#مصاحبه
فایل مصاحبه اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی با سرکار خانم مهندس شمسایی برگزیده المپیاد دانشجویی کشور در رشته بیوتکنولوژی کشاورزی.

در این فایل صوتی سرکار خانم مهندس شمسایی به تشریح شرایط برگزاری المپیاد دانشجویی، منابع مورد استفاده در آزمون و همچنین اطلاعات تکمیلی دیگر را در اختیار ما قرار دادند. امیدواریم دانشجویان عزیز بتوانند با پشتکار و تلاش خود گامی موثر در راستای کسب موفقیت های بیشتر در حوزه های تخصصی بردارند و باعث سربلندی و پیشرفت ایران عزیز شوند.
@irbioinformatics
#المپیاد
#بیوتکنولوژی

در مورد وراثت عمودی و افقی ژن چه می دانید؟
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/1033

وراثت عمودی (Vertical Inheritance) به انتقال صفات و ویژگی‌های ژنتیکی از والدین به فرزندان در یک خط خانوادگی اشاره دارد. این فرآیند به‌طور عمده از طریق تولید مثل انجام می‌شود و اطلاعات ژنتیکی در DNA موجود در گامت‌ها (سلول‌های جنسی) منتقل می‌شود. وراثت عمودی شامل انتقال ویژگی‌های فیزیکی، بیماری‌ها و صفات دیگر از نسل به نسل است و این امر می‌تواند تأثیرات چشمگیری بر تکامل و تنوع زیستی داشته باشد. به‌عنوان مثال، صفات ارثی مانند رنگ چشم، قد و مستعد بودن به برخی بیماری‌ها از طریق وراثت عمودی به فرزندان منتقل می‌شود.
@irbioinformatics
در مقابل، وراثت افقی (Horizontal Inheritance) به انتقال ویژگی‌ها و صفات بین افراد غیر مرتبط یا درون گروه‌های مختلف اشاره دارد. این نوع وراثت معمولاً در موجودات میکروسکوپی مانند باکتری‌ها دیده می‌شود، جایی که ژن‌ها می‌توانند از یک سلول به سلول دیگر از طریق روش‌هایی مانند ترانسفورمیشن (جذب DNA از محیط)، ترانسداکشن (انتقال DNA از طریق ویروس‌ها) یا کانژوگیشن (انتقال DNA از یک سلول به سلول دیگر از طریق تماس مستقیم) منتقل شوند. وراثت افقی می‌تواند به سرعت تنوع ژنتیکی را افزایش دهد و در مواردی مانند مقاومت به آنتی‌بیوتیک‌ها در باکتری‌ها نقش مهمی ایفا کند.

اگر روزی دنیا را دوست نداشتی، جایت را عوض کن تا از زاویه ای دیگر به آن بنگری.

دنیا از بعضی زوایا دوست داشتنی ست و در بعضی زوایا نه. در بعضی از زوایا بهتر و زیباست، در بعضی زوایا تاریک و خسته کننده. یادت باشد تو باید جایت را عوض کنی، چرا که دنیا هرگز از جایش تکان نخواهد خورد

صبح سه‌شنبه‌تون بخیر
😘😘

اپیستازی چیست و چه کاربردی دارد؟
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/1036

اپیستازی به معنای تأثیر یک ژن بر بیان یا عملکرد ژن دیگر است. این پدیده می‌تواند در فرآیندهای وراثتی و توسعه صفات مختلف در موجودات زنده نقش مهمی ایفا کند. به عبارت دیگر، وقتی دو یا چند ژن در یک مسیر بیوشیمیایی یا یک فرآیند بیولوژیکی تعامل دارند، یکی از ژن‌ها می‌تواند تأثیر دیگری را مهار یا تقویت کند. این نوع تعاملات می‌توانند منجر به تنوع و پیچیدگی در صفات فنوتیپی شوند.

یکی از مثال‌های بارز اپیستازی، تأثیر رنگ پوست در برخی از حیوانات است. در این حالت، یک ژن می‌تواند رنگ پوست را تحت تأثیر قرار دهد، در حالی که ژن دیگری ممکن است بر توزیع یا شدت رنگ تأثیر بگذارد. بنابراین، حتی اگر یک ژن خاص برای تولید رنگ خاصی وجود داشته باشد، وجود یا عدم وجود ژن‌های دیگر می‌تواند مانع از بروز آن رنگ شود یا آن را تغییر دهد. این نوع تعاملات می‌توانند به طور قابل توجهی بر روی ویژگی‌های ظاهری و عملکردی موجودات زنده تأثیر بگذارند.

اپیستازی همچنین می‌تواند در زمینه‌های تحقیقاتی و پزشکی اهمیت زیادی داشته باشد. درک این پدیده می‌تواند به دانشمندان کمک کند تا الگوهای وراثتی بیماری‌ها را بهتر شناسایی کنند و در نتیجه درمان‌های مؤثرتری ارائه دهند. به عنوان مثال، در برخی از بیماری‌ها، ترکیب خاصی از ژن‌ها ممکن است خطر ابتلا به بیماری را افزایش دهد، در حالی که وجود یک ژن دیگر می‌تواند این خطر را کاهش دهد. بنابراین، مطالعه اپیستازی می‌تواند به کشف راهکارهای جدید برای پیشگیری و درمان بیماری‌ها کمک کند.

اپیستازی به چند نوع مختلف تقسیم می‌شود که هر یک ویژگی‌ها و تأثیرات خاص خود را دارند. در زیر به برخی از انواع اصلی اپیستازی اشاره می‌کنم:

1. اپیستازی غالب (Dominant Epistasis):

• در این نوع، وجود یک آلل غالب در یک ژن می‌تواند اثرات ژن دیگر را کاملاً مهار کند. به عبارت دیگر، حتی اگر یک ژن دیگر دارای آلل‌های مختلف باشد، فقط وجود آلل غالب کافی است تا اثر آن ژن تحت تأثیر قرار گیرد.

• مثال: در گیاهان، وجود یک آلل غالب ممکن است رنگ گل را به طور کامل تغییر دهد، صرف‌نظر از ژن‌های دیگر.

2. اپیستازی مغلوب (Recessive Epistasis):

• در این نوع، برای اینکه اثر یک ژن مهار شود، باید هر دو آلل آن ژن مغلوب باشند. به عبارت دیگر، فقط در صورت وجود دو آلل مغلوب در یک ژن، اثر آن ژن قابل مشاهده نیست.

• مثال: در برخی از حیوانات، وجود دو آلل مغلوب ممکن است باعث شود که رنگ خاصی از مو یا پوست ظاهر نشود.

3. اپیستازی مکمل (Complementary Epistasis):

• در این نوع، دو ژن مختلف باید هر دو فعال باشند تا یک صفت خاص بروز کند. اگر یکی از این دو ژن غیرفعال باشد، صفت مورد نظر بروز نخواهد کرد.

• مثال: در برخی از گیاهان، برای تولید یک رنگ خاص، هر دو ژن باید فعال باشند؛ در غیر این صورت، رنگ مورد نظر ایجاد نمی‌شود.

4. اپیستازی متقابل (Antagonistic Epistasis):

• در این نوع، یک ژن می‌تواند اثرات دیگری را کاهش دهد یا معکوس کند. این نوع اپیستازی معمولاً به صورت تعاملات پیچیده‌ای بین چندین ژن بروز می‌کند.

• مثال: در برخی از موجودات زنده، وجود یک ژن می‌تواند اثرات مثبت یک ژن دیگر را کاهش دهد.

5. اپیستازی چندگانه (Multiple Epistasis):

• در این نوع، چندین ژن به طور همزمان بر روی یک صفت تأثیر می‌گذارند و تعاملات پیچیده‌ای میان آن‌ها وجود دارد.

• مثال: رنگ پوست در انسان‌ها تحت تأثیر چندین ژن قرار دارد که هر کدام به تنهایی و به صورت ترکیبی بر روی رنگ نهایی تأثیر می‌گذارند.

در مجموع، اپیستازی می‌تواند نقش مهمی در تنوع و پیچیدگی صفات موجودات زنده ایفا کند و مطالعه آن می‌تواند به درک بهتر فرآیندهای وراثتی و بیولوژیکی کمک کند.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/1037

Cultivating Success: Interview with Mark van Gerven, UC Davis Outstanding Student Award Winner

✅ Link

✅ Seed World Europe
-------------------------------
@IRBioinformatics

اگر می‌تونستم و اگر قدرت این رو داشتم که فقط یک‌چیز، تنها یک‌چیز رو از هستی و روزگار محو کنم، فقر بود.

💭 هرچی بیشتر به زندگی آدم‌های تاثیرگذار نگاه می‌کنم بیشتر متوجه میشم که اونها تو "نه گفتن" تمایل حیرت‌انگیزی دارن. نه گفتن به هرچیزی که اونها رو از اولویت‌هاشون دور میکنه. میخواد نه گفتن به وسوسه چک کردن گوشی حین درس خوندن باشه! میخواد نه گفتن به یه کنجکاوی بی‌جای خونه خراب کن…

📌 می‌خواد "نه گفتن" به آدمی باشه که می‌دونیم قراره وقت و انرژی و هزینه‌مون رو بگیره! و می‌خواد نه گفتن به یه لذتی باشه که می‌دونیم الان حال میده اما بعدا حتما حال‌مون‌رو می‌گیره!.

📍نه گفتن از تعهد میاد و اگر به چیزی متعهد نباشیم، هرچیزی می‌تونه حواس ما رو به خودش پرت کنه...

📄 Deep learning methods for protein structure prediction

📘Journal: MedComm – Future Medicine
🗓Publish year: 2024

🧑‍💻Authors: Yiming Qin, Zihan Chen, Ye Peng, ...
🏢University: Macau University of Science and Technology, China

📎 Study the paper

📲Channel: @irBioinformatics
#review #deep_learning #protein

📃Diffusion Models in De Novo Drug Design

📔Journal: Journal of Chemical Information and Modeling (I.F.=5.6) - Q1
🗓Publish year: 2024

🧑‍💻Authors: Amira Alakhdar, Barnabas Poczos, Newell Washburn
🏢Universities: Carnegie Mellon University, USA

📎 Study the paper

📲Channel: @irBioinformatics
#review #drug #diffusion

چه استعدادهایی در این مملکت در گمنامی خاموش می شوند 😢 ناز نفست ایشالا هرجا هستی در سلامتی و تندرستی باشی برادر عزیز

منظور از big data چیست و چه کاربردی دارد؟
@irbioinformatics
مفهوم "بیگ دیتا" (Big Data) در حوزه علوم زیستی به مجموعه‌ای از داده‌های بسیار بزرگ و پیچیده اشاره دارد که به‌طور معمول از منابع مختلفی جمع‌آوری می‌شوند. این داده‌ها شامل اطلاعات ژنتیکی، داده‌های بالینی، نتایج آزمایش‌ها، تصاویر پزشکی و حتی داده‌های مربوط به رفتارهای محیطی و اجتماعی هستند. با توجه به رشد سریع تکنولوژی‌های جمع‌آوری داده، حجم این اطلاعات به‌طور تصاعدی افزایش یافته و نیاز به ابزارهای تحلیلی پیشرفته را ایجاد کرده است.

استفاده از بیگ دیتا در علوم زیستی می‌تواند به درک بهتر بیماری‌ها، شناسایی الگوهای جدید در سلامت و پیشگیری از بیماری‌ها کمک کند. به‌عنوان مثال، با تحلیل داده‌های ژنتیکی و بالینی، محققان می‌توانند ارتباطات بین ژن‌ها و بیماری‌ها را شناسایی کنند. همچنین، با استفاده از داده‌های بزرگ، می‌توان به شناسایی عوامل محیطی مؤثر بر سلامت انسان پرداخت و برنامه‌های پیشگیرانه موثرتری طراحی کرد.

چالش‌های مرتبط با بیگ دیتا در علوم زیستی شامل مسائل مربوط به حریم خصوصی، امنیت داده‌ها و یکپارچگی اطلاعات است. همچنین، نیاز به مهارت‌های تحلیلی و فنی برای پردازش و تفسیر این داده‌ها وجود دارد. پژوهشگران باید قادر باشند تا از ابزارهای پیشرفته مانند یادگیری ماشین و هوش مصنوعی برای استخراج اطلاعات مفید از این حجم وسیع داده استفاده کنند.

در نهایت، بیگ دیتا پتانسیل تغییرات بنیادی در تحقیقات زیستی و پزشکی را دارد. با استفاده از این داده‌ها، می‌توان به توسعه درمان‌های شخصی‌سازی‌شده، بهبود کیفیت مراقبت‌های پزشکی و افزایش دقت تشخیص بیماری‌ها دست یافت. این روند نه‌تنها به پیشرفت علم کمک می‌کند بلکه می‌تواند تأثیرات مثبت زیادی بر روی سلامت عمومی و کیفیت زندگی افراد داشته باشد.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/1044

نرگس بیمار تو گشته پرستار من

تا چه کند این طبیب با دل بیمار من

تا چه کند این طبیب با دل بیمار من

نرگس بیمار تو گشته پرستار من

تا چه کند این طبیب با دل بیمار من

رسم تو عاشق کشی پیشه‌ی من عاشقی

تیغ و زدن کار تو کشته شدن کار من
تا ز خط عنبرین حسن تو شد بیش تر

عاشق روی توام بیشتر از پیش تر

پرسش اگر میکنی عاشق درویش را

از همه عاشق ترم وز همه درویش تر

از عشق تو شیدا شدم شیدا شدم شیدا

از عشق تو رسوا شدم رسوا شدم رسوا
فروغی بسطامی