Итак, по поводу библиографии. Я тут заканчиваю некое "великое деланье" (потом расскажу), в рамках которого мне пришлось столкнуться с библиографией на полторы сотни позиций, так что видел некоторое дерьмо. Так что самое время встать на табуретку и обратиться к молодым шутливым юным исследователям, особенно математикам.

Полагаю, что вы пишете свои статьи в TeX. Конечно, "шапка" кочует из статьи в статью, а у некоторых даже собрана в отдельный стилевой файл (хотя я предпочитаю раздутую преамбулу). Ну и, конечно, кочуют из статьи в статью и ссылки на предыдущие статьи. Итак, какие у вас есть проблемы (даже если вы их пока не осознали): 1) При сдаче статьи в журнал все ссылки нужно оформить по правилам журнала; 2) Хочется менять порядок вхождения статей (алфавит vs по упоминанию vs по году) и отслеживать не пропала ли ссылка на статью из текста (на всё что есть в библиографии должна быть ссылка в тексте); 3) ссылку нужно сопровождать doi и\или прямой ссылкой; 4) Однажды найденную удачную ссылку не хочется терять в будущем, а лазать по своим старым работам несколько утомительно (а уж искать нужный исходник статьи сданной в печать n лет назад — это прямо веселье.

Еще кусок мотивации. Почему у вас в статье должен быть нормальный литобзор. 1) Сравнивая ваши результат с другими вы получаете понимание контекста исследований; 2) Радость взаимного цитирования; 3) Вы не занимаетесь изобретением велосипеда и пользуетесь результатами коллег; 4) Вы совершаете меньше ошибок (сравнивая свои результаты с чужими). Я стараюсь что бы у меня в каждой работе был хотя бы десяток ссылок на другие работы уважаемых коллег (и хотя бы пара-тройка совсем свежих).

Итак, что у нас есть в качестве стандартного инструмента. Встроенный инструмент thebibliography. То есть \bibitem{key-name} {ручками оформленная ссылка на статью}. Как легко понять — ничего не автоматизировано. Оформление ссылки — каждый сам кузнец своего счастья (и половых сношений с редактурой текста). Так что thebibliography нам не бро. Кто нам бро — BibTeX. Смысл в том, что ваша библиография будет находиться в отдельном файле (который может быть один на все случаи жизни). Ну, а к примеру оформление "по ГОСТу", в стиле Chicago или любом другом — достигается буквально выставлением одного параметра при подкючении пакет biblatex. Подробный мануал есть здесь, на русском здесь и, разумеется, в оверлифе. Документация для госта отдельно.

Полезные фишки. Есть куча конвертеров из doi в bibtex. Например вот. Ну и у многих журналов и агрегаторов (типа semantic того же) есть встроенный инструмент, возвращающий ссылку в нужном формате. Ещё удобно пользоваться оболочкой JabRef (визуальный инструмент c включенным поиском по doi, кстати).

С чем будут проблемы. 1) Сделать это в первый раз. 2) Фамилии авторов на иностранных языках (напр. цитируя сволочь с норвежеской фамилией, придется не забыть подключить норвежский язык — иначе будете смотреть на странные errorы) 3) Порог вхождения — несколько часов жизни потратить придется.