Белковые маркеры: первые шаги и их ограничения
Белковые маркеры (прежде всего запасные белки семян, такие как глиадины у злаков) стали первыми биохимическими инструментами для сортовой идентификации. В 1983 году метод был утвержден Международной ассоциацией по семенному контролю (ISTA) в качестве арбитражного . Однако с развитием молекулярной биологии стали очевидны существенные недостатки этого подхода.
Основные недостатки белковых маркеров
1. Экологическая нестабильность. Белки являются конечными продуктами экспрессии генов и частью фенотипа растения, поэтому их состав подвержен влиянию внешней среды . Исследования показали значительную погодичную изменчивость компонентов спектра:
- У сортов пшеницы изменчивость составляла 15-35%, у ячменя — от 20 до 94% .
- В экстремальные по погоде годы (например, холодные) изменчивость возрастала на 12-50% .
- У сортов вишни в благоприятный год число компонентов увеличивалось на 76% по сравнению с неблагоприятным .
2. Зависимость от условий выращивания. На состав и количество запасных белков влияют стрессовые факторы: недостаток питательных веществ (серы, азота), отклонения температуры. Это означает, что один и тот же сорт, выращенный в разных условиях, может показать разный белковый профиль .
3. Низкая разрешающая способность. Белковые маркеры выявляют лишь небольшую часть существующего генетического разнообразия. Только около 30% нуклеотидных замен могут быть обнаружены с помощью белкового маркирования, так как не каждая замена в ДНК приводит к замене аминокислоты .
4. Мономорфизм у родственных генотипов. У многих близкородственных сортов спектры запасных белков могут быть идентичными, что делает невозможной их дифференциацию .
5. Ограничения по стадии анализа. Для анализа используются преимущественно запасные белки семян, поэтому паспортизацию нельзя провести на стадии проростка или вегетирующего растения .
6. Формирование по материнскому типу. Спектры запасных белков формируются по материнскому типу, что затрудняет идентификацию гибридных форм .
В связи с этими недостатками белковые маркеры сегодня считаются устаревшим методом с низкой информативностью, и в современной практике они постепенно уступают место ДНК-технологиям. .
Белковые маркеры (прежде всего запасные белки семян, такие как глиадины у злаков) стали первыми биохимическими инструментами для сортовой идентификации. В 1983 году метод был утвержден Международной ассоциацией по семенному контролю (ISTA) в качестве арбитражного . Однако с развитием молекулярной биологии стали очевидны существенные недостатки этого подхода.
Основные недостатки белковых маркеров
1. Экологическая нестабильность. Белки являются конечными продуктами экспрессии генов и частью фенотипа растения, поэтому их состав подвержен влиянию внешней среды . Исследования показали значительную погодичную изменчивость компонентов спектра:
- У сортов пшеницы изменчивость составляла 15-35%, у ячменя — от 20 до 94% .
- В экстремальные по погоде годы (например, холодные) изменчивость возрастала на 12-50% .
- У сортов вишни в благоприятный год число компонентов увеличивалось на 76% по сравнению с неблагоприятным .
2. Зависимость от условий выращивания. На состав и количество запасных белков влияют стрессовые факторы: недостаток питательных веществ (серы, азота), отклонения температуры. Это означает, что один и тот же сорт, выращенный в разных условиях, может показать разный белковый профиль .
3. Низкая разрешающая способность. Белковые маркеры выявляют лишь небольшую часть существующего генетического разнообразия. Только около 30% нуклеотидных замен могут быть обнаружены с помощью белкового маркирования, так как не каждая замена в ДНК приводит к замене аминокислоты .
4. Мономорфизм у родственных генотипов. У многих близкородственных сортов спектры запасных белков могут быть идентичными, что делает невозможной их дифференциацию .
5. Ограничения по стадии анализа. Для анализа используются преимущественно запасные белки семян, поэтому паспортизацию нельзя провести на стадии проростка или вегетирующего растения .
6. Формирование по материнскому типу. Спектры запасных белков формируются по материнскому типу, что затрудняет идентификацию гибридных форм .
В связи с этими недостатками белковые маркеры сегодня считаются устаревшим методом с низкой информативностью, и в современной практике они постепенно уступают место ДНК-технологиям. .
❤3
RFLP-анализ: первый ДНК-маркер
RFLP (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов) стал одним из первых ДНК-маркеров, который произвел революцию в генетическом картировании. Суть метода, если в двух словах, заключается в том что геномная ДНК разрезается специальным ферментом, (рестриктазой) в определенных местах (сайтах рестрикции) и далее полученные фрагменты разделяются с помощью электрофореза. Однако для рутинной паспортизации сортов метод имеет ряд недостатков.
Недостатки RFLP
1. Технологическая сложность. RFLP-анализ — многостадийный процесс, включающий выделение высокоочищенной ДНК, обработку рестриктазами, электрофорез, блоттинг (перенос на мембрану), гибридизацию с мечеными зондами и авторадиографию . Метод плохо поддается автоматизации.
2. Высокие требования к качеству ДНК. Требуется ДНК очень высокого молекулярного веса и чистоты.
3. Использование радиоактивной метки. Классический протокол подразумевает применение радиоактивно меченных зондов, что требует особых мер безопасности .
4. Низкая пропускная способность. Получение результата занимает дни и недели, что делает метод дорогим и непрактичным для массовой паспортизации .
5. Необходимость создания зондов. Для каждого маркера требуется специфичный ДНК-зонд, что представляет собой отдельную дорогостоящую работу .
Несмотря на высокую стабильность и кодоминантный тип наследования (позволяющий различать гомо- и гетерозиготы), RFLP оказался слишком сложным и медленным для рутинного применения в паспортизации сортов .
RFLP (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов) стал одним из первых ДНК-маркеров, который произвел революцию в генетическом картировании. Суть метода, если в двух словах, заключается в том что геномная ДНК разрезается специальным ферментом, (рестриктазой) в определенных местах (сайтах рестрикции) и далее полученные фрагменты разделяются с помощью электрофореза. Однако для рутинной паспортизации сортов метод имеет ряд недостатков.
Недостатки RFLP
1. Технологическая сложность. RFLP-анализ — многостадийный процесс, включающий выделение высокоочищенной ДНК, обработку рестриктазами, электрофорез, блоттинг (перенос на мембрану), гибридизацию с мечеными зондами и авторадиографию . Метод плохо поддается автоматизации.
2. Высокие требования к качеству ДНК. Требуется ДНК очень высокого молекулярного веса и чистоты.
3. Использование радиоактивной метки. Классический протокол подразумевает применение радиоактивно меченных зондов, что требует особых мер безопасности .
4. Низкая пропускная способность. Получение результата занимает дни и недели, что делает метод дорогим и непрактичным для массовой паспортизации .
5. Необходимость создания зондов. Для каждого маркера требуется специфичный ДНК-зонд, что представляет собой отдельную дорогостоящую работу .
Несмотря на высокую стабильность и кодоминантный тип наследования (позволяющий различать гомо- и гетерозиготы), RFLP оказался слишком сложным и медленным для рутинного применения в паспортизации сортов .
Прежде чем перейти к рассмотрению конкретных типов маркеров, необходимо понять базовый метод, лежащий в основе большинства современных подходов, — полимеразную цепную реакцию (ПЦР) .
ПЦР — это метод амплификации (размножения) заданных фрагментов ДНК in vitro. Метод был разработан Керри Мюллисом, за что в 1993 году он получил Нобелевскую премию . Суть метода заключается в многократном копировании определенного участка ДНК с помощью фермента ДНК-полимеразы.
Принцип ПЦР основывается на естественной репликации ДНК и включает повторяющиеся циклы из трех этапов :
1. Денатурация — нагревание ДНК до 90-95°С, при котором комплементарные цепи расходятся.
2. Отжиг праймеров — охлаждение до 40-60°С для присоединения коротких синтетических олигонуклеотидов (праймеров, длиной 15-30 нуклеотидов) к комплементарным участкам ДНК.
3. Элонгация — синтез новой цепи ДНК при 72°С с помощью термостабильной Taq-полимеразы.
За 20-35 циклов количество копий целевого фрагмента увеличивается в геометрической прогрессии, достигая миллионов копий, что позволяет проводить дальнейший анализ . ПЦР легко автоматизируется с помощью специальных приборов — амплификаторов, относительно недорога и чрезвычайно специфична .
ПЦР — это метод амплификации (размножения) заданных фрагментов ДНК in vitro. Метод был разработан Керри Мюллисом, за что в 1993 году он получил Нобелевскую премию . Суть метода заключается в многократном копировании определенного участка ДНК с помощью фермента ДНК-полимеразы.
Принцип ПЦР основывается на естественной репликации ДНК и включает повторяющиеся циклы из трех этапов :
1. Денатурация — нагревание ДНК до 90-95°С, при котором комплементарные цепи расходятся.
2. Отжиг праймеров — охлаждение до 40-60°С для присоединения коротких синтетических олигонуклеотидов (праймеров, длиной 15-30 нуклеотидов) к комплементарным участкам ДНК.
3. Элонгация — синтез новой цепи ДНК при 72°С с помощью термостабильной Taq-полимеразы.
За 20-35 циклов количество копий целевого фрагмента увеличивается в геометрической прогрессии, достигая миллионов копий, что позволяет проводить дальнейший анализ . ПЦР легко автоматизируется с помощью специальных приборов — амплификаторов, относительно недорога и чрезвычайно специфична .
RAPD-анализ: простота ценой надежности
RAPD-анализ (случайно амплифицированная полиморфная ДНК) привлек внимание исследователей своей простотой и низкой стоимостью. В методе используются короткие (около 10 нуклеотидов) праймеры со случайной последовательностью .
Критические недостатки RAPD
1. Невоспроизводимость результатов. Это самый серьезный недостаток метода. Результат крайне чувствителен к малейшим изменениям условий ПЦР: качеству и концентрации ДНК, типу полимеразы, концентрации ионов магния, режимам температурных циклов . Профили могут различаться не только между лабораториями, но и при повторении эксперимента в одной лаборатории.
2. Доминантный тип наследования. RAPD-маркеры не позволяют отличить гетерозиготное состояние от гомозиготного . Для паспортизации сортов, особенно гибридов, это критически важно.
3. Чувствительность к качеству ДНК. При использовании ДНК из сухих семян результаты часто нестабильны и противоречивы. Воспроизводимые результаты получаются только на свежих листьях проростков .
4. Гетерогенность профилей. RAPD-профили даже в пределах одного сорта могут быть неоднородными, что создает проблемы при оценке соответствия сорта критериям отличимости, однородности и стабильности .
5. Ограниченный таксономический диапазон. Метод имеет ограниченную применимость выше внутривидового уровня .
Несмотря на способность выявлять высокий уровень полиморфизма, нестабильность RAPD делает его непригодным для создания надежных генетических паспортов .
RAPD-анализ (случайно амплифицированная полиморфная ДНК) привлек внимание исследователей своей простотой и низкой стоимостью. В методе используются короткие (около 10 нуклеотидов) праймеры со случайной последовательностью .
Критические недостатки RAPD
1. Невоспроизводимость результатов. Это самый серьезный недостаток метода. Результат крайне чувствителен к малейшим изменениям условий ПЦР: качеству и концентрации ДНК, типу полимеразы, концентрации ионов магния, режимам температурных циклов . Профили могут различаться не только между лабораториями, но и при повторении эксперимента в одной лаборатории.
2. Доминантный тип наследования. RAPD-маркеры не позволяют отличить гетерозиготное состояние от гомозиготного . Для паспортизации сортов, особенно гибридов, это критически важно.
3. Чувствительность к качеству ДНК. При использовании ДНК из сухих семян результаты часто нестабильны и противоречивы. Воспроизводимые результаты получаются только на свежих листьях проростков .
4. Гетерогенность профилей. RAPD-профили даже в пределах одного сорта могут быть неоднородными, что создает проблемы при оценке соответствия сорта критериям отличимости, однородности и стабильности .
5. Ограниченный таксономический диапазон. Метод имеет ограниченную применимость выше внутривидового уровня .
Несмотря на способность выявлять высокий уровень полиморфизма, нестабильность RAPD делает его непригодным для создания надежных генетических паспортов .
SSR-маркеры: "золотой стандарт"
SSR-маркеры (простые повторяющиеся последовательности, или микросателлиты) стали логичным ответом на недостатки предшествующих методов. Они анализируют вариабельность коротких тандемных повторов (обычно 2-6 нуклеотидов) в геноме с использованием специфичных праймеров .
Преимущества SSR
1. Кодоминантный тип наследования. SSR-маркеры позволяют четко различать гомозиготные и гетерозиготные состояния, что дает полную картину генетической структуры сорта .
2. Высокая воспроизводимость. В отличие от RAPD, SSR-анализ дает стабильные результаты, которые легко воспроизводятся в разных лабораториях .
3. Высокий полиморфизм. Микросателлитные локусы чрезвычайно вариабельны. Например, при анализе 48 сортов малины с использованием всего 8 SSR-маркеров было выявлено 113 уникальных аллелей .
4. Возможность стандартизации. Для многих культур разработаны стандартизированные наборы SSR-маркеров. Для картофеля существует международный набор PGI (Potato Genetic Identity Kit), включающий от 8 до 14 маркеров, что позволяет сравнивать результаты, полученные в разных странах .
5. Доступность. SSR-маркеры экономически эффективны, просты в использовании и не требуют радиоактивных изотопов .
В рамках задач по паспортизации можно использовать мультиплексные наборы маркеров которые различаются цветом флуоресцентно меченных праймеров и размерами продуктов амплификации что позволяет одновременно анализировать до 10 маркеров. Применяемые для разделения полученных фрагментов ДНК-анализаторы имеют разрешающую способность до 1 основания.
Доступность оборудования:
Российская научно-производственная компания "Синтол" (основана в 1997 году выпускниками химического факультета МГУ) совместно с Институтом приборостроения РАН разработала отечественный секвенатор ДНК в рамках программы импортозамещения .
Генетический анализатор "Нанофор-05" — первый 8-капиллярный секвенатор российского производства. Он предназначен для:
- Секвенирования по Сэнгеру (de novo и ресеквенирование)
- Фрагментного анализа (микросателлитный анализ, LOH, AFLP)
- Исследования однонуклеотидных полиморфизмов (SNP)
Преимущества прибора:
- Открытость системы — позволяет работать с наборами для капиллярного электрофореза как отечественных, так и импортных производителей (Thermo Fisher Scientific, Promega, Qiagen)
- Низкая цена на расходные материалы за счет производства в РФ
- Короткие сроки поставки
- Быстрая техническая поддержка
- Русскоязычное программное обеспечение
SSR-маркеры (простые повторяющиеся последовательности, или микросателлиты) стали логичным ответом на недостатки предшествующих методов. Они анализируют вариабельность коротких тандемных повторов (обычно 2-6 нуклеотидов) в геноме с использованием специфичных праймеров .
Преимущества SSR
1. Кодоминантный тип наследования. SSR-маркеры позволяют четко различать гомозиготные и гетерозиготные состояния, что дает полную картину генетической структуры сорта .
2. Высокая воспроизводимость. В отличие от RAPD, SSR-анализ дает стабильные результаты, которые легко воспроизводятся в разных лабораториях .
3. Высокий полиморфизм. Микросателлитные локусы чрезвычайно вариабельны. Например, при анализе 48 сортов малины с использованием всего 8 SSR-маркеров было выявлено 113 уникальных аллелей .
4. Возможность стандартизации. Для многих культур разработаны стандартизированные наборы SSR-маркеров. Для картофеля существует международный набор PGI (Potato Genetic Identity Kit), включающий от 8 до 14 маркеров, что позволяет сравнивать результаты, полученные в разных странах .
5. Доступность. SSR-маркеры экономически эффективны, просты в использовании и не требуют радиоактивных изотопов .
В рамках задач по паспортизации можно использовать мультиплексные наборы маркеров которые различаются цветом флуоресцентно меченных праймеров и размерами продуктов амплификации что позволяет одновременно анализировать до 10 маркеров. Применяемые для разделения полученных фрагментов ДНК-анализаторы имеют разрешающую способность до 1 основания.
Доступность оборудования:
Российская научно-производственная компания "Синтол" (основана в 1997 году выпускниками химического факультета МГУ) совместно с Институтом приборостроения РАН разработала отечественный секвенатор ДНК в рамках программы импортозамещения .
Генетический анализатор "Нанофор-05" — первый 8-капиллярный секвенатор российского производства. Он предназначен для:
- Секвенирования по Сэнгеру (de novo и ресеквенирование)
- Фрагментного анализа (микросателлитный анализ, LOH, AFLP)
- Исследования однонуклеотидных полиморфизмов (SNP)
Преимущества прибора:
- Открытость системы — позволяет работать с наборами для капиллярного электрофореза как отечественных, так и импортных производителей (Thermo Fisher Scientific, Promega, Qiagen)
- Низкая цена на расходные материалы за счет производства в РФ
- Короткие сроки поставки
- Быстрая техническая поддержка
- Русскоязычное программное обеспечение
👍1
SNP-маркеры: современный стандарт
SNP-маркеры (однонуклеотидный полиморфизм) представляют собой маркеры последнего поколения, которые сегодня считаются наиболее совершенным инструментом для генетической паспортизации . SNP — это различия в последовательности ДНК размером в один нуклеотид (A, T, G или C).
Преимущества SNP
1. Огромная распространенность в геноме. SNP встречаются в геноме очень часто — буквально миллионы таких маркеров можно найти у каждого вида. Это позволяет создавать панели из тысяч маркеров и получать уникальный, высокодетализированный "генетический портрет" сорта .
2. Кодоминантный тип наследования. Как и SSR, SNP позволяют различать гомо- и гетерозиготы.
3. Максимальная воспроизводимость. SNP-генотипирование дает исключительно стабильные результаты, легко сравнимые между разными лабораториями.
4. Высокая производительность и автоматизация. SNP-анализ идеально подходит для автоматизированных высокопроизводительных платформ (ДНК-чипы, NGS — секвенирование нового поколения).
Это позволяет анализировать тысячи образцов одновременно и снижать стоимость анализа при массовом использовании .
Ограничения SNP
1. Необходимость высокотехнологичного оборудования. Для полноценного использования SNP требуются сложные и дорогостоящие приборы (секвенаторы, ДНК-чипы) и высокая квалификация персонала.
2. Информационная сложность. Работа с огромными массивами SNP-данных требует развитой биоинформатической инфраструктуры для хранения, обработки и интерпретации результатов.
3. Сложность создания маркеров для сложных признаков. Невозможно создать ДНК-маркеры на такие признаки, как урожайность, качество семян и устойчивость к стрессам, поскольку они контролируются множеством генов и сильно зависят от условий среды.
Проблема импортозависимости в SNP-генотипировании в России
При всех преимуществах SNP-маркеров, их широкое внедрение в России сталкивается с серьезной проблемой — зависимостью от зарубежных поставок оборудования и расходных материалов.
Технология с использованием ДНК-микрочипов от американской компании Illumina — исключена, так-как из-за санкций и экспортных ограничений поставки прекратились .
Использование секвинаторов нового поколения для этого дорого как в плане стоимости оборудования так и с точки зрения стоимости 1 анализа. Кроме того это оборудование к сожалению в России не производится.
SNP-маркеры (однонуклеотидный полиморфизм) представляют собой маркеры последнего поколения, которые сегодня считаются наиболее совершенным инструментом для генетической паспортизации . SNP — это различия в последовательности ДНК размером в один нуклеотид (A, T, G или C).
Преимущества SNP
1. Огромная распространенность в геноме. SNP встречаются в геноме очень часто — буквально миллионы таких маркеров можно найти у каждого вида. Это позволяет создавать панели из тысяч маркеров и получать уникальный, высокодетализированный "генетический портрет" сорта .
2. Кодоминантный тип наследования. Как и SSR, SNP позволяют различать гомо- и гетерозиготы.
3. Максимальная воспроизводимость. SNP-генотипирование дает исключительно стабильные результаты, легко сравнимые между разными лабораториями.
4. Высокая производительность и автоматизация. SNP-анализ идеально подходит для автоматизированных высокопроизводительных платформ (ДНК-чипы, NGS — секвенирование нового поколения).
Это позволяет анализировать тысячи образцов одновременно и снижать стоимость анализа при массовом использовании .
Ограничения SNP
1. Необходимость высокотехнологичного оборудования. Для полноценного использования SNP требуются сложные и дорогостоящие приборы (секвенаторы, ДНК-чипы) и высокая квалификация персонала.
2. Информационная сложность. Работа с огромными массивами SNP-данных требует развитой биоинформатической инфраструктуры для хранения, обработки и интерпретации результатов.
3. Сложность создания маркеров для сложных признаков. Невозможно создать ДНК-маркеры на такие признаки, как урожайность, качество семян и устойчивость к стрессам, поскольку они контролируются множеством генов и сильно зависят от условий среды.
Проблема импортозависимости в SNP-генотипировании в России
При всех преимуществах SNP-маркеров, их широкое внедрение в России сталкивается с серьезной проблемой — зависимостью от зарубежных поставок оборудования и расходных материалов.
Технология с использованием ДНК-микрочипов от американской компании Illumina — исключена, так-как из-за санкций и экспортных ограничений поставки прекратились .
Использование секвинаторов нового поколения для этого дорого как в плане стоимости оборудования так и с точки зрения стоимости 1 анализа. Кроме того это оборудование к сожалению в России не производится.
Вывод. Не смотря на определенные технические преимущества методики основанной на SNP полиморфизме в текущих условиях она не является оправданным выбором так как:
1. Это поставит нас в зависимость от иностранных поставщиков.
2. Ведет к удорожанию анализа.
3. Стоимость оборудования и требования к квалификации кадров не позволят создать лаборатории в достаточном количестве
4. Исходя из выше перечисленного создаст не равные условия для участников рынка
1. Это поставит нас в зависимость от иностранных поставщиков.
2. Ведет к удорожанию анализа.
3. Стоимость оборудования и требования к квалификации кадров не позволят создать лаборатории в достаточном количестве
4. Исходя из выше перечисленного создаст не равные условия для участников рынка
💯2
P.S. паспортизация построена на поиске полиморфных участков генома. Маркеры должны быть равномерно распределены по геному. Источниками полиморфизма являются мутации. Есть 3 типа мутаций SNP однонуклеотидная замена. Может иметь два аллеля (некоторые считают что 4 то такое)), InDel вставка или пропуск одного или нескольких нуклиотидов в маркерной селекции используется для паспортизации не подходит из-за низкой плотности покрытия и малого количества аллелей иневозможности автоматизации, SSR тандемный повторяющийся мотив. Имеет много аллелей, по некоторым маркерам мы находили 7-8 аллельные варианты, а это означает высокую разрешающюю способность при меньшем количестве маркеров. Очень удобны для дальнейшей интерпретации и не требуют вычеслительных мощьностей для поступления анализа полученных результатов. Включать в ДНК-паспорт маркеры ассоциированные с определенными генами есть смысл только если вы создаете аналог существующей линии отличающийся только по 1-2 генам. Для оригинальных линий смысла нет.
❤5
Наш канал существует уже месяц, за это время на него подписалось уже свыше 300 человек.
Если честно, создавая канал и понимая, что такая непростая и весьма специфическая тематика интересна немногим, я рассчитывал на то, что при удачном стечении обстоятельств к концу года будет 50–70 подписчиков, а при неудачном РКН всё равно заблокирует Telegram, и провал не будет замечен.
Но поддержка со стороны Владимира Плотова, а также его подписчиков творит чудеса. Собственно говоря, канал «Заметки селекционера» был создан для того, чтобы давать ответы на вопросы интересующихся людей в его чате. Так что канал появился и успешно развивается во многом благодаря этим замечательным людям. Подписчикам, которые пришли не от Владимира Плотова, рекомендую подписаться на его канал, если вам интересно, чем живет современный российский фермер.
https://news.1rj.ru/str/vvplotov
Если честно, создавая канал и понимая, что такая непростая и весьма специфическая тематика интересна немногим, я рассчитывал на то, что при удачном стечении обстоятельств к концу года будет 50–70 подписчиков, а при неудачном РКН всё равно заблокирует Telegram, и провал не будет замечен.
Но поддержка со стороны Владимира Плотова, а также его подписчиков творит чудеса. Собственно говоря, канал «Заметки селекционера» был создан для того, чтобы давать ответы на вопросы интересующихся людей в его чате. Так что канал появился и успешно развивается во многом благодаря этим замечательным людям. Подписчикам, которые пришли не от Владимира Плотова, рекомендую подписаться на его канал, если вам интересно, чем живет современный российский фермер.
https://news.1rj.ru/str/vvplotov
Telegram
Владимир Плотов
О технологии прямого посева нотилл
В чате запрещена любая реклама, баню сразу.
В чате запрещена любая реклама, баню сразу.
🔥8❤3🫡3
Пришло время подводить итоги опроса: https://news.1rj.ru/str/breeders_notes/72
Не считая тех, кто просто хотел узнать результаты, в опросе приняло участие 73 человека. Трое проголосовавших, что составляет 4 процента, считают работу ГСК безукоризненной, еще 12% (9 голосов) оценили работу ГСК по защите интеллектуальной собственности и контролю сохранения заявленных качеств сортов/гибридов как удовлетворительную («нарушения случаются редко»), но подавляющее большинство — 84% (61 голос) — признали работу Госсорткомиссии неудовлетворительной. Это тревожный симптом. Ситуация, при которой участники рынка могут беспрепятственно коммерциализировать чужие селекционные достижения, ставит организации, добросовестно ведущие селекционную работу, в неравные условия. Создание нового сорта требует не только временных затрат, но и существенных материальных ресурсов, а подобное положение дел делает невыгодными инвестиции в селекцию и демотивирует самих селекционеров.
Не считая тех, кто просто хотел узнать результаты, в опросе приняло участие 73 человека. Трое проголосовавших, что составляет 4 процента, считают работу ГСК безукоризненной, еще 12% (9 голосов) оценили работу ГСК по защите интеллектуальной собственности и контролю сохранения заявленных качеств сортов/гибридов как удовлетворительную («нарушения случаются редко»), но подавляющее большинство — 84% (61 голос) — признали работу Госсорткомиссии неудовлетворительной. Это тревожный симптом. Ситуация, при которой участники рынка могут беспрепятственно коммерциализировать чужие селекционные достижения, ставит организации, добросовестно ведущие селекционную работу, в неравные условия. Создание нового сорта требует не только временных затрат, но и существенных материальных ресурсов, а подобное положение дел делает невыгодными инвестиции в селекцию и демотивирует самих селекционеров.
Telegram
ЗАМЕТКИ СЕЛЕКЦИОНЕРА
Ответьте на вопрос: как вы считаете, эффективна ли работа ГСК по защите интеллектуальной собственности и контролю сохранения заявленных качеств сортов/гибридов:
Эффективна, не к чему придраться. / Нормально выполняется, но бывают редкие нарушения. / Абсолютно…
Эффективна, не к чему придраться. / Нормально выполняется, но бывают редкие нарушения. / Абсолютно…
К вопросу о сортообновлении
В последнее время происходит активная смена нормативов в области семеноводства, вводятся дополнительные ограничения и меры контроля. Одним из новшеств является ограничение количества репродукций при производстве семян самоопыляющихся культур. Эта мера затрагивает большое количество предприятий, в том числе выращивающих семена для собственных нужд. Основным доводом в пользу введения этого ограничения является ухудшение сортовой чистоты и урожайных качеств поздних репродукций.
Вопрос определения оптимальных сроков сортообновления в науке и практике не нов. Нашел он отражение и в учебной литературе: «Академик П.П. Лукьяненко на основании многолетнего изучения урожайности элитных семян озимой пшеницы сорта Безостая 1 по сравнению с семенами последующих репродукций, полученных из различных хозяйств Краснодарского края после предварительного «уравнительного» пересева их в одинаковых условиях, пришел к выводу, что при выращивании растений на высоком агрофоне урожайные свойства семян длительное время, по крайней мере до VIII – X репродукции, не снижаются. Аналогичные данные были получены почти всеми другими научно-исследовательскими учреждениями, проводившими испытание урожайных свойств элитных семян в сравнении с семенами последующих репродукций.» (Гуляев Г.В., Гужов Ю.Л. Селекция и семеноводство полевых культур. - 3-е издание, переработанное и дополненное — М.: Агропромиздат, 1987.)
На основании каких исследований определены ограничения количеств репродукциий, не известно, но очень интересно на них посмотреть.
На мой взгляд, критерием пригодности репродукционных семян должна быть сортовая чистота, определяемая при апробации посевов. Для сохранения сортовой чистоты необходимо исключить все возможные риски засорения при производстве (соблюдение севооборота, зачистка комбайнов, складов и т.д.), а также со стороны селекционеров исключить передачу в ГСИ (Государственное сортоиспытание) и, само собой , - передачу в производство сортов, не обладающих стабильностью.
В последнее время происходит активная смена нормативов в области семеноводства, вводятся дополнительные ограничения и меры контроля. Одним из новшеств является ограничение количества репродукций при производстве семян самоопыляющихся культур. Эта мера затрагивает большое количество предприятий, в том числе выращивающих семена для собственных нужд. Основным доводом в пользу введения этого ограничения является ухудшение сортовой чистоты и урожайных качеств поздних репродукций.
Вопрос определения оптимальных сроков сортообновления в науке и практике не нов. Нашел он отражение и в учебной литературе: «Академик П.П. Лукьяненко на основании многолетнего изучения урожайности элитных семян озимой пшеницы сорта Безостая 1 по сравнению с семенами последующих репродукций, полученных из различных хозяйств Краснодарского края после предварительного «уравнительного» пересева их в одинаковых условиях, пришел к выводу, что при выращивании растений на высоком агрофоне урожайные свойства семян длительное время, по крайней мере до VIII – X репродукции, не снижаются. Аналогичные данные были получены почти всеми другими научно-исследовательскими учреждениями, проводившими испытание урожайных свойств элитных семян в сравнении с семенами последующих репродукций.» (Гуляев Г.В., Гужов Ю.Л. Селекция и семеноводство полевых культур. - 3-е издание, переработанное и дополненное — М.: Агропромиздат, 1987.)
На основании каких исследований определены ограничения количеств репродукциий, не известно, но очень интересно на них посмотреть.
На мой взгляд, критерием пригодности репродукционных семян должна быть сортовая чистота, определяемая при апробации посевов. Для сохранения сортовой чистоты необходимо исключить все возможные риски засорения при производстве (соблюдение севооборота, зачистка комбайнов, складов и т.д.), а также со стороны селекционеров исключить передачу в ГСИ (Государственное сортоиспытание) и, само собой , - передачу в производство сортов, не обладающих стабильностью.
👍11💯7🤡1
Если цель ограничения на количество репродукций заключается в том, чтобы повысить доходность селекционных организаций и не связана со снижением хозяйственной ценности семян, то, может, просто предоставить оригинаторам право самим определять количество допустимых репродукций в условиях лицензионного соглашения?
👍6
Forwarded from Кирилл
Интересный вопрос для селекционных компаний
По ПП РФ 754 Об утверждении Правил локализации производства семян сельскохозяйственных растений на территории Российской Федерации
Заполняете и сдаете ли?
Я имею ввиду только частные компании без участия в ФНТП и только на российской генетике.
По ПП РФ 754 Об утверждении Правил локализации производства семян сельскохозяйственных растений на территории Российской Федерации
Заполняете и сдаете ли?
Я имею ввиду только частные компании без участия в ФНТП и только на российской генетике.
❤4
Forwarded from Токмаков Никита | Сельское Хозяйство
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍1
Подведём итоги опроса (https://news.1rj.ru/str/breeders_notes/88), вызвавшего немало споров в комментариях. Больше половины участников, выразивших своё мнение, считают, что нужна бо́льшая гибкость в вопросе определения количества допустимых репродукций.
Telegram
ЗАМЕТКИ СЕЛЕКЦИОНЕРА
Считаете ли вы что:
Нужно для всех закрепить одинаковое количество допустимых репродукций. / Оригинатор вправе сам определять количество репродукций в лицензионном соглашении. / Посмотреть результаты
Нужно для всех закрепить одинаковое количество допустимых репродукций. / Оригинатор вправе сам определять количество репродукций в лицензионном соглашении. / Посмотреть результаты
Хотел рассказать об одном успешном селекционном проекте, встретившем трудности на этапе внедрения, но оказалось, что об этом уже есть статья в Википедии — https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%97%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D1%82%D0%BE%D0%B9_%D1%80%D0%B8%D1%81, поэтому с подробностями предлагаю ознакомиться там, а здесь кратко изложу суть.
Цель создания «золотого риса» (golden rice) — борьба с дефицитом витамина A в развивающихся странах (Африка, Южная и Юго-Восточная Азия). По данным ВОЗ, от гиповитаминоза страдают миллионы детей и беременных, что ежегодно приводит к смертям и слепоте. Программы прямого снабжения витамином A сократили дефицит, но рис — основа питания в этих регионах, поэтому его модификация — простое и дешёвое решение.
Витамин A синтезируется в организме из бета-каротина. Учёные внедрили в рис гены нарцисса и бактерии, чтобы бета-каротин накапливался в зерне. Первая версия риса (2000 год) давала мало каротина. Улучшенная версия (Golden Rice 2, 2005) с геном кукурузы производит до 37 мкг/г каротиноидов: 100–150 граммов такого риса покрывают 60% суточной потребности в витамине A.
После создания «золотого риса» его нужно было адаптировать для тропического климата Азии. Этим занялся Международный институт риса (Филиппины). Учёные перенесли нужные гены в местные сорта (Rc82, IR64, BR29) с помощью скрещивания. Лучшей признали линию GR2E: она сохранила свойства обычного риса, а содержание каротина позволяло покрыть 40–80% нормы витамина A для детей.
Права на технологию принадлежат компании Syngenta, но фермеры с доходом до $10 000 в год могут использовать её бесплатно, однако экспорт зерна запрещён.
У проекта много противников, особенно Greenpeace. Критики сомневались в безопасности и эффективности риса, но исследования (2006–2012) доказали: он не вызывает аллергии, каротин не разрушается при варке и хорошо усваивается организмом. Проблемой остаётся потеря каротина при хранении.
Несмотря на одобрение регуляторов США, Канады, Австралии и Филиппин (2021), в 2023 году Верховный суд Филиппин отменил разрешение на выращивание под давлением экологов. В Бангладеш вопрос о допуске риса до сих пор не решён.
Цель создания «золотого риса» (golden rice) — борьба с дефицитом витамина A в развивающихся странах (Африка, Южная и Юго-Восточная Азия). По данным ВОЗ, от гиповитаминоза страдают миллионы детей и беременных, что ежегодно приводит к смертям и слепоте. Программы прямого снабжения витамином A сократили дефицит, но рис — основа питания в этих регионах, поэтому его модификация — простое и дешёвое решение.
Витамин A синтезируется в организме из бета-каротина. Учёные внедрили в рис гены нарцисса и бактерии, чтобы бета-каротин накапливался в зерне. Первая версия риса (2000 год) давала мало каротина. Улучшенная версия (Golden Rice 2, 2005) с геном кукурузы производит до 37 мкг/г каротиноидов: 100–150 граммов такого риса покрывают 60% суточной потребности в витамине A.
После создания «золотого риса» его нужно было адаптировать для тропического климата Азии. Этим занялся Международный институт риса (Филиппины). Учёные перенесли нужные гены в местные сорта (Rc82, IR64, BR29) с помощью скрещивания. Лучшей признали линию GR2E: она сохранила свойства обычного риса, а содержание каротина позволяло покрыть 40–80% нормы витамина A для детей.
Права на технологию принадлежат компании Syngenta, но фермеры с доходом до $10 000 в год могут использовать её бесплатно, однако экспорт зерна запрещён.
У проекта много противников, особенно Greenpeace. Критики сомневались в безопасности и эффективности риса, но исследования (2006–2012) доказали: он не вызывает аллергии, каротин не разрушается при варке и хорошо усваивается организмом. Проблемой остаётся потеря каротина при хранении.
Несмотря на одобрение регуляторов США, Канады, Австралии и Филиппин (2021), в 2023 году Верховный суд Филиппин отменил разрешение на выращивание под давлением экологов. В Бангладеш вопрос о допуске риса до сих пор не решён.
😢1