Matrix decomposition
Syllabus for 1st and 2nd sessions
Using linear matrix factorization methods to discover patterns in nature and explaining them
What are patterns?
Projecting high throughput data into high-dimensional spaces
Advantageous of high-dimensional data spaces
[Primers on linear algebra]
Vectors and Vector operations
Thinking in coordinate systems
Linear combinations, span, and basis vectors
Linear dependence
Matrix and matrix operations
Dot product, cosine similarity, covariance, and correlation
Linear transformations, and matrix as a transformation function
Matrix decomposition
Eigendecomposition
Principal Component Analysis (PCA), computation and interpretation
Dimensionality Reduction
Truncation, Elbow rule, Marchenko–Pastur distribution
PCA Application [Hands-on practice in MATLAB]
[Example 1] World Happiness Report
[Example 2] RNA sequencing dataset
[Example 3] Trial-Structured Neural Data
PCA assumptions and limitations
#neurosyntax #matrixdecomposition
Syllabus for 1st and 2nd sessions
Using linear matrix factorization methods to discover patterns in nature and explaining them
What are patterns?
Projecting high throughput data into high-dimensional spaces
Advantageous of high-dimensional data spaces
[Primers on linear algebra]
Vectors and Vector operations
Thinking in coordinate systems
Linear combinations, span, and basis vectors
Linear dependence
Matrix and matrix operations
Dot product, cosine similarity, covariance, and correlation
Linear transformations, and matrix as a transformation function
Matrix decomposition
Eigendecomposition
Principal Component Analysis (PCA), computation and interpretation
Dimensionality Reduction
Truncation, Elbow rule, Marchenko–Pastur distribution
PCA Application [Hands-on practice in MATLAB]
[Example 1] World Happiness Report
[Example 2] RNA sequencing dataset
[Example 3] Trial-Structured Neural Data
PCA assumptions and limitations
#neurosyntax #matrixdecomposition
NeuroSyntax
Matrix decomposition Syllabus for 1st and 2nd sessions Using linear matrix factorization methods to discover patterns in nature and explaining them What are patterns? Projecting high throughput data into high-dimensional spaces Advantageous of high-dimensional…
این کارگاه آموزشی برای افرادی طراحی شده است که با دیتاستهای بزرگ و چندبعدی در حوزههای مختلف مانند علوم اعصاب، ژنتیک، اجتماعی و روانشناسی کار میکنند. کارگاه برای افراد با سطوح مختلف تخصص و علاقهمند به یادگیری عمیق این مفاهیم طراحی شده است. در این دوره، تلاش شده است تا مفاهیم بنیادین این حوزهها به طور دقیق بررسی شوند تا شرکتکنندگان بتوانند درک عمیقی از ریاضیات پایه این مفاهیم کسب کنند. همچنین، مطالب به گونهای سادهسازی شدهاند تا دسترسی به درک خوبی از هر موضوع فراهم آید.
کارگاه شامل مثالهای متنوعی در حوزههای گوناگون است؛ برای مثال، بررسی اهمیت فاکتورهای مختلف در میزان شادی افراد، کشف الگوهای فعالیت نورونی در مجموعهای از نورونها، یا شبکههای ژنی و غیره. هدف از این کارگاه آن است که شرکتکنندگان نه تنها محتوای این رویکردها را به طور عمیق یاد بگیرند بلکه در استفاده از آنها نیز خلاق باشند. برای هر متد، انواع مختلفی از مثالها طراحی شدهاند. همچنین پیشفرضها، محدودیتها و بایاسهای هر متد مورد بررسی قرار گرفته و تفاوتها و شباهتهای متدها نیز بحث شده است.
بسیاری از این متد ها هر چند در منابع دیگه جداگانه آموزش داده میشه اما از یک مجموعه مبانی ریاضیاتی پایه ای بدست میاد. در نتیجه سعی کردم در ریاضیات هم ارتباط متدهای مختلف رو بحث کنم.
#neurosyntax #matrixdecomposition
کارگاه شامل مثالهای متنوعی در حوزههای گوناگون است؛ برای مثال، بررسی اهمیت فاکتورهای مختلف در میزان شادی افراد، کشف الگوهای فعالیت نورونی در مجموعهای از نورونها، یا شبکههای ژنی و غیره. هدف از این کارگاه آن است که شرکتکنندگان نه تنها محتوای این رویکردها را به طور عمیق یاد بگیرند بلکه در استفاده از آنها نیز خلاق باشند. برای هر متد، انواع مختلفی از مثالها طراحی شدهاند. همچنین پیشفرضها، محدودیتها و بایاسهای هر متد مورد بررسی قرار گرفته و تفاوتها و شباهتهای متدها نیز بحث شده است.
بسیاری از این متد ها هر چند در منابع دیگه جداگانه آموزش داده میشه اما از یک مجموعه مبانی ریاضیاتی پایه ای بدست میاد. در نتیجه سعی کردم در ریاضیات هم ارتباط متدهای مختلف رو بحث کنم.
#neurosyntax #matrixdecomposition
NeuroSyntax
Matrix decomposition Syllabus for 1st and 2nd sessions Using linear matrix factorization methods to discover patterns in nature and explaining them What are patterns? Projecting high throughput data into high-dimensional spaces Advantageous of high-dimensional…
یادآوری
نخستین جلسه کارگاه تجزیه ماتریس ها، امروز ساعت 18 به وقت تهران برگزار خواهد شد. دومین جلسه یکشنبه (فردا) همین ساعت خواهد بود. مدت زمان هر جلسه بین 2 تا 3 ساعت.
نخستین جلسه کارگاه تجزیه ماتریس ها، امروز ساعت 18 به وقت تهران برگزار خواهد شد. دومین جلسه یکشنبه (فردا) همین ساعت خواهد بود. مدت زمان هر جلسه بین 2 تا 3 ساعت.
لینک زوم شرکت در کارگاه Matrix Decomposition
https://vanderbilt.zoom.us/j/92059845441
پس از اتصال به لینک روی گزینه میکروفن کلیک کنید و گزینه وایرلس را انتخاب کنید.
برای ورود به لینک زوم ممکن است نیازمند وی پی ان باشید ولی برای مشاهده جلسه نیاز نیست. (پس از وصل شدن به لینک میتوانید وی پی ان را قطع کنید.)
جلسه ساعت 18:00 به وقت تهران آغاز خواهد شد.
#neurosyntax
https://vanderbilt.zoom.us/j/92059845441
پس از اتصال به لینک روی گزینه میکروفن کلیک کنید و گزینه وایرلس را انتخاب کنید.
برای ورود به لینک زوم ممکن است نیازمند وی پی ان باشید ولی برای مشاهده جلسه نیاز نیست. (پس از وصل شدن به لینک میتوانید وی پی ان را قطع کنید.)
جلسه ساعت 18:00 به وقت تهران آغاز خواهد شد.
#neurosyntax
جلسه نخست کارگاه Matrix Decomposition
Youtube link
موضوعات:
Discover patterns in nature and explain them
Patterns
Observation and data structure
Discover patterns in high-throughput datasets
High-dimensional data spaces
Vectors, Matrix, Linear Operations
Dot product, cosine similarity, covariance, correlation
Linear transformations
_________________________________________
_________________________________________
CHAPTERS:
00:00 #1. Introduction
02:50 #2. Discover patterns in nature and explain them
15:30 #3. High-dimensional data spaces
26:53 #4. Vector
54:11 #5. Matrix
01:08:38 #6. Linear Transformations
01:28:07 #7. Summary
دوستان خواهشمندم ویدیوهای یوتیوب رو نشر بدید تا بیشتر دیده بشه. و اینکه اگر در یوتیوب مارو دنبال میکنید کامنت بذارید.
#neurosyntax #video #matrixdecomposition
Youtube link
موضوعات:
Discover patterns in nature and explain them
Patterns
Observation and data structure
Discover patterns in high-throughput datasets
High-dimensional data spaces
Vectors, Matrix, Linear Operations
Dot product, cosine similarity, covariance, correlation
Linear transformations
_________________________________________
_________________________________________
CHAPTERS:
00:00 #1. Introduction
02:50 #2. Discover patterns in nature and explain them
15:30 #3. High-dimensional data spaces
26:53 #4. Vector
54:11 #5. Matrix
01:08:38 #6. Linear Transformations
01:28:07 #7. Summary
دوستان خواهشمندم ویدیوهای یوتیوب رو نشر بدید تا بیشتر دیده بشه. و اینکه اگر در یوتیوب مارو دنبال میکنید کامنت بذارید.
#neurosyntax #video #matrixdecomposition
YouTube
جلسه 1 - کارگاه تجزیه ماتریس ها - ساختار داده، فضاهای داده ابعاد بالا، مبانی جبر خطی
Discover patterns in nature and explain them
Patterns
Observation and data structure
Discover patterns in high-throughput datasets
High-dimensional data spaces
Vectors, Matrix, Linear Operations
Dot product, cosine similarity, covariance, correlation
Linear…
Patterns
Observation and data structure
Discover patterns in high-throughput datasets
High-dimensional data spaces
Vectors, Matrix, Linear Operations
Dot product, cosine similarity, covariance, correlation
Linear…
NeuroSyntax pinned «جلسه نخست کارگاه Matrix Decomposition Youtube link موضوعات: Discover patterns in nature and explain them Patterns Observation and data structure Discover patterns in high-throughput datasets High-dimensional data spaces Vectors, Matrix, Linear Operations…»
جلسه دوم کارگاه Matrix Decomposition
موضوعات:
Youtube link
Eigendecomposition and Principal Component Analysis:
Correlation spaces,
Covariance and correlation matrix
Eigendecomposition
Interpreting PCA output
Dimensionality Reduction
PCA Assumptions and Limitations
________________________________________________
________________________________________________
CHAPTERS:
00:00 #1. Session 1 summary
01:16 #2. Magnitude of a vector
05:50 #3. Patterns and Correlation Spaces
21:08 #4. Compute Covariance Matrix
31:10 #5. Principal Component Analysis
41:38 #6. Eigendecomposition
55:13 #7. Explained Variance
01:00:32 #8. Dimensionality Reduction
01:27:27 #8. Truncation
01:32:07 #9. Marchenko-Pastur Distribution
01:37:23 #10. PCA Uniqueness
01:39:40 #11. PCA assumptions and limitations
#neurosyntax #video #matrixdecomposition
موضوعات:
Youtube link
Eigendecomposition and Principal Component Analysis:
Correlation spaces,
Covariance and correlation matrix
Eigendecomposition
Interpreting PCA output
Dimensionality Reduction
PCA Assumptions and Limitations
________________________________________________
________________________________________________
CHAPTERS:
00:00 #1. Session 1 summary
01:16 #2. Magnitude of a vector
05:50 #3. Patterns and Correlation Spaces
21:08 #4. Compute Covariance Matrix
31:10 #5. Principal Component Analysis
41:38 #6. Eigendecomposition
55:13 #7. Explained Variance
01:00:32 #8. Dimensionality Reduction
01:27:27 #8. Truncation
01:32:07 #9. Marchenko-Pastur Distribution
01:37:23 #10. PCA Uniqueness
01:39:40 #11. PCA assumptions and limitations
#neurosyntax #video #matrixdecomposition
YouTube
جلسه 2 - کارگاه تجزیه ماتریس ها - فضاهای همبستگی، PCA و کاهش ابعاد داده
Eigendecomposition and Principal Component Analysis:
Correlation spaces,
Covariance and correlation matrix
Eigendecomposition
Interpreting PCA output
Dimensionality Reduction
PCA Assumptions and Limitations
________________________________________________…
Correlation spaces,
Covariance and correlation matrix
Eigendecomposition
Interpreting PCA output
Dimensionality Reduction
PCA Assumptions and Limitations
________________________________________________…
دیدگاه های خودتون درباره دو جلسه نخست کارگاه تجزیه ماتریس ها رو میتونید در بخش کامنت های این پست بفرستید. سفر طولانی ای در پیش رو داریم و نگاه های شما به من کمک میکنه که بهتر بدونم از چه بخش های مسیر بیشتر باید عبور کنیم. سپاس
درود دوستان
جلسه امروز کارگاه تجزیه ماتریس ها رو نمیتونم برگزار کنم. جلسه یکشنبه (فردا) برگزار خواهد شد.
در جلسه یکشنبه به بررسی مثال های عملی PCA خواهیم پرداخت.
مثال از جامعه شناسی ( بررسی علل شادمانی کشورها)
ژنتیک (بررسی طبقه بندی سرطان های مختلف بر اساس داده های توالی ژنی)
علوم اعصاب ( پیدا کردن cell assembly ها و بررسی تئوری و عملی neural manifold)
#neurosyntax
جلسه امروز کارگاه تجزیه ماتریس ها رو نمیتونم برگزار کنم. جلسه یکشنبه (فردا) برگزار خواهد شد.
در جلسه یکشنبه به بررسی مثال های عملی PCA خواهیم پرداخت.
مثال از جامعه شناسی ( بررسی علل شادمانی کشورها)
ژنتیک (بررسی طبقه بندی سرطان های مختلف بر اساس داده های توالی ژنی)
علوم اعصاب ( پیدا کردن cell assembly ها و بررسی تئوری و عملی neural manifold)
#neurosyntax
بخشی از مثال هایی که جلسه پیش رو (یکشنبه - فردا - ساعت 6) بررسی خواهیم کرد. مبانی تئوری، علمی و تفسیر کامل بررسی خواهد شد.
دوستانی که جلسات رو همراهی میکنن به صورت حضوری و یا از یوتیوب میتونن برای بحث و طرح سوالات عضو گروه تلگرامی پایین بشن:
https://news.1rj.ru/str/thepath_iran/259062
در اینجا میتونید سوالات خودتون رو مطرح کنید، بحث کنید و رویکردهای جدیدی که میشناسید رو ارائه کنید.
https://news.1rj.ru/str/thepath_iran/259062
در اینجا میتونید سوالات خودتون رو مطرح کنید، بحث کنید و رویکردهای جدیدی که میشناسید رو ارائه کنید.