آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.6K subscribers
1.57K photos
46 videos
423 files
725 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
نکته جالبی که در خصوص کمپلکس پروتئوزوم بایستی به آن اشاره کرد این است که در ناحیه کلاهک این کمپلکس یک حلقه هگزامری وجود دارد که به عنوان انفولداز از آن یاد می شود. این حلقه از شش زیرواحد تشکیل شده است که با مصرف مولکول های ATP پروتئینی که قرار است تجزیه شود را به داخل خود می کشد- همانند یک خرمنکوب- و سپس از طریق زیرواحدهای خود فولدینگ و تاخوردگی موجود در ساختمان پروتئین هدف را از بین می برد تا به راحتی مسیر حذف آن در درون سلول را دنبال نماید. زیرواحدهای این حلقه دقیقا در عکس جهت همدیگر عمل میکنند و مانند تیغه های داخل یک خرمنکوب که برای خرد کردن ساقه های گیاهان استفاده می شود به صورت موثری فولدینگ پروتئین را در هم می شکنند...
@irbioinformatics
👍3🫡1
مولکولهای تداخلگر RNA سیستمیک (RNAi) در Caenorhabditis elegans توانایی انتقال RNAهای خاموش‌کننده از سلولی به سلول دیگر و حتی به نسل‌های بعدی را فراهم می‌کند. گروه پژوهشی کریگ پی. هانتر نشان دادند که پروتئین SID1 به‌عنوان یک کانال RNA دو رشته‌ای، ورود این مولکول‌ها به سلول‌ها را بدون نیاز به انرژی ممکن می‌سازد. این ویژگی منجر به تحقیقات درباره همولوگ‌های SID1 در پستانداران (SIDT1 و SIDT2) شده است که می‌توانند به‌عنوان اهداف دارویی بالقوه در درمان‌های مبتنی بر RNA و ارتباطات بین سلولی مورد استفاده قرار گیرندساختار با وضوح بالای کریو-EM پروتئین SID1 در ترکیب با dsRNA جزئیاتی از عملکرد آن را آشکار می‌سازد که با کد PDB 8XC1 در دسترس است.
👍2🤷‍♀1
اهمیت راه اندازی مجدد دستگاه تلفن همراه

شما چند وقت یک‌بار دستگاه تلفن هوشمند خود را راه‌اندازی دوباره (restart) یا می‌کنید؟ اگر هفته‌ها بگذرد و حتی یک‌بار هم دستگاه تلفن و دیگر دستگاه‌های هوشمند خود را خاموش و روشن نمی‌کنید، باید این عادت را تغییر دهید، چرا که طبق گزارش جدید، راه‌اندازی دوباره دستگاه هوشمند می‌تواند راهی مؤثر برای پاک‌سازی بدافزارها از سیستم باشد.

چرا راه‌اندازی دوباره دستگاه هوشمند می‌تواند از شما محافظت کند؟

در نگاه اول، ممکن است عجیب به نظر برسد، چون معمولا ویروس‌ها با راه‌اندازی دوباره سیستم از بین نمی‌روند. اگر درباره بدافزارهای دسکتاپ صحبت می‌کردیم، حق با شما بود اما در مورد برخی از بدافزارهای تلفن همراه، شرایط کمی متفاوت است. برخی از انواع بدافزارهای تلفن همراه به‌طور کامل روی حافظه RAM دستگاه شما اجرا می‌شوند. این کار باعث می‌شود که از دید آنتی‌ویروس‌ها – که معمولا فقط حافظه ذخیره‌سازی را اسکن می‌کنند – پنهان بمانند. اما اگر با انواع حافظه‌های کامپیوتری آشنا باشید، می‌دانید که RAM با قطع‌شدن برق، تمامی داده‌های ذخیره‌شده خود را از دست می‌دهد.

بنابراین، یکی از بهترین راه‌ها برای پاکسازی بدافزار در دستگاه تلفن هوشمند این است که به‌طور دوره‌ای آن را خاموش کنید. این کار حافظه RAM را پاک کرده و بدافزارهای موجود در آن را حذف می‌کند.

چه مواردی با راه‌اندازی دوباره دستگاه تلفن برطرف نمی‌شوند؟

قبل از اینکه بخواهید برنامه آنتی‌ویروس خود را لغو کنید، توجه داشته باشید که راه‌اندازی دوباره تلفن فقط بدافزارهایی را که در حافظه RAM هستند، از بین می‌برد. اگر بدافزاری روی سیستم شما دانلود شده باشد و در حافظه ذخیره‌سازی گوشی قرار گرفته باشد، با ری‌استارت از بین نمی‌رود.

اگر مشکوک هستید که دستگاه تلفن‌تان به ویروسی آلوده شده و راه‌اندازی دوباره کمکی به بهبود آن نمی‌کند، بهتر است از یکی از بهترین اپلیکیشن‌های آنتی‌ویروس برای اندروید استفاده و سیستم خود را اسکن کنید. پس از اینکه آنتی‌ویروس تایید کرد که تلفن شما پاک است، می‌توانید با ترکیب اسکن و راه‌اندازی دوباره دوره‌ای، مطمئن شوید که دستگاه شما عاری از بدافزار می‌ماند.

منبع/تواناتک
👍2👏2
در پاسخ به اون فضلا و مراجعی که عملکرد ریس یک شرکت لبنی در برخورد با پرسنلی که ریش و سیبیل دارند رو تقبیح می کنند و با تمام وجود با نقدهای غیر منصفانه و جهت گیری های بدون تفکرشون ثابت کردن بدون مغز هم میشه به زندگی ادامه داد😂🤏
😁5
معرفی فناوری PROTAC
تهیه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@IRbioinformatics
فناوری PROTAC یا کایمراهای هدف گیرنده تجزیه پروتئین یک رویکرد نوآورانه در کشف دارو است که از ماشین طبیعی تخریب پروتئین در سلول برای حذف انتخابی پروتئین‌های هدف بهره می‌برد. یک PROTAC مولکولی با عملکرد دو گانه است که از دو بخش اصلی تشکیل شده است که با یک زنجیره انعطاف‌پذیر به هم متصل شده‌اند: یک لیگاند که به پروتئین هدف متصل می‌شود و یک لیگاند که به لیگاز E3 اوبیکوئیتین متصل می‌شود، که پروتئین‌ها را با مولکول‌های اوبیکوئیتین نشان‌گذاری می‌کند تا برای تخریب توسط پروتئازوم علامت‌گذاری شوند.
@IRbioinformatics
زمانی که یک PROTAC به هر دو پروتئین هدف و لیگاز E3 متصل می‌شود، یک کمپلکس سه‌گانه تشکیل می‌دهد که لیگاز و پروتئین هدف را به نزدیکی یکدیگر می‌آورد. این نزدیکی به لیگاز اجازه می‌دهد تا انتقال اوبیکوئیتین به پروتئین هدف را کاتالیز کند و آن را برای تخریب نشان‌گذاری نماید. پس از اوبیکوئیتین‌گذاری، پروتئین هدف توسط پروتئازوم شناخته شده و تجزیه می‌شود، که به‌طور مؤثری غلظت آن را در سلول کاهش می‌دهد. این مکانیسم به PROTACها اجازه می‌دهد تا پروتئین‌ها را تجزیه کنند نه این‌که آن‌ها را مهار کنند، و به این ترتیب ابزاری قدرتمند برای هدف‌گذاری پروتئین‌هایی است که معمولاً به دلیل نبود جایگاه‌های فعال مناسب "غیر قابل داروشدن" در نظر گرفته می‌شوند.
👍6
کمپلکس سه‌گانه DCAF1-PROTAC-WDR5 پتانسیل فناوری PROTAC را برای تخریب پروتئین‌های دشوار برای هدف‌گذاری، مانند WDR5 برجسته می‌کند. با بهره‌گیری از سیستم اوبیکوئیتین-پروتئازوم سلولی از طریق نزدیکی القایی، این کمپلکس سه‌گانه امکان تخریب انتخابی و مؤثر WDR5 را فراهم می‌کند. این رویکرد امیدوارکننده‌ای برای درمان سرطان‌ها و بیماری‌های دیگر مرتبط با اختلالات اپی‌ژنتیک محسوب می‌شود و راه‌های جدیدی را برای تنظیم سطوح پروتئین در تحقیقات و کاربردهای درمانی باز می‌کند. در اینجا می‌توانید ساختار کریستالی کمپلکس سه‌گانه DCAF1 و WDR5 با PROTAC را مشاهده کنید (کد PDB: 9B9T).
👍41
مروری کوتاه بر پیری زیستی یا Biological ageing
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
@irbioinformatics
پیری زیستی با کاهش یکپارچگی فیزیولوژیکی مشخص می‌شود و تقریباً هر عضوی از بدن، از جمله عضلات اسکلتی را تحت تأثیر قرار می‌دهد. با افزایش سن، این عضلات با کاهش در توده و عملکرد خود مواجه می‌شوند. این کاهش، که با نام "سارکوپنی یا sarcopenia" شناخته می‌شود، از سال ۲۰۱۸ به عنوان یک بیماری عضلانی طبقه‌بندی شده است، و در این میان، قدرت عضلانی بیش از توده عضلانی به‌عنوان شاخص اصلی سارکوپنی در نظر گرفته می‌شود. در حال حاضر، حدود ۱۰ درصد از سالمندان به سارکوپنی مبتلا هستند، و پیش‌بینی می‌شود که این رقم تا سال ۲۰۴۵ در اروپا به طور قابل توجهی افزایش یابد که به طور منفی بر کیفیت زندگی تأثیر خواهد گذاشت.
@irbioinformatics
مکانیسم‌های دقیق ایجاد سارکوپنی همچنان نامشخص است، اما عواملی مانند اختلال در تنظیم ایمنی و التهاب مزمن در این فرایند نقش دارند. به‌طور سنتی، تصور می‌شد که عملکرد عضله و واکنش ایمنی مستقل از هم هستند؛ اما مطالعات اخیر نشان می‌دهند که عضله اسکلتی ممکن است بر فرآیندهای ایمنی تأثیر بگذارد. اصطلاح "پیری ایمنی" به کاهش عملکرد ایمنی مرتبط با افزایش سن اشاره دارد که با آتروفی تیموس، تجمع سلول‌های T پیریافته و نقص در واکنش‌های ایمنی ذاتی همراه است.
@irbioinformatics
منبع:
Nelke C, Dziewas R, Minnerup J, Meuth SG, Ruck T. Skeletal muscle as potential central link between sarcopenia and immune senescence. EBioMedicine. 2019 Nov;49:381-388. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.10.034
👍5
اینفوگرافی عوامل دخیل در سارکوپنی و پیری زیستی
👍4
#خبر
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
اخیرا یک مطالعه جدید نشان داده است که قارچ کرم ابریشمی (Cordyceps sinensis) می‌تواند رشد سلول‌های سرطانی را کند نماید. این قارچ به دلیل ترکیبات فعال زیستی، از جمله #Cordycepin و پلی‌ساکاریدهای خاص، مورد توجه قرار گرفته است که ممکن است اثرات ضد سرطانی داشته باشند. مطالعات نشان داده‌اند که این ترکیبات می‌توانند فرایندهایی مانند تکثیر سلولی و متاستاز را مهار کنند و آپوپتوز (مرگ برنامه‌ریزی شده سلول‌ها) را در سلول‌های سرطانی تحریک نمایند. این ویژگی‌ها باعث شده که قارچ کرم ابریشم به عنوان یک درمان مکمل در تحقیقات درمان سرطان مورد بررسی قرار گیرد.
@irbioinformatics
👍6
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
#خبر تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران اخیرا یک مطالعه جدید نشان داده است که قارچ کرم ابریشمی (Cordyceps sinensis) می‌تواند رشد سلول‌های سرطانی را کند نماید. این قارچ به دلیل ترکیبات فعال زیستی، از جمله #Cordycepin…
تحقیقات روی ماده شیمیایی تولید شده توسط قارچ کرم ابریشم نشان داده است که این ماده چگونه می‌تواند به عنوان یک درمان برای سرطان عمل کند. این ماده سیگنال‌های رشد سلولی که در سرطان بیش‌فعال هستند را مختل می‌کند و می‌تواند در مقایسه با بسیاری از درمان‌های موجود، آسیب کمتری به بافت‌های سالم وارد کند.

دانشمندان دانشکده داروسازی دانشگاه ناتینگهام در حال بررسی اثرات قارچ انگل‌گونه‌ای هستند که روی کرم‌های ابریشم رشد می‌کند و ممکن است به‌عنوان یک درمان بالقوه برای طیف وسیعی از بیماری‌ها کاربرد داشته باشد. آن‌ها به‌ویژه در حال مطالعه ماده کوردیسپین هستند که یکی از ترکیبات موجود در این قارچ‌هاست. این تحقیق در مجله FEBS Letters منتشر شده است

قارچ‌های کرم ابریشم در آسیا به عنوان غذای سلامت‌بخش و داروی سنتی شهرت دارند. کوردیسپین، که توسط قارچ Cordyceps militaris تولید می‌شود – قارچی نارنجی رنگ که کرم‌های ابریشم را آلوده می‌کند – در مطالعات مختلفی به عنوان داروی ضد سرطان نویدبخش بوده است، اما تاکنون نحوه عملکرد آن مشخص نبوده است.

تیم تحقیقاتی انجام دهنده این مطالعه با استفاده از تکنیک‌های پیشرفته توانستند اثرات کوردیسپین را بر فعالیت هزاران ژن در چندین رده سلولی اندازه‌گیری کنند. نتایج مقایسه اثرات کوردیسپین با سایر درمان‌ها در پایگاه‌های داده نشان داد که کوردیسپین از طریق تأثیرگذاری بر مسیرهای القاکننده رشد در سلول‌ها عمل می‌کند.

با بررسی نحوه عملکرد کوردیسپین درون سلول، تیم تحقیقاتی تأیید کرد که کوردیسپین به کوردیسپین تری‌فسفات تبدیل می‌شود که آنالوگی از حامل انرژی سلول، یعنی ATP است. کوردیسپین تری‌فسفات به عنوان عامل احتمالی اثرات آن بر رشد سلولی شناسایی شد و به این ترتیب، به عنوان مولکولی که می‌تواند مستقیماً بر سلول‌های سرطانی تأثیر بگذارد، معرفی شد.

دکتر کورنلیا د مور، از دانشکده داروسازی دانشگاه ناتینگهام که این پژوهش را رهبری کرده است، توضیح می‌دهد: «ما سال‌هاست که در حال تحقیق روی اثرات کوردیسپین بر طیف وسیعی از بیماری‌ها هستیم و با هر گام به درک نحوه استفاده از آن به عنوان یک درمان مؤثر نزدیک‌تر می‌شویم. یکی از نکات هیجان‌انگیز این است که انجام این آزمایش‌های بزرگ اکنون آسان‌تر و ارزان‌تر شده است، بنابراین توانستیم هزاران ژن را به‌طور همزمان بررسی کنیم.

داده‌های ما تأیید می‌کند که کوردیسپین نقطه شروع خوبی برای داروهای نوین ضد سرطان است و اثرات مفید آن را توضیح می‌دهد. به عنوان مثال، مشتقات کوردیسپین می‌توانند به تولید فرم تری‌فسفات این دارو هدف‌گذاری کنند تا اثر مشابهی داشته باشند. علاوه بر این، این داده‌ها به پایش اثرات کوردیسپین در بیماران کمک خواهد کرد، زیرا داده‌های ما نشان می‌دهند که برخی ژن‌ها به‌طور قابل اعتمادی به کوردیسپین پاسخ می‌دهند، که می‌توان آن‌ها را مثلاً در سلول‌های خونی اندازه‌گیری کرد
👍4
#خبر
تدوین: ادامین کانال
🤏⭕️ارتباط میان سنتز کلسترول و سرطان
در یک مطالعه جدید ارتباط مهمی بین سرطان، سلول‌های بنیادی و اجزای سازنده کلسترول ارائه شده است. به‌طور خاص، این تحقیق نشان می‌دهد که آنزیم FAXDC2 چگونه از طریق نقش خود در سنتز کلسترول، بر رشد و تمایز سلول‌های سرطانی تأثیر می‌گذارد. این یافته‌ها رویکردهای جدیدی را برای درمان سرطان پیشنهاد می‌دهند.
این مطالعه به تشریح زنجیره‌ای از رویدادهای مولکولی می‌پردازد که از سرکوب FAXDC2 آغاز شده و به اختلال در سنتز طبیعی کلسترول و تغییرات سرنوشت سلول‌های سرطانی منتهی می‌شود. این تحقیق بر آسیب‌پذیری احتمالی در سلول‌های سرطانی تأکید دارد که می‌تواند به عنوان هدفی برای مداخله درمانی شناسایی شود
👍4
🚩 کتاب مبانی PCR و طراحی پرایمر تالیف مهندس حسن رسولی و دکتر فاطمه دهقان نیری

🧬 راهنمای جامع آزمایشگاه مولکولی برای یادگیری مراحل تکثیر ژن، اشنایی با طراحی پرایمر، ژنومیکس مقایسه ای، مارکرهای مولکولی و ...

🔑 قابل استفاده برای تمامی دانشجویان علاقه مند به مباحث مولکولی

📦 روش تهیه کتاب: متقاضیان ارجمند می توانند به یکی از سه طریق زیر این کتاب را تهیه نمایند:

۱-مراجعه مستقیم به آدرس انتشارات در خیابان انقلاب: خیابان انقلاب-روبروی دبیرخانه دانشگاه تهران-ساختمان ولیعصر، پلاک ۱۴، طبقه دوم، دفتر مرکزی انتشارات آثار سبحان.

۲- سفارش از طریق واتس اپ: درخواست کتاب با ثبت سفارش از طریق شماره ۰۹۰۱۳۱۰۵۰۳۹

۳-سفارش انلاین از طریق آدرس سایت انتشارات:
www.asaresobhan.com


@irbioinformatics
3👍1
آلودگی های پلاستیکی تأثیرات تمام مرزهای سیاره‌ای را بدتر می‌کند.
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
👍2
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
آلودگی های پلاستیکی تأثیرات تمام مرزهای سیاره‌ای را بدتر می‌کند. تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
یک مقاله جدید نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی به صورت چشمگیری اثرات مخرب بر روی تمام مرزهای سیاره‌ای، از جمله تغییرات اقلیمی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها و از دست رفتن تنوع زیستی را تشدید می‌کند. پیش از مذاکرات نهایی پیمان بین‌المللی پلاستیک، محققان از تصمیم‌گیران می‌خواهند که به آلودگی پلاستیکی فقط به‌عنوان یک مشکل مدیریت پسماند نگاه نکنند.

پاتریشیا ویاروبیا-گومز، نویسنده اصلی مقاله از مرکز تاب‌آوری استکهلم، می‌گوید: "ضروری است که به کل چرخه حیات پلاستیک‌ها توجه کنیم، از استخراج سوخت فسیلی گرفته تا تولید اولیه پلیمرهای پلاستیکی." پلاستیک‌ها به آن اندازه که قبلاً تصور می‌شد ایمن و خنثی نیستند. مقاله پژوهشی جدید که توسط یک تیم بین‌المللی از محققان نوشته شده، از چارچوب مرزهای سیاره‌ای برای ساختاربندی شواهد فزاینده اثرات پلاستیک بر محیط زیست، سلامت و رفاه انسانی استفاده می‌کند. سالانه ۵۰۰ میلیون تن پلاستیک تولید می‌شود، اما تنها ۹ درصد از آن‌ها در سطح جهانی بازیافت می‌شود. پلاستیک‌ها همه جا هستند: از قله کوه اورست تا عمیق‌ترین نقطه گودال ماریانا.
تیم تحقیقاتی از طریق بررسی تحلیلی مطالعات علمی درباره تأثیرات پلاستیک‌ها در محیط طبیعی نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی فرآیندهای کل سیستم زمین را تغییر می‌دهد و بر همه مشکلات مهم زیست‌محیطی جهانی، از جمله تغییرات اقلیمی، از دست رفتن تنوع زیستی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها، و استفاده از آب شیرین و زمین تأثیر می‌گذارد.

این مقاله با عنوان "Plastics pollution exacerbates the impacts of all planetary boundaries
" بر ضرورت درک پیچیدگی پلاستیک‌ها تأکید دارد. به‌عنوان موادی مبتنی بر پلیمرهای مصنوعی که با هزاران ماده شیمیایی دیگر همراه هستند، تأثیرات پلاستیک‌ها در تمام چرخه حیات این محصولات و مواد رخ می‌دهد
پاتریشیا ویاروبیا-گومز، دانشجوی دکتری در مرکز تاب‌آوری استکهلم در دانشگاه استکهلم، می‌گوید: "پلاستیک‌ها به‌عنوان محصولاتی بی‌اثر دیده می‌شوند که از محصولات محبوب ما محافظت می‌کنند یا زندگی ما را آسان‌تر می‌کنند و به‌راحتی قابل پاک‌سازی هستند هنگامی که به زباله تبدیل شوند. اما این دیدگاه بسیار دور از واقعیت است. پلاستیک‌ها از ترکیب هزاران ماده شیمیایی ساخته شده‌اند. بسیاری از این مواد، مانند مختل‌کننده‌های غدد درون‌ریز و مواد شیمیایی ماندگار، دارای سمیّت و زیان برای اکوسیستم‌ها و سلامت انسان هستند. ما باید پلاستیک‌ها را به‌عنوان ترکیبی از این مواد شیمیایی ببینیم که روزانه با آن‌ها تعامل داریم."
👍3
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
دزدا دنبال این پسر ۲۸ساله کردن یارو رفت تو خونه با ار‌پی‌جی برگشت 😂 آرپیجی داشت تو خونه ش 😂🤏🔫
😁6🤣1
آیا می دانید فرایند دیالیز چگونه کار می کند؟ در این مقاله مروری که در ژورنال جاما چاپ شده است چگونگی این فرایند تشریح شده است.
🔥4👏1