🗣 سمينار "استفاده از شيمي كوانتومي محاسباتي در مطالعات دارويي"

💠ارائه دهنده: خانم دكتر باقري💠

⏱ زمان: چهارشنبه يكم آذر ۱۱ صبح
📍مكان: آزمايشگاه بيوانفورماتيك پارس سيليكو

@practicalbioinformatics

📚 #Biostar_handbook

🔔بخش دوم پاسخ به سوالات متداول بیوانفورماتیک

▪️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔بخش دوم پاسخ به سوالات متداول بیوانفورماتیک

❔کامپیوتر پیشنهادی برای بیوانفورماتیک چیست؟

✍️با توجه به تجربه ما، استفاده از کامپیوتر دارای سیستم عامل Mac OS برای راه اندازی و تست روش ها، بسیار مناسب و پر کاربرد می باشد و در ادامه یک ورک استیشن لینوکسی با توان بالا یا کلاستر برای اجرا پاپلاین ها برروی دیتا ها مورد استفاده قرار میگیرد. البته با ارایه نسخه Windows 10 Creator Edition یک شل لینوکسی برروی ویندوز قابل نصب می باشد که می توان ابزار ها را برروی ویندوز ران و اجرا کرد.

❔چه مقدار توان محاسباتی نیاز داریم ؟

✍️روش های بیوانفورماتیکی به سرعت در حال پیشرفت هستند. یک ورک استیشن معمولی اغلب همه نیاز های شما را برای انالیز داده های حاصل از یک ران توالی یابی معمولی، با حجم بالا را براورده می کند.برای مثال، شما با یک کامپیوتر iMac هشت هسته ای با رم 32 گیگ، در طی یک روز می توانید از پس انالیز داده RNA-Seq با الاینر hisat2 بر بیایید. انالیز های بزرگتر مانند اسمبلی ژنوم، نیاز به میزان بیشتری از مموری دارند. همانطور که داده های با کیفیت پایین ( دارای الودگی، اماده سازی غلط نمونه و..) انالیز و محاسبات بیشتری را نسبت به داده های دارای کیفیت بالا نیاز دارند.

❔آیا برای یادگیری بیوانفورماتیک به سیستم با توان محاسباتی بالا نیاز داریم؟

✍️ خیر!!
یادگیری بیوانفورماتیک نیاز به چیزی ندارد به جز یک لپتاپ استاندارد یونیکسی. شما می توانید بیوانفورماتیک را تنها با یک کروم بوک 100 دلاری بیاموزید.
البته که توان محاسباتی مورد نیاز برای به کاربردن روش های بیوانفورماتیک برروی مسائل بخصوص به حجم و میزان داده ها بستگی دارد.یک کورم بوک 100 دلاری ابزار های مورد نیاز را دارد اما احتمالا توان محاسباتی، فضای ذخیرسازی و مموری لازم برای اجرای ابزار ها و تحلیل ها برروی دیتاست ها حجیم را ندارد.
شما از اینکه با یک کروم بوک چه کار های می شود کرد، شگفت زده خواهید شد!
یادتون باشه. شما نیازی به یک سیستم قدرتمند و گرانقیمت برای تبدیل شدن به یکی از بهترین متخصصین بیوانفورماتیک دنیا، ندارید! شما تنها با یک سیستم ساده یونیکسی می توانید آموزش ببینید، تمرین کنید و درک بالایی از تمامی حوزه های بیوانفورماتیک بدست آورید .

🔔 برگرفته از کتاب Biostar Handbook

▫️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🗣 هم اکنون سمينار "استفاده از شيمي كوانتومي محاسباتي در مطالعات دارويي" در حال برگزاری است.

💠ارائه دهنده: خانم دكتر باقري💠


📍مكان: آزمايشگاه بيوانفورماتيك پارس سيليكو

@practicalbioinformatics

🏳تحقیقات جدید نشان داده که اینترلوکین 8 بیومارکر مناسبی برای سرطان پروستات نیست!
https://goo.gl/3tJrjr

▪️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔پایگاه Sci Hub از دسترس خارج شده!
🏳برای دسترسی از دی ان اس های 80.82.77.83 و 80.82.77.84 استفاده کنید.

آدرس جدید سایت🎁

💡 http://sci-hub.bz
▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔مقاله جدید که نشان میدهد چطور در کمتر از 30 ثانیه DNA یا RNA موجودات مختلف را با کاغذ صافی و یا حتی دستمال کاغذی استخراج کرد.

https://goo.gl/ZwdxqC

▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

✍️ژن های محبوب ژنوم انسان
🏳مقاله جذاب از nature که ژن های محبوبی که برروی انها بیشتر مطالعه شده، را معرفی می کند. 👇

📃https://goo.gl/pyVhP6
▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

✍️10 تا ژن که در مقالات بیشتر گزارش شده است.
🏳مقاله جذاب از nature 👇

📃https://goo.gl/pyVhP6
▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

✍️ژن های محبوب ژنوم انسان
🏳مقاله جذاب که دیروز در مجله nature چاپ شده و ژن های محبوبی که بیشتر در مقالات گزارش شده، را معرفی می کند.

📃22 November 2017
▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▫️اندر احوالات بیوانفورماتیک😄🙃


▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

▫️اندر احوالات بیوانفورماتیک🙃
😴وقتی عسل بیوانفورماتیک را هم در میارن🍯


▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

Gates Cambridge Scholarship
🎓فرصت های تحصيل در رشته مختلف زیستی در Gates Cambridge

📌زمينه هاي تحقيقاتي:
field of Interest:
Allergy, oncology, cancer, cardiology, Gastroenterology, Genetics, Immunology, Pediatrics, Surgery, Neurosciences, Orthopedics, Nephrology, Neurology, Critical Care Medicine, Pulmonology, Emergency Medicine, Infertility, Infectious Diseases, Molecular Biology, Global Health, Tropical Diseases, Hepatology, Hematology, Obstetrics, Gynecology, Diabetes, Pathology, Public Health, Ophthalmology, Microbiology, Radiology, Anesthesia, Stem cells, Informatics, Data, Geriatrics, Cell biology, Bioinformatics, all other fields


✍️فرصت تکمیل فرم: 6دسامبر ٢٠١٧



🌍اطلاعات بيشتر در لينك:
https://goo.gl/2jE33m

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

🎁اسلاید سخنرانی خانم دکتر باقري
با عنوان "کاربرد شيمي كوانتومي محاسباتي در مطالعات دارويي"

▫️ارائه شده در پارس سیلیکو

▪️آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔با ابزار آنلاین LiteMol به آسانی می توانید ساختار های ۳ بعدی بسیار حجیم را، حتی بر روی تبلت خود، مشاهده و انالیز کنید!!

▫️لینک 👇
goo.gl/56Zn8A

▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

👏خوش آمد بگویید به آینده

▫️توالی یابی DNA بر روی تلفن همراه

▫️با استفاده از دستگاه SmidgION شرکت Oxford Nanopore و نرم افزار اندروید BaseCaller

▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📚مجموعه کتاب در زمینه های Precision Medicine و Personalized Medicine

▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📚مجموعه کتاب در زمینه Precision Medicine و Personalized Medicine

📚 Genomic and Precision Medicine. Primary Care
Sean P. David, Geoffrey S. Ginsburg and Huntington F. Willard (Eds.)
Academic Press
(2017)

📚Translational Biomedical Informatics_ A Precision Medicine Perspective
Bairong Shen, Haixu Tang, Xiaoqian Jiang (eds.)
Springer Singapore
(2016)

📚Personalized Medicine_ A New Medical and Social Challenge
Nada Bodiroga-Vukobrat, Daniel Rukavina, Krešimir Pavelić, Gerald G. Sander (eds.)
Springer International
(2016)

📚Genomics and Personalized Medicine_ What Everyone Needs to Know
Michael Snyder
Oxford University Press
(2016)

📚Personalized medicine_ promises and pitfalls
Gronowicz, Gloria
CRC Press_Taylor & Francis Group
(2016)

📚Cancer genetics and genomics for personalized medicine-Pan
Il-Jin Kim
Stanford, Crc Press
(2016)

📚Metabolomics and Microbiomics. Personalized Medicine from the Fetus to the Adult
Vassilios Fanos
Academic Press
(2016)

📚Omics for Personalized Medicine
Nalini Raghavachari, Marjan Gucek (auth.), Debmalya Barh, Dipali Dhawan, Nirmal Kumar Ganguly (eds.)
Springer India
(2013)

▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📚 مجموعه کتاب:
📙 Precision Medicine - Personalized Medicine
⏳ Year: 2017-2013
💾 Size: 51 MB
✨ #Book
🌐 www.ParsSilico.com
@practicalbioinformatics

goo.gl/uKva33

🔔گزارشی از همایش "Discovery of the Target"

بیشتر از 1300 نماینده های از بیست کشور در سپتامبر 2017 در بوستون برای 15امین همایش "Discovery of the Target" شرکت کردند: "رویدادی در مورد تارگت های جدید مورد توجه صنعت دارویی " که ده ها محقق در زمینه (ایمونوتراپی سرطان، کشف مبتنی بر هدف، تارگت های مورد توجه و تارگت های جدید، روش ها و استراتژی های اعتبارسنجی برای مولکول های کوچک شیمیایی و زیستی جدید) سخنرانی داشتند.

در ادامه این مطلب، کلیپی از خلاصه این همایش به همراه پادکست مصاحبه با یکی از سخنرانان خدمت شما عزیزان ارایه می شود.

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics