NeuroSyntax – Telegram
NeuroSyntax
4.58K subscribers
399 photos
84 videos
70 files
320 links
Download Telegram
درود دوستان. فردا و هفته آینده جلسات آزمایشگاه به صورت حضوری برگزار نخواهد شد. من کوشش میکنم ویدیو UMAP رو به صورت آفلاین ضبط کنم و در یوتیوب قرار بدم و بعدا براش یک جلسه پرسش و پاسخ هم خواهم گذاشت.
NeuroSyntax pinned «درود دوستان. فردا و هفته آینده جلسات آزمایشگاه به صورت حضوری برگزار نخواهد شد. من کوشش میکنم ویدیو UMAP رو به صورت آفلاین ضبط کنم و در یوتیوب قرار بدم و بعدا براش یک جلسه پرسش و پاسخ هم خواهم گذاشت.»
صفحه گتهاب آزمایشگاه نوروسینتکس رو راه اندازی کردم. میتونید کدهایی که در جلسات کار میشه رو از این مجموعه دریافت کنید:

https://github.com/NeurosyntaxAcademy/Neurosyntaxlab

#neurosyntax
درود به همگی دوستان

نوروسینتکس چندین سال هست که راه اندازی شده و پیش از اون هم با گروه "مسیر The Path" با بچه ها همراه بودم. برخی از بچه ها الآن بیش از 7-8 سال هست که محتوای تولید شده گروه ها رو دنبال میکنن. در هر مرحله ای از همراهی نوروسینتکس یا مسیر که هستید، در زیر این پست بنویسید که چطور این دو گروه به شکل گیری اندیشه و یا مسیر آموزشی-پژوهشی شما کمک کرده (اگر که کرده)؟ لطفا موارد مشخصی رو نام ببرید. هدفم این هست که از خلال این پیام ها با نوع اثرگذاری گروه هایی که بنیان گذاری کردم آشنا بشم و بدونم مسیر پیشرو رو باید چطور برنامه ریزی کنم.

سپاس
NeuroSyntax pinned a photo
آزمایشگاه نوروسینتکس - قسمت 3 - UMAP

در مجموعه جلسات آزمایشگاه علوم اعصاب، تلاش می‌کنیم خود را جای پژوهشگران مقالات علمی قرار داده و پرسش‌ها و رویکردهای آن‌ها را نقد کنیم. با استفاده از داده‌های به اشتراک‌گذاشته‌شده، به روش‌های متنوع تحلیل داده‌ها آشنا می‌شویم. در این مجموعه، شما یاد می‌گیرید:

- تفکر نقادانه داشته باشید.
- پرسش‌های مناسب مطرح کنید.
- رویکردهای تحلیلی متناسب با پرسش‌های خود انتخاب کنید.
- تصاویر جذاب تولید کرده و مقاله بنویسید.

موضوع این قسمت:
آموزش پیاده سازی Dimensionality Reduction بر مبنای الگوریتم های UMAP در پایتون

Projecting high throughput data into high-dimensional spaces
Feature selection and Dimensionality Reduction
Manual feature selection (cell type classification)
Semi/unsupervised feature selection
Dimensionality reduction methods for unsupervised feature specification
Dimensionality reduction based on Distance Preservation
UMAP: Uniform Manifold Approximation and Projection for Dimension Reduction
Distance measures
Dot product and correlation
Euclidean distance
Building a topological representation
UMAP Hyperparameters
Manifold learning
Improving Clustering Algorithms Using UMAP Dimensionality Reduction Technique
Limitations
Same data, different methods, different results

پیش‌نیازها:
مشاهده جلسات 1 تا 4 مجموعه Matrix Decomposition:
https://www.youtube.com/playlist?list=PLrG-ctUc94nfl3GmepmhouwHbarMXOSgx|

کانال تلگرام:
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax

#neurosyntax #lab
درود بر همراهان نوروسینتکس

جلسه جدید آزمایشگاه نوروسینتکس شنبه این هفته ساعت شش برگزار خواهد شد.

در این جلسه یاد میگیریم:

1- با دیتاهای مقاله (فعالیت عصبی نورون ها در زمان پردازش بوهای مختلف) کار کنیم.

2- چطور نتایج رو پلات کنیم و خروجی های تصویری با کیفیت از پایتون بگیریم.

3 - چطور این خروجی ها (تصاویر وکتوری) رو در Adobe Illustrator پردازش کنیم تا به تصاویر با کیفیت برای مقالات برسیم.

4 - آشنایی با برخی از پایگاه های ارائه دهنده تصاویر وکتوری در حوزه علوم زیستی


به اضافه افرادی که تا الآن ما رو همراهی میکردن، این جلسه برای گروه های پایین هم مفید خواهد بود:

1- افرادی که میخوان کار کردن ساده با Adobe Illustrator رو یاد بگیرن

2 - حتی اگر با زبان های برنامه نویسی دیگه (مثل متلب) کار میکنید کار کردن با Illustrator برای شما مفید خواهد بود و قواعد مشابهی رو باید رعایت کنید.

#neurosyntax
جلسه امروز (شنبه) درباره ساخت تصاویر علمی رو از دست ندید. حتی اگر پیشتر تجربه مقاله نویسی دارید این کارگاه میتونه بسیار برای شما مفید باشه. جزئیات بسیاری رو مطرح خواهم کرد از ساختار یک پلات، تا ساختار تصویر و اجزای اون مثل انتخاب رنگ ها، کار با وکتور ها، اهمیت انتخاب پلات درست، بررسی راهنمای ژورنال های مهمی مثل نیچر در پرداخت تصاویر

جلسه شاید دو بخش بشه و بخشی این هفته برگزار بشه و بخشی هفته آینده. بستگی به حجم مطالب و سرعت پیشرفت من در انتقال مطالب خواهد داشت.

#neurosyntax
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax
به عنوان تمرین ما در جلسه امروز (شنبه) یا جلسه بعدش بخشی از تصویر بالا که مقاله مرجع ما هست رو درست میکنیم. از کدنویسی تا رفتن به Adobe Illustrator و گرفتن خروجی آماده چاپ

جلسه رو بهتره حضوری شرکت کنید هر چند ویدیو جلسه رو میذارم. در جلسه حضوری امتحان پرسش و پاسخ و رفع اشکالات رو دارید و پویایی جلسه بالاتر میشه و برای منم انگیزه بیشتر میشه.

#neurosyntax
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax
جلسه شنبه ساعت شش بعد از ظهر به وقت تهران خواهد بود.
همه جلسات در بستر نرم افزار Zoom برگزار میشه. منظور من هم از حضوری، حضور پیدا کردن در این نرم افزار زمان برگزاری جلسه هست. بهتره از الآن نرم افزار زوم رو نصب کنید. لینک شرکت در جلسه رو پیش از جلسه ارسال میکنم در کانال
آزمایشگاه نوروسینتکس - قسمت 4 - Scientific Figures


در مجموعه جلسات آزمایشگاه علوم اعصاب، تلاش می‌کنیم خود را جای پژوهشگران مقالات علمی قرار داده و پرسش‌ها و رویکردهای آن‌ها را نقد کنیم. با استفاده از داده‌های به اشتراک‌گذاشته‌شده، به روش‌های متنوع تحلیل داده‌ها آشنا می‌شویم. در این مجموعه، شما یاد می‌گیرید:

تفکر نقادانه داشته باشید.
پرسش‌های مناسب مطرح کنید.
رویکردهای تحلیلی متناسب با پرسش‌های خود انتخاب کنید.
تصاویر جذاب تولید کرده و مقاله بنویسید.

موضوع این قسمت:
چطور تصاویر علمی با کیفیت تولید کنیم؟

تصویر علمی چیست؟
مبانی طراحی تصاویر علمی چیست؟
انتخاب ساختار درست برای تصاویرعلمی
انتخاب ساختار رنگ ها در تصاویر علمی
برری تفاوت های تصاویر پیکسلی و وکتوری
بررسی معیار های ژورنال های مهمی مانند نیچر


کانال تلگرام:
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax