آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
بخاطر اورید اولین زنی که جایزه نوبل دریافت کرد، اولین فردی که دو جایزه نوبل گرفت و هنوز تنها فردی است که در دو دسته علمی مختلف دو جایزه نوبل دریافت کرده است: ماری اسکودوفسکا کوری.
«عجله کن کارتو تموم کن که من هم بتونم به کارم برسم.»
گفته میشود ماری اسکودوفسکا کوری این جمله را هنگام این جلسه عکاسی در آزمایشگاهش به عکاس گفته است. این عکس در اوایل قرن بیستم گرفته شده است.
تلاش خستگیناپذیر کوری برای تحقیق، با نگاهی به دستاوردهای علمیاش کاملاً آشکار میشود. او بیوقفه و با وجود کار فیزیکی سخت و در نهایت مرگبار، عناصر پلونیوم و رادیوم را کشف کرد، استفاده از تابش در پزشکی را ترویج داد و درک ما از رادیواکتیویته را بهطور بنیادین تغییر داد. برای فداکاری علمی و پیشرفتهای چشمگیرش، او جایزه نوبل فیزیک در سال ۱۹۰۳ و جایزه نوبل شیمی در سال ۱۹۱۱ را دریافت کرد. او دانشمندی پیشگام بود.
گفته میشود ماری اسکودوفسکا کوری این جمله را هنگام این جلسه عکاسی در آزمایشگاهش به عکاس گفته است. این عکس در اوایل قرن بیستم گرفته شده است.
تلاش خستگیناپذیر کوری برای تحقیق، با نگاهی به دستاوردهای علمیاش کاملاً آشکار میشود. او بیوقفه و با وجود کار فیزیکی سخت و در نهایت مرگبار، عناصر پلونیوم و رادیوم را کشف کرد، استفاده از تابش در پزشکی را ترویج داد و درک ما از رادیواکتیویته را بهطور بنیادین تغییر داد. برای فداکاری علمی و پیشرفتهای چشمگیرش، او جایزه نوبل فیزیک در سال ۱۹۰۳ و جایزه نوبل شیمی در سال ۱۹۱۱ را دریافت کرد. او دانشمندی پیشگام بود.
❤7👏2👍1
ساختار cryo-EM کمپلکس inhibitor-bound Vo complex from Enterococcus hirae (PDB code: 8WCI)
👍2😱1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
ساختار cryo-EM کمپلکس inhibitor-bound Vo complex from Enterococcus hirae (PDB code: 8WCI)
کمپلکس V₀ از Enterococcus hirae یکی از اجزای کلیدی ATPase نوع واکوئلی (V-ATPase) است که نقش مهمی در انتقال پروتون از طریق غشاهای سلولی ایفا میکند. این پمپ پروتونی برای حفظ تعادل pH، تأمین انرژی برای انتقالات غشایی و همچنین پیشبرد فرآیندهایی مانند سنتز ATP و متابولیسم سلولی ضروری است.
@irbioinformatics
عملکرد اصلی کمپلکس V₀
عملکرد اصلی کمپلکس V₀ انتقال پروتون است. در طی عملیات، دامنه V₁ که به V₀ متصل است، از انرژی حاصل از هیدرولیز ATP برای ایجاد حرکت چرخشی در حلقه c کمپلکس V₀ استفاده میکند. این چرخش به پروتونها امکان میدهد تا از سیتوپلاسم به سمت کمپلکس V₀ حرکت کرده و به فضای خارج سلولی یا واکوئل آزاد شوند. شیب پروتونی تولید شده از این فرآیند به عنوان منبع انرژی برای فرآیندهای فیزیولوژیکی مختلف، از جمله انتقال فعال ثانویه و حفظ تعادل pH داخل سلول، استفاده میشود.
@irbioinformatics
نقش V-ATPase در Enterococcus hirae
در Enterococcus hirae، V-ATPase که شامل کمپلکس V₀ نیز میشود، بهویژه برای خروج یون سدیم اهمیت دارد. این سیستم انتقال Na⁺ را با شیب پروتونی جفت میکند. این تبادل یونی برای سازگاری این باکتری با شرایط محیطی متغیر، از جمله تغییرات غلظت سدیم، حیاتی است.
@irbioinformatics
ساختار و اهمیت کمپلکس V₀
کمپلکس V₀ در Enterococcus hirae بخشی جداییناپذیر از دستگاه V-ATPase باکتریایی است. زیرواحدهای ساختاری آن بهطور هماهنگ کار میکنند تا انتقال پروتون را تسهیل کرده و فرآیندهای حیاتی سلولی مانند تعادل یونی و تولید ATP را پیش ببرند. درک ساختار و عملکرد کمپلکس V₀ برای درک نقشهای فیزیولوژیکی گستردهتر V-ATPase در متابولیسم و بقای باکتریها بسیار مهم است.
@irbioinformatics
عملکرد اصلی کمپلکس V₀
عملکرد اصلی کمپلکس V₀ انتقال پروتون است. در طی عملیات، دامنه V₁ که به V₀ متصل است، از انرژی حاصل از هیدرولیز ATP برای ایجاد حرکت چرخشی در حلقه c کمپلکس V₀ استفاده میکند. این چرخش به پروتونها امکان میدهد تا از سیتوپلاسم به سمت کمپلکس V₀ حرکت کرده و به فضای خارج سلولی یا واکوئل آزاد شوند. شیب پروتونی تولید شده از این فرآیند به عنوان منبع انرژی برای فرآیندهای فیزیولوژیکی مختلف، از جمله انتقال فعال ثانویه و حفظ تعادل pH داخل سلول، استفاده میشود.
@irbioinformatics
نقش V-ATPase در Enterococcus hirae
در Enterococcus hirae، V-ATPase که شامل کمپلکس V₀ نیز میشود، بهویژه برای خروج یون سدیم اهمیت دارد. این سیستم انتقال Na⁺ را با شیب پروتونی جفت میکند. این تبادل یونی برای سازگاری این باکتری با شرایط محیطی متغیر، از جمله تغییرات غلظت سدیم، حیاتی است.
@irbioinformatics
ساختار و اهمیت کمپلکس V₀
کمپلکس V₀ در Enterococcus hirae بخشی جداییناپذیر از دستگاه V-ATPase باکتریایی است. زیرواحدهای ساختاری آن بهطور هماهنگ کار میکنند تا انتقال پروتون را تسهیل کرده و فرآیندهای حیاتی سلولی مانند تعادل یونی و تولید ATP را پیش ببرند. درک ساختار و عملکرد کمپلکس V₀ برای درک نقشهای فیزیولوژیکی گستردهتر V-ATPase در متابولیسم و بقای باکتریها بسیار مهم است.
👍2👌1🤡1
معرفی AlphaBridge
خیلی از دوستانی که با الفافولد کار میکنند موقع حصول خروجی از نرم افزار متاسفانه یا نمی توانند خروجی ها را باز کنند یا هنگام باز کردن انها با نرم افزارهای روتین شماره اتم های خروجی های الفا فولد دارای مشکلاتی است که امکان پردازش های بعدی بر روی انها را دشوار می کند. شما می توانید خروجی های الفافولد رو به الفابریج بدین و از این طریق فایل های pdb بدون نقصی ایجاد کنین که خروجی های شماره اتم و همچنین ارایش کنفورماسیونی صحیح امینواسیدها رو در خودش داره. کافیه فقط خروجی های الفافولد را در ادرس زیر اپلود کنید. برخلاف الفافولد این پلتفرم برای کاربران ایرانی فیلتر نیست. امروز تستش کردیم و عالی بود
https://alpha-bridge.eu/
@irbioinformatics
خیلی از دوستانی که با الفافولد کار میکنند موقع حصول خروجی از نرم افزار متاسفانه یا نمی توانند خروجی ها را باز کنند یا هنگام باز کردن انها با نرم افزارهای روتین شماره اتم های خروجی های الفا فولد دارای مشکلاتی است که امکان پردازش های بعدی بر روی انها را دشوار می کند. شما می توانید خروجی های الفافولد رو به الفابریج بدین و از این طریق فایل های pdb بدون نقصی ایجاد کنین که خروجی های شماره اتم و همچنین ارایش کنفورماسیونی صحیح امینواسیدها رو در خودش داره. کافیه فقط خروجی های الفافولد را در ادرس زیر اپلود کنید. برخلاف الفافولد این پلتفرم برای کاربران ایرانی فیلتر نیست. امروز تستش کردیم و عالی بود
https://alpha-bridge.eu/
@irbioinformatics
👍3🐳1
در چنین روزی مصادف با 8 نوامبر ، در سال ۱۸۹۵، ویلهلم کُونراد رِنْتگِن یکی از مهمترین کشفیات تاریخ علم را انجام داد: اشعه ایکس. هنگامی که در آزمایشگاه خود مشغول کار بود، رِنْتگِن متوجه شد که صفحه فلورسانسی بدون هیچ دلیل ظاهری در حال درخشش است. او چند هفته در آزمایشگاه خود به طور مداوم وقت گذراند و در نهایت توانست علت این درخشش مرموز را شناسایی کند – اشعه ایکس.
اولین تصویری که رِنْتگِن از طریق اشعه ایکس گرفت، دست همسرش برتا بود که در آن حلقه ازدواج او به وضوح قابل مشاهده است. این تصویر یکی از مشهورترین تصاویر علمی تاریخ محسوب میشود.
این کشف باعث شد رِنْتگِن به شهرت جهانی برسد و تبعات پزشکی این کشف بلافاصله به رسمیت شناخته شد. رِنْتگِن نام این کشف را "اشعه ایکس" یا "X-rays" گذاشت، زیرا حرف "X" در ریاضیات به معنای چیز ناشناخته است.
کشف اشعه ایکس باعث شد که رِنْتگِن اولین جایزه نوبل فیزیک را در سال ۱۹۰۱ دریافت کند.
اولین تصویری که رِنْتگِن از طریق اشعه ایکس گرفت، دست همسرش برتا بود که در آن حلقه ازدواج او به وضوح قابل مشاهده است. این تصویر یکی از مشهورترین تصاویر علمی تاریخ محسوب میشود.
این کشف باعث شد رِنْتگِن به شهرت جهانی برسد و تبعات پزشکی این کشف بلافاصله به رسمیت شناخته شد. رِنْتگِن نام این کشف را "اشعه ایکس" یا "X-rays" گذاشت، زیرا حرف "X" در ریاضیات به معنای چیز ناشناخته است.
کشف اشعه ایکس باعث شد که رِنْتگِن اولین جایزه نوبل فیزیک را در سال ۱۹۰۱ دریافت کند.
👍5😈1
مراقب شبکه های کلاهبرداری بازاریابی باشین. این شبکه ها که در ظاهر در قالب شرکت های دارای مجوز فعالیت میکنند، در بطن خود دارای سیستم های پیچیده کلاهبرداری هستند که عمدتا به صورت پولشویی و کلاهبرداری مالی از بازاریابان خود سواستفاده می کنند. این شرکت ها که از اوایل دهه 90 شمسی در ایران فعالیت خود را آغاز کردند عمدتا با دادن وعده های پوچ جوانان مشتاق و جویای کار را در تله می اندازند و سپس با سواستفاده از این شبکه اقدام به ادامه کارهای خلاف خود می کنندکه عمده ترین آنها پولشویی است. مراقب وعده های شبکه های بازاریابی که با حرف های چرب و چیل سعی در فریب شما دارند باشید. از این شبکه های بازاریابی که با اسامی و القاب مختلف در ایران فعالیت می کنند باشید. خواندن این گزارش پیرامون یکی از این شبکه های بازاریابی و فراز و فرود و کلاهبرداری آن از جوانان خالی از لطف نیست.
👍2🍓1
نکته جالبی که در خصوص کمپلکس پروتئوزوم بایستی به آن اشاره کرد این است که در ناحیه کلاهک این کمپلکس یک حلقه هگزامری وجود دارد که به عنوان انفولداز از آن یاد می شود. این حلقه از شش زیرواحد تشکیل شده است که با مصرف مولکول های ATP پروتئینی که قرار است تجزیه شود را به داخل خود می کشد- همانند یک خرمنکوب- و سپس از طریق زیرواحدهای خود فولدینگ و تاخوردگی موجود در ساختمان پروتئین هدف را از بین می برد تا به راحتی مسیر حذف آن در درون سلول را دنبال نماید. زیرواحدهای این حلقه دقیقا در عکس جهت همدیگر عمل میکنند و مانند تیغه های داخل یک خرمنکوب که برای خرد کردن ساقه های گیاهان استفاده می شود به صورت موثری فولدینگ پروتئین را در هم می شکنند...
@irbioinformatics
@irbioinformatics
👍3🫡1
مولکولهای تداخلگر RNA سیستمیک (RNAi) در Caenorhabditis elegans توانایی انتقال RNAهای خاموشکننده از سلولی به سلول دیگر و حتی به نسلهای بعدی را فراهم میکند. گروه پژوهشی کریگ پی. هانتر نشان دادند که پروتئین SID1 بهعنوان یک کانال RNA دو رشتهای، ورود این مولکولها به سلولها را بدون نیاز به انرژی ممکن میسازد. این ویژگی منجر به تحقیقات درباره همولوگهای SID1 در پستانداران (SIDT1 و SIDT2) شده است که میتوانند بهعنوان اهداف دارویی بالقوه در درمانهای مبتنی بر RNA و ارتباطات بین سلولی مورد استفاده قرار گیرندساختار با وضوح بالای کریو-EM پروتئین SID1 در ترکیب با dsRNA جزئیاتی از عملکرد آن را آشکار میسازد که با کد PDB 8XC1 در دسترس است.
👍2🤷♀1
اهمیت راه اندازی مجدد دستگاه تلفن همراه
شما چند وقت یکبار دستگاه تلفن هوشمند خود را راهاندازی دوباره (restart) یا میکنید؟ اگر هفتهها بگذرد و حتی یکبار هم دستگاه تلفن و دیگر دستگاههای هوشمند خود را خاموش و روشن نمیکنید، باید این عادت را تغییر دهید، چرا که طبق گزارش جدید، راهاندازی دوباره دستگاه هوشمند میتواند راهی مؤثر برای پاکسازی بدافزارها از سیستم باشد.
چرا راهاندازی دوباره دستگاه هوشمند میتواند از شما محافظت کند؟
در نگاه اول، ممکن است عجیب به نظر برسد، چون معمولا ویروسها با راهاندازی دوباره سیستم از بین نمیروند. اگر درباره بدافزارهای دسکتاپ صحبت میکردیم، حق با شما بود اما در مورد برخی از بدافزارهای تلفن همراه، شرایط کمی متفاوت است. برخی از انواع بدافزارهای تلفن همراه بهطور کامل روی حافظه RAM دستگاه شما اجرا میشوند. این کار باعث میشود که از دید آنتیویروسها – که معمولا فقط حافظه ذخیرهسازی را اسکن میکنند – پنهان بمانند. اما اگر با انواع حافظههای کامپیوتری آشنا باشید، میدانید که RAM با قطعشدن برق، تمامی دادههای ذخیرهشده خود را از دست میدهد.
بنابراین، یکی از بهترین راهها برای پاکسازی بدافزار در دستگاه تلفن هوشمند این است که بهطور دورهای آن را خاموش کنید. این کار حافظه RAM را پاک کرده و بدافزارهای موجود در آن را حذف میکند.
چه مواردی با راهاندازی دوباره دستگاه تلفن برطرف نمیشوند؟
قبل از اینکه بخواهید برنامه آنتیویروس خود را لغو کنید، توجه داشته باشید که راهاندازی دوباره تلفن فقط بدافزارهایی را که در حافظه RAM هستند، از بین میبرد. اگر بدافزاری روی سیستم شما دانلود شده باشد و در حافظه ذخیرهسازی گوشی قرار گرفته باشد، با ریاستارت از بین نمیرود.
اگر مشکوک هستید که دستگاه تلفنتان به ویروسی آلوده شده و راهاندازی دوباره کمکی به بهبود آن نمیکند، بهتر است از یکی از بهترین اپلیکیشنهای آنتیویروس برای اندروید استفاده و سیستم خود را اسکن کنید. پس از اینکه آنتیویروس تایید کرد که تلفن شما پاک است، میتوانید با ترکیب اسکن و راهاندازی دوباره دورهای، مطمئن شوید که دستگاه شما عاری از بدافزار میماند.
منبع/تواناتک
شما چند وقت یکبار دستگاه تلفن هوشمند خود را راهاندازی دوباره (restart) یا میکنید؟ اگر هفتهها بگذرد و حتی یکبار هم دستگاه تلفن و دیگر دستگاههای هوشمند خود را خاموش و روشن نمیکنید، باید این عادت را تغییر دهید، چرا که طبق گزارش جدید، راهاندازی دوباره دستگاه هوشمند میتواند راهی مؤثر برای پاکسازی بدافزارها از سیستم باشد.
چرا راهاندازی دوباره دستگاه هوشمند میتواند از شما محافظت کند؟
در نگاه اول، ممکن است عجیب به نظر برسد، چون معمولا ویروسها با راهاندازی دوباره سیستم از بین نمیروند. اگر درباره بدافزارهای دسکتاپ صحبت میکردیم، حق با شما بود اما در مورد برخی از بدافزارهای تلفن همراه، شرایط کمی متفاوت است. برخی از انواع بدافزارهای تلفن همراه بهطور کامل روی حافظه RAM دستگاه شما اجرا میشوند. این کار باعث میشود که از دید آنتیویروسها – که معمولا فقط حافظه ذخیرهسازی را اسکن میکنند – پنهان بمانند. اما اگر با انواع حافظههای کامپیوتری آشنا باشید، میدانید که RAM با قطعشدن برق، تمامی دادههای ذخیرهشده خود را از دست میدهد.
بنابراین، یکی از بهترین راهها برای پاکسازی بدافزار در دستگاه تلفن هوشمند این است که بهطور دورهای آن را خاموش کنید. این کار حافظه RAM را پاک کرده و بدافزارهای موجود در آن را حذف میکند.
چه مواردی با راهاندازی دوباره دستگاه تلفن برطرف نمیشوند؟
قبل از اینکه بخواهید برنامه آنتیویروس خود را لغو کنید، توجه داشته باشید که راهاندازی دوباره تلفن فقط بدافزارهایی را که در حافظه RAM هستند، از بین میبرد. اگر بدافزاری روی سیستم شما دانلود شده باشد و در حافظه ذخیرهسازی گوشی قرار گرفته باشد، با ریاستارت از بین نمیرود.
اگر مشکوک هستید که دستگاه تلفنتان به ویروسی آلوده شده و راهاندازی دوباره کمکی به بهبود آن نمیکند، بهتر است از یکی از بهترین اپلیکیشنهای آنتیویروس برای اندروید استفاده و سیستم خود را اسکن کنید. پس از اینکه آنتیویروس تایید کرد که تلفن شما پاک است، میتوانید با ترکیب اسکن و راهاندازی دوباره دورهای، مطمئن شوید که دستگاه شما عاری از بدافزار میماند.
منبع/تواناتک
👍2👏2
در پاسخ به اون فضلا و مراجعی که عملکرد ریس یک شرکت لبنی در برخورد با پرسنلی که ریش و سیبیل دارند رو تقبیح می کنند و با تمام وجود با نقدهای غیر منصفانه و جهت گیری های بدون تفکرشون ثابت کردن بدون مغز هم میشه به زندگی ادامه داد😂🤏•
😁5
معرفی فناوری PROTAC
تهیه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@IRbioinformatics
فناوری PROTAC یا کایمراهای هدف گیرنده تجزیه پروتئین یک رویکرد نوآورانه در کشف دارو است که از ماشین طبیعی تخریب پروتئین در سلول برای حذف انتخابی پروتئینهای هدف بهره میبرد. یک PROTAC مولکولی با عملکرد دو گانه است که از دو بخش اصلی تشکیل شده است که با یک زنجیره انعطافپذیر به هم متصل شدهاند: یک لیگاند که به پروتئین هدف متصل میشود و یک لیگاند که به لیگاز E3 اوبیکوئیتین متصل میشود، که پروتئینها را با مولکولهای اوبیکوئیتین نشانگذاری میکند تا برای تخریب توسط پروتئازوم علامتگذاری شوند.
@IRbioinformatics
زمانی که یک PROTAC به هر دو پروتئین هدف و لیگاز E3 متصل میشود، یک کمپلکس سهگانه تشکیل میدهد که لیگاز و پروتئین هدف را به نزدیکی یکدیگر میآورد. این نزدیکی به لیگاز اجازه میدهد تا انتقال اوبیکوئیتین به پروتئین هدف را کاتالیز کند و آن را برای تخریب نشانگذاری نماید. پس از اوبیکوئیتینگذاری، پروتئین هدف توسط پروتئازوم شناخته شده و تجزیه میشود، که بهطور مؤثری غلظت آن را در سلول کاهش میدهد. این مکانیسم به PROTACها اجازه میدهد تا پروتئینها را تجزیه کنند نه اینکه آنها را مهار کنند، و به این ترتیب ابزاری قدرتمند برای هدفگذاری پروتئینهایی است که معمولاً به دلیل نبود جایگاههای فعال مناسب "غیر قابل داروشدن" در نظر گرفته میشوند.
تهیه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@IRbioinformatics
فناوری PROTAC یا کایمراهای هدف گیرنده تجزیه پروتئین یک رویکرد نوآورانه در کشف دارو است که از ماشین طبیعی تخریب پروتئین در سلول برای حذف انتخابی پروتئینهای هدف بهره میبرد. یک PROTAC مولکولی با عملکرد دو گانه است که از دو بخش اصلی تشکیل شده است که با یک زنجیره انعطافپذیر به هم متصل شدهاند: یک لیگاند که به پروتئین هدف متصل میشود و یک لیگاند که به لیگاز E3 اوبیکوئیتین متصل میشود، که پروتئینها را با مولکولهای اوبیکوئیتین نشانگذاری میکند تا برای تخریب توسط پروتئازوم علامتگذاری شوند.
@IRbioinformatics
زمانی که یک PROTAC به هر دو پروتئین هدف و لیگاز E3 متصل میشود، یک کمپلکس سهگانه تشکیل میدهد که لیگاز و پروتئین هدف را به نزدیکی یکدیگر میآورد. این نزدیکی به لیگاز اجازه میدهد تا انتقال اوبیکوئیتین به پروتئین هدف را کاتالیز کند و آن را برای تخریب نشانگذاری نماید. پس از اوبیکوئیتینگذاری، پروتئین هدف توسط پروتئازوم شناخته شده و تجزیه میشود، که بهطور مؤثری غلظت آن را در سلول کاهش میدهد. این مکانیسم به PROTACها اجازه میدهد تا پروتئینها را تجزیه کنند نه اینکه آنها را مهار کنند، و به این ترتیب ابزاری قدرتمند برای هدفگذاری پروتئینهایی است که معمولاً به دلیل نبود جایگاههای فعال مناسب "غیر قابل داروشدن" در نظر گرفته میشوند.
BioMed Central
Proteolysis-targeting chimera (PROTAC) for targeted protein degradation and cancer therapy - Journal of Hematology & Oncology
Proteolysis-targeting chimera (PROTAC) has been developed to be a useful technology for targeted protein degradation. A bifunctional PROTAC molecule consists of a ligand (mostly small-molecule inhibitor) of the protein of interest (POI) and a covalently linked…
👍6
کمپلکس سهگانه DCAF1-PROTAC-WDR5 پتانسیل فناوری PROTAC را برای تخریب پروتئینهای دشوار برای هدفگذاری، مانند WDR5 برجسته میکند. با بهرهگیری از سیستم اوبیکوئیتین-پروتئازوم سلولی از طریق نزدیکی القایی، این کمپلکس سهگانه امکان تخریب انتخابی و مؤثر WDR5 را فراهم میکند. این رویکرد امیدوارکنندهای برای درمان سرطانها و بیماریهای دیگر مرتبط با اختلالات اپیژنتیک محسوب میشود و راههای جدیدی را برای تنظیم سطوح پروتئین در تحقیقات و کاربردهای درمانی باز میکند. در اینجا میتوانید ساختار کریستالی کمپلکس سهگانه DCAF1 و WDR5 با PROTAC را مشاهده کنید (کد PDB: 9B9T).
👍4❤1