы классный перец в своей области, публикуетесь в журналах и ведёте активную жизнь (=заметны), с вами может связаться журнал и время от времени присылать вам статьи на рецензию. Нюанс: за это вообще не платят, а рецензентов-специалистов может быть человек 100 в мире. А теперь представьте: вы прокручиваете миллионы статей в год и не имеете возможности автоматически проверить, видели ли вы такую же работу. Нагрузка на издателей и рецензентов может раздуваться до бесконечности, а при попытке двойной публикации статьи грозит случиться этический конфликт.

Про то, как возникло решение этой проблемы от идеи до реализации (и про корпоративную работу, и всю математику) можно почитать здесь и здесь. Как обычно в процессе появились подводные камни: выяснилось, что вычислительная сложность будет в 10 раз больше (сначала делали анализ названий статей и абстрактов, после перешли к полным текстам), а продвижение этой идеи снизу вверх заняло почти год.

Круто, что есть люди, которые находят такие задачки и bottom-up решают их, создавая реальный профит на уровне индустрии. Мне, как человеку, не связанному с внутрянкой издательских дел, было очень любопытно узнать, как всё работает и чего стоит реализация такого проекта.

Осень — пора студенческих экскурсий

Наш институт сотрудничает с множеством университетских кафедр, поэтому студенты приходят отовсюду, да ещё и бывают разных возрастов. С моего выступления в Вышке не было ни одной недели, когда к нам бы не приходила экскурсия.

Сегодня я водила по институту 1-2 курсы Физтеха. У нас занимаются очень разнопрофильными задачами, поэтому обзорный обход по нескольким лабораториям — это день. К вечеру студентота уже была еле живая (как впрочем и моя поясница), поэтому вопросов задавали мало. Но "сколько ты зарабатываешь" меня спросили раз пять, не меньше :)

Что ещё хочется сказать?

Мне пришлось выбирать кафедру вслепую, поэтому круто, что сейчас младших студентов водят и показывают, какие где задачи, жизнь и так далее. Это про выбор и это очень важно.

Пришло время очередных находок недели

Напоминаю, что под этим постом вы можете оставлять то, что вам показалось любопытным/забавным и чем хочется поделиться. Welcome, короче.

1) Вышел препринт (то, как статья может жить до официальной публикации в журнале), в котором изучали ключевые точки лиц (мордолиц) кошек. Благодаря этой технологии работают всякие лицевые айди и так далее, в случае животных предлагается считывать мимику, которая связана с болью и оказывать котам более своевременную ветеринарную помощь.

2) Для тех кому зашёл вот этот пост про дубликаты в Elsevier. Автор выпустил продолжение, где по красоте расписана вся математика. Наслаждаемся :)

3) Продолжаю проходить курс по машинному обучению от Вышки, рассказали про рекомендательные системы. Это всё глубоко в нашей жизни присутствует: здесь и рекомендации Ютуба/музыки, самоката, озона и всего, что пытается какие-то услуги продать. Любопытно было узнать, как вообще работают рекомендации и что основное продвижение в этой сфере случилось благодаря Нетфликсу: они устроили контест и автору лучшего рекомендательного алгоритма платили до миллиона $.

Короче, машинное обучение рулит)

Убежала щёлкнуть кошку по её facial landmarks, чтобы она достала свой нос из тарелки. Всем пис!

Сегодня принесла забавное: сработал закон парных случаев.

(Это когда вы обращаете внимание на сравнительно редкое событие, а потом оно вас преследует.)

На прошлой неделе меня позвали участвовать в трансмедиасаенс проекте. Что это такое, я сама не до конца понимаю, но кратко попробую рассказать.

Какие-то люди в Вышке хотят свести людей, которые делают дизайн, геймдев и медиа проекты с теми, кто занимается hard science (физбиохим etc). Совместными усилиями надо получить продукт, который популярно рассказывает о науке и представляет собой фильм/игру/NFT арт, короче, всё, что только можно придумать.

Идея, конечно, забавная, но я настолько с трудом представляю себе реализацию, что отказалась. Да и со временем у меня сейчас не особо. Посмотрим, что сделают ребята, если что-то классное из этого выйдет, будет здорово. (Все ещё не понимаю, как срастить тот же псевдоспин, которым я занимаюсь, с арт-объектом, ну ладно).

Отказалась от участия в проекте, думать об этом забыла. А теперь у нас в Черноголовке проводят лекцию на ту же тему. Какие-то люди из ИТМО будут читать лекцию по Art&Science. Преследует меня эта тема)

Может вы слышали что-то про синергию науки и современного искусства? Есть примеры с удачной реализацией?

Я добираюсь домой в пятницу вечером

Вас уже посетило предновогоднее настроение, или вы со мной в лагере ненавидящих снегопады за перебои в электричестве? (У нас на работе утром был скачок и прибор, который может подать на образец КИЛОВОЛЬТ, перезагрузился ☠️ все живы, кроме моих нервных клеток)

Издательство Elsevier объявляет охоту на ведьм

Принесла ещё мемов из мира издательств, в этот раз обсудим вопрос авторского права.

Начнем с основ. Если вы с наскока захотите скачать какую-нибудь статью, вероятно, вас попросят оформить подписку и заплатить немаленькие деньги (в этот раз мы не говорим об open access случаях).  Так, годовая подписка на Nature Physics обойдется вам в 200 €, а средняя цена за покупку одной статьи составит около 30-40 €.

Для сотрудников научных институтов этот вопрос решается подпиской через организацию (это, конечно, в разы дешевле, чем произведение цены каждой отдельной статьи на число читающих). Вы заходите под правильным айпишником и имеете открытый доступ ко всему, с кем договорился ваш оператор национальной подписки (ныне РЦНИ).

Но и здесь есть нюанс. Иногда хочется прочитать статью из журнала, на который нет подписки (это, к слову, будет почти любой журнал не из вашей области, так у нас нет подписки на журналы для гуманитариев, например, да и не на все физические). Да и вообще, насколько этично ограничивать дистрибуцию всемирного знания? Так появился сайхаб и многие другие сайты/боты, которые помогают студентам и учёным по всему миру пиратить статьи.

У таких ботов всегда есть недостатки: то совсем свежую работу в нем не найти, то их банят (есть костыльные решения, о них ниже). Основатель сайхаба Александра Элбакян годами судилась с Elsevier, а в последние годы на нее подали в суд издатели из Индии. Индийцы сами довольно продолжительное время судятся с Elsevier за свободное распространение знаний. Вот ирония.

Сегодня я поднимаю эту тему, потому что в одном из чатов взаимопомощи, в который люди могут прийти и попросить тех, у кого есть доступ, скачать статью, случилась беда. К работодателям участников чата стали адресно приходить люди, аффилированные с Elsevier, и писать официальные письма о нарушениях. У нас за такое вряд ли будет сильный скандал, а на Западе вполне себе.

В ходе разбирательств выяснили, что при скачивании статьи сохраняются некоторые метаданные (время скачивания, точка доступа, иногда личный аккаунт), которые позволяют вычислять нарушителя. В сообществе уже вовсю бурлят разговоры о том, как переконвертировать пдф и эти следы за собой подчищать.

Пока хочется сказать следующее: если вы находитесь не в России, будьте осторожны с тем, какие статьи распространяете в открытом доступе. Я буду следить за происходящим, обязательно обсудим ещё.

Завтра у нас в институте будет защищать докторскую мой старший коллега и преподаватель. Он занимается очень близкими к моей теме вещами, только смотрит на них через призму оптики (да, я каламбурист). Для меня оптика это почти всегда тёмный лес, но без нее физика, которую мы исследуем не будет такой объёмной, что ли. (Не зря я везде, где могу, показываю картинку с фазовым переходом из *его* оптической статьи).

Собираюсь сходить и послушать, может что-то полезное узнаю. На самом деле в занятиях физикой делать доклады это отдельный навык, поэтому ещё и этому учусь мимоходом. Иногда на докладах удается подцепить классные фишки/идеи :)

Сходила на защиту докторской диссертации. Процедура, конечно, по своей форме специфическая. Но об этом не сегодня. Содержание очень понравилось, было много любопытного про то, как оптикой можно тыкать в разные состояния квантового эффекта Холла.

Кстати по случаю защиты приезжали гости (Пудалов и Глазов), которым меня немножко показывали как экспонат в естественной среде обитания, гыгы.

Пока я лежу и перевариваю банкет (Глазов душка, диссертант — тоже), расскажу, как моя жизнь превратилась в матрицу.

Приходим вчера домой. В ванной опрокинута бельевая корзина, но, спасибо ее механизму, закрыта. Думаю, хорошо, кошки не научились открывать, поднимаю корзину. В комнате на сборовленной (здесь надо передать привет моей Вятской ветке семьи) постели лежит свитер. Свитер, который уже доставали из предыдущей итерации корзины. Это заставило нас купить текущую, которая закрывается лучше. И спрятать в нее свитер (уже окончательно испорченный, но рука выкинуть не поднимается)! Повторяю: кошки достали свитер из корзины и закрыли ее за собой. Медленный вдох. Пожалеть кошек, что им очень грустно и скучно без нас днём. Всё за ними убрать.

Сегодня. Возвращаемся с отмечания успешной защиты. Корзина в ванной опрокинута. Свитер опять в кровати. Я на всякий случай спросила мужа, видит ли он ту же картину, подтвердил.

Что скажете: будет ли свитер завтра?

Upd: шок-контент, свитера не было

С последних находок прошло уже две недели и за это время админ удалил три восьмёрки (потребовалось всего полтора года отрицания) и страдальчески лечится прикладыванием котов.

На этой неделе хочу отметить :

- Любимое про жадин и говядин. Раскопала относительно старую статью на N+1 со географической и возрастной аналитикой из 40+ тыс. ответов. Трепещите, пустые шоколадины!

- Выпуск подкаста "Бостонский брак" с Аней Гладких (можете знать ее как anyagrapes). Очень много нежности про родительство, о том, как бывает на самом деле (очень страшно местами, но абсолютно жизнеутверждающе).

- Новость этой недели: ввели упрощёнку для защиты кандидатской диссертации. Теперь можно сделать доклад на основе своих статей и не писать сам диссер. О том, добро это или зло, поговорим отдельно :)

Пишите в комментариях, что вам показалось любопытным за последние две недели, обсудим!

Упрощёнка для получения кандидатской степени

Продолжаем говорить на остросоциальные темы из мира науки :)

Что случилось?

На прошлой было принято постановление, согласно которому получить кандидатскую степень стало возможно по докладу на основе своих публикаций (которых должно быть ≥ 10 штук уровня ВАК и выше).

Что это значит? Что изменилось?

Ранее для защиты нужно было опубликовать не менее двух статей (могут быть усложнения, в Вышкинском диссовете просили две статьи Q1) и написать диссертацию. После вы проходите много сайд-квестов с отзывами, предзащитой, защитой и вуаля — вы кандидат. Сейчас порог прохождения этой процедуры облегчили, но хорошо ли это?

Для начала давайте попробуем понять, кому в принципе может быть полезно такое изменение и какие есть подводные камни. Обратимся к тексту положения.

Защититься по докладу можно в течение года после окончания аспирантуры, имея не менее 10 публикаций.

В такой постановке защититься могут:

- работающие в одной лабе с бакалавриата и активно публикующиеся молодые люди (про реальность публикационной активности и возможность сделать за это время 10 хороших статей ещё поговорим)
- женщины, уходящие в декрет в аспирантуре (надо уточнять, как это работает и когда формально кончается аспирантура)
- люди, которые публикуются в "мурзилках" (и фиктивно заканчивают заочную аспирантуру для удовлетворения критериев)

Есть опасение, что людей из последней категории будет больше всего и добросовестных людей, кто сможет достойно защититься по докладу, будет мало.

Также указано, что всех диссертантов, защищающихся по докладу, будут вызывать на отдельный экспертный совет ВАК и проверять на актуальность работы и личный вклад. Хочется верить, что пока в составе экспертного совета по физике есть люди вроде Игоря Бурмистрова, этот город может спать спокойно.

Сегодня отправила наконец тезисы на мою любимую нижегородскую конференцию. В том году я в районе этого дедлайна лежала с температурой 40 и узнала, что мои тезисы не тезисы вовсе :( 
Правки в этом году совсем нежные (см. рис.)

Помимо посещения докладов собираюсь увидеть там много знакомых лиц и поесть пельменей))