جلسه آینده درباره الگوریتم UMAP صحبت خواهیم کرد.

UMAP: Uniform Manifold Approximation and Projection for Dimension Reduction

میتونید برای آشنایی اولیه مقاله زیر و ویدیوها رو ببینید:

Uniform manifold approximation and projection

Dimensionality reduction by UMAP to visualize physical and genetic interactions

ویدیو آموزشی

UMAP Dimension Reduction, Main Ideas!!!

UMAP: Mathematical Details (clearly explained!!!)

کاربردها در علوم اعصاب

WaveMAP for identifying putative cell types from in vivo electrophysiology

Topological analysis of sharp-wave ripple waveforms reveals input mechanisms behind feature variations

Analysis methods for large-scale neuronal recordings

آزمایشگاه نوروسینتکس - قسمت 2 - Support Vector Machines

در مجموعه جلسات آزمایشگاه علوم اعصاب، تلاش می‌کنیم خود را جای پژوهشگران مقالات علمی قرار داده و پرسش‌ها و رویکردهای آن‌ها را نقد کنیم. با استفاده از داده‌های به اشتراک‌گذاشته‌شده، به روش‌های متنوع تحلیل داده‌ها آشنا می‌شویم. در این مجموعه، شما یاد می‌گیرید:

تفکر نقادانه داشته باشید.
پرسش‌های مناسب مطرح کنید.
رویکردهای تحلیلی متناسب با پرسش‌های خود انتخاب کنید.
تصاویر جذاب تولید کرده و مقاله بنویسید.

موضوع این قسمت:
آموزش پیاده سازی Classification بر مبنای الگوریتم های Support Vector Machines در پایتون

آنچه در این قسمت خواهید آموخت:

Classification/Decoding/Statistical pattern recognition
Support Vector Machines - Mathematical foundation
Train-Test split to avoid overfit
Cross-validation
Hyperparameters
Hyperparameter Optimization
Assessing linear SVM feature weights in binary classifications
Kernel Methods (Tricks)
Radial basis function kernel
Hypothesis testing with randomization


کانال تلگرام:
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax

#neurosyntax #lab

دوستان اگر امکانش رو دارید کانال یوتیوب نوروسینتکس رو دنبال کنید چه جلسات رو آنلاین میبینید و چه آفلاین پیگیری میکنید. سابسکرایب کردن، لایک کردن و به اشتراک گذاری ویدیو ها کمک بزرگی به گسترش کانال میکنه. اگر درباره جلسات پرسشی هم دارید میتونید به صورت کامنت زیر پست های یوتیوب قرار بدید و من سعی میکنم پاسخ بدم.

اگر افرادی هستن که علاقه مندن و میتونن کاور جلسات رو در اینستاگرام نورسینتکس بذارین و اینستا رو کمی فعال تر کنن زیر این پست بگن. تنها کاری که کافیه بکنید اینکه کاور های یوتیوب رو بگیرید و بذارید اینستا + یک توضیح مختصر از ویدیو.

https://www.youtube.com/@neurosyntaxacademy/videos

بسیاری از ویدیوهای قدیمی نوروسینتکس هم هنوز در یوتیوب بارگزاری نشده. با محدود شدن زمان من کمی دشوار شده پیگیری همه این مسائل. من همیشه علاقه مند بودم و هستم که نوروسینتکس با یک تیم بزرگ رشد بکنه. در نتیجه اگر علاقه مند هستید که فعال محتوا تولید بکنید یا محتواهای تولید شده رو سازمان دهی بکنید پیام بذارید.

درود دوستان. فردا و هفته آینده جلسات آزمایشگاه به صورت حضوری برگزار نخواهد شد. من کوشش میکنم ویدیو UMAP رو به صورت آفلاین ضبط کنم و در یوتیوب قرار بدم و بعدا براش یک جلسه پرسش و پاسخ هم خواهم گذاشت.

صفحه گتهاب آزمایشگاه نوروسینتکس رو راه اندازی کردم. میتونید کدهایی که در جلسات کار میشه رو از این مجموعه دریافت کنید:

https://github.com/NeurosyntaxAcademy/Neurosyntaxlab

#neurosyntax

درود به همگی دوستان

نوروسینتکس چندین سال هست که راه اندازی شده و پیش از اون هم با گروه "مسیر The Path" با بچه ها همراه بودم. برخی از بچه ها الآن بیش از 7-8 سال هست که محتوای تولید شده گروه ها رو دنبال میکنن. در هر مرحله ای از همراهی نوروسینتکس یا مسیر که هستید، در زیر این پست بنویسید که چطور این دو گروه به شکل گیری اندیشه و یا مسیر آموزشی-پژوهشی شما کمک کرده (اگر که کرده)؟ لطفا موارد مشخصی رو نام ببرید. هدفم این هست که از خلال این پیام ها با نوع اثرگذاری گروه هایی که بنیان گذاری کردم آشنا بشم و بدونم مسیر پیشرو رو باید چطور برنامه ریزی کنم.

سپاس

آزمایشگاه نوروسینتکس - قسمت 3 - UMAP

در مجموعه جلسات آزمایشگاه علوم اعصاب، تلاش می‌کنیم خود را جای پژوهشگران مقالات علمی قرار داده و پرسش‌ها و رویکردهای آن‌ها را نقد کنیم. با استفاده از داده‌های به اشتراک‌گذاشته‌شده، به روش‌های متنوع تحلیل داده‌ها آشنا می‌شویم. در این مجموعه، شما یاد می‌گیرید:

- تفکر نقادانه داشته باشید.
- پرسش‌های مناسب مطرح کنید.
- رویکردهای تحلیلی متناسب با پرسش‌های خود انتخاب کنید.
- تصاویر جذاب تولید کرده و مقاله بنویسید.

موضوع این قسمت:
آموزش پیاده سازی Dimensionality Reduction بر مبنای الگوریتم های UMAP در پایتون

Projecting high throughput data into high-dimensional spaces
Feature selection and Dimensionality Reduction
Manual feature selection (cell type classification)
Semi/unsupervised feature selection
Dimensionality reduction methods for unsupervised feature specification
Dimensionality reduction based on Distance Preservation
UMAP: Uniform Manifold Approximation and Projection for Dimension Reduction
Distance measures
Dot product and correlation
Euclidean distance
Building a topological representation
UMAP Hyperparameters
Manifold learning
Improving Clustering Algorithms Using UMAP Dimensionality Reduction Technique
Limitations
Same data, different methods, different results

پیش‌نیازها:
مشاهده جلسات 1 تا 4 مجموعه Matrix Decomposition:
https://www.youtube.com/playlist?list=PLrG-ctUc94nfl3GmepmhouwHbarMXOSgx|

کانال تلگرام:
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax

#neurosyntax #lab

این جلسات شنبه (ساعت 6) برگزار خواهد شد. برای یکشنبه یک برنامه ویژه دیگری داریم با پوریا تدارک میبینیم که اعلام میکنم وقتی برنامه ریزی هاش کامل شد.

به عنوان تمرین ما در جلسه امروز (شنبه) یا جلسه بعدش بخشی از تصویر بالا که مقاله مرجع ما هست رو درست میکنیم. از کدنویسی تا رفتن به Adobe Illustrator و گرفتن خروجی آماده چاپ

جلسه رو بهتره حضوری شرکت کنید هر چند ویدیو جلسه رو میذارم. در جلسه حضوری امتحان پرسش و پاسخ و رفع اشکالات رو دارید و پویایی جلسه بالاتر میشه و برای منم انگیزه بیشتر میشه.

#neurosyntax
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax

جلسه شنبه ساعت شش بعد از ظهر به وقت تهران خواهد بود.