معرفی سیستم عامل Rhino Linux
این سیستم عامل نسخه پایدار و جدیدی از توزیع اوبنتو لینوکس است که دارای رابط LTS پایدارتر در مقایسه با اوبنتو کلاسیک است و سادگی و سهولت کار با منوهای این سیستم عامل، آن را به انتخابی مناسب برای متخصصان علوم داده بخصوص بیوانفورماتیکدانان تبدیل کرده است. اجرای نرم افزارهای محاسباتی زیستی در این سیستم عامل به سهولت و با چند کلیک ساده انجام می شود و پیچیدگی های مسیردهی مانند انچه که در توزیع های دیگر لینوکس اتفاق می افتد در اینجا وجود ندارد. اگرچه این سیستم عامل به صورت گسترده در حال حاضر استفاده نمی شود ولی به دلیل فیچرهای خاصی که ارائه می دهد به انتخاب اول متخصصان توسعه نرم افزار و کدهای اجرایی در برخی از زمینه ها تبدیل شده است و پیش بینی می شود در سال های اینده یکی از توزیع های پرکاربرد لینوکس در حوزه انالیزهای زیستی باشد.
دانلود و مشاهده اطلاعات بیشتر
@irbioinformatics
آموزش نصب و اجرای نرم افزارها و مشخصات کلی این سیستم عامل لینوکسی
این سیستم عامل نسخه پایدار و جدیدی از توزیع اوبنتو لینوکس است که دارای رابط LTS پایدارتر در مقایسه با اوبنتو کلاسیک است و سادگی و سهولت کار با منوهای این سیستم عامل، آن را به انتخابی مناسب برای متخصصان علوم داده بخصوص بیوانفورماتیکدانان تبدیل کرده است. اجرای نرم افزارهای محاسباتی زیستی در این سیستم عامل به سهولت و با چند کلیک ساده انجام می شود و پیچیدگی های مسیردهی مانند انچه که در توزیع های دیگر لینوکس اتفاق می افتد در اینجا وجود ندارد. اگرچه این سیستم عامل به صورت گسترده در حال حاضر استفاده نمی شود ولی به دلیل فیچرهای خاصی که ارائه می دهد به انتخاب اول متخصصان توسعه نرم افزار و کدهای اجرایی در برخی از زمینه ها تبدیل شده است و پیش بینی می شود در سال های اینده یکی از توزیع های پرکاربرد لینوکس در حوزه انالیزهای زیستی باشد.
دانلود و مشاهده اطلاعات بیشتر
@irbioinformatics
آموزش نصب و اجرای نرم افزارها و مشخصات کلی این سیستم عامل لینوکسی
👍6
اهمیت روغن کاملینا در صنعت غذایی و مارکتینگ جهانی آن
امروزه تقاضای جهانی برای محصولات پایدار و زیستمحور، باعث گسترش قابل توجهی در بازار روغن camelina sativa, شده است. روغن کملینا که به خاطر ویژگیهای منحصر به فرد و مزایای زیستمحیطیاش ارزشمند است، در چندین صنعت از جمله بیودیزل، مواد غذایی، لوازم آرایشی و دارویی به طور فزایندهای محبوب شده است. امروزه روغن کملینا به یک منبع ارزشمند روغنی تبدیل شده است که این موضوع آن را به حوزهای جذاب برای نوآوری و سرمایهگذاری تبدیل میکند، زیرا مصرفکنندگان و شرکتها به دنبال جایگزینهای دوستدار محیط زیست برای محصولات سنتی هستند. امار و ارقام کنونی نشان می دهد که روغن کاملینا دارای بازار جهانی بسیار خوبی است و در سال 2023 و 2024 بازار فروش جهانی این روغن به حداکثر رشد خود رسیده است و براوردها حاکی از این است همچنان به صورت فزاینده ای تقاضا برای این محصول زیست سازگار و سرشار از مواد مغذی در حال گسترش است. ادامه داستان را در اینجا بخوانید.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/966
امروزه تقاضای جهانی برای محصولات پایدار و زیستمحور، باعث گسترش قابل توجهی در بازار روغن camelina sativa, شده است. روغن کملینا که به خاطر ویژگیهای منحصر به فرد و مزایای زیستمحیطیاش ارزشمند است، در چندین صنعت از جمله بیودیزل، مواد غذایی، لوازم آرایشی و دارویی به طور فزایندهای محبوب شده است. امروزه روغن کملینا به یک منبع ارزشمند روغنی تبدیل شده است که این موضوع آن را به حوزهای جذاب برای نوآوری و سرمایهگذاری تبدیل میکند، زیرا مصرفکنندگان و شرکتها به دنبال جایگزینهای دوستدار محیط زیست برای محصولات سنتی هستند. امار و ارقام کنونی نشان می دهد که روغن کاملینا دارای بازار جهانی بسیار خوبی است و در سال 2023 و 2024 بازار فروش جهانی این روغن به حداکثر رشد خود رسیده است و براوردها حاکی از این است همچنان به صورت فزاینده ای تقاضا برای این محصول زیست سازگار و سرشار از مواد مغذی در حال گسترش است. ادامه داستان را در اینجا بخوانید.
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/966
👍7
ژنوم #کلروپلاست
@irbioinformatics
#ژنوم کلروپلاست یک مولکول DNA حلقوی است که در کلروپلاستهای گیاهان و جلبکها یافت میشود. این ژنوم شامل حدود 120 تا 170 ژن است که برای فتوسنتز و سنتز پروتئینها ضروری هستند. امروزه ژنوم کلروپلاست بهطور گستردهای مورد مطالعه قرار گرفته تا تکامل گیاهان و جلبکها و همچنین مکانیسمهای فتوسنتز را درک کنیم. مقالات مروری و تحقیقاتی که درباره ژنوم کلروپلاست چاپ شده است یک مرور کلی و جامع از ساختار، عملکرد و تکامل آن ارائه میدهند که شامل آخرین تحقیقات و کشفیات است. این بررسیها منابع ارزشمندی برای محققان و دانشجویان در زمینههای زیستشناسی گیاهی، ژنتیک و بیوتکنولوژی هستند. برای آشنایی بیشتر با ژنوم کلروپلاست می توانید این مقاله را مطالعه کنید
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/967
@irbioinformatics
#ژنوم کلروپلاست یک مولکول DNA حلقوی است که در کلروپلاستهای گیاهان و جلبکها یافت میشود. این ژنوم شامل حدود 120 تا 170 ژن است که برای فتوسنتز و سنتز پروتئینها ضروری هستند. امروزه ژنوم کلروپلاست بهطور گستردهای مورد مطالعه قرار گرفته تا تکامل گیاهان و جلبکها و همچنین مکانیسمهای فتوسنتز را درک کنیم. مقالات مروری و تحقیقاتی که درباره ژنوم کلروپلاست چاپ شده است یک مرور کلی و جامع از ساختار، عملکرد و تکامل آن ارائه میدهند که شامل آخرین تحقیقات و کشفیات است. این بررسیها منابع ارزشمندی برای محققان و دانشجویان در زمینههای زیستشناسی گیاهی، ژنتیک و بیوتکنولوژی هستند. برای آشنایی بیشتر با ژنوم کلروپلاست می توانید این مقاله را مطالعه کنید
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/967
👍5
#دانستنیها
#کلروپلاستها، #اندامکهای نیمهخودمختار و فعال متابولیکی هستند که در گیاهان، جلبکها و سیانو باکتریها یافت میشوند. عملکرد اصلی آنها انجام فرآیند #فتوسنتز است که شامل تبدیل انرژی نور به انرژی پیوندهای شیمیایی برای سنتز ترکیبات آلی میشود. پروتئوم کلروپلاستها شامل چندین نوع پروتئین است که علاوه بر فتوسنتز، در بیوسنتز اسیدهای چرب، آمینو اسیدها، هورمونها، ویتامینها، نوکلئوتیدها و متابولیتهای ثانویه شرکت میکنند. بیشتر پروتئینهای کلروپلاست از ژنهای هستهای کدگذاری میشوند. در طول فرایند تکامل، بسیاری از ژنهای کلروپلاستهای باستانی به #هسته سلول منتقل شدهاند. با این حال، پروتئینهایی که برای فتوسنتز ضروری هستند، در #ژنوم کلروپلاست حفظ شدهاند
انتشار با ذکر نام کانال مجاز است
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/971
#کلروپلاستها، #اندامکهای نیمهخودمختار و فعال متابولیکی هستند که در گیاهان، جلبکها و سیانو باکتریها یافت میشوند. عملکرد اصلی آنها انجام فرآیند #فتوسنتز است که شامل تبدیل انرژی نور به انرژی پیوندهای شیمیایی برای سنتز ترکیبات آلی میشود. پروتئوم کلروپلاستها شامل چندین نوع پروتئین است که علاوه بر فتوسنتز، در بیوسنتز اسیدهای چرب، آمینو اسیدها، هورمونها، ویتامینها، نوکلئوتیدها و متابولیتهای ثانویه شرکت میکنند. بیشتر پروتئینهای کلروپلاست از ژنهای هستهای کدگذاری میشوند. در طول فرایند تکامل، بسیاری از ژنهای کلروپلاستهای باستانی به #هسته سلول منتقل شدهاند. با این حال، پروتئینهایی که برای فتوسنتز ضروری هستند، در #ژنوم کلروپلاست حفظ شدهاند
انتشار با ذکر نام کانال مجاز است
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics/971
👍5
ترسیم Chord diagram و پلات های circular با نرم افزار R
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
انتشار و استفاده از این کدها با ذکر نام کانال مجاز است.
@irbioinformatics
با به اشتراک گذاری کانال در میان دوستان خود جامعه مخاطبان کانال را افزایش دهید.
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
انتشار و استفاده از این کدها با ذکر نام کانال مجاز است.
@irbioinformatics
با به اشتراک گذاری کانال در میان دوستان خود جامعه مخاطبان کانال را افزایش دهید.
👍5
ترسیم_Chord_diagram_و_پلات_های_circular_با_نرم.pdf
3 MB
ترسیم Chord diagram و پلات های circular با نرم افزار R
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
انتشار و استفاده از این کدها با ذکر نام کانال مجاز است.
@irbioinformatics
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
انتشار و استفاده از این کدها با ذکر نام کانال مجاز است.
@irbioinformatics
👍5
#دانستنیها
پروتئین PilA5 (کد دسترسی در بانک PDB: 8QQJ) یک زیرواحد حیاتی از پیلوسهای نوع چهارم (T4P) در Thermus thermophilus است، یک باکتری گرمادوست که به دلیل تواناییاش در رشد در محیطهای با دمای بالا شناخته شده است. این پیلوسهای نوع چهارم ساختارهای رشتهای و پویایی هستند که از سطح باکتری بیرون میآیند و نقشهای کلیدی در فرآیندهای مولکولی دارند.این پروتئین از لحاظ ساختاری شباهت زیادی به مرجان های دریایی دارد که در اقیانوس ها زندگی می کنند.
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی.
@irbioinformatics
پروتئین PilA5 (کد دسترسی در بانک PDB: 8QQJ) یک زیرواحد حیاتی از پیلوسهای نوع چهارم (T4P) در Thermus thermophilus است، یک باکتری گرمادوست که به دلیل تواناییاش در رشد در محیطهای با دمای بالا شناخته شده است. این پیلوسهای نوع چهارم ساختارهای رشتهای و پویایی هستند که از سطح باکتری بیرون میآیند و نقشهای کلیدی در فرآیندهای مولکولی دارند.این پروتئین از لحاظ ساختاری شباهت زیادی به مرجان های دریایی دارد که در اقیانوس ها زندگی می کنند.
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی.
@irbioinformatics
👍4
در مورد این تصویر چه چیزی به ذهن شما می رسد؟
اولین چیزی که به ذهن می رسد ترکیبات شیمیایی براساس ساختارشون ممکنه رفتارهای متفاوتی داشته باشن و در نتیجه مکانیسم های مخلتفی از خودشون نشون بدن. ولی ما این تصویر به این خاطر انتخاب کردیم تا نسخه اپدیت شده نرم افزار LiProS رو بهتون معرفی کنیم که در طراحی دارو خیلی کاربرد داره و برای پیشبینی شاخص لیپوفیلیستی ترکیبات مهارکننده برای آنزیم های هدف به کار میره. برای دانلود این نرم افزار رایگان و مطالعه دستورالعمل کار با آن از لینک های زیر استفاده کنید
فایل راهنما
@irbioinformatics
دانلود نرم افزار
اولین چیزی که به ذهن می رسد ترکیبات شیمیایی براساس ساختارشون ممکنه رفتارهای متفاوتی داشته باشن و در نتیجه مکانیسم های مخلتفی از خودشون نشون بدن. ولی ما این تصویر به این خاطر انتخاب کردیم تا نسخه اپدیت شده نرم افزار LiProS رو بهتون معرفی کنیم که در طراحی دارو خیلی کاربرد داره و برای پیشبینی شاخص لیپوفیلیستی ترکیبات مهارکننده برای آنزیم های هدف به کار میره. برای دانلود این نرم افزار رایگان و مطالعه دستورالعمل کار با آن از لینک های زیر استفاده کنید
فایل راهنما
@irbioinformatics
دانلود نرم افزار
👍5
معرفی ابزار آنلاین Expasy pI calculator
این ابزار رایگان یکی از ابزارهای ساده و در عین حال کاربردی برای محاسبه pI است. به طور کلی pH ایزوالکتریک(Isoelectric point یا pI) به نقطهای از pH گفته میشود که در آن یک مولکول، مانند یک پروتئین یا آمینواسید، دارای بار خالص صفر است. در این نقطه، تعداد بارهای مثبت و منفی مولکول با یکدیگر برابر است و مولکول از نظر الکتریکی خنثی میشود. برای پروتئینها یا پپتیدها، pH ایزوالکتریک به شدت به ترکیب آمینواسیدهای تشکیلدهنده آنها بستگی دارد، به ویژه آمینواسیدهایی که دارای گروههای قابل یونیزه شدن (مانند گروههای آمینی و کربوکسیلی) هستند. در pH کمتر از pI، مولکول معمولاً دارای بار مثبت است و در pH بالاتر از pI، مولکول دارای بار منفی میشود. به طور معمول pI در مطالعات بیوشیمیایی و بیوفیزیکی اهمیت زیادی دارد، مثلاً در فرآیندهایی مانند الکتروفورز ایزوالکتریک برای جداسازی پروتئینها و سایر مولکولها از نقطه ایزوالکتریک به وفور استفاده می شود.
@irbioinformatics
این ابزار رایگان یکی از ابزارهای ساده و در عین حال کاربردی برای محاسبه pI است. به طور کلی pH ایزوالکتریک(Isoelectric point یا pI) به نقطهای از pH گفته میشود که در آن یک مولکول، مانند یک پروتئین یا آمینواسید، دارای بار خالص صفر است. در این نقطه، تعداد بارهای مثبت و منفی مولکول با یکدیگر برابر است و مولکول از نظر الکتریکی خنثی میشود. برای پروتئینها یا پپتیدها، pH ایزوالکتریک به شدت به ترکیب آمینواسیدهای تشکیلدهنده آنها بستگی دارد، به ویژه آمینواسیدهایی که دارای گروههای قابل یونیزه شدن (مانند گروههای آمینی و کربوکسیلی) هستند. در pH کمتر از pI، مولکول معمولاً دارای بار مثبت است و در pH بالاتر از pI، مولکول دارای بار منفی میشود. به طور معمول pI در مطالعات بیوشیمیایی و بیوفیزیکی اهمیت زیادی دارد، مثلاً در فرآیندهایی مانند الکتروفورز ایزوالکتریک برای جداسازی پروتئینها و سایر مولکولها از نقطه ایزوالکتریک به وفور استفاده می شود.
@irbioinformatics
👍5