✍ پیش نیاز های علوم #بیوانفورماتیک

💠 #کموانفورماتیک : بیوانفورماتیک عمومی، بیوانفورماتیک ساختاری، داروسازی و شیمی و دینامیک مولکولی،
زبان برنامه نویسی پایتون...

💠 #ایمونوانفورماتیک :
بیوانفورماتیک عمومی، بیوانفورماتیک ساختاری، ایمونولوژی و میکروبیولوژی و دینامیک مولکولی...

💠 #فیلوژنی و انالیزهای تکاملی:
بیوانفورماتیک عمومی و ژنتیک و بیولوژی سیستمی و اشنایی با الگوریتم های فیلوژنی...

💠 #دینامیک_مولکولی :
بیوانفورماتیک عمومی و ساختاری و شیمی و بیوفیزیک...

💠 #ژنتیک_جمعیت : بیوانفورماتیک عمومی و اشنایی با ژنتیک جمعیت و اصول اماری...

💠 #انالیز_داده های ریزارایه ها، توالی یابی عمیق و RNAse :
اشنایی با زیست مولکولی و مفاهیم اماری و روش مورد استفاده. زبان R و...

💠 #سم_شناسی مجازی. دانش عمیق از سم شناسی و داروسازی

💠 #کیوسار و #فارماکوفور :
دانش عمیق از شیمی فیزیک و تا اندازه ای داروسازی.
امار، روش های کلاسترینگ و دسته بندی

💠 #سیستم_بیولوژی :
شناخت شبکه های زیستی و توانایی انالیز و تفسیر شبکه. آشنایی با نظریه های گراف و شبکه..




🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

☀️ سوالات مطرح شده در گروه:

📂موضوع : #دینامیک_مولکولی

📰 بررسی تاثیر جهش بر روی ساختار پروتئین

❔با سلام خدمت همکاران عزیز در مورد تاثیر جهش های یک ژن بر روی ساختار پروتئین چه نرم افزاری را پیشنهاد ميکنيد؟ (تاثیر جهش بر روی ساختار دوم و سوم پروتئین)

📎 پاسخ های مطرح شده :
شما می توانید تاثیر جهش بروی ساختار پروتئین را با تکنیک #دینامیک_مولکولی بررسی کنید (با پکیج های #گرومکس و #NAMD)
۱-ابتدا با نرم افزار های مانند SPDV جهش های مورد نظرتان را بروی ساختار پروتئین ایجاد کرده.
۲- با استفاده از تکنیک دینامیک مولکولی (پکیج گرومکس) ساختار پروتئین تغییر داده شده را مینیمایز کرده و ساختار های دوم و سوم ان را انالیز کنید.
*سورس پکیج گرومکس در اینترنت موجود است و برروی سیستم عامل #لینوکس نصب می شود*

برخی از نرم افزارهای دینامیک مولکولی مثل gromcas رایگان (free) هستند و برخی نیاز به license دارند. برای مورد شما گرومکس گزینه مناسبی است.
غیر از نرم افزارها، می تونید از server هایی که به این منظور طراحی شدن هم استفاده کنید.

http://mordred.bioc.cam.ac.uk/sdm/sdm.php
http://cupsat.tu-bs.de/
http://omictools.com/protein-stability-change-prediction-category
❔سوال ( 2)
آیا منبع آموزشی و یا مراکزی وجود دارد برای یادگیری تکنیک دینامیک مولکولی؟
📎 پاسخ
منابع آموزشی در اینترنت موجود است. همچنین شما میتوانید از دوره های آموزشی عمومی و خصوصی آزمایشگاه پارس سیلیکو استفاده نمایید.


🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

☀ #سیستم_فارماکولوژی

📂موضوع : #سیستم_بیولوژی

رهیافت های سیستم بیولوژِی در #فارماکولوژی از دیرباز برای درک اثر #دارو استفاده می شده است. به کارگیری روش های سیستم های محاسباتی و تجربی زیست شناسی در فارماکولوژی به ما این اجازه را می دهد تا اصطلاح "#سیستم_فارماکولوژی" را معرفی کنیم، سیستم فارماکولوژی توصیف کننده زمینه ای تازه از تحقیقات در داروسازی می باشد که به ما درباره چگونگی اثر داروها یک دید جامع می دهد. و توصیف میکند که نحوه عمل دارو، ریشه در برهمکنش های مولکولی بین دارو و اهداف خود در بافت سلولی انسان دارد، . پیشرفت ها در سیستم فارماکولوژی، در دراز مدت، به توسعه در کشف داروهای جدید و درمان های موثر برای مدیریت درمان بیمار کمک می کند. چندین کاربرد مهم بالینی در کشف دارو وجود دارد که روش های سیستم های زیست شناسی سهم قابل توجهی در رشد و پیشرفت آن ها داشته است. در اینجا، می توان به پنج مورد از کاربرد های سیستم بیولوژی در کشف دارو اشاره کرد:
(1) شبکه های دارو - هدف
(2) پیش بینی های برهمکنش های بین دارو - هدف
(3) بررسی عوارض جانبی داروها
(4) تغییر استفاده از از دارو و کشف هدف های جدید برای دارو
(5) پیش بینی و پیشگویی استفاده از ترکیب چند دارو


در مطالب بعدی درباره این موارد بیشتر توضیح خواهم داد.

🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

شماره اپریل مجله Sсiеncе
English | 162 pages | True PDF | 71.20 MB
کانال بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

Sсiеncе - 8 April 2016
English | 162 pages | True PDF | 71.20 MB
🔎 عضویت در کانال بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

☀️ سوالات مطرح شده در گروه (پرسش و پاسخ بیوانفورماتیک):

📂موضوع : #پیشگویی_ساختار_پروتئین

📰 سرورهای پیشگویی ساختار دوم پروتئین

سوال (۱)
🔒با سلام برای بدست آوردن ساختار دوم یک پروتئین توالی آن را به 4 سرور Cfssp, Gor4, Rapturx, Predict protein دادم. نتایج با هم متفاوت است. کدام سرور را ملاک قرار بدهم.؟


🔑 پاسخ های مطرح شده :

1- در انتخاب سرور های که برای #پیشگویی_ساختار استفاده می کنید . دقت کافی داشته باشید. از #الگوریتمی که سرور برای پیشگویی استفاده میکنند اطلاع داشته باشید بعضی از سرور های از متد ها و الگوریتم های بسیار قدیمی استفاده میکنند و جواب مناسبی به شما نمیدهند.
2- از سرور های بیشتر و به روزتر و تخصصی تری استفاده کنید. یکی - دو تا از سرور های که استفاده کرده اید. out-of-data و برای پیشگویی ساختار دوم غیر تخصصی هستند.
3- اصولا سرور های "درصد دقت پیشگویی "متد خودشان را ذکر میکنند . به این مورد هم توجه کنید.
2- جدولی تهیه کرده و در یک ستون سرور ها مورد استفاده و متد های مورد استفاده در این سرور ها را درج کنید و در ستون دیگر نتایج پیشگویی، سپس با بررسی این جدول، نتیجه ای که بیشترین اشتراک را در سرور ها داشته را انتخاب نمایید .
لیستی از سرور های پیشگویی ساختار دوم👇
http://www.expasy.org/resources/search/keywords:secondary%20structure%20prediction
http://toolkit.tuebingen.mpg.de/sections/secstruct
http://www.russelllab.org/gtsp/secstrucpred.html


🔑پاسخ 2
تعیین ساختار دوم ، به سبب رشد روزافزون برنامه های پیشگویی ساختار سوم (که ساختار دوم را نیز در خود دارد) و با عملکرد پروتئین نیز رابطه مستقیم داشته و شکل نهایی پروتئین است، مهجور گشته است و محققان تنها در موارد خاص از آن استفاده میک نند. سرور gorV نیز (که شما نسخه 4 آن را ذکر کرده اید) با عملکرد بهتر توسعه یافته است. جهت چاپ مقاله معمول ترین سرور که در مقالات به تواتر استفاده شده استgor می باشد و از نظر داوران قابل پذیرش است. شما به صورت چشمی نیز در صورت داشتن علم کافی از بیوانفورماتیک ساختاری می توانید میان سرورها قضاوت کنید و در معرفی هر سرور ارائه شد بهترین را از نظر حساسیت و دقت انتخاب کنید. شایان ذکر است امروزه با پیشرفت پایگاههای داده پروتئین نیاز به انجام این انالیز وجود ندارد و پایگاههای داده به صورت پایه این انالیز و انالیزهای سطح پایه را انجام می دهند. رجوع شود به پایگاه داده uniprotkb


🔒سوال ( 2)
آیا در انتخاب سرور مناسب باید به تعدد استفاده سرور در مقالات بسنده کنیم که نشانه اعتماد عمومی به سرور موردنظر است و یا اینکه به ادعای دقت سرورهای جدید و روشهای پیشگویی مدرنتر توجه کنیم که شاید مانند قبلی پر استفاده هم نباشد.
مثلا روش neural network که جدیدتر است و ادعای دقت 70 درصدی را در مقابل روش gor با دقت 65درصدی دارد و از آن هم جدیدتر روش deep neural network سرور spider2 و سرور قدیمیتر Rapturx است که دقت بالای 80 درصدی دارند؟


🔑 پاسخ (1)
تعدد استفاده از یک سرور ، ملاک "مناسب بودن آن سرور" نمی‌تواند باشد.
خوب بودن سرور و متد مورد استفاده، باید از روی اعتبارسنجی که بروی سرور ها صورت گرفته ، تعیین شود.
در مورد deep learning، مقالات جدید، نشون داده که نتایج بهتری در پیشگویی ساختار پروتئین میدهد.

🔑 پاسخ (2)
یک سرور پیشگویی کننده می بایست حداقل شش ماه تا یک سال از زمان تاسیس آن بگذرد تا عملکرد درست ان برای پروتئین های مختلف مشخص شود و همچنین در مقایسه سرورها، علاوه بر توجه به دقت و حساسیت آن ، می بایست به Trained dataset داده شده جهت توسعه اشان توجه کرد . *همچنین در صورت وجود پروتئین جدید، ما می توانیم به نتایج پروتئین های موجود از همان پروتئین یا پروتئین های هومولگ در پایگاه داده نگاهی انداخته و پروتئین خود را برمبنای انها، جهت ساختار دوم بررسی کنیم همچنین اگر کریستالوگرافی پروتئین موجود باشد بسیار این امر اسان تر می گردد.* از سوی دیگر الگوریتم های recurrent neural network و svm نسبت به الگوریتم NN معمولی کارایی بالاتری دارد. در #بیوانفورماتیک هیبرید کار کردن و استفاده از چند سرور می تواند مفید باشد.


👇👇👇
◀️نظر شما در مورد پاسخ های ارایه شده چیست؟؟؟▶️
💎پاسخ خود را می توانید با مدیریت کانال با ایدی @Bioinformatics1 در میان بگذارید.💎


🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

☀️ جلسه رفع اشکال

📂موضوع : جلسه رفع اشکال طراحی دارو ( #داکینگ )

آزمایشگاه پارس سیلیکو با توجه به رسالت خود که معرفی و آموزش علوم #زیست_شناسی_محاسباتی و #بیوانفورماتیک به جامعه اکادمیک کشور می باشد.اقدام به برگزاری دوره های تخصصی در این زمینه کرده است از آنجایی که یادگیری پایدار نتیجه آموزش مداوم است، پشتیبانی و راهنمایی طولانی مدت کاراموزان و شرکت کنندگان در این دوره ها را جزء وظایف خود می داند، از این رو در نظر دارد جلساتی تحت عنوان #رفع_اشکال را برای این عزیزان فراهم نمایید.

💎جلسه رفع اشکال #طراحی_دارو و #داکینگ بصورت رایگان در روز چهار شنبه 95/02/08 از ساعت 16 و 30 دقیقه الی 19 در محل آزمایشگاه برگزار می گردد.💎
⬅️دوستانی که تمایل به شرکت در این جلسه را دارند. از طریق یکی از 2 راه ارتباطی زیر اعلام آمادگی نمایند.
1-از طریق ارسال ایمیل به info@drugdesign.ir
2-تماس با ادمین کانال @bioinformatics1

📎جلسات رفع اشکال مباحث دیگر مانند: #ایمونوانفورماتیک، #دینامیک_مولکولی و #کیوسار نیز به زودی اعلام خواهد شد.

با تشکر
مدیریت آزمایشگاه پارس سیلیکو
WWW.DRUGDESIGN.IR

☀️ #سمینار

📂موضوع : معرفی روش های نوین در #طراحی_دارو
http://drugdesign.ir/images/blog/seminar2f.jpg
آزمایشگاه #پارس_سیلیکو با توجه به رسالت خود که معرفی و آموزش علوم #زیست_شناسی_محاسباتی و #بیوانفورماتیک به جامعه اکادمیک کشور می باشد.اقدام به برگزاری دوره های تخصصی و سمینارهای رایگان در این زمینه کرده است. لذا به اطلاع علاقه مندان می رساند. سمیناری تحت عنوان 💊""معرفی روش های نوین در طراحی دارو""💊
بصورت رایگان در روز چهارشنبه 95/02/15 از ساعت 16 و 30 دقیقه الی 18 در محل آزمایشگاه برگزار می گردد.

⬅️دوستانی که تمایل به شرکت در این جلسه را دارند. از طریق مراجعه به آدرس زیر و تکمیل فرم مربوطه، برای حضور در سمینار اعلام امادگی نمایند.⬅️
http://drugdesign.ir/index.php/j-blog/218-seminar

✨اولویت با کاراموزان و شرکت کنندگان در دروه های آزمایشگاه پارس سیلیکو می باشد.

🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

📥 Molegro Molecular Viewer (Windows)
✨ #Protein_analyzer #PDB
💾 6.5 MB
🏆ParsSilico Laboratory
🌐www.DrugDesign.ir

#نرمافزار Molegro Molecular Viewer یک نرم افزار تخصصی برای مشاهده ساختار ماکرومولکولها است. که به شما امکان مطالعه و تجزیه و تحلیل #اینتراکشن بین #لیگاند و #ماکرومولکول ها را میدهد.با امکاناتی که دارد می توانید ماکرومولکول ها را با جزئیات بررسی و مطالعه بفرمایید. رایگان و ساده می باشد. فرمت های SDF MOL2 PDB را می خواند .
http://drugdesign.ir/images/parssilico.jpg
با درج کد چهار رقمی PDB امکان دریافت ساختار ماکرومولکول بصورت انلاین را نیز دارد. برای ادیت کردن #پروتئین بسیار کاربردی است.

🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

☀️ پرسش و پاسخ مطرح شده گروه:

📂موضوع : #طراحی_دارو #داکینگ
📰 معرفی داکینگ معکوس


🔒سوال

با سلام reverse docking چیست؟ و چه تفاوتی با داکینگ مرسوم دارد.؟

🔑 پاسخ های مطرح شده :
🔑پاسخ 1

داکینگ مرسوم معمولا به این صورت هست که یک سری بزرگ از ترکیبات لیگاندی علیه یک هدف (پرتئین) غربالگری می شوند. اما در ریورس داگینگ(داکینگ برگشتی، داکینگ معکوس) شما یک ترکیب یا تعداد کوچکی ترکیب رو علیه تعدادی هدف داک می کنید. این روش میتواند باعث شود که دارو های موجود یا بلقوه رو برای مقاصد درمانی دیگری استفاده گردند
http://www.cell.com/cms/attachment/2008137029/2030915388/gr1.jpg

🔑پاسخ 2

داکینگ معکوس یک ابزار بسیار قدرتمند در repositioning دارو و یافتن تارگت جدیدی دارویی می باشد.
داکینگ معکوس یعنی داکینگ لیگاند یا داروی کوچک در پاکت های اتصالی بلقوه تعدادی از ماکرومولکولهای تارگت که از نظر بالینی به هم مرتبط هستند.انالیز نتایج داکینگ منجر به شناسایی تارگت جدید برای دارو می باشد.

از وب تولز های داکینگ معکوس می توان به وب سرور TarFisDock اشاره کرد.
http://www.dddc.ac.cn/tarfisdock/
مقالات بسیار جذابی در این زمینه وجود دارد که در ادامه ارسال خواهد شد.

🔎 عضویت در کانال بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

📚 کتاب هفته:
Peptide Chemistry and Drug Design
Author(s): Ben M. Dunn
Year: 2015
Size: 3 MB
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

📥 Peptide Chemistry and Drug Design
✨ #Peptide #Book
💾 3 MB
🏆ParsSilico Laboratory
🌐www.DrugDesign.ir

☀️ #کتاب هفته

📰 Peptide Chemistry and Drug Design

میاحث این کتاب بر پپتیدهایی دارویی متمرکز است #پپتید های دارویی در چند سال اخیر به عنوان یک موضوع جذاب و تازه ای در مباحث تحقیق و توسعه دارویی مطرح شده است. این کتاب به خوانندگان برای حل مشکلاتشان در کشف، توسعه، تولید و انتقال داروهای مبتنی بر پپتید کمک کند. از این کتاب به عنوان یک مرجع تخصصی و هم یک منبع آموزشی برای دانشجویان یاد می کنند.
امیدارم که دوستان علاقه مند از مطالعه این کتاب لذت ببرند.
🔎 عضویت در کانال بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

Advanced Drug Design Workshop
Pars Silico Bioinformatics Laboratory
کارگاه طراحی دارو پیشرفته
www.DrugDesign.ir

☀️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

📂موضوع : #ژنومیکس_مقایسه_ای
📰 تعریف ژنومیکس مقایسه ای و کاربرد های آن

ژنومیکس مقایسه ای یک حوزه هیجان انگیز از تحقیقات بیولوژیکی است که که در آن پژوهشگران با استفاده از انواع ابزارها، از جمله آنالیز های بر پایه کامپیوتر، توالی های کل #ژنوم گونه های مختلف را با هم مقایسه می کند. با مقایسه دقیق ژنوم ارگانیسم های مختلف - از جمله ژنوم موجودات اعم از انسان به شامپانزه تا مخمر - محققان می توانند مناطق مشابه و متفاوت را بطور دقیق تعیین کنند. این اطلاعات به دانشمندان کمک کند تا درک بهتری از ساختار و عملکرد ژن های انسان و تهیه استراتژی های جدید برای مبارزه با بیماری های انسانی داشته باشند.
________________________________________
سالها مطالعات برروی ژنومیکس مقایسه ای به نتایج چشمگیری رسیده است. محققان به طور فزاینده ای از #ژنومیکس مقایسه ای برای کشف حوزه های مختلفی از علوم زیستی و پزشکی، اعم از مطالعه توسعه و رفتار انسان تا بررسی متابولیسم و کشف استعداد ابتلا به بیماری استفاده می کنند. محققان از ژنومیکس مقایسه ای برای آشکار ساختن زیربنا و اساس ژنومی بیماری ها در حیوانات استفاده می کنند تا به بینش جدید در درمان بیماری در انسان برسند.
محققان #ژنوم صدها گونه از حیوانات و گیاهان را به طور کامل توالی یابی کرده اند بیش از 250 گونه های جانوری و 50 گونه از پرندگان، و به این لیست بطور مرتبط و روزانه اضافه می شود.
http://drugdesign.ir/images/blog/comprtive_genomics.jpg
________________________________________
🔆 مثال های از نتایج مطالعات ژنومیک مقایسه ای 🔆
________________________________________
✨ یک مطالعه نشان داد که حدود 60 درصد از ژن ها بین #مگس میوه و #انسان حفاظت شده است، به این معنی که به نظر می رسد دو ارگانیسم مجموعه ای از ژن ها را به اشتراک گذاشتن اند. دو سوم از ژن های انسان که در #سرطان نقش داشته باشد مشابه آن در مگس میوه نیز وجود دارد.
✨ تجزیه و تحلیل ژنومیکس مقایسه ای شش گونه #مخمر دانشمندان را وادار کرد تا کاتولوگ اولیه تهیه شده از ژن ها مخمر را بازبینی کنند و در نتیجه این تجزیه تحلیل مجموعه ای جدید از عناصر عملکردی که نقش مهمی در تنظیم فعالیت ژنوم، نه تنها در در مخمر بلکه در بسیاری از گونه های دیگر بازی می کنند، را کشف کردند.
✨ محققان که برروی تولید شیر مطالعه می کردند با نقشه برداری ژن های که باعث افزایش تولید شیر با چربی بالا در گاو می شوند ،باعث افزایش تولید شیر به میزان بالاتری و در نتیجه تاثیر چشمگیری در اقتصاد ایجاد کرده اند .این یکی از بسیاری از مطالعات با هدف افزایش تولید مواد غذایی است.
✨ دانشمندان ژن ها که باعث افزایش ماهیچه سازی در گاو را کشف کردند. همچنین آنها همان ژن ها را در سگهای مسابقه پیدا کردند، و نتایج این یافته ها به مطالعاتی که بروی افزایش عملکرد انسانها صورت می گیرد نیز کمک می کند.
✨ مقایسه ژنوم، نزدیک به 50 گونه پرنده یک #شبکه_ژنی مسئول آواز در پرندگان را اشکار ساخت که ممکن است این شبکه ژنی نقش مهمی در سخن گفتن و زبان انسان نیز داشته باشد. محققان همچنین شبکه های ژنی مسئول صفات مانند پر و منقار را نیز کشف کرده اند.
✨ در مطالعات دیگر، محققان NHGRI برای درک بهتر از نحوه رشد و توسعه موجودات و برای رسیدن به این پاسخ که ژنها چگونه برروی شکل و اندازه بدن تأثیر می گذارد ژنوم سگ های با اندازه های مختلف.را با هم مقایسه کرده اند. همچنین مطالعات انجام شده برروی سگ های مبتلا به مشکلات خواب، ژن ها و مسیرهای درگیر را آشکار و برای درمان مشکلات خواب، اهداف دارویی تازه ای را پیشنهاد کرده اند.
🔆 اینها چندین مثال از صد ها مثال کاربرد ژنومیکس مقایسه ای بود. نتایج مطالعه ژنومیکس مقایسه ای می تواند در مطالعات #فیلوژنی و #تکامل ، کشف ژن های درگیر در مسیر های مختلف بیوشیمیایی، در شناسایی ژن های عامل صفات منحصر به فرد در یک موجود، عامل ایجاد بیماری و... به کار برده شود.
🔎 عضویت در کانال بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

🖥 معرفی نرم افزار

📂موضوع : نرم افزار مدلر برای مدلسازی و بهینه سازی ساختار پروتئین

#مدلر #modeller برای #مدلسازی #همولوژی و یا مدل سازی مقایسه ای ساختارهای سه بعدی #پروتئین استفاده می شود. کاربر برای مدلسازی، یک توالی الاینمنت شده را به نرم افزار داده تا مدلسازی با استفاده از ساختارهای شناخته شده مرتبط به آن توالی انجام شود.سپس مدلر به طور خودکار یک مدل که شامل تمام اتم ها بجز هیدروژن است را می سازد.
همچنین می توان از مدلر برای مدل سازی لوپ ها در ساختارهای پروتئینی، بهینه سازی مدل های مختلف از ساختار پروتئین با توجه به انعطاف پذیری تعریف شده ، #الایمنت چند تایی #توالی های پروتئینی و / یا ساختار های آن، خوشه بندی، جستجو توالی از پایگاه داده ها، مقایسه ساختارهای پروتئین، و غیره .. استفاده کرد.
http://drugdesign.ir/images/modeller.jpg
نرمافزار مدلر برای نسخه های #لینوکس، #ویندوز و #مک در دسترس است.
🔑لایسنس نرم افزار 👈 MODELIRANJE

✨نرمافزار مدلر در کارگاه بیوانفورماتیک ساختاری آموزش داده می شود.

⬅️دوستانی که تمایل به شرکت درکارگاه آموزشی بیوانفورماتیک ساختاری ( مدلسازی ساختار پروتئین، داکینگ پروتئین- پروتئین دارند از طریق مراجعه به آدرس زیر و تکمیل فرم مربوطه، اقدام به ثبت نام نمایند.⬅️
http://drugdesign.ir/index.php/e-services/structural-bioinformatics


🔎 عضویت در کانال آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو 👇
https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

📥 #Modeller (Windows-32bit)
✨ #Protein_modelling #PDB
💾 13 MB
🏆ParsSilico Laboratory
🌐www.DrugDesign.ir

☀️ جلسه رفع اشکال #دینامیک_مولکولی #گرومکس
✨آخرین فرصت برای شرکت در جلسه رایگان رفع اشکال مولکولار دینامیک و نرم افزار گرومکس
http://drugdesign.ir/images/articles/md/mp-MD.jpg

🖥جلسه رفع اشکال #دینامیک_مولکولی #گرومکس ✨بصورت رایگان در روز چهار شنبه 95/02/22 از ساعت 17 الی 18:30 ✨در محل آزمایشگاه برگزار می گردد.
⬅️ ثبت نام از طریق لینک زیر👇👇👇
http://drugdesign.ir/index.php?option=com_rsform&formId=4



با تشکر
مدیریت آزمایشگاه پارس سیلیکو
WWW.DRUGDESIGN.IR

📣 #سخنرانی با موضوع :
✅(( روش های مدرن در #طراحی_دارو ))
امروز ساعت 21
💎