آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
716 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
چگونه مشخصات پردازنده سیستم عامل لینوکس را مشاهده کنیم؟
برای این کار کافی است یکی از کامندهای زیر را در ترمینال لینوکس وارد کنید تا مشخصات سخت افزاری سیستم برای شما نشان داده شود.
1- کامند اول مشخصات کلی cpu و سیستم عامل را در اختیار شما قرار می دهد.
2- کامند دوم اطلاعات ضروری که کاربر نیاز دارد را نشان می دهد
3- کامند سوم سرعت cpu را به هرتز برای کاربر در کنار سایر مشخصات نشان می دهد.

🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
lscpu

lscpu | grep -i bogo

lscpu | grep -i hz
تعیین مشخصات کلی و جزیی پردازنده ها و سایر اطلاعات موردنیاز از بیس سخت افزاری که کاربر هنگام کار بر روی سیستم عامل لینوکس می خواهد به آنها دسترسی پیدا کند

🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
sudo apt install inxi -y

inxi
خروجی دستور lscpu و مشاهده اطلاعات سخت افزاری سیستم هنگام کار بر روی سیستم عامل لینوکس
🧬
@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس
برای مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس از کامندهای زیر می توانید به ترتیب استفاده کنید.
کامند اول: لیست کارتهای حافظه به همراه ظرفیت آنها
کامند دوم: مشخصات حافظه ها از لحاظ ظرفیت، سرعت، نوع، و برند و مشخصات دیگر
کامند سوم: حداکثر حافظه قابل نصب بر روی سیستم
کامند چهارم: مشاهده اسلات های باز حافظه و اطلاع از امکان نصب حافظه بیشتر یا خیر

dmidecode -t memory | grep -i size

lshw -short -C memory

dmidecode -t memory | grep -i max

lshw -short -C memory | grep -i empty
مشاهده مشخصات دیسک سخت افزاری با استفاده از کامند زیر در سیستم عامل لینوکس
lshw -short -C disk
لیست کردن تمام کارت های حافظه قابل استفاده سیستم عامل بعد از نصب لینوکس:
lsblk
👍1
برای مشاهده اطلاعات کارت شبکه در سیستم عامل لینوکس از کامند زیر استفاده کنید
lshw -C network
👍1
مشاهده ip و gateway در سیستم عامل لینوکس: از یکی از دو دستور زیر استفاده کنید. دقت داشته باشید که برای استفاده از netstat حتما بایستی از قبل آن را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید. در صورتی که از درایو مجازی برای اجرای لینوکس استفاده می کنید، چنانچه مجوز اجرای این دستور را نداشتید به صورت super-user یا root دستور آخر را اجرا کنید.
ip route | column -t

sudo apt install net-tools

netstat -r
👍1
مشاهده مشخصات BIOS: دقت داشته باشید برای اجرای کامند زیر بایستی به صورت root آن را اجرا کنید. در حالت عادی دسترسی به خروجی این کامند میسر نمی باشد (مطابق شکل نشان داده شده)
sudo -su

dmidecode -t bios
👍3
مشاهده مشخصات پایه سیستم عامل و کرنال لینوکس:
uname -a
👍3
معرفی نرم افزار:
مجموعه نرم افزاری امبر یکی از بهترین ابزارهای محاسباتی برای انجام دینامیک مولکولی است که در دو نسخه فری و تجاری برای کاربران ارائه می شود. همانند گرومکس این ابزار می تواند در بازه های زمانی مختلف برای انجام انواع شبیه سازی های دینامیک مولکولی مورد استفاده قرار گیرد و همچنین می توان از آن برای کارهای محاسباتی همانند مدلسازی های کوانتومی بهره برد. در این بخش فایل آخرین ورژن نرم افزار امبر و امبرتولز 23 برای کاربران عزیز قرار داه شده است.
🧬@IRBioinformatics
👍1
Amber22 (1).tar.bz2
102.9 MB
دانلود اخرین بیلد نرم افزار محاسباتی امبر22
🧬@IRBioinformatics
👍1
Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
135.1 MB
نرم افزار miniconda محیط تلفیقی بر پایه پایتون برای نصب و اجرای نرم افزارهای وابسته با پایتون
🧬@IRBioinformatics
👍1
ambertools-feedstock-main.zip
42.5 KB
نصب امبرتولز با واسطه conda: برای مشاهده کدها و شیوه نصب فایل readme را مشاهده کنید

🧬@IRBioinformatics
👍21
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
نصب آسان و سریع کوندا در محیط لینوکس:
برای نصب سریع و بدون دردسر مینی کوندا در محیط لینوکس از کد دستورسی زیر استفاده کنید. در صورتی که فایل مینی کوندا را از قبل دانلود کرده اید نیاز به اجرای کامند wget و دانلود مجدد پلتفرم مذکور نمی باشد. به ترتیب کامندها را وارد کنید و برنامه را نصب کنید.سپس با مطالعه این راهنما می توانید آمبرتولز را نیز به راحتی در مینی کوندا نصب نمایید.

mkdir -p ~/miniconda3 
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda3/miniconda.sh
bash ~/miniconda3/miniconda.sh -b -u -p ~/miniconda3
rm -rf ~/miniconda3/miniconda.sh

~/miniconda3/bin/conda init bash
~/miniconda3/bin/conda init zsh
👍1
membrane.gif
13.5 MB
میخای با Anaconda تو محیط پایتون فایل های تراژکتوری خروجی گرومکس رو آنالیز کنی؟ پس حتما حتما کار با nglview رو یاد بگیرین. نحوه نصب و راه اندازیش رو تو فایل بعدی براتون گذاشتم. بعد از اینکه از حالت فشرده خارجش کردین مطابق فایل README اون رو نصب کنین و ازش استفاده کنین

🧬@IRBioinformatics

نصب آسان در محیط کوندا:

conda install nglview -c conda-forge


نصب آسان به عنوان یک بسته پایتون:
pip install nglview


با ما همراه باشید
👍3